introducció a la bioinformàtica
description
Transcript of introducció a la bioinformàtica
![Page 1: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/1.jpg)
introducció a la bioinformàtica
roderic guigó i serraIMIM/UPF/CRG
![Page 2: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/2.jpg)
tecnologies de la genòmica
• DNA sequencing
• DNA microarrays
• mass spectroscopy and 2-D gels
• yeast two hibrids
• X-ray cristallography and NMR
![Page 3: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/3.jpg)
tecnologies de la genòmica
L’aplicació de les tecnologies de la genòmica permet per primer cop una aproximació global al funcionament de la cél.lula viva.
La biologia de ser una ciència “analítica”: la realitat és
diseccionada en els seus components més elementals per tal de ser entesa
ha passat a ser una ciència “sintètica”: en la qual el repte
és integrar informació globlal sobre el funcionament dels éssers vius
![Page 4: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/4.jpg)
bioinformàtica
• La biologia, una disciplina en la que l’esforç ha estat tradicionalment dedicat a l’obtenció de les dades, ha esdevingut en poc temps una disciplina en la que les dades s’obtenen de manera gairebé automàtica, i l’esforç s’ha desplaçat cap a l’anàlisi de les dades.
![Page 5: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/5.jpg)
DNA microarrays
![Page 6: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/6.jpg)
bioinformàtica
• la bioinformática és una nova disciplina científica, en la intersecció entre la biologia i la computació, l’objectiu de la qual és l’aplicació i el desenvolupament de mètodes per l’obtenció, l’emmagatzamatge, l’anàlisi i la integració de les dades que genera la investigació en biologia.
![Page 7: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/7.jpg)
bioinformàtica
![Page 8: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/8.jpg)
decodificació del genomaACTCAGCCCCAGCGGAGGTGAAGGACGTCCTTCCCCAGGAGCCGGTGAGAAGCGCAGTCGGGGGCACGGGGATGAGCTCAGGGGCCTCTAGAAAGATGTAGCTGGGACCTCGGGAAGCCCTGGCCTCCAGGTAGTCTCAGGAGAGCTACTCAGGGTCGGGCTTGGGGAGAGGAGGAGCGGGGGTGAGGCCAGCAGCAGGGGACTGGACCTGGGAAGGGCTGGGCAGCAGAGACGACCCGACCCGCTAGAAGGTGGGGTGGGGAGAGCATGTGGACTAGGAGCTAAGCCACAGCAGGACCCCCACGAGTTGTCACTGTCATTTATCGAGCACCTACTGGGTGTCCCCAGTGTCCTCAGATCTCCATAACTGGGAAGCCAGGGGCAGCGACACGGTAGCTAGCCGTCGATTGGAGAACTTTAAAATGAGGACTGAATTAGCTCATAAATGGAAAACGGCGCTTAAATGTGAGGTTAGAGCTTAGAATGTGAAGGGAGAATGAGGAATGCGAGACTGGGACTGAGATGGAACCGGCGGTGGGGAGGGGGAGGGGGTGTGGAATTTGAACCCCGGGAGAGAAAGATGGAATTTTGGCTATGGAGGCCGACCTGGGGATGGGGAAATAAGAGAAGACCAGGAGGGAGTTAAATAGGGAATGGGTTGGGGGCGGCTTGGTAACTGTTTGTGCTGGGATTAGGCTGTTGCAGATAATGGAGCAAGGCTTGGAAGGCTAACCTGGGGTGGGGCCGGGTTGGGGTCGGGCTGGGGGCGGGAGGAGTCCTCACTGGCGGTTGATTGACAGTTTCTCCTTCCCCAGACTGGCCAATCACAGGCAGGAAGATGAAGGTTCTGTGGGCTGCGTTGCTGGTCACATTCCTGGCAGGTATGGGGCGGGGCTTGCTCGGTTTTCCCCGCTTCTCCCCCTCTCATCCTCACCTCAACCTCCTGGCCCCATTCAAGCACACCCTGGGCCCCCTCTTCTTCTGCTGGTCTGTCCCCTGAGGGGAAAGCCCAGGTCTGAGGCTTCTATGCTGCTTTCTGGCTCAGAACAGCGATTTGACGCTCTGTGAGCCTCGGTTCCTCCCCCGCTTTTTTTTTTTCAGCCAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCTATTCTCCCGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTGAGTAGGGAAGGGGTTTCACTGTATTATCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCTCCGCGCCCGGCCTCCCCATCCTTAATATAGGAGTTAGAAGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTGAGATGAAGTCCCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCCCAGGCTGGAGTTCAGTGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACTACAGGAACATGCCACCACACCCGACTAACTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCTTCAACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGGGCCACCGCGCCCGGCTGGGAGTTAAGAGGTTTCTAATGCATTGCATTAGAATACCAGACACGGGACAGCTGTGATCTTTATTCTCCATCACCCCACACAGCCCTGCCTGGGGCACACAAGGACACTCAATACACGCTTTTCGGGCGCGGTGGCTCAAGCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGTACATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAACTAGCCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGCGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACACGCTTTTCCGCTAGGCACGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAACACCAGACTCAGCAACATAGTGAGACTCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCCTGGTGCCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGAAGGCTAAGGCAGGAGGATCGCTTAAGCCCAGAAGGTCAAGGTTGCAGTGAACCACGTTCAGGCCACTGCAGTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTGTAAATAAATAACGCTTTTCAAGTGATTAAACAGACTCCCCCCTCACCCTGCCCACCATGGCTCCAAAGCAGCATTTGTGGAGCACCTTCTGTGTGCCCCTAGGTACTAGCTGCCTGGACGGGGTCAGAAGGAACCTGAACCACCTTCAACTTGTTCCACACAGGATGCCAGGCCAAGGTGGAGCAACCGGTGGAGCCAGAGACAGAACCCGACGTTCGCCAGCAGGCTGAGTGGCAGAGCGGCCAGCCCTGGGAGCTGGCACTGGGTCGCTTTTGGGATTACCTGCGCTGGGTGCAGACACTGTCTGAGCAGGTGCAGGAGGAGCTGCTCAGCCCCCAGGTCACCCAGGAACTGACGTGAGTGTCCCCATCCCGGCCCTTGACCCTCCTGGTGGGCGGCTATACCTCCCCAGGTCCAGGTTTCATTCTGCCCCTGCCACTAAGTCTTGGGGGCCTGGGTCTCTGCTGGTTCTAGCTTCCTCTTCCCATTTCTGACTCCTGGCTTTAGCTCTCTGGAATTCTCTCTCTCAGTTCTGTTTCTCCCTCTTCCCTTCTGACTCAGCCTGTCACACTCGTCCTGGCGCTGTCTCTGTCCTTCACTAGCTCTTTTATATAGAGACAGAGAGATGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATAGAGACATGAGCCACCTTGCTCGGCCTCCTAGCTCTTTCTTCGTCTCTGCCTCTGCTCTCTGCGTCTGTCTTTGTCTCCTCTCTGCCTCTGTCCCGTTCCTTCTCTCTTGGTTCACTGCCCTTCTGTCTCTCCCTGTTCTCCTTAGGAGACTCTCCTCTCTTCCTTCTCGAGTCTCTCTGGCTGATCCCCATCTCACCCACACCTATCC
la seqüència del genoma humà
![Page 9: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/9.jpg)
QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAEKMKILELPFASGDLSMLVLLPDEVSDLERIEKTINFEKLTEWTNPNTMEKRRVKVYLPQMKIEEKYNLTSVLMALGMTDLFIPSANLTGISSAESLKISQAVHGAFMELSEDGIEMAGSTGVIEDIKHSPESEQFRADHPFLFLIKHNPTNTIVYFGRYWSP
la seqüència i l’estructura de les proteïnes
![Page 11: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/11.jpg)
gene function
![Page 12: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/12.jpg)
ACTCAGCCCCAGCGGAGGTGAAGGACGTCCTTCCCCAGGAGCCGGTGAGAAGCGCAGTCGGGGGCACGGGGATGAGCTCAGGGGCCTCTAGAAAGATGTAGCTGGGACCTCGGGAAGCCCTGGCCTCCAGGTAGTCTCAGGAGAGCTACTCAGGGTCGGGCTTGGGGAGAGGAGGAGCGGGGGTGAGGCCAGCAGCAGGGGACTGGACCTGGGAAGGGCTGGGCAGCAGAGACGACCCGACCCGCTAGAAGGTGGGGTGGGGAGAGCATGTGGACTAGGAGCTAAGCCACAGCAGGACCCCCACGAGTTGTCACTGTCATTTATCGAGCACCTACTGGGTGTCCCCAGTGTCCTCAGATCTCCATAACTGGGAAGCCAGGGGCAGCGACACGGTAGCTAGCCGTCGATTGGAGAACTTTAAAATGAGGACTGAATTAGCTCATAAATGGAAAACGGCGCTTAAATGTGAGGTTAGAGCTTAGAATGTGAAGGGAGAATGAGGAATGCGAGACTGGGACTGAGATGGAACCGGCGGTGGGGAGGGGGAGGGGGTGTGGAATTTGAACCCCGGGAGAGAAAGATGGAATTTTGGCTATGGAGGCCGACCTGGGGATGGGGAAATAAGAGAAGACCAGGAGGGAGTTAAATAGGGAATGGGTTGGGGGCGGCTTGGTAACTGTTTGTGCTGGGATTAGGCTGTTGCAGATAATGGAGCAAGGCTTGGAAGGCTAACCTGGGGTGGGGCCGGGTTGGGGTCGGGCTGGGGGCGGGAGGAGTCCTCACTGGCGGTTGATTGACAGTTTCTCCTTCCCCAGACTGGCCAATCACAGGCAGGAAGATGAAGGTTCTGTGGGCTGCGTTGCTGGTCACATTCCTGGCAGGTATGGGGCGGGGCTTGCTCGGTTTTCCCCGCTTCTCCCCCTCTCATCCTCACCTCAACCTCCTGGCCCCATTCAAGCACACCCTGGGCCCCCTCTTCTTCTGCTGGTCTGTCCCCTGAGGGGAAAGCCCAGGTCTGAGGCTTCTATGCTGCTTTCTGGCTCAGAACAGCGATTTGACGCTCTGTGAGCCTCGGTTCCTCCCCCGCTTTTTTTTTTTCAGCCAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCTATTCTCCCGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTGAGTAGGGAAGGGGTTTCACTGTATTATCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCTCCGCGCCCGGCCTCCCCATCCTTAATATAGGAGTTAGAAGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTGAGATGAAGTCCCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCCCAGGCTGGAGTTCAGTGGCTGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACTACAGGAACATGCCACCACACCCGACTAACTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCTTCAACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGGGCCACCGCGCCCGGCTGGGAGTTAAGAGGTTTCTAATGCATTGCATTAGAATACCAGACACGGGACAGCTGTGATCTTTATTCTCCATCACCCCACACAGCCCTGCCTGGGGCACACAAGGACACTCAATACACGCTTTTCGGGCGCGGTGGCTCAAGCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGTACATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAACTAGCCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGCGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACACGCTTTTCCGCTAGGCACGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAACACCAGACTCAGCAACATAGTGAGACTCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCCTGGTGCCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGAAGGCTAAGGCAGGAGGATCGCTTAAGCCCAGAAGGTCAAGGTTGCAGTGAACCACGTTCAGGCCACTGCAGTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTGTAAATAAATAACGCTTTTCAAGTGATTAAACAGACTCCCCCCTCACCCTGCCCACCATGGCTCCAAAGCAGCATTTGTGGAGCACCTTCTGTGTGCCCCTAGGTACTAGCTGCCTGGACGGGGTCAGAAGGAACCTGAACCACCTTCAACTTGTTCCACACAGGATGCCAGGCCAAGGTGGAGCAACCGGTGGAGCCAGAGACAGAACCCGACGTTCGCCAGCAGGCTGAGTGGCAGAGCGGCCAGCCCTGGGAGCTGGCACTGGGTCGCTTTTGGGATTACCTGCGCTGGGTGCAGACACTGTCTGAGCAGGTGCAGGAGGAGCTGCTCAGCCCCCAGGTCACCCAGGAACTGACGTGAGTGTCCCCATCCCGGCCCTTGACCCTCCTGGTGGGCGGCTATACCTCCCCAGGTCCAGGTTTCATTCTGCCCCTGCCACTAAGTCTTGGGGGCCTGGGTCTCTGCTGGTTCTAGCTTCCTCTTCCCATTTCTGACTCCTGGCTTTAGCTCTCTGGAATTCTCTCTCTCAGTTCTGTTTCTCCCTCTTCCCTTCTGACTCAGCCTGTCACACTCGTCCTGGCGCTGTCTCTGTCCTTCACTAGCTCTTTTATATAGAGACAGAGAGATGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATAGAGACATGAGCCACCTTGCTCGGCCTCCTAGCTCTTTCTTCGTCTCTGCCTCTGCTCTCTGCGTCTGTCTTTGTCTCCTCTCTGCCTCTGTCCCGTTCCTTCTCTCTTGGTTCACTGCCCTTCTGTCTCTCCCTGTTCTCCTTAGGAGACTCTCCTCTCTTCCTTCTCGAGTCTCTCTGGCTGATCCCCATCTCACCCACACCTATCC
gene function
![Page 13: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/13.jpg)
LA SEQÜÈNCIA DEL GENOMA HUMÀ
![Page 14: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/14.jpg)
computing at Celera Genomics
![Page 15: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/15.jpg)
•200 teraflops•1000 vegades més potent que deep blue•Més potent que els 500 ordinadors més potents avui en dia
![Page 16: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/16.jpg)
llei de Moore
![Page 17: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/17.jpg)
growth of genomic data(http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/growth/)
![Page 18: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/18.jpg)
de que tracta la bioinformàtica?
![Page 19: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/19.jpg)
predicció de gens
![Page 20: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/20.jpg)
predicció de gens
![Page 21: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/21.jpg)
alineament de seqüències
Margaret Dayhoff i colaboradors van començar a compilar lesseqüències d’aminoàcids conegudes: els Atlas of Protein Sequence and structure. En la quarta edició a finals dels 60, l’Atlas contenia al voltant de 300 seqüències de proteïnes.
![Page 22: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/22.jpg)
alineament de seqüències
![Page 23: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/23.jpg)
alineament de seqüències
Les seqüències d’aminoàcids i de nucleòtids són portadores de gran quantiat de informació sobre la funció i la història d’aquestes molècules: seqüències similars indiquen una funció o una història similar.
El problema de determinar el grau de similitud entre dues seqüències és clau en Biologia Molecular.
Query: 25 IPREVIERLARSQIHSIRDLQRLLEIDSVGSEDSLDTSLRAHGVHATKHVPEKRPLPIRR 84 IP E+ + L+ I S DLQRLL+ DS G ED + L H+ + R Sbjct: 10 IPEELYKMLSGHSIRSFDDLQRLLQGDS-GKEDGAELDLNMTRSHSGGELESLA----RG 64
Query: 85 KRSI------EEAVPAVCKTRTVIYEIPRSQVDPTSANFLIWPPCVEVKRCTGCCNTSSV 138 KRS+ E A+ A CKTRT ++EI R +D T+ANFL+WPPCVEV+RC+GCCN +VSbjct: 65 KRSLGSLSVAEPAMIAECKTRTEVFEISRRLIDRTNANFLVWPPCVEVQRCSGCCNNRNV 124
Query: 139 KCQPSRVHHRSVKVAKVEYVRKKPKLKEVQVRLEEHLECAC 179 +C+P++V R V+V K+E VRKKP K+ V LE+HL C CSbjct: 125 QCRPTQVQLRPVQVRKIEIVRKKPIFKKATVTLEDHLACKC 165
![Page 24: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/24.jpg)
cerques de similaritat en bases de dades
FASTA
1982: Wilbur and Lipman,
1985: Lipman and Pearson
BLAST
1990: Altschul, Gish, Miller, Myers and Lipman
![Page 25: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/25.jpg)
growth factors and oncogens.
>sp|P01128|TSIS_SMSAV TRANSFORMING PROTEIN P28-SIS Length = 226
Score = 140 bits (350), Expect = 2e-33 Identities = 75/161 (46%), Positives = 100/161 (61%), Gaps = 11/161 (6%)
Query: 25 IPREVIERLARSQIHSIRDLQRLLEIDSVGSEDSLDTSLRAHGVHATKHVPEKRPLPIRR 84 IP E+ + L+ I S DLQRLL+ DS G ED + L H+ + R Sbjct: 10 IPEELYKMLSGHSIRSFDDLQRLLQGDS-GKEDGAELDLNMTRSHSGGELESLA----RG 64
Query: 85 KRSI------EEAVPAVCKTRTVIYEIPRSQVDPTSANFLIWPPCVEVKRCTGCCNTSSV 138 KRS+ E A+ A CKTRT ++EI R +D T+ANFL+WPPCVEV+RC+GCCN +VSbjct: 65 KRSLGSLSVAEPAMIAECKTRTEVFEISRRLIDRTNANFLVWPPCVEVQRCSGCCNNRNV 124
Query: 139 KCQPSRVHHRSVKVAKVEYVRKKPKLKEVQVRLEEHLECAC 179 +C+P++V R V+V K+E VRKKP K+ V LE+HL C CSbjct: 125 QCRPTQVQLRPVQVRKIEIVRKKPIFKKATVTLEDHLACKC 165
Doolittle: Search of the Platelet Derived Growth Factor sequence
![Page 26: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/26.jpg)
predicció de l’estructura de les proteïnes
![Page 27: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/27.jpg)
modelització molecular
![Page 28: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/28.jpg)
disseny de fàrmacs
![Page 29: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/29.jpg)
reconstrucció filogenètica
Construcció de filogènies a partir de les seqüències compilades per Dayhoff
![Page 30: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/30.jpg)
genomics as information science
![Page 31: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/31.jpg)
anàlisi comparativa de genomes:Helicobacter pylori
![Page 32: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/32.jpg)
gens humans implicats en malaties, en llevat
![Page 33: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/33.jpg)
informàtica de microarrays
![Page 34: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/34.jpg)
interaccions entre proteïnes
![Page 35: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/35.jpg)
gene function
![Page 36: introducció a la bioinformàtica](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081520/56814d7d550346895dbad938/html5/thumbnails/36.jpg)
decodificació del genoma computational biology,biological computations
LM Adelman, “Molecular computations of soluctions to combinatorial problems”,Science 1994.