Human y chromosome
-
Upload
137156 -
Category
Technology
-
view
353 -
download
0
description
Transcript of Human y chromosome
X & Y chromosome
Alireza zenhari
58 million base pairs (the building blocks of DNA)
1% of the total DNA in a male cell contains 86 genes, which code for only 23
distinct proteins Acrocentric Smaller than X
Human Y chromosome
کروموزوم های وژن ها Yویژگی
کروموزوم های وژن ها Xویژگی
کروموزوم تشابه Yو Xوجه
کروموزوم تکاملی Yسیر
کروموزوم تحول گر بیان تکاملی های Yنظریه
:موضوعات
The human Y chromosome is unable to recombine with the X chromosome, except for small pieces of pseudoautosomal regions at the telomeres (which comprise about 5% of the chromosome's length).
The bulk of the Y chromosome which does not recombine is called the "NRY" or non-recombining region of the Y chromosome.
47,XXY Klinefelter syndrome 45,X Turner Syndrome (XO)male femaletall stature short staturetestes do not mature rudimentary ovariessterile sterilelowered IQ is common IQ typically normal1/700 male births 1/3000 female births
47,XYY Double-Y syndrome 47,XXX Trisomy-X syndromemaleabove average height, otherwise phenotypicallynormal. At one time, it was claimed that XYY males are proneto violent or antisocial behavior, based on elevatedincidence of 47,XYY among incarcerated men. Nowthought to be due to higher incidence of moderatemental retardation than for XY males.
many phenotypically normalthe frequency of lowered IQ is higher than amongXX females.
Sex chromosome aberrations
◦ These regions are called the pseudoautosomal regions., PAR1 and PAR2.
◦ a crossover in PAR1 is necessary in male meiosis to get proper segregation of the chromosomes.
◦ AZF1 (azoospermia factor 1)◦ BPY2 (basic protein on the Y chromosome)◦ DAZ1 (deleted in azoospermia)◦ DAZ2◦ PRKY (protein kinase, Y-linked)◦ RBMY1A1◦ SRY (sex-determining region)◦ TSPY (testis-specific protein)◦ USP9Y◦ UTY (ubiquitously transcribed TPR gene on Y
chromosome)◦ ZFY (zinc finger protein)
Genes
ژنSRY (Sex-determining Region on the Y) درکروموزوم اتوزومی شبه ناحیه از و Yخارج داشته قرار
. دارد مرد جنسیت تعیین در اساسی یک SRYنقشبه شونده متصل DNA qپروتئین احتماًال که میکند تولید
. تعیین ژنهای دیگر است برداری نسخه فاکتور یککروموزوم روی بر .Xجنسیت اند گرفته قرار اتوزومها و
سندرومswyer ژن در جهش SRYتوسط
SRY
SHOX و بازوها در ها استخوان تکامل و رشد در مهمی نقش
کند می ایفا پاها ساقpseudoautosomalUSP9Y پروتئاز کردن فعال کوئیتین یوبی در 9سازنده
AZFAناحیه اسپرم سلول توسعه
pseudoautosomal regions
large submetacentric 1100 gene One of 2 X is inactive Most gene are unrelated to sex XIST (X Inactive Specific Transcripts)
Human X chromosome
سازی غیرفعال باند Xمرکز . Xq13در این دارد قراربنام ژنی حاوی XIST (X Inactive Specificمرکز
Transcripts) است
قرار شده فعال غیر کروموزوم روی بر که ژنهایی تمام . از بیش بیان آنالیز نمیگردند فعال غیر ژن 250دارند
به حدود Xوابسته که میدهد از% 15تا 10نشان ژنها . میگریزند شدن فعال غیر
کروموزوم جزئی آنیوپلوئیدی در امر مهمی Xاین کاربردژنهای. ژنهای Xpدارد از شدن Xqبیش فعال غیر از
میگریزند
XIST
سال بنام ۱۹۴۹در سلول Barrدانشمندی در که دریافتکروماتینی کوچک جسم ماده، پستانداران سوماتیک هاینمی دیده مردان سوماتیکی های سلول در که دارد وجود
شود. بار جسم را کوچک جسم این که Barr Bodyوی نامید
آن به جنسی امروزه . کروماتین یکی واقع در گویند میهای کرومزوم سوماتیکی Xاز های سلول در زنان
های کرومزوم بقیه و ماند می باقی فعال Xبصورت. شوند می غیرفعال و متراکم
Barr Body
Barr Body
های کرومزوم از یکی شدن فعال غیر فرضیه در Xاما ماده جنسسال در خانم ۱۹۶۲پستانداران، شد، Mary Lyonبوسیله ارائه
: است زیر بصورت که:از الف یکی ماده پستانداران سوماتیکی های سلول در
های کرومزوم Xکرومزوم یک فقط و شده فعال غیر و Xمتراکم. دارد وجود فعال
:کرومزوم ب شدن جنینی Xغیرفعال رشد اولیه مراحل در . مرحله در یعنی گیرد می لقاح صورت از بعد روز سه یا ، موروًال
. شود می کامل جنینی اول هفته پایان تا و شروع شدن فعال غیر:کرومزوم ج شدن فعال کامال Xغیر مادری یا پدری منشاء با
یک که هنگامی اما است، یک Xتصادفی در انتخابی بصورتاز و سلول این از که هایی سلول تمام شد، فعال غیر سلول
و نموده تبعیت وضعیت همان از شوند، می حاصل میتوز طریق.Xهمان کنند می فعال غیر را
: کرومزوم است این شود می مطرح که سوالی می Xاما فعال غیر چگونهشود؟
از زیادی های کپی سلول SiRNA or Small interference RNAدراین که شود می کرومزوم RNAتولید شدن کروماتینه هترو عمل را Xها
. این دهند می کرومزوم SiRNAانجام روی فعال Xها غیر است قرار که. کنند می فعال غیر را آن نهایت در و نشسته شود،
کرومزوم شدن فعال غیر اثبات برای که آزمایشاتی از این Xیکی از شد: بود قرار
کرومزوم بنام Xروی دارد وجود کم Hژنی ضد فاکتور سنتز مسئول کهیا . Anti Hemophilia Factorخونی انعقاد باعث فاکتور این باشد می
. شود می خونریزی هنگام در خون کروکزوم شدن کروماتینه هترو که کنیم فرض این Xاگر نداشت، وجود
کرومزوم ) دو زنان چون باشد مردان از بیشتر زنان پالسمای در باید فاکتورX.) یکی مردان و دارند
کرومزوم دو از یکی زنان در که چرا بود، برعکس کامال مشاهده نتایج ولیX دو هر پالسمای در خونی کم ضد فاکتور مقدار و شود می فعال غیر
. بود برابر سالم جنس
• Female mammals have an XX genotype.– Expression of sex-linked genes is similar to autosomal genes in females.– X chromosome inactivation randomly “turns off” one X chromosome
– ensures that females, like males, have one functional copy of the X chromosome in each body cell
X
The Y chromosome was identified as a sex-determining chromosome by Nettie Stevens at Bryn Mawr College in 1905 during a study of the mealworm Tenebrio molitor
Hermann Henking the Y chromosome was the pair of the X
chromosome . Stevens named the chromosome "Y"
simply to follow on from Henking's "X" alphabetically
That was depond on it shape
Discovery
كروموزوم تكامل نظریه qحدود Yبراساس تا ۲۴۰احتماًالفاقد ۳۲۰ كه خزندگان از پستانداران اشتقاق از پس پیش، سال میلیون
كروموزوم از اند، جنسى .Xكروموزوم است آمده وجود به کروموزوم حاضر محتوی Yدرحال به 200تنها نسبت بر 1100ژن حاضر ژن
کروموزوم دانشمندان Xروی های بینی پیش ترین تازه براساس که استخواهند بین از زمان گذشت با نیز ژنها اندک تعداد این پنسیلوانیا ایالت دانشگاه
رفت. کروموزوم تکامل محققان کروموزوم Yاین با را کیسه Yانسان پستانداران
. کردند مقایسه پوسها پالتی و کانگوروها مثل اولیه دار های کروموزوم که دهد می نشان مقایسات جفت Yو Xاین یک از ابتدا در
. زمان از اند شده متفاوت تدریج به و شده ساخته جنسی غیر های کروموزومکروموزومهای تمایز، . Xاین اند داده ادامه خود توسعه به عادی ریتم یک در
کروموزومهای که مشخص Yدرحالی آن علل هنوز که منتظره غیر شتاب یک بااز بسیاری تدریج به زمان گذشت با دلیل همین به و اند کرده پیدا تکامل نیست
. اند داده دست از را خود ژنتیکی اطالعات
Origins and evolution
Sex Chromosome Evolution: Y as Rotting X
A pair ofautosomes
X
SRY
YX
SRY
YX
SRY
Y
Most mammals have only one pair of sex chromosomes in each cell. Males have one Y chromosome and one X chromosome, while females have two X chromosomes. In mammals, the Y chromosome contains a gene, SRY, which triggers embryonic development as a male
Exception of SRY mammals the platypus(similarity) with the avian
Z chromosome
Variations
The X and Y chromosomes are thought to have evolved from a pair of identical chromosomes termed autosomes
Until recently, the X and Y chromosomes were thought to have diverged around 300 million years ago
However, research published in 2010, and particularly research published in 2008 documenting the sequencing of the platypus genome,has suggested that the XY system would not have been present more than 166 million years ago
Origins and evolution
Over time, the Y chromosome changed in such a way as to inhibit the areas around the sex determining genes(SRY) from recombining at all with the X chromosome. As a result of this process, 95% of the human Y chromosome is unable to recombine
The tips of the Y chromosome that could recombine with the X chromosome are referred to as the pseudoautosomal region.
Recombination inhibition نوترکیبی مهار
By one estimate, the human Y chromosome has lost 1,393 of its1,438 original genes over the course of its existence, and linear extrapolation of this 1,393 gene loss over 300 million years gives a rate of genetic loss of 4.6 genes per million years. Continued loss of genes at the 4.6 genes per million year rate would result in a Y chromosome with no functional genes that is the Y chromosome would lose complete function within the next 10 million years. Comparative genomic analysis, however, reveals that many mammalian species
Shrinking theory کاهشی نظریه
The Y chromosome is passed exclusively through sperm, which undergo multiple cell divisions during gametogenesis. Each cellular division provides further opportunity to accumulate base pair mutations. Additionally, sperm are stored in the highly oxidative environment of the testis, which encourages further mutation. These two conditions combined put the Y chromosome at a greater risk of mutation than the rest of the genome
High mutation rate
Without the ability to recombine during meiosis, the Y chromosome is unable to expose individual alleles to natural selection. Deleterious alleles are allowed to "hitchhike" with beneficial neighbors, thus propagating maladapted alleles in to the next generation. Conversely, advantageous alleles may be selected against if they are surrounded by harmful alleles (background selection). Due to this inability to sort through its gene content, the Y chromosome is particularly prone to the accumulation of "junk" DNA. Massive accumulations of retrotransposable elements are scattered throughout the Y.[10] The random insertion of DNA segments often disrupts encoded gene sequences and renders them nonfunctional. However, the Y chromosome has no way of weeding out these "jumping genes". Without the ability to isolate alleles, selection cannot effectively act upon them.
A clear, quantitative indication of this inefficiency is the entropy rate of the Y chromosome. Whereas all other chromosomes in the human genome have entropy rates of 1.5–1.9 bits per nucleotide (compared to the theoretical maximum of exactly 2 for no redundancy), the Y chromosome's entropy rate is only 0.84.[18] This means the Y chromosome has a much lower information content relative to its overall length; it is more redundant.
Inefficient selection
Even if a well adapted Y chromosome manages to maintain genetic activity by avoiding mutation accumulation, there is no guarantee it will be passed down to the next generation. The population size of the Y chromosome is inherently limited to 1/4 that of autosomes: diploid organisms contain two copies of autosomal chromosomes while only half the population contains 1 Y chromosome. Thus, genetic drift is an exceptionally strong force acting upon the Y chromosome
Genetic drift
Thanks for your attention