Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

15
Chapter 25: Chapter 25: Reconstructing and Using Reconstructing and Using Phylogenies Phylogenies

description

Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies. Begrepp. Stamegenskap (ancestral trait): egenskap ärvd av förfader Homologa egenskaper: egenskaper som besläktade arter har ärvt av samma stamfader (t.ex. Människans naglar och kattens klor) - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Page 1: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Chapter 25: Reconstructing Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogeniesand Using Phylogenies

Page 2: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies
Page 3: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies
Page 4: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

BegreppBegrepp Stamegenskap Stamegenskap (ancestral trait):(ancestral trait):

egenskap ärvd av förfaderegenskap ärvd av förfader Homologa egenskaper:Homologa egenskaper: egenskaper som egenskaper som

besläktade arter har ärvt av samma stamfader besläktade arter har ärvt av samma stamfader (t.ex. Människans naglar och kattens klor)(t.ex. Människans naglar och kattens klor)

””Derived trait”Derived trait” (ung. avledd egenskap): (ung. avledd egenskap): egenskap som skiljer sig från stamfadernegenskap som skiljer sig från stamfadern

Om en egenskap är en stamegenskap eller en Om en egenskap är en stamegenskap eller en avledd egenskap är beroende av vilken avledd egenskap är beroende av vilken stamfader man relaterar till, d.v.s. en avledd stamfader man relaterar till, d.v.s. en avledd egenskap i en stor grupp kan vara en egenskap i en stor grupp kan vara en stamegenskap i en delgrupp.stamegenskap i en delgrupp.

Page 5: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Figure 25.2 Figure 25.2 The Bones Are Homologous, but the Wings Are NotThe Bones Are Homologous, but the Wings Are Not

Page 6: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

BegreppBegrepp

Konvergent evolution: Konvergent evolution: liknande egenskaper har liknande egenskaper har utvecklats flera gånger självständigtutvecklats flera gånger självständigtT.ex. Bläckfiskens och människans ögaT.ex. Bläckfiskens och människans öga

Evolutionary reversal Evolutionary reversal (ung. Evolutionell (ung. Evolutionell tillbakagång): en egenskap som gått förlorad tillbakagång): en egenskap som gått förlorad återutvecklas eller en egenskap som utvecklats återutvecklas eller en egenskap som utvecklats går tillbakagår tillbaka

De två ovanstående är exempel på De två ovanstående är exempel på homoplasihomoplasi: : egenskaper som liknar varandra har inte samma egenskaper som liknar varandra har inte samma ursprung (ursprung (homoplastiska egenskaperhomoplastiska egenskaper).).

Page 7: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

BegreppBegrepp

ingruppingrupp: den grupp arter man undersöker: den grupp arter man undersöker utgrupputgrupp: en besläktad grupp : en besläktad grupp

Man kan undersöka vilka av ”ingruppens” Man kan undersöka vilka av ”ingruppens” egenskaper som är avledda genom att jämföra egenskaper som är avledda genom att jämföra ”ingrupp” med ”utgrupps”. Om egenskapen ”ingrupp” med ”utgrupps”. Om egenskapen saknas i närbesläktade grupper är den saknas i närbesläktade grupper är den antagligen avledd (m.a.o. har utvecklats efter att antagligen avledd (m.a.o. har utvecklats efter att utvecklingslinjerna separerat).utvecklingslinjerna separerat).

Page 8: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies
Page 9: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Att rekonstruera ett Att rekonstruera ett fylogenetiskt trädfylogenetiskt träd

Steg 1. Välj målet för undersökningen (ingrupp) Steg 1. Välj målet för undersökningen (ingrupp) och referensgrupp (utgrupp)och referensgrupp (utgrupp)

Steg 2. Välj vilka egenskaper som ska analyserasSteg 2. Välj vilka egenskaper som ska analyseras

Steg 3. Ta reda på vilka av egenskaperna som är Steg 3. Ta reda på vilka av egenskaperna som är stamegenskaper och vilka som är avledda.stamegenskaper och vilka som är avledda.

Steg 4. Konstruera utvecklingslinjer och använd Steg 4. Konstruera utvecklingslinjer och använd dem för att särskilja homologa egenskaper från dem för att särskilja homologa egenskaper från homoplastiskahomoplastiska

Upprepa steg 2-4 för flera olika egenskaper och Upprepa steg 2-4 för flera olika egenskaper och jämför resultaten.jämför resultaten.

Page 10: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Hurdana egenskaper kan man Hurdana egenskaper kan man studera?studera?

Anatomi/morfologiAnatomi/morfologi IndividutvecklingIndividutveckling FysiologiFysiologi BeteendeBeteende Molekylstruktur (protein-, DNA-sekvenser)Molekylstruktur (protein-, DNA-sekvenser)

Egenskaper som kan studeras också i fossil är Egenskaper som kan studeras också i fossil är att föredra.att föredra.

Page 11: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies
Page 12: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Figure 25.5 Figure 25.5 A Probable A Probable Phylogeny of Eight Phylogeny of Eight

Vertebrates Vertebrates

Page 13: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

Linnés hierarkiska systemLinnés hierarkiska system

RikeRike - - prokaryoter, protister, svampar, prokaryoter, protister, svampar, växter, djurväxter, djur

PhylumPhylum

KlassKlass

OrdningOrdning

FamiljFamilj

SläkteSläkte

ArtArt

bildar artnamnet (binär nomenklatur)T.ex. Canis lupus

Taxon: grupp oberoende av rang

Page 14: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies

BegreppBegreppMonofyletisk grupp: en grupp som består av alla organismer med gemensam stamfaderMonofyletisk grupp: en grupp som består av alla organismer med gemensam stamfader

Polyfyletisk grupp: en grupp som inte delar en gemensam stamfaderPolyfyletisk grupp: en grupp som inte delar en gemensam stamfader

Parafyletisk grupp: en grupp som består av en del, men inte alla organismer med gemensam stamfaderParafyletisk grupp: en grupp som består av en del, men inte alla organismer med gemensam stamfader

Page 15: Chapter 25: Reconstructing and Using Phylogenies