INTRODUCAO A DEP GENÔMICA

Prof. Raysildo B. Lôbo

ANCP - USP

= G + E

FENÓTIPO Mérito Genético

Nutrição

Manejo

Sanidade

Mudanças transmitidas

de pai/mãe para filho

Mudanças

Temporárias

Contribuição do reprodutor

• ½ do Mérito Genético

Mérito Genético do Animal ½ Mérito Genético

DEP

Diferença Esperada na Progênie (DEP)

Prediz a habilidade de transmissão genética de um animal avaliado como PROGENITOR.

DEP- Efeitos

DEP para efeito direto: previsão da habilidade

de transmitir genes de crescimento ou

fertilidade à progênie.

DEP para efeito materno: diferença esperada

em peso da progênie das filhas do reprodutor,

ou seja, netos.

Base Genética

A base genética (zero) é determinada pelos valores das DEPs dos “animais fundadores”.

Animais fundadores são aqueles sem pedigree de um ou de ambos os pais.

A base genética é específica para cada avaliação.

Acurácia

Mede a confiança no valor da DEP

Depende do número de informações disponíveis do animal

DEP – Informações Utilizadas

DEP Pedigree DEP Interina DEP Progênie

Informações Pais/Parentes

Pais/Parentes

Performance

própria

Pais/Parentes

Performance própria

e das progênies

Uso Animais jovens

TE/FIV

Animais jovens

Animais sem

progênies

Animais com

progênies

Acurácia Muito baixa Baixa Média a Alta

Acurácia

A seleção deve ser baseada no valor da DEP, a acurácia será usada como guia da intensidade de uso dos reprodutores.

+ 10

Touro A DEP = + 10 kg Touro C

Acc. = 0,90 Acc. = 0,30

A C

O que são Marcadores Genéticos?

O que são Marcadores?

Marcador Genético

Aquele que segrega segundo as Leis de Mendel.

Referências

Discrimina

Classifica

SNP Polimorfismos de nucleotídeo único que pode variar de

animal para animal

IDEAL

Alteração no SNP

Alteração Fenotípica

Animal 1 C/G: menor IPP Animal 2 T/A: maior IPP

RARAMENTE UM ÚNCO SNP É RESPONSÁVEL POR VARIAÇÃO EM CARACTERÍSTICAS DE INTERESSE ECONÔMICO

Modelo Animal

1980

Seleção Assistida

Marcadores

1995

Seleção Auxiliada Genômica

2009

Seleção Genômica

2009

Seleção Auxiliada pela

Genômica

2011

Nelore

Evolução das Avaliações Genéticas

AG: tradicional x Auxiliada pelo Genômica

Resultados Preliminares

Avaliação Auxiliada pela Genômica

DEP

PROGÊNIES e COLATERAIS

+ FENÓTIPO

+ PEDIGREE

Irmãos

Filhos Gim de Garça

Dumu

Karvardi Imp.

Mara Imp.

Dahi

Survana Imp.

Cartomante

Netos

AG TRADICIONAL

AG Auxiliada pela Genômica

Irmãos

Filhos Gim de Garça

Dumu

Karvardi Imp.

Mara Imp.

Dahi

Survana Imp.

Cartomante

Netos

PEDIGREE

+ FENÓTIPO

+ PROGÊNIES E COLATERAIS

DEP/AG

+

VALOR MOLECULAR PREDITO

O que é DEP Auxiliada pela Genômica?

É a DEP calculada com informações de pedigree,

desempenho próprio e de progênies, acrescida dos Valores

Moleculares (MVPs). A interpretação é similar a da DEP

TRADICIONAL com as vantagens de aumentar a acurácia dos

animais jovens, diminuir o intervalo de gerações e os custos do

teste de progênie.

Efeito dos Marcadores Moleculares na Acurácia

Número aproximado de equivalente progênie

Característica h² r

Média

Acurácia

Pedigree

Média

Acurácia

Molecular

Mudança

Média

Número

aproximado

equivalente

progênie

IPP 0,11 0,40 0,13 0,25 0,12 10

PP30 0,24 0,32 0,10 0,19 0,09 3

PAC 0,20 0,27 0,12 0,20 0,08 4

STAY 0,12 0,38 0,13 0,21 0,08 6

MP120 0,11 0,23 0,12 0,19 0,07 6

P120 0,23 0,24 0,13 0,30 0,17 8

P365 0,32 0,21 0,15 0,35 0,20 7

P450 0,34 0,16 0,15 0,35 0,20 6

PE365 0,40 0,28 0,11 0,26 0,15 4

PE450 0,43 0,28 0,12 0,27 0,15 3

AOL 0,35 0,31 0,12 0,29 0,17 5

ACAB 0,35 0,09 0,12 0,25 0,13 3

Conclusão

• Aumento da Acurácia de animais jovens e da Pressão de Seleção

• Redução do intervalo de gerações

• Redução do tempo de teste de touros da RP

• Maior ganho genético e lucro

Seleção Auxiliada pela Genômica