Lecture 2 - Bacteria and Archaea

8/19/2019 Lecture 2 - Bacteria and Archaea

1/40

Lecture 2 – Microbiology :

Bacteria and ArchaeaDyke Gita Wirasisya, S.Farm., M.Sc., Apt.


2/40

PROKARYOTIC ORGANISM…

BACTERIA… ARCHAEA…


3/40

Continue…

Bacteria and Archaea share many traits and itwas not until 1980s that diferences rst!ecame e"ident #rom analyses o# $enese%uences…

&CR

&olymerase Chain Reaction…


4/40

BACTERIA AND ARCHAEA


5/40

BACTERIADiversity :

•Morphology

•Type of nutrition

•Adaptation

•Chemical

composition•Biochemicalactivities


6/40

TYPE OF NUTRITION…

Autotrophic 'r$anisme yan$ mem(eroleh dan mem!uat

nutrisi dari (roses #otosintesis)

Heterotrophic

'r$anisme yan$ !ertahan hidu( den$an

mem(eroleh nutrisi dari se*itar atau den$an

mende*om(osisi or$anisme lain dan

men+adi*annya se!a$ai nutrisi)


7/40

Morphology…

,or(holo$y

Bentu* sell ,a+or cell mor(holo$y

Coccus

Rod-!acillus

cocco!acillus .(irillum

/nusual sha(es .(irochetes lamentous !acteria "i!rio helical

comma etc

Bacilli

.(iral

Cocci


8/40

Morphology

.HA&E

.IE

ARRA23E,E2T

!I"E

!i#e range forpro$aryotes %&'

(m to )*%% (m indiameter

!I"E+% , -% (m in

diameter

!I"E

*.% (m in

diameter


9/40

Morphology

.HA&E

.IE

ARRA23E,E2T


10/40

Continue… 4ita tida* da(at mem!eda*an !a*teri dan archaea

hanya dari mor#olo$inya…

A(a yan$ menye!a!*an tia(5tia( s(esies mem(unyai

!entu* yan$ !er!eda66 A7A&TA.I

'(timisasi (en$am!ilan dan (en$$unaan nutrisi u*uran

*ecil

&er$era*an dalam lin$*un$an yan$ tida* mendu*un$

!a*teri heli*s

7alam la!oratorium media (ertum!uhan umur *ultur

tem(eratur in*u!asi


11/40

Continue…


12/40

Struktur Eksternal…

A3EA ,eru(a*an lamen yan$ mencuat

dari sel dan !er#un$si untu*(er$era*an)

3era*an :a$ela memun$*in*anor$anisme mende*ati ataumen+auhi stimulus 4emota*sis

otota*sis

Aerota*sis ma$netota*sis

Ada ; ti(e macam (enem(elan:a$ela

Atri*us monotri*us lo#otri*usamtri*us dan (eritri*us

E) Coli'1;


13/40

I,BRIA ,eru(a*an $olon$an (rotein yan$ dise!ut le*tin…

(rotein ini da(at men$enali dan teri*at (adaresidu $ula dan (olisa*arida)

or$anisme yan$ mem(unyai m!ria cenderun$!eri*atan satu sama lainnya)

,utasi (ada !a*teri !erm!ria misalnya N.gonorrhoeae menye!a!*an hilan$nya si#at"irulensi


14/40

&II .ecara mor#olo$i sama den$an m!ria namun

le!ih (an+an$)

un$sinya adalah untu* trans#er materi $eneti*?72A@ (ada (eristiwa *on+u$asi


15/40

Struktur Eksternal

3I4'4AI4.

4A&./ .u!stansi yan$ menyelu!un$i ataumen$elilin$i sel

un$si dari $li*o*ali*s &erle*atan !a*teri (ada (ermu*aan

&erlindun$an terhada( *e*erin$an

&eran$*at nutrisi

&rote*si terhada( ancaman

3li*o*ali*s tersusun atas

(olisa*arida yan$ meru(a*an !a$iandari $lu*osa $ula amino rhamnosaasam uronat dan !e!era(a asamor$ani* misalnya (iru"at dan asetat)


16/40

.I,E

A&I.A2 E27IR ,eru(a*an materi dari $li*o*ali*s yan$ di

e*s*resi*an (ada media (ertum!uhan or$anisme)

.lime tersusun atas e*so(olisa*arida $li*o(roteindan $li*oli(id)

un$si slime = &erlindun$an terhada( *e*erin$an

&eran$*at nutrisi

&rote*si terhada( ancaman

,em(ertahan*an *oloni terhada( (roses sterilisasi*imiawi


17/40

7I27I23 .E 7indin$ sel meru(a*an stru*tur

*om(le*s (enentu !entu* seldan (elindun$ sel)

Tersusun atas (rotein yan$dise!ut (e(tido$li*an…

&e(tido$li*an meru(a*anstru*tur ulan$an disa*arida 25acetyl$lucosamine ?2A3@ dan

25acetylmuramic acid ?2A,@yan$ mele*at (ada (e(tida ?5

alanin 75alanin asam 75$lutamat lisin dan asam

diamino(imelat@ mem!entu*rantai tetra(e(tida dalami*atan β-1-4-glukosida.


18/40

Berdasar*an (er!edaan dindin$ selnya !a*teridi!eda*an men+adi 3ram (ositi# dan 3ramne$ati#)


19/40

/RAM 01!ITI2

7indin$ sel !a*teri

$ram (ositi# !anya*men$andun$

(e(tido$li*an

90 yan$mem!uat

stru*turnya *a* dan

asam tei*oat yan$

men$andun$

al*ohol ?$liserolatau ri!itol@ dan

#os#at


20/40

/RAM 3E/ATI2

7indin$ sel !a*teri $ramne$ati# terdiri atas mem!ran

luar ?i(o(olisa*arida@ danla(isan (e(tido$li*an ?10@yan$ teri*at (adali(o(rotein…

Terda(at celah (eri(lasmaantara mem!ran luar dan

dalam yan$ !erisi enimende radasi dan rotein


21/40

Struktur Internal…

.IT'&A.,A .u!stansi *oloid yan$ menem(ati ruan$ sel!a$ian dalam) .ito(lasma terdiri atas !er!a$aienim air ?80@ (rotein *ar!ohidrat asamnu*leat dan li(id)

7AERAH I2TI 7aerah nu*leoid yan$ men$andun$ materi

$eneti*

RIB'.', Ber(eran (ada (roses sintesis (rotein)


22/40

BA7A2 I24/.I 'r$anel (enyim(an nutrisi *ar!on sul#ur dan

(oli#os#at)

E27'.&'RA 7i*enal se!a$ai restin$ cell… yaitu sel yan$

terde#erensiasi dari sel inan$ sehin$$a (ada suatu

*eadaan tertentu ?(anas e*strem senyawa *imiaradiasi@)

Endos(ora ter!entu* di dalam sel dan mam(umem!entu* sel "e$etati# a*ti#)

7ua !a*teri yan$ da(atmem!entu* endos(ora

Bacillus dan Clostridium)


23/40

,E,BRA2 &A.,A .tru*tur ti(is yan$ terleta* di se!elah dalam dindin$

sel dan !er!atasan lan$sun$ den$an sito(lasma) .ecara umum mem!ran (lasma disusun oleh

(hos(holi(id !ilayer yan$ mem(unyai !a$ianhidro#o!i* dan hidroli*)


24/40

&rotein inte$ral (ada mem!ran (lasma !er#un$sise!a$ai D3ate 4ee(er untu* su!stansi yan$ a*an*eluar dan masu* sel)


25/40

RE&R'7/4.I Binary ission 4on+u$asi


26/40

ARCHAEAArchaea di!eda*an

dari !a*teri *arena(er!edaan #enoti()

Archaea se!a$ian

!esar hidu( dalamlin$*un$an yan$

san$at e*strem)


27/40

,or#olo$i archaea menyeru(ai mor#olo$i!a*teri) 2amun !e!era(a $enus memili*i!entu* yan$ tida* !iasa)

/mumnya or$anisme adalah monomor*

?memili*i satu !entu*@ namun archaea da(at!eru(a (leomor* ?memili*i !anya* !entu*@Pyrodictiumabyssi


28/40

Continue…

,a+or diferences #rom !oth domain = Cell Falls

,em!ran (lasma

,eta!olite


29/40

DINDING SEL Archaea tida* !enar5!enar

mem(unyai dindin$ sel sehin$$atida* ada (e(tido$li*an)

Archaea hanya memili*i satulayer dindin$ sel yan$

menyeru(ai !a*teri $ram (ositi#) Be!era(a archaea s(erti (ada

methano!acterium memili*idindin$ sel yan$ terdiri dari(seudo(e(tido$li*an ?25

acetyltalosaminurinic acid@ yan$mem(unyai i*atan i*atan β-1-3-glukosida.


30/40

&ada methanosarcina dindin$ sel terdiri atasmetano*ondroitin ?$ala*tosamin asam$lu*oronat n5asetil $ala*tosamin dan$lu*osa@)

3enus methano(yrus dan methanothermusmemili*i .5ayer yan$ terdiri dari $li*o(rotein

*arena tida* memili*i (e(tido$li*an

archaea relati# tahan terhada( a*titas

lysoyme)


31/40

MEMBRAN PLASMA

Terda(at > (er!edaan mem!ran (lasma!a*teri dan archaea = Chirality

I*atan (en$hu!un$

Rantai iso(rena i(id layer


32/40

4iralitas

I$atan

penghu5ung

Rantai samping

6ipid layer


33/40

Rantai samping


34/40

7omain archaea secara umum da(at di!$aimen+adi G $olon$an yaitu halo!acteriatermoasidoli* dan metano$eni*)

HA'BACTERIA

,eru(a*an archea yan$ mam(u !ertahan hidu((ada lin$*un$an den$an *adar $aram yan$san$at tin$$i misalnya di $reat salt la*e atau lautmati… $enus yan$ termasu* adalahhalobacterium, haloferax dan halococcus.


35/40

TER,'A.I7'II4 ,eru(a*an archea yan$ hidu( (ada tin$*at (anas

dan *easaman yan$ e*strem)

Thermo(lasma acido(hilus T ;9 C dan (H 15

Thermo(roteales T 8;510; C

.ul#olo!us s() (H dan T


36/40

,ETA2'3E2I4 aitu $olon$an archea yan$ mam(u men$hasil*an

metan se!a$ai meta!olit sam(in$an)

3olon$an metano$eni* mutla* anaero!)

3enus yan$ termasu* $olon$an ini adalahmethanobacterium)

'r$anisme ini !iasanya diman#aat*an (en$olahanair selo*an dan lim!ah)


37/40

BACTERIA AND ARCHAEA

7alam !idan$ *esehatan !a*teri le!ih!er(eran di!andin$*an den$an archea)

Ba*teri da(at !er(eran se!a$ai a$en in#e*siatau(un !er(eran dalam (rodu*si ma*anan

dan (rodu* *e#armasian) .e+auh ini tida* ada dila(or*an in#e*si yan$

dise!a!*an oleh archea)


38/40

Bacaan…

,i*ro!iolo$i #armasi !a!

Broc* Biolo$y o# microor$ansism cha(ter G

Hu$o and Russells (harmaceuticalmicro!iolo$y (art and G)


39/40

TERIMAKASIH…


40/40

Lecture 2 - Bacteria and Archaea

Documents

Transcript of Lecture 2 - Bacteria and Archaea