Gephi
Transcript of Gephi
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Gephi
Il network «dining»
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Gephi è un software che permette di visualizzare i network, evidenziando le loro caratteristiche.
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Per comprendere come utilizzare Gephi vedremo un semplice esempio, impiegando il file «dining».
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Immaginiamo un gruppo di ragazze che devono partecipare ad una cena.
Ogni ragazza indica le due persone che desidera avere come vicini di tavolo.
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«dining» raccoglie le preferenze espresse da ogni ragazza. Attraverso
Gephi è possibile visualizzare il risultato finale.
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Grazie a Gephi la struttura del network risulta molto
più chiara ed evidente.
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Ad esempio, si nota subito come due ragazze raccolgono 8
preferenze (Marion ed Eva).
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In questa presentazione vedremo come raggiungere
questo risultato.
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
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Alcuni concetti di base
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Directed Undirected
5
1 2
3
4
Tipologie di network
5
1 2
3
4
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Il network «dining» è directed: le ragazze esprimono una
preferenza verso qualcuno.
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Qualità dei nodi
Degree Indegree Outdegree
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Outdegree 2
Ogni ragazza sceglie due persone come vicini di tavolo. Tutte le ragazze hanno un outdegree pari a 2.
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Le preferenze ottenute variano da ragazza a ragazza. Ad esempio, una ragazza può essere stata scelta da tre compagne come possibile vicina di tavolo. Indegree pari a 3.
Indegree 3
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La somma di tutti i collegamenti mi dà il Degree. Questa misura è utile quando il network è undirected (non ci sono le freccie) e per avere una visione complessiva. La ragazza precedente ha un Degree pari a 5.
Degree 5
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Eva
Indegree: 6Outdegree: 2
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Ada
Indegree: 1Outdegree: 2
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Helen
Indegree: 3Outdegree: 2
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Tutorial
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
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GephiFinestra di avvio
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Apro il progetto «dininig»
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Il network «dining»Il grafico è poco chiaro. E’ necessario applicare un
layout che renda visibilli i legami tra i nodi.
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
![Page 30: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/30.jpg)
Dal menu Layout seleziono la voce «Force
Atlas 2».
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Il menu con tutte le voci per personalizzare il
Layout.
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Seleziono la voce «Prevent Overlap».Quindi premo il pulsante «Run»
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L’effetto applicato. I nodi si sono allontanati, in modo da rendere visibili i legami.
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
![Page 35: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/35.jpg)
A questo punto voglio visualizzare i nodi più importanti.
Per farlo applico un effetto che mette in rilievo le persone più «richieste» all’interno del network.
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Il riquadro Ranking permette di agire sui nodi.
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Attraverso il menu si può scegliere se modificare i nodi in base a Degree, Indegree o Outdegree.
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Gli outdegree sono uguali per tutti i nodi (tutte le ragazze indicano due persone, nè più, nè meno).
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Gli indegree variano: ci sono ragazze che hanno ricevuto molte preferenze. Seleziono Indegree.
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Selezionando la voce Dimensioni si può modificare il valore della scala dal minimo al massimo.
In questo caso lasciamo le opzioni di base(min 2 max 10)
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L’effetto applicato. I nodi hanno una dimensione equivalente al numero collegamenti in entrata
(indegree)
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I due nodi centrali hanno più collegamenti in ingresso
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
![Page 44: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/44.jpg)
Utilizzando il menu Testo è possibile
impostare il testo del documento
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I nomi del network
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
![Page 47: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/47.jpg)
Per calcolare il Degree medio, è necessario utilizzare il riquadro
«Statistics». Attraverso il comando «Average Degree» il sistema calcola
il Degree medio di tutti i nodi del network.
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Dopo aver avviato il comando, il sistema visualizza la distribuzione dei Degree.
![Page 49: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/49.jpg)
Due persone hanno 8 connessioni, due persone 6, tre persone 5, nove persone 4.
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E’ possibile visualizzare i dati anche in formato tabellare, utilizzando la scheda Data Laboratory.
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E’ possibile visualizzare i dati anche in formato tabellare, utilizzando la scheda Data Laboratory.
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Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
![Page 53: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/53.jpg)
Per visualizzare i diversi componenti del network seleziono la voce «Connect Components»
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Dal menu seleziono la voce Directed
![Page 55: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/55.jpg)
Il sistema visualizza la distribuzione dei «connected components»
![Page 56: Gephi](https://reader038.fdocuments.net/reader038/viewer/2022103115/5566e941d8b42a70198b51f0/html5/thumbnails/56.jpg)
Il sistema visualizza la distribuzione dei «connected components»