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Design, Synthese und Analyse
multivalenter Inhibitoren der Adhäsion
des Hämagglutinin H5 des
Vogelgrippe Virus
Dissertation
zur Erlangung des akademischen Grades
Doktor der Naturwissenschaften
der Fakultät für Mathematik, Informatik und Naturwissenschaften
der Universität Hamburg
vorgelegt von
Moritz Waldmann
aus Hildesheim
Hamburg 2013
„Turn on, tune in, drop out.”
Für meine Eltern.
Die praktischen Arbeiten wurden in der Zeit von April 2009 bis November 2012 am Institut für
Organische Chemie, Department Chemie der Universität Hamburg, Geschäftsführender Direktor Prof.
Dr. Christian Stark, durchgeführt.
Herrn Prof. Dr. Bernd Meyer danke ich für die interessante Themenstellung, sowie für die stets
freundliche und erbauende Unterstützung und die gewährten Freiheiten bei der Durchführung dieser
Arbeit.
Herrn Prof. Dr. Dr. h.c. Wittko Francke danke ich für die Übernahme des Zweitgutachtens dieser
Arbeit.
1. Gutachter: Prof. Dr. Bernd Meyer
2. Gutachter: Prof. Dr. Dr. h.c. Wittko Francke
Tag der Disputation: 03.05.2013
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1 Einleitung ........................................................................................................................................ 1
1.1 Kohlenhydrat Erkennung viraler Oberflächenproteine ........................................................... 1
1.2 Influenza Hämagglutinin ......................................................................................................... 2
1.3 Multivalenz in biologischen Systemen .................................................................................... 3
1.4 Multivalente Inhibitoren in der medizinischen Chemie .......................................................... 6
1.5 Glycokonjugate und Neoglycopeptide .................................................................................... 7
1.6 Inhibitoren des Influenza Hämagglutinin .............................................................................. 10
2 Zielsetzung .................................................................................................................................... 13
3 Ergebnisse und Diskussion ............................................................................................................ 14
3.1 Entwicklung der Leitstruktur ................................................................................................. 15
3.2 Synthetische Studien zur Darstellung der Leitstruktur I ....................................................... 19
3.3 Weiterentwicklung zu den in dieser Arbeit untersuchten Strukturen .................................... 26
3.4 Entwicklung der neuen Synthesestrategie ............................................................................. 31
3.5 Durchgeführte Synthesen ...................................................................................................... 33
3.5.1 Darstellung der core-Struktur ........................................................................................ 33
3.5.2 Darstellung des Neuraminsäurederivats ........................................................................ 34
3.5.3 Darstellung der Glycokonjugate 21-26 .......................................................................... 35
3.5.4 Darstellung der geschützten Liganden 27-32 ................................................................ 40
3.5.5 Entschützung der Liganden ........................................................................................... 46
3.6 Vorbereitende Untersuchungen ............................................................................................. 49
3.6.1 CD spektroskopische Analyse des Linkers ................................................................... 49
3.6.2 Untersuchung des kommerziell bezogenen Hämagglutinins ......................................... 50
Inhaltsverzeichnis
3.7 Analyse der dargestellten Verbindungen ............................................................................... 53
3.7.1 STD-NMR Experimente ................................................................................................ 53
3.7.2 SPR-Experimente .......................................................................................................... 69
3.7.3 STD NMR Experimente mit 41 und abschließende Diskussion ................................... 92
3.8 Synthetische Studien zur möglichen Erhöhung der Valenz der Liganden ............................ 95
4 Zusammenfassung ......................................................................................................................... 99
5 Summary ..................................................................................................................................... 101
6 Experimentalteil .......................................................................................................................... 103
6.1 Geräte, Software und Chemikalien ...................................................................................... 103
6.2 Handhabung des Hämagglutinins H5 .................................................................................. 105
6.3 NMR Experimente .............................................................................................................. 105
6.3.1 Akquisition der NMR Daten ....................................................................................... 105
6.3.2 Vorbereitung der Proben für die STD Messungen ...................................................... 106
6.3.3 Akquisition und Prozessierung der STD-NMR Daten ................................................ 106
6.3.4 Auswertung der STD-Daten ........................................................................................ 107
6.4 SPR-Experimente ................................................................................................................ 107
6.5 Allgemeine Arbeitsvorschriften .......................................................................................... 108
6.6 Durchgeführte Synthesen .................................................................................................... 112
7 Toxikologische Daten .................................................................................................................. 144
8 Literaturverzeichnis ..................................................................................................................... 147
9 Danksagung ................................................................................................................................. 153
10 Curriculum vitae ...................................................................................................................... 155
Abkürzungsverzeichnis
Abkürzungsverzeichnis
AAV Allgemeine Arbeitsvorschrift
AA amino acid
Ac Acetyl
Ac2O Essigsäureanhydrid
AcOH Essigsäure
Ala Alanin
aq aquotisch
Äq Äquivalent
Boc tert-Butyloxycarbonyl
Boc2O Di-tert-butyldicarbonat
CD Circulardichroismus
CMC critical micelle concentration
COSY correlated spectroscopy
CRD carbohydrate recognition domain
d Dublett
Da Dalton
DCC Dicyclohexylcarbodiimid
DCM Dichlormethan
DIC Di-iso-propylcarbodiimid
DIPEA N,N-Diisopropylethylamin
DLS dynamic light scattering
DMAP 4-(Dimethylamino)-pyridin
DMF N,N-Dimethylformamid
DMSO Dimethylsulfoxid
EDC N-(3-Dimethylaminopropyl)-N'-ethylcarbodiimidhydrochlorid
EE Ethylacetat
es excitation sculpting
ESI electron spray ionisation
FA Ameisensäure
Fmoc 9-Fluorenylmethoxycarbonyl
Gly Glycin
HATU 2-(1H-7-Azabenzotriazol-1-yl)-1,1,3,3-tetramethyluronium-
hexafluorophosphat
HPLC high performance liquid chromatography
HSQC heteronuclear single-quantum correlation
IC50 mittlere inhibitorische Konzentration
J Kopplungskonstante
KD thermodynamische Dissoziationskonstante
KI inhibitorische Konstante
Lys Lysin
m Multiplett
m/z Masse/Ladung
MD Molekulardynamik
Me Methyl
MeCN Acetonitril
Abkürzungsverzeichnis
MeOH Methanol
MS Massenspektrometrie
MTL mass transfer limitation
Neu5Ac Neuraminsäure
NHS N-Hydroxysuccinimid
NMM N-Methylmorpholin
NMP N-Methyl-2-pyrrolidon
NMR nuclear magnetic resonance
NOESY nuclear Overhauser enhancement and exchange spectroscopy
PAGE Polyacrylamid Gelelektrophorese
PDB protein data bank
PE Petrolether
PG protecting group
Pip Piperidin
Piv Pivaloyl
ppm parts per million
Pyr Pyridin
Rf Retentionsfaktor
rmsd root mean square deviation
RP reversed phase
RT Raumtemperatur
Rt Retentionszeit
RU response unit