Estructura Síntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Estructura, sntesis, procesamiento y

    metabolismo de los cidos

    nucleicos. Tipos de ADN, ARN segnsu funcin. ARN polimerasa

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    ACIDOS NUCLEICOSDra. Carolina Cucho Espinoza

    BIOQUIMICA

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    Estructura de un nucletido...

    Los nucletidosestn formadospor una basenitrogenada, unapentosa y ungrupos fosfato.

    La basenitrogenada puedeser prica opirimidnica.

    Nucletido

    Ac.fosfrico Nuclesido

    Base nitrogenada Pentosa

    Purina Pirimidina

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    Las purinas y pirimidinas

    Tanto el ADN como el ARN contienen las mismas purinas:Adenina(A) y Guanina(G)

    Tanto el ADN como el ARN contienen la pirimidinaCitosina(C) pero difieren en la otra pirimidina.

    El ADN contiene Timina (T) y el ARN Uracilo(U)

    N

    N

    N

    NH

    NH2

    Adenina(A)

    N

    O N

    H

    NH2

    HN

    O

    O N

    HCitosina(C) Uracilo(U)

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    Los nuclesidos...

    La unin de una basenitrogenada y un azcar(pentosa), genera un

    nuclesido. Los nuclesidos de las basesA,G,T,C y U son: adenosina,guanosina, timidina, citidina yuridina.

    El azcar puede ser ribosa(ribonuclesido) y 2-desoxirribosa(desoxirribonuclesido)

    OH OH

    OHOH2C

    OH

    OHOH2C

    OH H

    OH

    ribosa

    Desoxirribosa

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    Los nucletidos...

    Los nucletidos sonsteres mono, di ytrifosfricos de los

    nuclesidos. El nuclesido adenosina,

    se une al cido fosfricopara formar: Nuclesido monofosfato: AMP Nuclesido difosfato: ADP Nuclesido trifosfato: ATP

    OOH2C

    OH

    ~P P P~~

    Base

    Nuclesido

    monofosfatoNuclesido difosfato

    Nuclesido trifosfato

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    Sntesis de nucletidos de laspurinas

    El proceso genera AMP yGMP.

    Los diversos carbonos del

    nucleo purina derivan dedistintos aminocidos, delCO2 y del tetrahidrofolato.

    El proceso tiene tres etapas: Sntesis de fosforribosil amina

    Sntesis de inosina monofosfato Sntesis de AMP y GMP

    aspartatoC

    C

    C C

    C

    N

    NN

    N

    CO2

    Formiltetrahidrofolato

    Glutamina

    Glicina

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    Sntesis de 5fosforribosil amina En primer trmino se sintetiza fosforribosil pirofosfato: a partir de la ribosa

    5fosfato Mediante la actividad de la ribosa pirofosfato fosfoquinasa en presencia deATP y de Mg

    Se activa por el Fosfato inorgnico y se inactiva por la presencia denuclesidos purnicos

    En la segunda etapa la 5 fosforribosil pirofosfato, en presencia de laGlutamina:fosforribosil pirofosfato amidotransferasa, de glutamina agua ymagnesio se transforma en fosforribosil amina

    O

    OH

    POH2C

    ATP AMP

    Mg

    Fosfoquinasa O

    O~P~P

    POH2C

    Ribosa 5 fosfato Fosforribosil1-pirofosfato

    OPOH2C NH2

    Glutamina+ H2O

    Glutamato+PPi

    Mg

    Amidotransferasa

    Foforribosilamina

    PRPP es precursor de purinas, pirimidinas, histidina y triptofano

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    Sntesis de Inosina Monofosfato

    Las siguientes nueve etapas para formar IMPrequieren de cuatro molculas de ATP y lapresencia de los donantes de N y C

    correspondientes.1. Sintetasa+Glicina +ATP2. Formil transferasa + Formil tetrahidrofolato3. Sintetasa + Glutamina +ATP + H2O4. Sintetasa +ATP

    5. Carboxilasa + CO26. Sintetasa +Aspartato +ATP7. Adenilo succinato liasa + H2O8. Formiltransferasa + Formil tetrahidrofolato9. Ciclohidrolasa

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    Sntesis de IMP (I)

    Glicina+ ATP

    ADPFormil tetraHidro folatoTetrahidrofolato

    OPOH2C NHO=C

    CH2-NHCHO

    OPOH2C NHHN=C

    CH2-NH

    CHO

    OPOH2CNH

    O=C

    CH2-NH2OPOH2C NH2

    POH2C NH2N

    N

    0

    5fosforribosilamina 5fosforribosil

    glicinamida 5fosforribosilformilglicinamid

    5fosforribosil

    formilglicinamidina

    5fosforribosil

    5aminoimidazol Ino

    ATP ADP+ Pi

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    Sntesis de IMP (II)

    CO2

    OPOH2C NH2N

    N

    HOOC

    OPOH2C NH2N

    N

    5fosforribosil5aminoimidazol

    5fosforribosilAminoimidazolcarboxilato

    ONH2N

    N

    Ribosa 5fosfato

    HC-NH-C

    COOH

    CH2

    HOOC

    ATPAspartato

    FosforribosilSuccinocarboxamidaaminoimidazol

    H2O

    Fumarato

    ONH2N

    N

    Ribosa 5fosfato

    NH2-CO

    FosforribosilCarboxamida

    aminoimidazol

    O NHC-NH

    N

    Ribosa 5fosfato

    CO

    H2N

    O

    Formiltetrahidrofolato

    FosforribosilCarboxamidaformamidoimidazol

    CiclohidrolasaO

    NN

    N

    Ribosa 5fosfato

    CO

    HN

    Inosina 5monofosfato(IMP)

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    Sntesis de AMP y GMP

    El IMP sirve de precursor para AMP o GMP.

    La va que lleva a AMP requiere energa en forma deGTP.

    La va que lleva a GMP utiliza ATP. De esta manera se controla que las proporciones en que

    se sintetizan el AMP y el GMP sean equivalentes.

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    Sntesis de AMP y GMP

    O NN

    N

    Ribosa 5fosfato

    CO

    HN

    NAD + H2O

    IMP dehidrogenasa

    Xantosinamonofosfato

    O NN

    N

    Ribosa 5fosfato

    CO

    HN

    OC

    GuanosinaMonofosfato

    (GMP)

    O NN

    N

    Ribosa 5fosfato

    CO

    HN

    NH2

    O NN

    N

    Ribosa 5fosfato

    NH

    HN

    HOOC-CH2-CH-COOH

    Glutamina + ATPGlutamina sintetasa

    Sintetasa

    GTP+Aspartico

    Adenilsuccinato

    Adenilsuccinasa

    O NN

    N

    Ribosa 5fosfato

    NH2

    HN

    AdenosinaMonofosfato

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    Transformacin de nucletidos monofosfatoen di y tri fosfato

    Los nuclesidos di fosfato son sintetizados a partir de losmonofosfato mediante nuclesido monofosfato quinasas. Igual si setrata de ribo o desoxirribo nuclesidos. El ATP es la fuente de fosfato

    Los nuclesidos tri fosfato se forman a partir de los di fosfatomediante una nuclesido di fosfato quinasa y ATP.

    ADPGDPATPGMPADPATPAMP

    2Adenilato quinasa

    Guanilato quinasa

    ADPCTPATPCDP

    ADPGTPATPGDP

    Nuclesido difosfatoquinasa

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    Regulacin de la Sntesis de lasPurinas

    Se regula la entrada y la salida.

    La sntesis de PRPP con la PRPP sintetasa esretroinhibida por ADP y GDP.

    La sntesis de fosforribosilamina con la PRPPamidotransferasa es retroinhibida por ATP, ADP y AMP enun sitio alostrico, y por GTP, GDP y GMP en otro. Laactividad es estimulada por PRPP.

    En la ramificacin que conduce de IMP a AMP y GMP, laacumulacin de ATP acelera la sntesis de GMP yviceversa, pues la adenilosuccinato sintetasa es inhibidapor AMP y la IMP deshidrogenasa por GMP.

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    Salvataje de las Purinas

    Las purinas libres que provienen de la dieta, del hgado odel recambio de nucletidos, pueden ser utilizadas pararesintetizar nucletidos en las vas de salvataje oreciclaje.

    En estas reacciones, la purina debe fosforribosilarse aexpensas de PRPP. Se ahorra energa.

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  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Catabolismo de las Purinas

    En primer lugar, los cidos nucleicos son degradados pornucleasas.

    Luego, los nucletidos son desfosforilados a nuclesidospor fosfatasas y nucleotidasas.

    Los nuclesidos son degradados por nucleosidasas onuclesido fosforilasas:

    nuclesido + H 2O base + ribosa

    nuclesido + Pi base + ribosa-1-PLa ribosa-1-P es isomerizada a ribosa-5-P

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    AMP

    H2O Pi

    Adenosina

    H2O NH3

    Inosina

    Adenosinadeaminasa

    Purina nuclesidofosforilasa

    Pi

    Ribosa 1-fosfatoHipoxantina

    O2+H2O

    H2O2

    Xantina

    Xantino oxidasa

    cido Urico

    Xantino oxidasa

    O2+H2O

    H2O2

    H2O2

    Guanina

    Guanosina

    Aminohidrolasa

    NH3H2O

    Purina nuclesidofosforilasa

    Pi

    Ribosa 1-fosfato

    GMP

    5 nu cleot idasa

    Catabolismo de lasPurinas

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Degradacin de las Purinas

    Deficiencia en adenosina deaminasa:inmunodeficiencia; clulas T y B

    Gota: hiperuricemia; artritis aguda por depsitode cristales de cido rico. Resulta de exceso de purinas o deficiencia parcial en

    la enzima de salvataje HGPRT.

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Sntesis de nucletidos de laspirimidinas

    A diferencia de los nucletidos de las purinas,donde las bases se sintetizan ya unidas a lapentosa, en el caso de las pirimidinas primero se

    sintetizan las bases y luego se unen a la pentosa. La primera base de las pirimidinas terminada sederiva de la glutamina, ATP, el CO2 y el cidoasprtico.

    El paso inicial es la sntesis de carbamil fosfato

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Sntesis de carbamil fosfato

    La glutamina y el CO2 en presencia de la carbamil fosfatosintetasa II y dos molculas de ATP produce carbamil fosfato.Esta enzima no requiere biotina como otras carboxilantes.

    El proceso es semejante al que da inicio a la sntesis de urea,

    catalizado por la carbamil fosfato sintetasa I . La sntesis de urea se produce en la mitocondria y las de las

    pirimidinas en el citosol. La fuente de nitrgeno en el primer casoes el amonio mientras que en el segundo es la glutamina

    2

    322 min2 POOCONHaGlutaCOATP

    Carbami l fosfato

    Carbamil fosfatosintetasa II

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Sntesis de Uridina 5monofosfato

    NH2

    C=O

    O

    PO32-

    Aspartato

    transcarbamilasa

    aspartato Pi

    C

    OOH

    H2N

    O=C

    NH

    CHCOOH

    CH2

    Carbamilfosfato

    Carbamilaspartato

    H2O

    DihidroorotasaC

    O

    HN

    O=C

    NH

    CHCOOH

    CH2

    dihidroorotato

    Deshidrogenasa

    NAD

    NADH+H

    C

    O

    HN

    O=C

    NH

    CCOOH

    CH

    Orotato

    C

    O

    HN

    O=CN

    CCOOH

    CH

    Ribosa 5 fosfato

    Orotidina 5monofosfato

    PRPPPPi

    C

    O

    HN

    O=CN

    C

    CH

    Ribosa 5fosfato

    Uridina 5monofosfato

    CO2

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Sntesis de CTP

    La Citidina trifosfato se forma a partir de la Uridinatrifosfato, por aminacin de esta ltima por la enzimaCTP sintetasa y como donante de nitrgeno laglutamina.

    Degradacin de Nucletidos Pirimidnicos

    Los anillos se abren y generan estructuras como Balanina y B aminoisobutrico, precursores de acetilCoA

    UTP CTP

    Glutamina Glutamato

    ATP ADP+Pi

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Conversin de ribonucletidos a desoxirribonucletidos

    La sntesis de purinas y pirimidinas generaribonucletidos, pero se necesitandesoxiribonucletidos para la sntesis de ADN.

    Ribonuclesido difosfato Desoxirribonuclesido difosfato

    Ribonucletido reductasa

    Tiorredoxina(reducida) Tiorredoxina(oxidada)Tiorredoxin reductasa

    NADPH+HNADP

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Digestin yaprovechamiento

    de cidos nucleicos en el

    intestino Ribonucleasas y

    desoxirribonucleasasdeljugo pancretico hidrolizanARN y ADN.

    Los oligonucletidos sonhidrolizados por lasfosfodiesterasaspancreticas

    Nucleotidasas ynucleosidasas liberanpurinas y pirimidinas queson degradadas en la clulaintestinal y excretadas porla orina, como en el casodel c.rico.

    mononucletidos

    ADN+ARN

    pH cido desnaturalicidos nucleicos

    cidos nucleicosdesnaturalizados

    oligonucletidos

    Nucleasas

    Nuclesidos

    Fosfodiesterasa

    Nucleot idasas

    c i

    do

    ric

    oOrina

    Basesnitrogenadas

    Nucleosidasas

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    ADN

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    ADN: generalidades Los cidos nucleicos (ADN y

    ARN) son estructuras qumicasfundamentales para elalmacenamiento y la expresinde la informacin gentica.

    El ADN est presente tanto enlos cromosomas de los ncleos

    de las clulas eucariotes, comoen las mitocondrias ycloroplastos de las plantas.

    En las clulas procariotes, queno tienen ncleo, tienen unnico cromosoma o pueden

    contener ADN no cromosomalcomo plsmidos. El ADN se replica durante la

    divisin celular y se expresa portranscripcin al ARN.

    ADN

    ADNADN

    ADN

    Replicacin

    Transcripcin

    ARN

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Estructura de ADN El ADN es unpolidesoxirribonucletido

    con muchosdesoxirribonucletidosunidos por enlacesfosfodiester 3,5

    Existe como una molculaformada por un par decadenas (salvo enalgunos virus)entorchadas una sobreotra, en una doble hlice.

    En las clulas eucariotesel ADN est asociado avarios tipos de protenasen una estructura llamadanucleoprotena

    Adenina

    Citosina

    Guanina

    Timina

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    El enlace 3,5 fosfodiester...

    Este enlace une el grupo 5hidroxilo de la desoxirribosa deun nucletido con el grupo 3hidroxilo de otro.

    La cadena muestra polaridaden un terminal 5 y en otros

    terminales 3 que no estnunidos.

    La secuencia se expresa delterminal 5 de la cadena alterminal 3.

    Los enlaces fosfodiester pueden ser rotos medianteendo (al medio) y exo (alextremo) desoxirribonucleasas

    P

    P

    P

    P

    P

    OH

    5

    5

    5

    5

    5

    3

    3

    3

    3

    3

    Terminal 5

    Terminal 3

    T

    A

    C

    G

    G

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    La hlice doble

    En la hlice doble, las doscadenas giran alrededor de uneje comn.

    Estn colocadas de formaantiparalela, esto es, el terminal5 de una cadena se une al

    terminal 3de la otra. En la forma clsica B el

    esqueleto de desoxirribosa yfosfato, hidroflico, est haciafuera, mientras que las basesestn hacia adentro

    La estructura genera unaescalera de caraco l con unaranura ancha y otra delgada.

    Terminal 3 Terminal 5

    Colum

    nadedesoxirribosafosfato

    Terminal 3 Terminal 5

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Pares de bases Las bases de una cadena

    estn pareadascon las basesde la segunda cadena;

    La adenina siempre estformando par con la timina yla guanina con la citosina

    Si conocemos la secuencia debases de una cadenaconoceremos la de lasegunda.

    Las cadenas se mantienenjuntas por efecto de losenlaces o puentes de

    hidrgeno generados entreellos.

    Dos enlaces entre adenina ytimina y tres enlaces entreguanina y citosina.

    Adenina Timina

    Guanina

    Citosina

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Formasestructurales de

    ADN

    Existen tres formasestructurales de ADN, lasformas B,A y Z.

    La forma B tiene 10 residuospor 260 con las basesperpendiculares al eje. Giraa la derecha.Es la ms

    frecuente. La forma A tiene 11 bases

    por 360, gira a la derecha ylas bases estn giradas 20de la perpendicular.

    La forma Z tiene 12 parespor 360, gira a la izquierdaSe le encuentra en algunasporciones del ADN.

    B-ADN Z-ADN

    Ranura

    ancha

    R

    anura

    d

    elgada

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Sntesis de ADN en procariotes Cada una de las cadenas del

    doble helice del ADN seseparan para generar cadenascomplementarias.

    Se forman entonces dosmolculas hijasde ADN conorientacin antiparalela como

    fue el ADN original. A esto se llama replicacinsemiconservadora porqueaunque las cadenas madreseseparan (no se conservan) semantienen intactacta en las

    dos molculas hijas de ADN. Las enzimas involucradas son

    las polimerasas que sintetizanla secuencia complementaria

    de cada cadena

    Separacin de bases

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Separacin de basescomplementarias en

    procariotes Para que las dos

    cadenas se separen debeiniciarse el proceso en

    algn pequeo lugar,debido a que lapolimerasa slo actasobre cadenas sueltas.

    En procariotes el proceso

    se inicia en un nicoorigen de replicacinmelt ing po in ta partir delcual se extiende.

    origen

    Apertura deldoble helice

    Bifurcacin

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Separacin debases

    complementarias eneucariotes

    En las clulaseucariotes, la

    replicacin se inicia enmltiples puntos a lolargo del ADN.

    Estas zonas incluyenuna secuencia

    Adenina: Timinarepetida, y sumultiplicidad acelera lareplicacin.

    Formacin de la

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Formacin de lahorquilla

    Conforme las dos cadenas delADN se separan, se formauna horq ui l la de repl icacinque avanza a la par que se

    produce la replicacin. Esta horquilla esbidireccional.

    Este fenmeno requiere lapresencia de varias protenasque forman el complejo pre-

    inicia l Protena DnaA : se unen a la

    secuencia inicial A:T en elorigen de la replicacin

    Protena captadora de lacadena libre delADN(SSB)Llamada protena

    desestabilizante del hlice.Mantiene el equilibrio entredoble y simple cadena.

    ADN helicasa: Fuerza laseparacin de las dos cadenas

    ADNpolimerasa

    Protena

    SSB

    ADN

    helicasa

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Super espiral... Conforme se separanlas dos cadenas de

    ADN, la cadena originalrota (gira sobre simisma) y se acumulan

    super espirales. Estos ltimos

    interfieren con laulterior separacin delADN original.

    Existe un grupo deenzimas que permitenla remocin de estossuper espirales y sellaman topoisomerasas.

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    ARN primer

    La ADN polimerasa requiere para iniciar el proceso desntesis la presencia de ARN pr imer, una porcin deARN con un hidroxilo libre en el terminal 3unido auna cadena de ADN. Este hidroxilo es el primer

    receptor de un nucletido. Primasa: Una ARN polimerasa sintetiza hileras cortas de ARN

    (diez nucletidos) complementaria y antiparalela al ADN. Enesta molcula hbrida (ADN:ARN) la adenina forma par con eluracilo y la guanina con la citosina.

    Primosoma: Resulta de la unin de la Primasa con un grupode protenas ligadas al proceso.

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    Elongacin de las cadenas... Las polimerasas de las clulas eucariotes y

    procariotes elongan la nueva cadena de ADN,aadiendo desoxirribonucletidos al terminal 3dela cadena.

    La secuencia depende de las bases del patrn

    original con los cuales los nucletidos de la nuevacadena van a formar par. ADN polimerasa III: Cataliza la elongacin del ADN.

    E3hidroxilo del RNA pr imeringresa el primerribonucletido. y elonga el ADN en direccin 5

    3antiparalelo al patrn original.

    Los nucletidos estn como molculas trifosforiladas(dATP,dGTP,dTTP, dCTP) y liberan pirofosfato al unirse.

    Adems de la ADN polimerasa existe un detecto r delecturaque prueba la secuencia en direccin opuesta.

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    Una clula humana tiene 46 cromosomas Este ADN est asociado a protenas llamadas Histonas, las cuales

    sirven para ordenar el ADN en unidades estructurales llamadasnucleosomas, con forma de esferas. Los nucleosomas conforman estructuras ms complejas

    llamadas nucleofilamentos que se unen constituyendo loscromosomas.

    ADN de clula Eucariote

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    Histonas y nucleosomas Las Histonas son protenas pequeas, cargadas

    positivamente por su contenido en lisina yarginina.

    Son de cinco clases H1, H2A, H2B, H3, H4. Forman puentes inicos con el ADN, que es

    negativo. Dos molculas de H2A, H2B, H3 y H4 forman el

    ncleo de cada nucleosoma, envuelto por ADN. Nucleosomas unidos por una unin de ADN de

    aproximadamente 50 nucletidos forma unnucleofilamento. La histona H1 no se encuentra en el nucleosoma,

    sino entre dos nucleosomas.

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    Nucleosomas ynucleofilamentos

    (H2A,H2B,H3,H4)2

    H1

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    Daos del ADN

    El ADN es constantemente sujeto de dao provocadopor sustancias qumicas y radiaciones.

    Los daos son generalmente prdida de nucletidos.Si el dao no es reparado se provoca una mutacinpermanente.

    La radiacin genera la unin covalente de dos timinasadyacentes formando un dmero que detiene a lapolimerasa del ADN.

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    Reparacin del ADN Tiene dos etapas:

    Reconocimiento deldmero por unaendonucleasaespecfica y ruptura de

    la cadena daada. Luego una

    exonucleasa deruptura, reconoce laincisin de la

    endonucleasa, yasociada a lapolimerasa I restituyela porcin daada.

    endonucleasa

    ADN polimerasaexonucleasa

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    ARN

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    Generalidades

    Si bin es cierto, la herencia gentica est contenidaen la secuencia de desoxirribonucletidos del ADN,es a travs de las copias hechas en ARN, que estaherencia se expresa.

    El proceso de copia de cada cadena de ADN se llamatranscripcin. El mensaje de ARN es traducido ensecuencias de aminocidos o cadenaspolipeptdicas.

    Hay regiones del ADN que se transcriben, otras casi

    n, para ello existen seales en el ADN que indican ala polimerasa del ARN donde iniciar, cun a menudohacerlo y dnde terminar el proceso.

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    transcripcinADN

    GPPPAAA

    mARN

    tARNrARN

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    Clases de ARN

    ARN ribosomal: ( rARN) se encuentra comocomponente de los ribosomas. En las clulasprocariotes y en las mitocondriales de los eucariotesse encuentran las clases 23S, 16S y 5S. En lasclulas eucariotes estn las clases 28S, 18S, 5,8S y

    5S. ARN de transferencia: (tARN)es la ms pequea de

    las molculas de ARN (4S). Tiene entre 74 y 95nucletidos. Hay un tipo especfico de ARN por cadaaminocido. Corresponde al 15% del ARN celular.

    ARN mensajero: (mARN). Es el 5% del ARN celular.Trae la informacin gentica del ADN al citosol.Incluye una larga secuencia de nucletidos de laadenina (cola poli A) en el terminal 3, y una 7 metilguanosina en el terminal 5.

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    Transcripcin de genes en procariotes

    La ARN pol imerasasintetiza todos los ARN, salvo elinicial o pr imer, que es sintetizado por una primasa.

    La ARN pol imerasaes una enzima que reconoce lasecuencia de nucletidos al inicio del ADN que debe

    ser transcrito, hace una copia complementaria delADN, luego reconoce el final de la secuencia quedebe ser transcrita.

    El ARN es sintetizado del terminal 5a 3, en forma

    antiparalela al patrn de ADN. El producto es llamadotranscripcin primaria.

  • 7/25/2019 Estructura Sntesis Procesamiento y Metabolismo Acidos Nucleicos

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    Sntesis de ARN en procariotes

    5

    3

    3

    5

    35

    Factor sigma

    Factor Rho

    El factor Sigma marca el lugar de inicio de la transcripcin, la enzimacoresintetiza el ARN hasta que el Factor Rho marca el fin de latranscripcin.

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    Etapas en la sntesis de ARN en procariotes

    Inicial.- Unin de ARN polimerasa a la reginpromotora. sta se caracteriza por: Una secuencia llamada de consenso formada por 6

    nucletidos TATAAT situada 10 nucletidos antes del lugarde inicio de la transcripcin (-10).

    Una secuencia llamada 35 , con seis nucletidos

    TTGACA, situada a 35 bases a la izquierda de latranscripcin.

    Inic io d e

    transcr ipcin

    TATAATTTGACA

    Secuencia de consensoSecuencia -35

    -15 bases -10 bases

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    Etapas en la sntesis de ARN en procariotes

    Elongacin: Una vez reconocida la regin promotora,

    la ARN polimerasa inicia la transcripcin. La ARNpolimerasa no requiere pr imer, ni tampoco tieneactividad endo-exonucleasa por lo que no repara lassecuencias daadas.

    La ARN polimerasa utiliza ribonuclesidos trifosfato ylibera pirofosfato cada vez que se une un nucletido.

    Etapas en la sntesis

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    Etapas en la sntesisde ARN enprocariotes

    Terminacin.- El pro-ceso de elongacin dela cadena de ARNcontina hasta que unaseal de trmino sealcanza.

    En unos casosencuentra una protena

    llamada factor Rho conactividad ATPasa. En otros casos la trans-

    cripcin debe poderformar un giro quelentifica a la ARN

    polimerasa y provocauna pausa.

    3~ACACGACTGNNNNNCAGTCGTAAAAT~5

    5~TGTGCTGACNNNNNGTCAGCATTTTA~3

    ADN

    Transcripcin

    ARN5~UGUGCUGACNNNNNGUCAGCAUUUUA~3

    NN NN NC= GA= UG= CU= AC= GG= C5~UGU AUUUUA~3

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    Transcripcin de genes en eucariotes

    La transcripcin de genes en eucariotes es algo mscomplicada que en procariotes.

    Adems de la ARN polimerasa reconociendo la reginpromotora e iniciando la sntesis de ARN, un nmerode factores complementarios de transcripcin se unena distintos sitios del ADN dentro y fuera de la reginpromotora, esto determina qu genes deben sertranscritos.

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    Clases de ARN polimerasas, en clulas eucariotes

    Hay tres tipos de ARN polimerasas en las clulas eucariotes: ARN polimerasa I: sintetiza los precursores de las ARN ribosomales

    (28S,18S y 5,8S)

    ARN polimerasa II: sintetiza precursores del ARN mensajero ytambin sintetiza el pequeo ARN nuclear. Promotores de genes clase II: una secuencia de ADN nucletidos casi

    idntica a la de la secuencia de cons ensose encuentra a 25 bases delinicio de transcripcin para la molcula de ARN mensajero; se le llama cajaTATA o caja Hogness. A 70 u 80 nucletidos del inicio de transcripcin seencuentra una segund a secuencia de consenso l lamada caja CAAT .Una de estas secuencias sirve de seal para el inicio de transcripcin enlas clulas eucariotes.

    Estimulantes de la regulacin gentica: Son secuencias de ADN queincrementan la velocidad de iniciacin de la transcripcin por la ARNpolimerasa II.

    ARN polimerasa III produce pequeos ARN, tipo 5S.

    SECUENCIAS RECONOCIDAS POR ARN POLIMERASA II

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    TATACAAT

    Secuenc ia de consenso

    Caja TATA o Caja HognessCaja CAAT

    40 bases 25 bases

    SECUENCIAS RECONOCIDAS POR ARN POLIMERASA IIINICIO

    Estimulante5 3Promotor Gene

    5 3Promotor Gene Estimulante

    Hasta 2000 pares de bases

    pueden separar el estimulantede la secuencia del gene.

    Estimulante arribadel gene

    Estimulante abajodel gene

    LOCALIZACIONES DEL ESTIMULANTE

    M difi i

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    ModificacionesPostranscripcionales

    Una transcripcin primaria es una copia delsegmento total de ADN entre el sitio de inicio y el detrmino.

    Esta transcripcin primaria es fragmentada porribonucleasas ARN ribosomal: es sintetizada como prerribosomal (45S).A partir de una sla molcula se fragmentan las formas 28S,18S y 5,8S .

    ARN transferencia: tambin se forma a partir de una slamolcula inicial, la que se fragmenta.

    Modificaciones Postranscripcionales

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    ADN

    ARN po l imerasa I

    28S 5,8S 18S

    45S PrerARN

    ARNasas

    28S 5,8S 18S

    Modificaciones Postranscripcionales

    Fragmentacin del ARNm

    RemocindeIntrones

    Fragmentos queinterrumpen la

    regin codificantedel transcripto

    Exones:Segmentoscodificantes

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    Modificaciones Postranscripcionales

    ARN mensajero: sintetizada por la ARN polimerasa II, latranscripcin primaria llamada ARNnh (ARN nuclear heterogneo). Normalmente sufre varias modificaciones talescomo: Casquete 5: el extremo se une a una 7 metil guanosina al

    terminal 5mediante la unin de tres cidos fosfricos, medianteuna guanilil transferasa.

    Cola poli A: muchos ARNm tienen una cadena de 40 a 200nucletidos de Adenina unidos al terminal 3. Generada por unapoli A polimerasa.

    Remocin de intrones: durante la maduracin del ARNm seeliminan los intrones que no participan de la sntesis proteica y seunen los exones que si forman el ARNm maduro y til, con laayuda de snRNAs (pequeos ncleos de partculas deribonucleoprotena).

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    Fuentes de informacin

    ALVARADO CARLOS. Repasando Bioqumica y Nutricin 2012Lima. 2da. Edicin.

    ROBERT MURRAY, VICTOR RODWELL, DAVID BENDER ANDKATHLEEN M. BOTHAM. Harper Illustrated Biochemistry 28th

    Edition. 2009

    MONTGOMERY, REX. Bioqumica: casos y texto. HarcourtBrace, 1999. 681 h. Madrid.

    Pgina web: http://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.php

    http://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.phphttp://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.phphttp://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.phphttp://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.phphttp://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.php
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