Consola Script. Significa NewVar = 1, esto es el valor 1 es guardado en la memoria como NewVar Luego...
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Transcript of Consola Script. Significa NewVar = 1, esto es el valor 1 es guardado en la memoria como NewVar Luego...
Consola
Script
Significa NewVar = 1, esto es el valor 1 es guardado en la memoria como NewVar
Luego de escribir NewVar se oprime la tecla ENTER
Entre comillas “ “
Significa que el valor de CharVar es justamente “Gene1”
tabla de datos
númerica carácter
Este ejemplo interprételo de la siguiente manera: hay 8 individuos (una muestra), y en un determinado sitio del genoma se “midió” el par de bases de nucleótidos
Esta función summary( ) realiza el cálculo de las frecuencias para cada nivel.
Como podemos observar, la entrada de la función matrix ( ) es un vector conteniendo los elementos de la matriz, empezando por la esquina izquierda para formar la primera columna de ocho filas, y luego empezando nuevamente otra vez desde arriba para completar la segunda columna. El número de filas está especificado por la instrucción nrow = 8
Se ha formado la misma matriz “uniendo” los vectores columnas x1 y x2.
Indica que es efectivamente una matriz de caracteres
Indica que la entrada (1, 2), primera fila y segunda columna, es el par “GC” recalcando que se encuentra en la segunda columna llamada x2
Indica que la matriz X es esencialmente un vector de longitud 16, y conserva las posiciones donde los primeros 8 elementos corresponden a la primera columna y los 8 restantes a la segunda columna
Esta función entrega las dimensiones de la matriz y los nombre de filas y columna. En este caso no tienen nombre las filas de esta matriz y sí para las columnas.
Cada atributo puede imprimirse separadamente, por ejemplo
Una gran tabla de datos en el Internet
Indica que en la primera fila del archivo de texto está el nombre de la variable
Indica que en la primera fila del archivo de texto son datos
Indica que los datos están delimitados por por tabulación (tab)
Indica que los datos están separados por columnas
Indica que los datos están separados por uno o más espacios
Sitio donde se encuentra el archivo llamado FMS_data.txt en el Internet
Renombramiento y configuración de los datos para su lectura
En el script
En la consola del R
single-nucleotide polymorphisms
La función que construye una tabla de datos
Observemos que podemos “aislar” los datos por columna con la instrucción $ seguido del nombre de la columna
Bajo contexto, trabajando con esa tabla de datos y para citar a la columna “rapiodamente, usamos la instrucción
… luego llamamos a las diferentes columnas de la tabla mediante su nombre
Recuerde que está “adjuntado” la tabla Datamuestra, y por eso utilizamos solo los nombres de las columnas
Observe las diferentes maneras de obtener el porcentaje del género
Observe el paso de codificación de caracteres a codificación numérica, en este caso 1 = mujer y 0 = hombre
Esta instrucción considera la segunda y cuarta columna
Esta instrucción “condiciona” solo los valores para el género mujer
Esta instrucción considera solo la tercera fila
Esta instrucción considera solo la cuarta columna