Guía uso Pubmed

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Guía de uso avanzado Guía de uso avanzado Duración del tutorial: 30’ 22/11/2010

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Guía de uso avanzadoGuía de uso avanzado

Duración del tutorial: 30’22/11/2010

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¿Qué es?PUBMEDPUBMED permite el acceso gratuito a bases de dades bibliográficas de ciencias de la salud como MEDLINEMEDLINE, de la National Library of Medicine de los Estados Unidos.MEDLINEMEDLINE está formado por unos 17 17 millones de referenciasmillones de referencias de artículos de revistas publicadas desde 1948desde 1948 hasta la actualidad, el 92% en inglés.el 92% en inglés.My NCBIMy NCBI Permite personalizar el uso de PUBMED grabando perfiles de interés y agregar alertasalertas a nuestro correo-e para seguir temas actuales.

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Búsqueda simpleBúsqueda simple

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Autocompletado

Cuando escribimos en el cuadro de búsqueda el sistema nos sugiere múltiples propostas de autoescritura. autoescritura. Elegimos la que más se ajusta con el puntero.

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Búsqueda simple de un tema / 1

Introducimos el térrmino o la frase en el cuadro de búsqueda y presionamos SEARCHSEARCH

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Búsqueda simple de un tema / 2

PubMed traducirá de forma automáticatraducirá de forma automática nuestro planteamiento en los descriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y en otras etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry term mappings), los autores, los títulos de las revistas, etc.

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Búsqueda simple de un tema / 3

El botón URL nos permite generar un localizadorlocalizador de internet para poder guardarlo y reproducir una búsqueda idéntica en el futuro:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22[MeSH%20Terms]%20OR%20%22silicosis%22[All%20Fields]%29%20AND%20%28%22lung%20neoplasms%22[MeSH%20Terms]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22neoplasms%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20neoplasms%22[All%20Fields]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22cancer%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20cancer%22[All%20Fields]%29&cmd=DetailsSearch

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Búsqueda simple de un tema / 4

Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT), operadores lógicos (AND, OR, NOT), en mayúscules siempre, para orientar la búsqueda:percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)

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Búsqueda con límites / 1

PubMed prevé la búsqueda de artículos usando límiteslímites que son muy habituales.habituales.

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Búsqueda con límites / 2

La búsqueda de artículos puede limitarselimitarse a un género, una lengua, una franja de edat, un sector de publicaciones, una especie, etc.En esta búsqueda con límites buscamos el término gonarthrosis en las revistas Core Core (son 120 revistas del total, unas 5.500)

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Búsqueda avanzadaBúsqueda avanzada

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Campos de Pubmed

Campos característicos de PubMed

Los registros de Pubmed están Los registros de Pubmed están formados por unos formados por unos campos característicos que son directamente que son directamente interrogables.interrogables.

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Búsqueda avanzada

• Búsqueda por autores, revistas, etc. (campos campos concretosconcretos)• Búsqueda a través de los descriptores MeSH MeSH (MeMedical SSubject HHeadings)

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Search Builder / 1

En la ventana de Search Search builderbuilder podemos obtener con el desplegable todos los nombres de los campos y consultar el Index Index de cada campo.

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Search Builder / 2

El IndexIndex se abre por la palabra o frase más aproximada a la frase que escribimos en el Search Search BuilderBuilder

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Search Builder / 3

Tal y como vamos encontrando etiquetas con el Search Builder y el índice las podemos ir incorporando con el botón en la ventana de búsqueda (Search Box), donde se combinan:

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Resultados

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MeMedical SSubject HHeadings (MeSHMeSH) / 1

Una búsqueda a través de los descriptores descriptores MeSHMeSH nos permite capturar información de manera:

a) más consistente,

b) más metódica; y,

c) más rigurosa.

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MeMedical SSubject HHeadings (MeSHMeSH) / 2

1) Introducimos el término pathologic fracture en el cuadro de interrogación,

2) MeSH traduce automáticamente pathologic fracture al descriptor Fractures, spontaneous,

3) Nos permite limitar la búsqueda p.e. a los artícules enfocados en la rehabilitación, i

4) Ambos elementos se combinan en el menú desplegable por la opción “Search Box with AND”

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Resultados

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VisualizaciónVisualizaciónde resultadosde resultados

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Visualización de resultados / 1

Artículos del dominio públic (2)

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Visualización de resultats / 2

El Hospital está subscrito

Se obtiene el texto completo clicando el logo del Hospital

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Visualización de resultados / 3

Vista “Abstract”

Texto complet

Captura de registros

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My NCBIMy NCBI

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¿Qué es My NCBIMy NCBI?

El instrumento El instrumento My NCBIMy NCBI en en PubMed permite PubMed permite registrarse y así registrarse y así retenerretener la la información recogida por información recogida por un usuario y sus un usuario y sus preferencias.preferencias.

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Registro en My NCBIRegistro en My NCBI

Podemos abrir gratuitamente una cuenta en My NCBIMy NCBI o bien usar p.e. la de Google o Gmail

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Función Función Collections Collections / / 11

Cuando queremos guardar un conjunto de guardar un conjunto de registrosregistros bibliográficos en PubMed podemos hacerlo con la función Clipboard,función Clipboard, que solo nos deja retener hasta 500 registros i solo se conservan si no estamos inactivos 8 horas seguidas.

La función Collectionsfunción Collections es por el contrario para usuarios que se han registrado a My NCBI y permite conservar hasta 5000 registros indefinidamente, y además compartirlos.

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Función Función Collections Collections / 2/ 2

Podemos compartir una coleccióncompartir una colección de registros configurándola como “pública” y proporcionando la URLla URL o enlace directo a colaboradores nuestros.

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Función Función Save Save search / 1search / 1

Tener una cuenta en My NCBIMy NCBI también nos permite grabar una búsqueda (su estrategia) para poderla ejecutar en el futuro.

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Función Función Save search / Save search / 22

La función Save SearchSave Search genera un formulario donde podemos inscribir nuestras preferencias para recibir continuadamente los resultados que se vayan incorporando a PubMed sobre nuestro tema en un correu-e correu-e personal.personal.

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Función Función My My Bibliography /1Bibliography /1

Por último, otra función de My NCBIMy NCBI útil es My BibliographyMy Bibliography, diseñada específicamente para guardar registros de un autor y editarlos en listas

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Función Función My My Bibliography /2Bibliography /2

Botones de edición de My My BibliographyBibliography

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Captura Captura de registrosde registros

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Podemos capturar los resultados de la búsqueda, sea a partir de la lista total, sea haciendo una selección de la lista marcando los botones de selección

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Cuando enviamos registros a una dirección de correu-e no podemos enviar más de 200 registros por mensaje, pero se pueden enviar fraccionados.

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Importar registrosImportar registrosaa

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Podemos importar un archivo extraído de

Pubmed

Con el registro o registros seleccionados desplegamos SEND TOSEND TO, escogemos la opción FILEFILE

y el formato MEDLINEMEDLINE

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Desde el submenú IMPORT REFERENCESIMPORT REFERENCES de EndNoteWeb podemos subir el archivo generado por la búsqueda anterior (pubmed_result.txt) aplicando el filtre PUBMED (NLM)filtre PUBMED (NLM)

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Registro en detalle

Registro en la lista

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Guia d’us completa de EndnoteWebEndnoteWeb

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Importar registrosImportar registrosaa

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El icono de documento en la barra de las direcciones nos indica que ZoteroZotero ha detectado los “metadatos” de un

artículo en PubmedPubmed

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1) Abrimos Zotero activando su botón en la barra. 2) En la columna izquierda activamos la carpeta donde queremos grabar un registro.3) Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo. 1

2

3

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Guía de uso completa de Zotero

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Otras funcionesOtras funciones

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Enlace permanente a un Enlace permanente a un artículoartículo

Una forma de crear un enlace permanente a un registro es con un URL que contenga la expresión http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número PMID. P.e.:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894

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Función Función ImagesImages

En octubre de 2010 PubMed ha incorporado imágenes en los artículos que pertenecen a las publicaciones de Pubmed Central, de libre acceso

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Agregadores RSSAgregadores RSS

PubMed ofrece diversos canales RSS para obtener fácilmente informació continuada sobre un tema, etc.

Más información en la Guía de uso de RSS

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Elaborado por: Marta-R. Domínguez Senra ([email protected])