Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II...

44
Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties Dr. Marco Boks Dr. Bart Rutten

Transcript of Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II...

Page 1: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties

Dr. Marco Boks

Dr. Bart Rutten

Page 2: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Disclosure Bart Rutten

• Speaker fees received from: Lundbeck

• Positions held on Advisory Boards: No

• Grants and sponsoring: No

Page 3: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Disclosure Marco Boks

• Speaker fees received from: - Astra Zenica

- Lundbeck

• Positions held on Advisory Boards: - Geen

• Grants and sponsoring: - Geen

Page 4: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Stellingen

• 1. Alleen de DNA sequentie (i.e. genetische factoren) is overerfbaar

• 2. Het epigenetisch profiel van een individu is stabiel over de tijd

• 3. Epigenetische mechanismen medieren de persistentie van de invloeden van omgevingsinvloeden op phenotypes

Page 5: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie
Page 6: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Development of the number of citations including the term epigenetic.

Gräff J et al. Physiol Rev 2011;91:603-649

©2011 by American Physiological Society

Page 7: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Hersenen From epidemiology to neuroscience

Van Os, Kenis, Rutten. Nature. 2010

Page 8: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

DNA mutation

X

Genotype changed Phenotype changed

no DNA mutation

X

Genotype unchanged Phenotype changed

X

Genotype unchanged Phenotype unchanged

EPIGENETICS

Page 10: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Epigenetics & the environment = changes in phenotype and/or gene expression by

mechanisms other than changes in the DNA sequence itself

ENV

IRO

NM

ENT`

Page 11: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

I. blocks transcription factors

II. attracts gene repressing molecules

Pishva et al. Translational Neuroscience. 2012

DNA Methylation ↓Gene Transcription

promoter exon 1 exon 2

quantity

gene methyl

e.g. MeCP2, mutations in MeCP2 -> Rett syndrome *

MTHFR, DNMT1, DNMT3a, DNMT3b

Page 12: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Jirtle et al. NRG 2007

Agouti

ACATATACGCGCGCGCGCGCGCGATATATCTGTCAA

promoter exon 1 exon 2 Agouti-gen

Page 13: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Jirtle et al. NRG 2007

X

Identical genotype

X

Agouti

= methyl

pregnancy

Page 14: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

methyl administration

Postnatal environment

RNA of

glucocorticoid receptor

in hippocampus

promoter exon 1 exon 2

glucocorticoid receptor gene

methyl

Low maternal care

High maternal care

Page 15: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Glucocorticoid receptor mRNA expression Glucocorticoid receptor methylation

McGowan et al. Nature Neuroscience 2009

Epigenetics and childhood trauma in human brain

Page 16: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

DNA methylation in psychosis

Page 17: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Histone Tail Alterations

Tsankova et al. NRN 2007

Page 18: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Tsankova et al. NRN 2007

no stress

chronic stress

chronic stress chronic TCA

Social Stress

BDNF

BDNF

BDNF

bdnf bdnf

bdnf bdnf bdnf

bdnf bdnf bdnf

bdnf

gene protein

Hippocampus

Page 19: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Genes regulating chromatin & bipolar disorder?

Genetic variations in genes involved in H3K4 methylation show associations with bipolar disorder

Page 20: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Identical environment

Anyway et al. Science 2005 Jirtle et al. NRG 2007

F4

pregnant female

Transgenerational Epigenetics

Altered DNA methylation Several generations: Identical genetic sequence

Altered DNA methylation Altered phenotype

Page 21: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Theory: Heritability of acquired traits

Lamarckism

1920s, William McDougall: training rats in a maze

Offspring of trained rats >> offspring of non-trained rats

Jean-Baptiste Lamarck 1744 -1829

History repeating?

Page 22: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

DNA

RNA

Protein

promoter exon 1 exon 2

SNP/mutation

quantity quality

Cell functions

gene

Environment

EPIGENETIC

Inheritable

Page 23: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Working model

Paternal age

Nutrition

Maternal stress

Hypoxia

Rearing environment

Childhood trauma

Urban environment

Maternal infection Cannabis

Migration

Subclinical experiences

Prodromal state

Perinatal events

Rutten & Mill. Schiz Bull. 2009

Stress

Disorder

Page 24: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties

Deel II

Marco Boks

Bart Rutten

Page 25: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Stelling

Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam

Page 26: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

• Relatie met psychiatrische

aandoeningen

• Relatie met medicatie

• Omgevingsinvloed

• Quiz

Page 27: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Wat is interessant aan epigenetica?

• Erfelijk

• Omgeving

• Trans generationele leer effecten

• Belangrijk in ontwikkeling

• Beïnvloedbaar door medicatie en dieet

Page 28: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Uitdagingen

• Invloed leeftijd en geslacht

• Invloed van DNA sequence variatie

• Invloed van medicatie

• Weefsel type

Page 29: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Correlatie tussen bloed en brein voor methylation levels onder invloed van

leeftijd

Horvath et al. Genome Biology 2012 13:R97

Page 30: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Sample plot of methylation levels by genotype groups

Boks MP et al. The relationship of DNA methylation with age, gender and genotype in twins and

healthy controls. PLoS One. 2009.

Page 31: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Cis and Trans correlations between DNA methylation and gene expression

van Eijk KR, de Jong S, Boks MP, et alBMC Genomics. 2012 Nov 17;13(1):636.

Page 32: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Stelling

“Epigenetische” medicijnen zijn volop in ontwikkeling

Page 33: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

MPM Boks et al, Epigenetics, 2012

Page 34: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Boks MP, de Jong NM, Kas MJ, Vinkers CH, Fernandes C, Kahn RS, Mill J, Ophoff RA. Current status and future prospects for epigenetic psychopharmacology.

Epigenetics. 2012 Jan 1;7(1)

Page 35: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Stelling

De belangrijkste invloed op epigenetica is voor de geboorte

Page 36: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Omgevingsinvloed

• Prenatal nutrition

• Prenatal exposure to alcohol

• Other drugs of abuse

• Prenatal stress

• Maternal care

• Traumatic early life experiences

• Environmental enrichment

Page 37: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Kofink, Boks, Kas, Neuroscience and Biobehavioral Reviews, in press

Page 38: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Psychiatrische aandoeningen

• Depressie

• Autisme

• Schizofrenie

• Bipolaire stoornis

• Cocaïne afhankelijkheid

• Alcoholisme

• Alzheimer

Page 39: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie
Page 40: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Bunnik Angry Bird Epigenetics Award

• 12 stellingen

• Rechterhand omhoog is JUIST

• Bij fout antwoord gaan zitten

Page 41: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Vragen

• Er zijn meer dan 25 epigenetische mechanismen

• Honger voor de geboorte heeft effect op de epigenetische status van het kind

• Met de leeftijd neemt DNA methylatie af (alles wordt minder).

• Er zijn geen medicijnen die direct op DNA methylatie werken

Page 42: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

• Natriumvalproaat is een HDAC inhibitor

• DNA methylatie verlaagd de expressie van genen

Page 43: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

Vragen?

Page 44: Epigenetica Theorie en mogelijke implicaties...Epigenetica: theorie en mogelijke implicaties Deel II Marco Boks Bart Rutten Stelling Epigenetische veranderingen zijn zeldzaam •Relatie

[email protected]

Universiteit Maastricht

Bart Rutten [email protected]

UMC Utrecht

Marco Boks [email protected]