doc. dr. Ana Jerončić - genom.mefst.hrajeronci/LIS/Uvod u LIS_Final.pdf · LISa i za izvršavanje...
-
Upload
nguyenduong -
Category
Documents
-
view
224 -
download
3
Transcript of doc. dr. Ana Jerončić - genom.mefst.hrajeronci/LIS/Uvod u LIS_Final.pdf · LISa i za izvršavanje...
doc. dr. Ana Jerončić
Definirati pojmove i žargon LISa
Opisati važnost rječnika za funkcionalnost LISa i za izvršavanje laboratorijskih radnji
Identificirati funkcije LISa. ◦ Na koji su način funkcije LISa povezane s radnim
tokovima u kliničkom (CP) i patološkom (AP) laboratoriju
1. Međusobno povezani softver (programi) i hardver (sklopovlje)
- Omogućava obradu elektroničkih podataka
- Ima funkciju informacijskog managementa
2. Baza podataka koja uspostavlja i održava standardne definicije i procedure obrade informacija (Elevitch and Aller)
LIS arhitektura
LIS rječnici
(LIS dictionaries ili Maintenance tables)
Funkcije LISa u laboratorijskom radnom toku Klinički laboratorij (CP)
Anatomsko patološki “Anatomic pathology” (AP)
Softver – LIS aplikacija
Sustav za upravljanje bazom podataka (DBMS od database management system)
Operacijski sustav
Hardver (Sklopovlje)
Glavno računalo: • kontrolira sve funkcije LISa i transakcije • na njemu su sačuvani baza podataka i cjelokupni LIS softver Terminali: • Isključivo prikaz i unos podataka • PC se mogu povezati korištenjem emulacije terminala
Host-based arhitektura
PCijevi (klijenti) šalju zahtjeve snažnijim računalima (serverima) koji izvršavaju različite LIS funkcije Server baze podataka
-na njemu se nalazi baza podataka Ostali serveri provode točno određene poslove (“business logic”) – fax, printanje, sučelje Funkcije LIS aplikacije su raspodijeljene po svim klijentima i serverima
Klijent-server arhitektura
Mainframe/Host-based Klijent/Server
Tekstualno sučelje (samo komandna linija)
Ograničena fleksibilnost
Sigurnost je zadovoljavajuća
Održavanje i kontrola su centralizirani
Izvor kvara moguć u samo jednoj točki
Grafičko sučelje (GUI) Veća konfigurabilnost Veći rizici za sigurnost
(virusi, PC ulazi) Održavanje je
decentralizirano Potencijalni izvor kvara
u više točaka, no kvarovi su manje katastrofični
Pojam “tanki” klijent odnosi se na mrežu u kojoj se na uređaju (npr. PC) pokreće softverska aplikacija koja je relativno jednostavna (=“tanka”) i koja zahtjeva manje računalnih resursa (CPU i memorije) Aplikacijska logika izvršava se na klijentskom poslužitelju (serveru) Malo podsjeća na host-based/mainframe model (povezivanje preko srednjeg poslužitelja)
Troškovi hardvera i licenci
Izvor kvara za sve radne stanice koje su povezane na “tanki” poslužitelj nalazi se u jednoj točci
Ovisite o učinkovitosti dobavljačeve implementacije “tankog” klijenta
Nemogućnost izvedbe specijaliziranih funkcija na “tankoj” klijentovoj radnoj stanici: slike, glasovno prepoznavanje, …
Olakšana administracija
Korištenje više platformi (PC, Mac)
Manji zahtjevi za hardverom i troškovi
Udaljeni pristup
Manje internetskog prometa
LIS arhitektura
LIS rječnici
(LIS dictionaries ili Maintenance tables)
Funkcije LISa u laboratorijskom radnom toku Klinički laboratorij (CP)
Anatomsko patološki “Anatomic pathology” (AP)
DEFINICIJE!
Standardiziraju općevažeća pravila i procedure za imenovanje
Standardiziraju laboratorijsku terminologiju i definicije
Ograničavaju izbore u podatkovnim poljima da bi osigurali valjan unos podataka (npr. spol M/Ž)
Određuju sadržaj i format izvještaja (npr. jedinice mjerenja)
Definiraju pravila i izračune
Definicije testova i baterije testova
Radne liste za testove
“Rječnik” osoba (liječnici koji naručuju, patolozi, tehnolozi)
Sigurnost/različite razine pristupa za vrste korisnika
Lokacija bolesnika
Lokacija laboratorija
Vrste uzoraka
Histološki protokoli za bojanje tkiva (npr. Giemsa)
Sučelje analizatora/instrumenata
Autoverifikacijski parametri
Mnogi drugi…
Vrste rječnika u LISu APa velikim se dijelom preklapaju s LISom CPa, ali..
Radnje i tokovi podataka u AP laboratoriju se dosta razlikuju od kliničkog laboratorija
Rječnici za Vrstu (dijela) uzoraka [Part Type] kao i rječnici za Vrstu boje [Special Stain] analogni su definicijama testova u CP
Definicije tablica su kritične za uspješnu implementaciju LISa i zahtijevaju pažnju i planiranje
Neki rječnici moraju se izgrađivati u slijedu budući da njihovi pojmovi ovise o drugim rječnicima
Rječnici mogu biti pre-definirani, no važno je definirati tablice na način koji odgovara specifičnim zahtjevima vašeg laboratorija
Promjena u definicijama zahtjeva da se odgovarajuće tablice pažljivo osvježe i da se promjene testiraju prije upotrebe.
Sučelje – softver (aplikacije) i računalne veze koje omogućavaju prijenos elektroničkih poruka između inače nekompatibilnih sustava
Sučelja LISa su od kritične važnosti za uspjeh laboratorija (npr. izvještavanje rezultata, zaprimanje zahtjeva za testove, …)
Download=direktan prijenos identifikacijskog broja pacijenta i podataka o naručenom testu iz LISa na instrument
Upload=direktan prijenos rezultata natrag u LIS
Jednosmjernost vs. dvosmjernost – narudžbe vs. rezultati
Objava vs. Upit
Jedinstveni broj uzorka koji se nalazi na oznaci barkoda a koju generira LIS, povezuje narudžbu i rezultate i u analizatoru i u LISu
Drugi uređaji povezani s LISom:
Dobavljači LISa imaju “off-the-shelf” sučelja za većinu instrumenata koji se učestalo koriste
Instalacija novog sučelja ipak nije “plug and play”
Softver sučelja mora biti instaliran u LIS rječnike ◦ Definicija podataka i slijed koji se očekuje prema
radnjama iz relevantnog radnog lista ◦ Rigorozno testiranje i validacija prije korištenja i
uvijek kada se uvode promjene
Elektronički medicinski zapisi (EMR) / Klinički informacijski sustavi / Bolnički informacijski sustavi (BIS)
Prijem-Otpuštanje -Transfer (ADT) – registracija bolesnika
Sustav web portala Sustav liječničkih ordinacija Sustav za izdavanje računa Drugi LIS Drugo…
HL7 definira format (sintaksu, strukturu) ali ne i specifični sadržaj poruke
HL7 definira različite vrste poruka, kao što su narudžbe laboratorijskih testova, ADT bolesnika, drugi.
Poruku (npr. narudžba, rezultat) čine segmenti koji su izgrađeni od polja
OBX|1|NM|CK^CK|1|251
|U/L|30-220|H|||F||||||201006082152|
Specifikacije za HL7 sučelje LISa ne moraju odgovarati drugim sustavima/dobavljačima
Institucije mogu definirati prilagođene, mjesno-specifične segmente u HL7.
Translacijske tablice su nužne da bi se povezali različiti kodovi testova u različitim sustavima.
Razvoj sučelja zahtjeva suradnju između dobavljača sustava, laboratorijskog osoblja i osoblja koje podržava informacijski sustav
–testiranje, validacija i dokumentacija
Sustav koji usmjerava i prenosi poruke između različitih računalnih sustava
Smanjuje se broj pojedinačnih sučelja (point to point) potrebnih za višestruke sustave
Česti u zdravstvenim ustanovama
Poboljšava upravljanje sučeljima u kompleksnim okružjima ali je isto tako i potencijalni izvor kvara
LIS arhitektura
LIS rječnici
(LIS dictionaries ili Maintenance tables)
Funkcije LISa u laboratorijskom radnom toku Klinički laboratorij (CP)
Anatomsko patološki “Anatomic pathology” (AP)
Unos narudžbe i odabir testa
Sakupljanje uzoraka i označavanje
Zaprimanje i praćenje uzoraka
Zaprimanje elektroničke narudžbe iz EMR/BIS
–narudžbe za određeni test unose se u EMR (na temelju odabiru iz menija i EMR definicija). ◦ Narudžbe preko HL7 sučelja => LIS. ◦ Dizajn sučelja osigurava da se točna narudžba unose u
LIS na temelju uparivanja kodova za test ili prevođenja koda za test.
Zaprimanje narudžbe u papirnatom obrazcu ◦ Papirnati obrazac prati uzorak do laboratorija ◦ Osoblje unosi narudžbu u LIS, s odabirom testa prema
LIS rječnicima.
npr. Sakupljanje uzoraka za dokazivanje Phlebotomus-a (nazofaringalni brisevi) u stacionarnih bolesnika ◦ LIS pridružuje jedinstveni broj uzoraka i/ili
spremnika svakoj narudžbi
◦ LIS postavlja narudžbu na listu čekanja
◦ Lista ili oznake mogu usmjeriti tehničara na vrstu odgovarajućeg spremnika koji treba koristiti
◦ Tehničar koristi oznaku za uzorak koju je generirao LIS
Stacionarni bolesnici - kliničar uzorkuje uzorak (npr. STAT) ◦ Kliničar unosi narudžbu u EMR ili ispunjava papirnati
obrazac
◦ EMR ispisuje generičke oznake za uzorak u trenutku unosa narudžbe; LIS može ispisati oznake na odjelu
Ambulantni bolesnici ◦ Narudžbe preko sučelja – tehničar pristupa postojećim
narudžbama u LISu, ispisuje oznake i sakuplja uzorak
◦ Papirnate narudžbe – tehničar unosi narudžbu za određene testove u LIS, ispisuje oznake i sakuplja uzorke
Narudžbe testova zaprimljene preko sučelja s EMR ◦ Kada uzorak stigne u laboratorij, narudžbe već
postoje u LISu. ◦ Osoblje potvrđuje primanje uzorka u LISu i prihvaća
oznaku i narudžbe.
Papirnati zahtjevi ◦ Narudžbe ne postoje u LISu kada uzorak stigne ◦ Osoblje naručuje testove u LISu, ispisuje i
upotrebljava oznake.
Status uzorka u LISu: ◦ “zaprimljen” ili “u-labu”
LIS pridružuje uzorku jedinstveni pristupni broj.
Koristi se određena struktura brojeva da bi se razlikovalo različite klase uzoraka ◦ Npr. prema lokaciji, HS-11-123, CS-11-123
Više poduzoraka (dijelova jednog uzorka) vode se pod jednim pristupnim brojem
A unose se i ostali podatci iz narudžbe (liječnik, odjel)
Demografski podatci bolesnika mogu biti već uneseni u LIS preko ADT sučelja (registracija bolesnika)
Dvije vrste polja u LISu identificiraju svaki dio uzorka: ◦ Vrsta (dijela) uzorka [Part type]– odabire se iz rječnika;
kategorije vrsta uzoraka su npr. kolon, polip, …
◦ Opis (dijela) uzorka [Part description] – dodatni opis koji se prikazuje uz uzorak; u slobodnom tekstu npr. “veliki polip na kolonu na 50tom cm”
Vrsta (dijela) uzorka može biti povezana u LISu s histološkim protokolom ili vrstama boja.
LIS može ispisati oznaku uzorka s bar kodom
Status uzorka je osvježen, npr. “Pristupan”.
Raspodjela posla i priprema uzoraka
Provođenje testova i analiza
Interpretacija testova
Dodatno testiranje na temelju početnih rezultata
Unos rezultata
Mnogi testovi koji se naručuju u CP u stvarnosti se sastoje od baterije testova (3-6testova) npr. elektroliti Na, K, Cr, ….
LIS zapisuje narudžbe za individualne komponente testa.
LIS generira oznake s barkodom koje sadrže ID uzorka i koje su ključne za povezivanje preko sučelja instrumenta i praćenje uzorka
Narudžbe testova se usmjeravaju na odgovarajuće radne liste LISa (radne liste temeljene na LIS definicijama).
Testovi koji su provedeni na instrumentima povezanima preko sučelja s LISom imaju radne liste LISa povezane s rječnikom održavanja instrumenta i tako osiguravaju download na odgovarajući instrument.
Download podataka na instrument može biti posljedica različitih okidača: ◦ Zaprimanje narudžbe u LISu preko EMR sučelja ◦ Zaprimanje uzorka u laboratorije (praćeno u LISu)
Za višestruke testove (baterija testova), narudžbe se usmjeravaju u odgovarajuće LIS radne liste kojima tehničari pristupaju (ili ih ispisuju) da bi vidjeli listu radnji za taj “run”.
Za instrumente povezane preko sučelja: ◦ Softver instrumenta “učitava” broj uzorka s barkod-a i
provodi testove prema download-anoj narudžbi (iz LISa) koja je povezana s tim brojem uzorka
Rezultati se upload-aju natrag u LIS, povezani preko broja uzorka
Specifikacije sučelja koje dijele i LIS i softver instrumenta osiguravaju prijenos podataka u očekivanom slijedu i formatu
Radne liste LISa povezane s održavanjem instrumenta osiguravaju da se rezultati testa upisuju ispravno u LIS.
Za testove koji se provode manualno ili na uređajima/s analizatorom bez sučelja, tehničar unosi rezultate u radnu listu LISa koristeći LIS funkcije.
Ponekad je potrebno rezultatima pridružiti komentar ili fusnotu – slobodni tekst vs. kodirani obrasci iz LIS rječnika
Radne liste povezuju test ili bateriju testova s određenim
pravilom ili izračunom koji se treba primijeniti/provesti na početnim rezultatima npr. “anion gap”
Ponovno testiranje (reflex testing) – automatsko generiranje nove narudžbe za određeni test u LISu na temelju inicijalnih rezultata koji zadovoljavaju određene kriterije npr. titracija pozitivnih ANA screen-ova
Autoverifikacija – automatska finalna verifikacija rezultata u LISu iz automatiziranih instrumenata bez manualne intervencije
Kriteriji se temelje na algoritmima definiranim u LISu Rezultati dobiveni iz instrumenta (ili bilo koji podatci koji
se odnose na uzorak) a nalaze se izvan definiranih kriterija zadržavaju se za naknadni pregled.
Referentni (normalni) raspon Tehnički raspon testa (rezolucija) Raspon punjenja definiran za instrument Raspon kritičnih vrijednosti ili neki drugi
“verificirani” raspon određen u rječniku Delta provjere (razlika u vrijednostima za
pojedinog bolesnika) Kriteriji za prihvat ambulantnih vs. stacionarnih
bolesnika Kriteriji temeljeni na izvedenim rezultatima istog
testa (npr. RBC index) Kritične vrijednosti instrumenta
Softver koji funkcionira kao spona između LISa i instrumenta ◦ Obrada podataka prema unaprijed određenim
pravilima proizvođača instrumenta
- Autoverifikacija
- Ponavljanje testova (reflex testing) na temelju rezultata
- Automatska ispiranja/razrjeđenja, ponavljanja, …
- Drugi aspekti upravljanja instrumentom (upozorenja vezana uz održavanje instrumenta)
Glavne izlazne informacija LISa u fazi pripreme uzoraka ( tzv. “grossing”) su: ◦ Unos teksta u polje LISa “Gross Description”
◦ Označavanje sekcije tkiva u Histološkom modulu
◦ Osvježavanje statusa, npr. “Gross Complete”
Interakcije s LISom tijekom faze pripreme uzorka mogu uključiti: ◦ Identifikaciju barkoda uzorka
◦ Softver za prepoznavanje govora nužan za unos podataka
◦ Snimanje digitalnih slika i unos u LIS
LIS navodi slijed radnji u pripremi preparata ◦ Predefinirani protokoli za bojanje
◦ Histološki zapisi (logovi) koji definiraju radne liste za slučajeve i blokove
◦ Oznake rezova (+/- barkodovi) koje se temelje na podatcima unesenima u histološki modulu i definicijama protokola/bojanja
Specijalne boje poredane su na temelju pojmova iz LIS rječnika i pojavljuju se u određenim logovima (npr. -imunohistokemijski log) ◦
LIS kao rezultat daje “draft radnji” ◦ Predaje se patologu zajedno s preparatima u
papirnatom obliku
◦ Digitalni pregled sačuvan u LISu
Obrazac i sadržaj “drafta radnji” temelje se na konfiguraciji predloška (tamplate) u LISu ◦ Klinička informacija
◦ Opis preparata
◦ Izvještaj za smrznutu sekciju
◦ Sažeti prikaz prethodnih rezultata, na temelju pretrage baze podataka u LISu.
Unos konačne dijagnoze u LIS olakšan je: ◦ Unaprijed definiranim predlošcima, checklistama i
formatima
◦ Unosom kodiranog teksta – kratki kodovi koji pokreću automatsku pretragu rječnika i translacije u prošireni tekst
◦ Mogućnost konverzije govora u tekst
◦ Automatski unos računovodstvenih kodova i kodova dijagnoza, a na temelju definicija u rječniku
Nakon unosa dijagnoze, status se osvježava u “Final complete”
Patolozi mogu uređivati i uređuju slučajeve iz radne liste
Odjava podrazumijeva da se na formu stavlja elektronički potpis kojim se slučajevi zaključavaju i koji predstavlja konačnu verifikaciju u bazi podataka.
Generiranje i dostava laboratorijskih rezultata i izvješća o testovima
Izmjena, dopuna i sažimanje izvješća
Format papirnatog izvješća temelji se na podesivim predlošcima u LISu ◦ Ispis – redoviti automatski ispis ili na zahtjev ◦ Faksiranje – automatski ukoliko je broj faxa u rječniku
Za elektronička izvješća, izvješća putuju internetom, od LISa da sustava koji ih prima
Format i prikaz izvješća koja se prenose preko sučelja diktiran je dizajnom zaslona u sustavima koja ih primaju
Sučelja koja se temelje na PDF i RTF mogu sačuvati formatiranje ali drugi sustav ne mora prikladno sačuvati i podatke
Izvješće koje se ispisuje iz LISa mora jasno označiti ispravljene rezultate kao takve
Ispravljeni rezultati moraju ujedno uključiti originalni rezultat
Uobičajeno je da takvi rezultati ujedno sadrže dokumentaciju o osobi koja ih je ispravila te zapis o bilo kakvoj komunikaciji između osoblja ukoliko ju je bilo
Ispravljeno izvješće obično zamjeni prethodno izvješće u EMR (original se čuva u kontrolnom zapisu)
LIS identificira dopunjena i sažeta izvješća
Formati izvješća moraju se podesiti tako da je status o dopuni i sažimanju očigledan
U EMR novo izvješće zamjenjuje staro izvješće
Middleware
Sustavi za identifikaciju bolesnika uz postelju
Lab portal = Web-orijentirani rezultati i naručivanje
Upravljanje dokumentima
Praćenje uzoraka i arhiviranje
Integracija digitalnih slika
Prepoznavanje glasa
LIS rječnici postavljaju okvir za obradu informacija i radni tok
Radne liste i logovi (zapisi) određuju tok podataka i uzoraka u laboratoriju
LIS je ključan za upravljanje podatcima tijekom cijelog ciklusa laboratorijskih testiranja
Postoje bitne razlike u radnim tokovima CP i AP laboratorija