Gephi
Transcript of Gephi
Gephi
Il network «dining»
Gephi è un software che permette di visualizzare i network, evidenziando le loro caratteristiche.
Per comprendere come utilizzare Gephi vedremo un semplice esempio, impiegando il file «dining».
Immaginiamo un gruppo di ragazze che devono partecipare ad una cena.
Ogni ragazza indica le due persone che desidera avere come vicini di tavolo.
«dining» raccoglie le preferenze espresse da ogni ragazza. Attraverso
Gephi è possibile visualizzare il risultato finale.
Grazie a Gephi la struttura del network risulta molto
più chiara ed evidente.
Ad esempio, si nota subito come due ragazze raccolgono 8
preferenze (Marion ed Eva).
In questa presentazione vedremo come raggiungere
questo risultato.
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
Alcuni concetti di base
Directed Undirected
5
1 2
3
4
Tipologie di network
5
1 2
3
4
Il network «dining» è directed: le ragazze esprimono una
preferenza verso qualcuno.
Qualità dei nodi
Degree Indegree Outdegree
Outdegree 2
Ogni ragazza sceglie due persone come vicini di tavolo. Tutte le ragazze hanno un outdegree pari a 2.
Le preferenze ottenute variano da ragazza a ragazza. Ad esempio, una ragazza può essere stata scelta da tre compagne come possibile vicina di tavolo. Indegree pari a 3.
Indegree 3
La somma di tutti i collegamenti mi dà il Degree. Questa misura è utile quando il network è undirected (non ci sono le freccie) e per avere una visione complessiva. La ragazza precedente ha un Degree pari a 5.
Degree 5
Eva
Indegree: 6Outdegree: 2
Ada
Indegree: 1Outdegree: 2
Helen
Indegree: 3Outdegree: 2
Tutorial
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
GephiFinestra di avvio
Apro il progetto «dininig»
Il network «dining»Il grafico è poco chiaro. E’ necessario applicare un
layout che renda visibilli i legami tra i nodi.
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
Dal menu Layout seleziono la voce «Force
Atlas 2».
Il menu con tutte le voci per personalizzare il
Layout.
Seleziono la voce «Prevent Overlap».Quindi premo il pulsante «Run»
L’effetto applicato. I nodi si sono allontanati, in modo da rendere visibili i legami.
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
A questo punto voglio visualizzare i nodi più importanti.
Per farlo applico un effetto che mette in rilievo le persone più «richieste» all’interno del network.
Il riquadro Ranking permette di agire sui nodi.
Attraverso il menu si può scegliere se modificare i nodi in base a Degree, Indegree o Outdegree.
Gli outdegree sono uguali per tutti i nodi (tutte le ragazze indicano due persone, nè più, nè meno).
Gli indegree variano: ci sono ragazze che hanno ricevuto molte preferenze. Seleziono Indegree.
Selezionando la voce Dimensioni si può modificare il valore della scala dal minimo al massimo.
In questo caso lasciamo le opzioni di base(min 2 max 10)
L’effetto applicato. I nodi hanno una dimensione equivalente al numero collegamenti in entrata
(indegree)
I due nodi centrali hanno più collegamenti in ingresso
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
Utilizzando il menu Testo è possibile
impostare il testo del documento
I nomi del network
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
Per calcolare il Degree medio, è necessario utilizzare il riquadro
«Statistics». Attraverso il comando «Average Degree» il sistema calcola
il Degree medio di tutti i nodi del network.
Dopo aver avviato il comando, il sistema visualizza la distribuzione dei Degree.
Due persone hanno 8 connessioni, due persone 6, tre persone 5, nove persone 4.
E’ possibile visualizzare i dati anche in formato tabellare, utilizzando la scheda Data Laboratory.
E’ possibile visualizzare i dati anche in formato tabellare, utilizzando la scheda Data Laboratory.
Operazioni
1. Aprire il file «dining» con Gephi2. Applicare un layout3. Evidenziare le ragazze con più preferenze4. Visualizzare i nomi delle ragazze5. Individuare la distribuzione dei
collegamenti nel network6. Visualizzare i componenti del network
Per visualizzare i diversi componenti del network seleziono la voce «Connect Components»
Dal menu seleziono la voce Directed
Il sistema visualizza la distribuzione dei «connected components»
Il sistema visualizza la distribuzione dei «connected components»