GeneCloning strategier för kloning - Linköping … f ör Kloning Hur hitta klonen för en specifik...

41
Strategier för Kloning Hur hitta klonen för en specifik gen? Begrepp: Direkt selektion Olika typer av DNA bibliotek Identifiering från genbibliotek Hur identifiera en klon

Transcript of GeneCloning strategier för kloning - Linköping … f ör Kloning Hur hitta klonen för en specifik...

Strategier för KloningHur hitta klonen för en specifik

gen?

Begrepp:• Direkt selektion• Olika typer av DNA bibliotek• Identifiering från genbibliotek• Hur identifiera en klon

Selektionsproblem!!

Sid 127

Olika strategier för selektion

Sid 128

Direkt selektion

Sid 129

Direkt selektion för TrpA genen

Sid 130

Genbibliotek i en cosmid

Sid 132

Expression av gener

Sid 132

Sid 134

Nukleinsyra hybridisering

Sid 135

Sid 135

32P-dATP

Sid 136

Labeling olika tekniker

Sid 136

Sid 138

Identifiering av vanligt förekommande gener

Sid 139

Sid 139

Sid 140

Sid 141

Heterologous prbing

Sid 142

Sid 143

Southern hybridisering

Sid 143

Sid 144

Immunoscreening

Sid 145

PCR

• Hur designar man primer• Skillnader mellan olika DNA polymeraser• Felfrekvensen på Taq Polymeras• Kvantifiering av DNA och RNA

Sid 148

Sid 149

Sid 150

Agarosgelelektrofores

Sid 150

Amplifiering av α1-globin genen

Sid 151

Korta primer ger ospecifik bindning

Sid 151

Typisk PCR cykel

Sid 152

Annealingtemperaturens betydelse

Sid 153

Beräkning av Tm värde för primer

Sid 154

Sid 155

Kombinatorisk screening

Sid 155

Taq Polymeras adderar extra A

Sid 156

Sid 157

Felfrekvens på Taq polymeras

Sid 158

Kvantifiering av PCR produkt

Sid 159

Realtids PCR

Sid 160

Kvantifiering med realtids PCR

Sid 160

Kvantifiering av RNA

Sid 161