DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

66
© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN 公共データベースを使い倒した 知のめぐりのよい生命科学研究 坊農 秀雅 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベース センター(DBCLS) [email protected]

description

「公共データベースを使い倒した知のめぐりのよい生命科学研究」

Transcript of DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

Page 1: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

公共データベースを使い倒した知のめぐりのよい生命科学研究

坊農 秀雅 情報・システム研究機構

ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)

[email protected]

Page 2: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

公共データベースとは?

•誰でも自由に使えるデータベース(DB)!

•世界中の研究者が協力して維持!•日本では「統合データベースプロジェクト」!

– NBDC DBCLS DDBJ を中心に多くの大学や研究機関が協力!

–安心してすぐに利用できるデータを提供!–公共DBとして外に出す際にデータを綺麗に

2

Page 3: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

• 2014年度から!•柏の葉キャンパス駅前のビル!•遺伝研DDBJ/CIBの隣のビル!

•「統合」なのに分割移転w!

•予算的、制度的な都合!•地理的に     と統合

3

DBCLS移転しました

Page 4: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

本日のトピック: 統合DBの

1. 現状 2. 活用法 3. 活用事例

1. 現状 2. 活用法 3. 活用事例

Page 5: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

3つの「センター」

• DDBJ: DNAデータアーカイブ!• DBCLS: データベース統合基盤技術開発!• NBDC: 戦略立案、funding

5

http://dbcls.rois.ac.jp/about

Page 6: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

NBDC

• Since 2011 (4年目)!

• http://biosciencedbc.jp/

6

Page 7: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

integbio.jp

7

Page 8: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

DBを探す(カタログ)

8

http://integbio.jp/dbcatalog/

Page 9: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

データを探す(横断検索)

9

http://biosciencedbc.jp/dbsearch/

Page 10: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

データを使う(アーカイブ)

10

http://dbarchive.biosciencedbc.jp/

Page 11: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

本日のトピック: 統合DBの

1. 現状 2. 活用法 3. 活用事例

Page 12: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

2. 統合DBの活用法•使い方動画!

–統合TV!

•文献!–新着論文レビュー・領域融合レビュー!

–PubMed+PMC!• Allie/colil/inMexes!

–OMIM+gene!• gendoo!

• DNA配列!–GGRNA/GGGenome!–DBCLS SRA!

•遺伝子発現!–発現目次!–RefEx!

• RDF!–togogenome!–togotable

12

Page 13: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

togotv(統合TV)•動画によるDBやツールのチュートリアル!

–各DBやツール名で検索!

•統合データベース講演会AJACSの動画も!• YouTubeにも!!

!

•約770の動画             (アップデート込)

13クリエイティブ・コモンズ 表示 2.1 日本

http://youtube.com/togotv

http://togotv.dbcls.jp/

Page 14: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN1414

NGS

Page 15: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN15

Page 16: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN1616

Page 17: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN17

Page 18: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

流行りのクラウド化!

18

Page 19: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN19

クラウド化とはいうものの…

謹告•統合TV作り手を募集しています!

–生命科学のDBやウェブツールに興味のある方!

–Camtasia studioというソフトウェアで作成!

–作成プロトコール: 「統合TVの作り方」!– http://togotv.dbcls.jp/20120220.html – http://togotv.dbcls.jp/20120221.html

–国立遺伝学研究所(三島市)まで来れる方(応相談)

Page 20: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN20大人気のサービス

Page 21: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

新着論文レビュー

21クリエイティブ・コモンズ 表示 2.1 日本

http://first.lifesciencedb.jp/

Page 22: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN22

http://leading.lifesciencedb.jp/

Page 23: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

Pubmed & PMC

23

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/?term=ALL%5Bfilter%5D

Page 24: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

Allie

24

http://allie.dbcls.jp/

Page 25: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN25

http://colil.dbcls.jp/

Page 26: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

inMeXes

26

http://docman.dbcls.jp/im/

Page 27: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

gendoo遺伝子、疾患について、関連する疾患、薬剤、臓器、生命現象などの特徴をキーワードでリスト表示するツール

27

http://gendoo.dbcls.jp/

Nakazato T et al. Nucl.Acids Res. (2009) 37, W166-W169

Page 28: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN28

Page 29: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

塩基配列データベース

29

INSDC!DDBJ/(EMBL)/GenBank

NCBI!RefSeq

TraceArchive

Sequence Read

Archive (SRA)

nr/nt Title:Nucleotide collection (nt) Description:The nucleotide collection consists of GenBank+EMBL+DDBJ+PDB+RefSeq sequences, but excludes EST, STS, GSS, WGS, TSA, patent sequences as well as phase 0, 1, and 2 HTGS sequences. The database is partially non-redundant.

http://www.insdc.org/Annotated sequences

Capillary reads

Next generation reads

Page 30: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

RefSeq• Reference Sequenceの略!

• NCBIが提供する配列解析に使うための文字通り "reference"(リファレンス)となるべき配列データベースのこと!

•その配列の多くは核酸配列データベースのDDBJやEMBL、GenBank由来であり、それらの中からもっとも代表としてふさわしい(参照の基準となる)ものが、目で見て選ばれている

30

Page 31: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

GGRNAあらゆるキーワードや 塩基配列・アミノ酸配列から遺伝子(RefSeqのmRNA+ncRNA)をGoogle のように検索できるウェブサーバ

31

http://ggrna.dbcls.jp/

Naito Y and Bono H Nucl.Acids Res. (2012), 40, W592-W596

Page 32: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN3232

GooGle ライクな Genome 検索エンジンhttp://GGGenome.dbcls.jp/

Genomeも検索できたらええなあ… やりましょう!!

Page 33: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN33

プローブも検索できたらええなあ… やりましょう!!Probe Search http://probe.dbcls.jp/

GGRNA GGGenomeへ

Page 34: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

SRA(Sequence Read Archive)• NGSのデータベース(除くヒト個人のデータ)!

• NCBI/EBI/DDBJによって維持管理!–DDBJではDRAとも呼称

34

NBDCヒトデータベース

http://humandbs.biosciencedbc.jp/

Image generated by http://sra.dbcls.jp/

Page 35: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN35

http://sra.dbcls.jp/

Page 36: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN36

http://sra.dbcls.jp/

Page 37: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN37

http://sra.dbcls.jp/

Page 38: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN38

http://sra.dbcls.jp/

Page 39: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN39

Page 40: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

遺伝子発現データベース• GEO(NCBI)とArrayExpress(EBI)!

–http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ –http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/

•かつてはCIBEX(DDBJ)も!

• RNAseqデータはこちらにも登録がある!–Transcriptome analysisとも!

•必要なデータを見つけづらい

40

Page 41: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

遺伝子発現目次

41

http://lifesciencedb.jp/geo/

Page 42: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN42 http://RefEx.dbcls.jp

Page 43: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN43

Page 44: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN44

Page 45: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

RDFによるDB統合

45

ゲノムの配列情報と多種多様なアノテーションデータを個別のオントロジー、データ変換プログラムを開発し RDF 形式にして統合

45

Slide from トーゴーの日シンポジウム2013 「データベース統合の実現に向けて2」 by 岡本忍 (DBCLS)

NCBI: BioProject/RefSeq -- 既存のリファレンス配列 DDBJ: Annotation pipeline/GTPS -- 新規ゲノム配列

ゲノム配列

UniProt: Protein functions and links Formats: GFF3, GTF, GVF, DAS, BED ... Tools: Cufflinks, BLAST, InterProt ...

アノテーション

NCBO: BioPortal, OBO (GO, SO ...) DBCLS: MEO, GMO, MCCV ...

オントロジー

INSDC, NCBI: SRA, GEODBCLS: RefEx, Kusarinoko GOLD, GSC: 環境メタデータBulk data: 文献, 画像 ...

実験・メタデータ

Page 46: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

Togogenome•生物種とゲノムに関連する多種多様な情報をセマンティック・ウェブ技術により集約し、ゲノム情報の統合的で新しい検索を実現したシステム

46

http://togogenome.org/

Page 47: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

TogoTable• EXCELなどの表形式データに記載されているバイオデータベースのID番号やアクセッション番号からアノテーション情報をネットワーク経由で取得し、元の表形式データに追加するウェブアプリケーション

47

http://togotable.dbcls.jp/

Page 48: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

祝! PDB record数10万越え• TogoTableによるDB紐付け→TogogenomeによるNGS readの可視化!?!

!

•参考!–塩基配列 171M records, 202G bases (DDBJ Rel.96)!

• http://www.ddbj.nig.ac.jp/breakdown_stats/dbgrowth-e.html

–遺伝子発現 50k experiments, 1.4M samples (Arrayexpress latest) http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/

48

Page 49: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

本日のトピック: 統合DBの

1. 現状 2. 活用法 3. 活用事例

Page 50: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

3. 統合DBの活用事例

A. ヒト疾患モデル化研究: パーキンソン病様のカイコ!

B. ブタ成熟脂肪細胞の脱分化機構の網羅的解析

50

Page 51: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

パーキンソン病• Parkinson’s disease(PD)!•神経変性疾患!•症状の進行に伴って血液中の尿酸量が減少!

–その理由はこれまで不明!

• PDモデル生物種:尿酸代謝系に異常を持つ変異体は未発見!–PDの症状に似た特徴があり、なおかつ尿酸代謝系に異常を持つカイコ変異体系統(op)

51

doi:10.1371/journal.pone.0069130.g001

Page 52: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

非モデル生物には!遺伝子機能アノテーションがない

52

Data source: ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-68/fasta/

「localBLASTで遺伝子対応表作成」http://bonohu.jp/blog/2013/07/25/

TBLASTX

11,285 IDs in B.mori !(5,854 H.sapiens transcript IDs)

B.mori H.sapiens E-value DescriptionKa00003 ENST00000373371 5e-16 solute carrier family 2 Ka00005 ENST00000394878 2e-21 ribosomal protein,

large P0Ka00006 ENST00000277541 2e-12 notch 1…… …… ……Conversion table

ないものは作ればいい → Kaiko functional annotation pipeline

Kaiko array

B.mori WT op50 Sequence

Ka00003 0.1 0.5 CAAATAA.

Ka00005 0.2 -1.2 TAGCGA.

Ka00006 0.3 1.0 GGCTTC.

…… …… ……

H.sapiens Sequence GOID

ENST00000373371 ATTGGCTGC..

ENST00000394878 ATGCCCAGG..

ENST00000277541 GCGCGTGT...

…… …… ……

Page 53: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

ヒトのIDに変換すると…•ヒトで使われているツールが利用可能!

–市販のパスウェイ解析ソフト KeyMolnet®を利用!• KeyMolnet®はUniProtIDを入力として受け付けるので、対応するそのIDをBiomartで付与!

–参考:「BioMartを使ってさまざまなIDの変換対応表を作成する」 http://togotv.dbcls.jp/20110927.html

53

B.mori Ensembl UniProt UniProt IDKa00003 ENST000003733 Q9NY64 GTR8_HUMANKa00005 ENST000003948Ka00006 ENST000002775 P46531 NOTC1_HUMAN…… …… …… ……

Page 54: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

研究者によるmanual curation!を経て…

54

Induced expression

Activation or direct binding

doi:10.1371/journal.pone.0069130.g002

Page 55: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

qPCR in wild-type & op mutant

•脂肪体(左)と精巣(右)

55

Rel

ativ

e Q

uant

ifica

tion

(RQ

)

Rel

ativ

e Q

uant

ifica

tion

(RQ

)

Tabunoki H, Ono H, Ode H, Ishikawa K, Kawana N, Banno Y, Shimada T, Nakamura Y, Yamamoto K, Satoh J, Bono H. PLOS ONE 8(7): e69130. (2013)!http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0069130

doi:10.1371/journal.pone.0069130.g002

Page 56: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

3. 統合DBの活用事例

A. ヒト疾患モデル化研究: パーキンソン病様のカイコ!

B. ブタ成熟脂肪細胞の脱分化機構の網羅的解析

56

Page 57: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

ブタ成熟脂肪細胞の脱分化機構の 網羅的解析

•日大生物資源科学部 加野浩一郎教授との共同研究!

•脱分化脂肪細胞(dedifferentiated fat cells: DFAT) vs 成熟脂肪細胞(mature adipocytes: MAs)

57

http://www.med.nihon-u.ac.jp/department/saisei/dfat.html より

Page 58: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

DFAT cells vs MAs

Ono H, Oki Y, Bono H, Kano K. Biochem Biophys Res Commun. (2011) 407, 562-7. doi: 10.1016/j.bbrc.2011.03.063.

58

Page 59: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

ブタをヒトに対応づける

59

Affy Porcine Affy HG U133-PLUS-2

Ensembl Transcript

Description

Ssc.26492.1.A1_at 1553137_s_at ENST00000305883 Kruppel-like factor 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:11811]

Ssc.27622.1.S1_at 1553137_s_at ENST00000305883 Kruppel-like factor 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:11811]

Ssc.9136.1.S1_at 1554283_at ENST00000515616 CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) [Source:HGNC Symbol;Acc:14254]

Ssc.17478.1.A1_at 1558101_at ENST00000403491 nuclear factor I/A [Source:HGNC Symbol;Acc:7784]

Ssc.22678.1.S1_at 1558101_at ENST00000403491 nuclear factor I/A [Source:HGNC Symbol;Acc:7784]

Ssc.23810.3.A1_at 1558101_at ENST00000403491 nuclear factor I/A [Source:HGNC Symbol;Acc:7784]

Ssc.9986.1.A1_at 1558101_at ENST00000403491 nuclear factor I/A [Source:HGNC Symbol;Acc:7784]

Ssc.17286.1.A1_at 201236_s_at ENST00000290551 BTG family, member 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:1131]

Ssc.9707.1.A1_at 201236_s_at ENST00000290551 BTG family, member 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:1131]

Ssc.22550.1.A1_at 201465_s_at ENST00000371222 jun proto-oncogene [Source:HGNC Symbol;Acc:6204]

Ssc.9075.1.A1_at 201465_s_at ENST00000371222 jun proto-oncogene [Source:HGNC Symbol;Acc:6204]

Ssc.3411.1.A1_at 201531_at ENST00000248673 zinc finger protein 36, C3H type, homolog (mouse) [Source:HGNC Symbol;Acc:12862]

Ssc.16460.1.S1_at 201693_s_at ENST00000239938 early growth response 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:3238]

Ssc.19629.1.A1_at 201693_s_at ENST00000239938 early growth response 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:3238]

Ssc.19629.2.S1_s_at 201693_s_at ENST00000239938 early growth response 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:3238]

.... .... .... ....

ブタのマイクロアレイデータをヒトに外挿!⇒ ヒトのマイクロアレイ解析ツールが利用可能に!!

Page 60: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

対応付けの詳細• BLASTを自分でやる方法!

• biomartを使う方法!–「BioMartを使って二つの生物種の対応するデータを取得する」 http://togotv.dbcls.jp/20120628.html !

–「BioMartを使ってさまざまなIDの変換対応表を作成する」 http://togotv.dbcls.jp/20110927.html

60

Page 61: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

During MA dedifferentiation• 308 down-regulated genes!• 368 up-regulated genes

61

Data analyzed with Ingenuity Pathways Analysis(IPA)

Page 62: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN62

Page 63: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

詳細な手順は統合TVに•「DAVIDを使ってマイクロアレイデータを解析する」 http://togotv.dbcls.jp/20120927.html!

•「DAVIDの使い方 実践編」      http://togotv.dbcls.jp/20130528.html

63

Affymetrix webinarにも…

http://bit.ly/bonoaffywebinar

Page 64: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

同じプラットフォームなら 別グループのデータも比較可能

• NCBI GEOの同じプラットフォームで検索!–GSE15472 “Induced

Pluripotent Stem Cells from the Pig Somatic Cells”!

•自分のデータと混ぜて正規化+クラスタリング

64

•統合TVの「発現制御解析」!• http://togotv.dbcls.jp/ja/contents/category/expression

Page 65: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN

結論: それ、統合TVでできるよ• Local BLASTの使い方!

–Windows http://togotv.dbcls.jp/20110119.html !•導入・準備編 !

•検索実行・オプション編!

–MacOSX http://togotv.dbcls.jp/20110420.html !•導入・準備編!•検索実行・オプション編!

–AJACS名古屋 http://motdb.dbcls.jp/?AJACS32%2Fbono

 65

Page 66: DDBJing on 20140612 by Hidemasa Bono

© 2014 DBCLS Licensed under CC BY 2.1JAPAN66

募集

謹告•統合TV作り手!

–三島エリアで一緒にコンテンツ作成してくれる人!•インターン ‒公共DBを使い倒した大規模データ解析を一緒に ‒単なるデータ解析でなく、統合TVの新しいコンテンツとなるような解析事例を「共同研究」で

‒大学院生や若手のポスドクを想定 ‒「解析請負」ではなく、「解析技術教育請負」 ‒2014年夏にDBCLSのスペースが出来てから…