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Curso de formação:
Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF
Rui Figueira
Nó Português do GBIF, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa
Introdução
Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFPorto, Junho de 2019
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em:
Cés
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
SUMÁRIO
Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFPorto, Junho de 2019
GBIF EM NÚMEROS Dados de
ocorrência de espécies
Instituiçõespublicadoras
https://www.gbif.org/the-gbif-network
1 304 825 2427 869 6757 095 889
Global:
Para PT:
Por PT:
1 40820
Global:
De PT:
59 países / 38 participantes associados
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GBIF A NÍVEL NACIONAL
NÓNACIONAL
UNIVERSI-DADES
UNIDADES DE I&D MUSEUS
CIÊNCIACIDADÃ
SECTORPRIVADO
INVESTI-GADORES
PUBLICAÇÃO / USO / FORMAÇÃOINST.
PÚBLICOS
USO / FORMAÇÃO
RIPORBIOTA
INFRAESTRUTURA PADRÕESFORMAÇÃO
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DADOS PUBLICADOS PELO GBIF
Baseados em Observações● Projectos científicos● Monitorização / amostragens /
inventários● Ciência Cidadã
Baseados em Espécimes● Coleções biológicas (incluindo HN)● Bancos de germoplasma / coleções
vivas
OCORRÊNCIAS E DADOS DE AMOSTRAGENS
CHECKLISTS
METADADOS
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PORTAIS de DADOSNACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org
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PUBLICAÇÃO PORINSTITUIÇÕES PORTUGUESAS
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VANTAGENS DA PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF
● Plataforma global: dados padronizados → indexação → pesquisa
● Fácil citação do uso através de DOI
● Mais citações → Maior impacto
● Preservação dos dados
● Rastreamento e informação sobre o uso dos dados
● Dados mantém a propriedade original
● Licença padrão: CC0, CC-BY, CC-BY-NC
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USO DOS DADOS
Palavras-chave de ~1900 artigos que citam o GBIFhttp://www.mendeley.com/groups/1068301/gbif-public-library/
6400 artigos científicos (link)
151 para autores com afiliação portuguesa
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170
20
40
60
80
100
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Portugal
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170
50010001500200025003000350040004500
Global
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http://www.biodiversityinformatics.org
ENQUADRAMENTO GLOBAL
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http://www.biodiversityinformatics.org
ENQUADRAMENTO GLOBAL
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http://www.biodiversityinformatics.org
ENQUADRAMENTO GLOBAL
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O PANORAMA GLOBAL
GBIF coopera com outras organizações ou iniciativas internacionais, que desenvolvem actividade complementar:
- Catalogue of Life, Encyclopedia of Life, Biodiversity Heritage Library, BOLD, Plazi
- LifeWatch, DISSCO, CETAF;
- EEA
- CBD, IPBES, UNEP-WCMC
- comunidade: TDWG
- desenvolvimento de um curriculum académico em informática para a biodiversidade
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
SUMÁRIO
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
https://www.mentimeter.com/s/1d4715d90494592c51ff62bd286f81ce/377d8d914219
www.menti.com
27 89 34
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Aumentar o impacto
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
A disponibilidade dos dados da investigação científica decresce rapidamente com a idade
Vines, Timothy H et al.. 2014. “The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age.” Current Biology 24 (1): 94–97. doi:10.1016/j.cub.2013.11.014.
Assegurar a preservação e acessibilidade dos dados
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Aumentar a visibilidade da colecção / bd
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?Potenciar investigação inovadora
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Requisito do financiador
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Compromisso assumido por Portugal, através da Declaração do Rio de Janeiro (2003),durante a cimeira de MCT da CPLP, de partilha e disponibilização, por via digital, do patrimóniocientífico nacional com origem nos países da CPLP.
Responder à missão da instituição/ Responsabilidade social
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Ciência cidadã / participação social
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PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS
Aumentar do impacto científico
Aumentar a exposição a nível global, valorizando
Facilitar a revisão das colecções por especialistas
Assegurar a preservação dos dados
Responder a compromissos internacionais
Responder ao interesse de comunidades específicas
Cumprir requisitos do financiador
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PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS
Executar a decisão política - adopção de acesso aberto
● Maximizar o reconhecimento pelo uso dos dados
● Potenciar nova investigação
● Promover a boa gestão de recursos naturais
Melhorar a qualidade dos estudos de impacte ambiental
Promover a capacitação
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BARREIRAS À PUBLICAÇÃO DE DADOS
Psicológicas e culturais
– falta de conhecimento
– falta de vontade
– qualidade dos dados
Institucionais
– privacidade
– autorização
Capacidade e recursos
– tempo / planificação
– capacidade
Práticas
– fundos / RH
– infraestrutura
Sharon Grant. Foundations for the BID Workshop – Biodiversity Data Mobilization. Kigali 2016
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
SUMÁRIO
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CIÊNCIA ABERTA / DADOS ABERTOS
FAIR
Findable, Accessible, Interoperable, Reusable.
http://www.ciencia-aberta.pt/
FACILITATE OPEN SCIENCE TRAINING FOR EUROPEAN RESEARCH
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
PARTE 1.4
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TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF
DA
RP
A -
De
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se A
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Res
earc
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roje
cts
Age
ncy
(DA
RP
A)
● Metadados de recursos de dados
● Lista de espécies (Checklists)
● Dados de ocorrênciaCORE: OCORRÊNCIA
● Dados baseados em eventos de amostragens ou inventários
CORE: EVENTO
Os dados podem ser apenas publicados por INSTITUIÇÕES ou ORGANIZAÇÕES.
Os cidadãos podem publicar através de projectos de ciência cidadã
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TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF
DA
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Res
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Age
ncy
(DA
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Fontes de dados:
- colecções zoológicas, de herbário, microbianas, de tecidos, de ADN, bancos de germoplasma, colecções vivas;
- dados de satélite, armadilhas, câmaras fotográficas ou vídeo automáticas;
- teses, relatórios, literatura;
- bases de dados de observações, programas de monitorização, estudos de impacte ambiental;
- projectos de ciência cidadã;
- listas de espécies, checklists, listas vermelhas.
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TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF
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https://www.gbif.org/sampling-event-data
Dados baseados em eventos de amostragem ou inventários - estrutura
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FLUXO DE PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF
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(DA
RP
A)
1. Estabelecer acordos/autorizações institucionais
2. Fazer o registo e solicitar o aval pelo Nó:https://www.gbif.org/become-a-publisher
- Tomar conhecimento do Acordo de Publicação de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-publisher - Tomar conhecimento do Acordo de Uso de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-user
3. Seleccionar as ferramentas de publicação e estabelecer a infraestrutura
Pode usar-se o serviço IPT.GBIF.PT para alojamento dos dados
4. Preparar os dados para publicaçãoFormatar segundo o padrão de dados, fazer verificação de qualidade
5. Seleccionar uma licença (CC0, CC-BY, CC-BY-NC) (pode ser definida para cada dataset)
PASSOS INSTITUCIONAIS (1ª vez)
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PREPARAÇÃO DE UM CONJUNTO DE DADOS
Dados Padronização(DwC)
Descrição(metadados)
Validação
Publicação de dados
Publicação de metadados
(Artigos de dados)
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ACESSO AOS DADOS PUBLICADOS
NACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org
FONTE: e.g. http://ipt.gbif.pt(gerido autonomamente pelo publicador)
Obrigado pela atençãoNó Português do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbárioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa, Portugal
Tel: (+351) 213653165email: [email protected]://www.gbif.pt
O Nó Português é acolhido no ISA com o apoio da FCT.
Esta apresentação é publicada segundo a licença CC-BY-SA
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