Fusion Protein Separation NOTES - obrnutafaza.hr · rtech.com info@sepax tech.com Toll Free: 1...

10
www.sepaxtech.com [email protected] Toll Free: 1877SEPAXUS 1 NOTES Fusion Protein Separation Fc Fusion Protein 1 Mobile Phase Effect Column: Zenix TM SEC300 ( 3 µm, 300 Å, 7.8 x 300 mm); Mobile phase 1: 150 mM Phosphate buffer, pH 7.0; Mobile phase 2: 50mM phosphate buffer, 150 mM NaCl, 27 mM LArginine, pH 7.0; Flow rate: 0.5 mL/min; Detector: UV 280 nm; Column temperature: Room temperature; Injection volume: 50 µL; Pressure: 50 bar; Sample: CHO cell expressed Fcfusion protein 160 kD ( 2.0 mg/mL ). Fc Fusion Protein 2: rhTNFRFc SEC Phase Comparison Column: Zenix TM SEC300 (3 µm, 300 Å, 7.8 x 300 mm); Zenix TM C SEC300 (3 µm, 300 Å, 7.8 x 300 mm); Mobile phase: 150 mM Phosphate buffer, pH 7.0; Flow rate: 1.0 mL/min; Detector: UV 280 nm; Column temperature: 25, Injection volume: 10 µL; Samples: Recombinant human tumor necrosis factor receptorFc ( rhTNFRFc ) 2 mg/mL in water. Fusion Protein 3 Mobile Phase Effect Column: Zenix TM C SEC300 ( 3 µm, 300 Å, 7.8 x 300 mm) Mobile phase: as indication; Flow rate: 0.5 mL/min; Detector: UV 214 nm; Column temperature: 25 ; Injection volume: 10 µL; Samples: 1 mg/mL fusion protein, MW 170 kD, pI 6.87.0 10% retention time offset for presentation purpose. Fusion Protein 3 SEC Phase comparison Column: Zenix TM SEC300, Zenix TM C SEC300 ( 3 µm, 300 Å, 7.8 x 300 mm); Mobile phase: 150 mM Phosphate buffer ( pH 7.0 ) + 200 mM NaCl; Flow rate: 0.5 mL/min; Detector: UV 214 nm; Column temperature: 25 ; Injection volume: 10 µL; Samples: 1 mg/mL fusion protein, MW 170 kD, pI 6.87.0. ¾ Fusion proteins are structural hybrids that contain two different proteins, which retain the functional properties from the original proteins. ¾ Zenix and ZenixC SEC are suitable for aggregation/monomer separation of fusion proteins including Fc fusion and HSA fusion proteins. Highlighted FACTS: ¾ Proteomix SAX and SCX provide high resolution separation of fusion proteins, especially different glycosylation forms, charge variants and fusion proteins from their formulation components. *Please click above highlights for more product information.

Transcript of Fusion Protein Separation NOTES - obrnutafaza.hr · rtech.com info@sepax tech.com Toll Free: 1...

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

   

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

                                       www.sepax-­‐tech.com                                                                            info@sepax-­‐tech.com                                                        Toll  Free:  1-­‐877-­‐SEPAX-­‐US            1  

   NOTES                        Fusion  Protein  Separation    

Fc  Fusion  Protein  1  -­‐  Mobile  Phase  Effect  Column:  ZenixTM  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);  Mobile  phase  1:  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0;  Mobile  phase  2:  50mM  phosphate  buffer,  150  mM    NaCl,  27  mM  L-­‐Arginine,  pH  7.0;  Flow  rate:  0.5  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  Room  temperature;  Injection  volume:  50  µL;  Pressure:  50  bar;  Sample:  CHO  cell  expressed  Fc-­‐fusion  protein  160  kD  (  2.0  mg/mL  ).  

Fc  Fusion  Protein  2:  rhTNFR-­‐Fc  -­‐  SEC  Phase  Comparison  Column:  ZenixTM  SEC-­‐300  (3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);    ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);    Mobile  phase:  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0;  Flow  rate:  1.0  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  25℃,  Injection  volume:  10  µL;  Samples:  Recombinant  human  tumor  necrosis  factor  receptor-­‐Fc  (  rhTNFR-­‐Fc  )  2  mg/mL  in  water.  

Fusion  Protein  3  -­‐  Mobile  Phase  Effect  Column:    ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm)  Mobile  phase:  as  indication;  Flow  rate:  0.5  mL/min;  Detector:  UV  214  nm;  Column  temperature:  25  ℃;  Injection  volume:  10  µL;  Samples:  1  mg/mL  fusion  protein,  MW  170  kD,  pI  6.8-­‐7.0    10%  retention  time  offset  for  presentation  purpose.  

Fusion  Protein  3  -­‐  SEC  Phase  comparison  Column:  ZenixTM  SEC-­‐300,  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);  Mobile  phase:  150  mM  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  +  200  mM  NaCl;  Flow  rate:  0.5  mL/min;  Detector:  UV  214  nm;  Column  temperature:  25  ℃;  Injection  volume:  10  µL;  Samples:  1  mg/mL  fusion  protein,  MW  170  kD,  pI  6.8-­‐7.0.  

¾ Fusion  proteins  are  structural  hybrids  that  contain  two  different  proteins,  which  retain  the  functional  properties  from  the  original  proteins.  

¾ Zenix  and  Zenix-­‐C  SEC  are  suitable  for  aggregation/monomer  separation  of  fusion  proteins  including  Fc  fusion  and  HSA  fusion  proteins.  

 Highlighted  FACTS:  

¾ Proteomix  SAX  and  SCX  provide  high  resolution  separation  of  fusion  proteins,  especially  different  glycosylation  forms,  charge  variants  and  fusion  proteins  from  their  formulation  components.  

 *Please  click  above  highlights  for  more  product  information.  

 

 

 

                                     www.sepax-­‐tech.com                                                                          info@sepax-­tech.com                                                Toll  Free:  1-­‐877-­‐SEPAX-­‐US                2  

   NOTES                    Fusion  Protein  Separation    

 Fusion  Protein  4  -­‐  Mobile  Phase  Effect  Column:  ZenixTM  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);  Mobile  phase  1:  25  mM  Na2HPO4,  200  mM  NaCl,  pH  6.8;  Mobile  phase  2:  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0;  Flow  rate:  1.0  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  25℃;  Pressure:  82  bar;  Injection  volume:  2  µL;  Sample:  10  mg/mL  Fusion  protein  (150  kD,  pI  5.0,  50  mg/mL,  dilute  to  10  mg/mL).  

Fusion  Protein  4  -­‐  Column  Length  Effect  Column:  ZenixTM  SEC-­‐300  (3  µm,  300  Å),  7.8  x  300  mm  and  7.8  x  50  mm+  7.8  x  300  mm;    Mobile  phase:  25  mM  Na2HPO4,  200  mM  NaCl,  pH  6.8;    Flow  rate:  1.0  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  25℃;  Pressure:  90  bar;  Injection  volume:  2  µL;  Sample:  10  mg/mL  Fusion  protein  (150  kD,  pI  5.0,  50  mg/mL,  dilute  to  10  mg/mL).  

HSA  Conjugated  Peptide  -­‐  SEC  Phase  Comparison  Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300,  ZenixTM  SEC-­‐300  (3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);  Mobile  phase:  A.  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0;    Flow  rate:  1.0  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  25℃;  Injection  volume:  10  µL;    Samples:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment).  

HSA  Fusion  Protein  -­‐  Mobile  Phase  Effect  Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);    Mobile  phase:  A.  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0,  B:  150  mM;  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  :  IPA  =  95  :  5  (  v/v  );  Flow  rate:  1.0  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  25℃;  Injection  volume:  10  µL;  Samples:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment).  

HSA  Fusion  Protein  vs  HSA  Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm);  Mobile  phase:  150  mM;  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  :  IPA  =  95  :  5  (  v/v  );  Flow  rate:  1.0  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  25℃;  Injection  volume:  10  µL;  Samples:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment),  HSA  2  mg/mL.  

HSA  conjugated  peptide  Analysis  on  Proteomix®  SAX-­‐NP5  Column:  Proteomix®  SAX-­‐NP5  (5  µm,  4.6  x  250  mm);    Mobile  phase:  Piperazine,  Triethanolamine,  bis-­‐tris  propane  and  N-­‐methylpiperazine,  20  mM  each,A,  pH  9.7;  B,  pH  3.0  (  adjust  by  HCl  );  Flow  rate:  0.5  mL/min;  Detector:  UV  280  nm;  Column  temperature:  30  ℃;  Pressure:  139  bar;  Injection  volume:  10  µL,  MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment.  

ZP1009

© Sepax Technologies, Inc.

Columns: SRT® SEC-300  (5  µm,  300  Ǻ,  7.8  x  300  mm),  Zenix™ SEC-300 (3 µm,  300  Ǻ,  7.8  x  300  mm)

Mobile Phase: 150 mM sodium phosphate buffer, pH 7.0 Flow Rate: 1.0 mL/min; Temperature: Ambient Detection: UV 214 nm Injection Volume: 20 µL Samples: Recombinant tumor necrosis factor receptor-Fc fusion protein

(rhTNFR-Fc), including oligomers (440 kD and 360 kD), monomer (150 kD), and impurity (120 kD).

Analysis of Fc fusion protein on Zenix™ vs. SRT®

Keywords: Size exclusion, SRT, Zenix, protein, Recombinant tumor necrosis factor receptor-Fc fusion protein, high resolution

min0 2 4 6 8 10 12 14

SRT SEC-300

Zenix SEC-300

1

Column:  ZenixTM SEC-­‐300,  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm)  

Mobile  phase:  150  mM  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  +  200  mM  NaCl;

Flow  rate:  0.5  mL/min;  Detector:  UV  214  nm;  Column  temperature:  25  ℃;

Injection  volume:  10  µL;  Samples:  1  mg/mL  fusion  protein,  MW  170  kD,  pI  6.8-­‐7.0

Fusion  Protein  Analysis  on  SEC-­‐300  (  7830  )

min0 5 10 15 20 25

mAU

0

50

100

150

200

250

300

350 Blue:  ZenixTM SEC-­‐300

Red:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300

C-­line  SEC  minimizes  the  secondary  interaction.www.sepax-­tech.com

Better  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

EP1001

2

Column:   ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm)  

Mobile  phase:  as  indication

Flow  rate:  0.5  mL/min;  Detector:  UV  214  nm;  Column  temperature:  25  ℃;

Injection  volume:  10  µL;  Samples:  1  mg/mL  fusion  protein,  MW  170  kD,  pI  6.8-­‐7.0

Fusion  Protein  Analysis  on  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  7830  )Mobile  phase  effect

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

10%  retention  time  offset  for  presentation  purpose

min0 5 10 15 20 25 30

mAU

0

50

100

150

200

250

300

3501. 150  mM  Phosphate  buffer  ,  pH  7.0    +  200  mM  NaCl

2. 150  mM  phosphate,  pH  7.0  +10%  ACN

3. 150  mM  phosphate,  pH  7.0

1

2

3

EP1001

3

Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm)  

Mobile  phase:  150  mM  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  +  200  mM  NaCl,

Flow  rate:  1.0  mL/min,  Detector:  UV  214  nm,  Column  temperature:  25  ℃,

Injection  volume:  10  µL,  Samples:  1  mg/mL  fusion  protein  

Pressure:  76  bar

Fusion  Protein  Analysis  on  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  7830  )

min0 2 4 6 8 10 12 14

mAU

0

50

100

150

200

6.283

7.087

7.955

min4 5 6 7 8 9

mAU

0

20

40

60

80

6.283

7.087

7.955

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

EP1001

HSA  fusion  protein  separation  on  Zenix-­‐C  SEC-­‐300

min2 4 6 8 10 12

mAU

0

10

20

30

40

50

60

70

80

Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm)  

Mobile  phase:  A.  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0, B:  150  mM  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  :  IPA  =  95  :  5 (  v/v  ),  

Flow  rate:  1.0  mL/min,  Detector:  UV  280  nm,  Column  temperature:  25℃,  Injection  volume:  10  µL,  

Samples:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment)

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

R=1.58  

R=  1.09A

B

EP1003

HSA  fusion  protein  separation  on  Zenix-­‐C  SEC-­‐300

Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300  (  3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm)  

Mobile  phase:  150  mM  Phosphate  buffer  (  pH  7.0  )  :  IPA  =  95  :  5 (  v/v  ),  

Flow  rate:  1.0  mL/min,  Detector:  UV  280  nm,  Column  temperature:  25℃,  Injection  volume:  10  µL,  

Samples:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment),  HSA  

2  mg/mL

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

min4 6 8 10 12

mAU

0

10

20

30

40

50

60

70

80

HSA  fusion  protein

HSA

EP1003

HSA  fusion  protein  separation  on  Zenix  and  Zenix-­‐C

Column:  ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300,  ZenixTM SEC-­‐300  (3  µm,  300  Å,  7.8  x  300  mm),  

Mobile  phase:  A.  150  mM  Phosphate  buffer,  pH  7.0,

Flow  rate:  1.0  mL/min,  Detector:  UV  280  nm,  Column  temperature:  25℃,  Injection  volume:  10  µL,  

Samples:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment)

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

min2 4 6 8 10 12 14

mAU

0

10

20

30

40

50

60

70

ZenixTM-­‐C  SEC-­‐300

ZenixTM SEC-­‐300

EP1003

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

HSA  fusion  protein  Analysis  on  Proteomix® SAX-­‐NP5

www.sepax-­tech.comBetter  Surface  Chemistry  for  Better  Separation  ©  Sepax  Technologies,  Inc.

Column: Proteomix® SAX-­‐NP5 (5  µm,  4.6  x  250  mm)

Mobile  phase:  Piperazine,  Triethanolamine,  bis-­‐tris  propane  and  N-­‐methylpiperazine,  20  mM  each,  

A,  pH  9.7;  B,  pH  3.0  (  adjust  by  HCl  )  

Flow  rate:  0.5  mL/min,  Detector:  UV  280  nm,  Column  temperature:  30  ℃,  Pressure:  139  bar

Sample:  HSA  fusion  peptide  5  mg/mL,  10  µL  (MW  75  kD,  pI  5.0,  HSA  conjugated  peptide  in  diabetes  treatment)

min0 5 10 15 20 25

mAU

0

25

50

75

100

125

150

175

200

HSA,  2  mg/mL,  10  µL

E2HSA,  5  mg/mL,  10  µL

HSA+E2HSA  (1:1  v/v),  30  µL

Time(  min  )

Flow(  mL/min)

A% B%

00.5

35 6530 0 100

PP1021