生命科学领域常用资源分享 - CAS · 写作投稿以及共享。...
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生命科学领域常用资源分享 中国科学院文献情报中心 用户服务与知识传播中心 巩玥
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生命科学领域常用资源分享
中国科学院文献情报中心用户服务与知识传播中心
巩玥
内容
生命科学领域常用资源
文献中心资源与服务
一、生命科学领域重要文献数据库资源介绍
二、生命科学领域重要信息资源获取
生命科学领域常用资源
Unique
Data
独特的数据
Quality
质量
• Web of science 只收录高质量的学术期刊
•与100年来的学术引文回溯数据构成了其数据的独特性，
揭示概念与技术的发展过程
1.Web of Science
Diversity
广度Depth
深度
期刊引用报告JCR• 以定量的方式了解全球的学术期刊在本学术期刊相应领域中的影响力。
• 描述指标：影响因子、总被引次数、被引半衰期或期刊名称。
采用视图页脚填写课件名称
采用视图页脚填写课件名称
基本科学指标ESI：• 基于22个学科的全球总影响力（总被引次数）分析，筛选出进入全球前1%的科学
家、研究机构以及进入全球前50%的国家和学术期刊。
• 描述指标：文献量、篇均被引次数、总被引次数、高影响力论文数。揭示不同国
家、机构学科发展优势比较。
2. PubMedPubMed系统是由National Library of Medicine的国家生物技
术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMEDLINE数
据库的网上检索系统。
从1997年6月起，PubMed在网上免费向用户开放。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
PMC是美国国立卫生研究院提供的一项服务，存档生物医学，
生命科学科研文献，PMC获得NLM(National Library of Medicine)的授
权，收录存档生物/医学文献，以电子副本的形式储存。PMC与2000
年2月份启动,目前由 NCBI ( NLM’s National Center for Biotechnology
Information )负责开发与维护。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
3.CSHL美国冷泉港实验室Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL)是生命
科学领域国际著名的研究机构，也是国际生命科学的会议中
心与培训基地。名列世界上影响最大的十大研究学院榜首，
被称为世界生命科学的圣地与分子生物学的摇篮。
http://www.cshlpress.com/
1、Genes & Development《基因与发展》
2、Genome Research《基因组研究》
3、Learning & Memory《学习与记忆》
4、RNA《核糖核酸》
5、Perspectives in Biology 《生物学进展》
6、Perspectives in Medicine 《医学进展》
7、CSH Protocols《冷泉港实验室实验方案指南》
BioMed Central（以下简称BMC）是生物医学领域的一家独
立的新型出版社，以出版网络版期刊为主，目前出版237种生物
学和医学领域的期刊，少量期刊同时出版印刷版。BMC出版社
在BMC网站免费为读者提供信息服务，其出版的网络版期刊可
供世界各国的读者免费检索、阅读和下载全文。Genome
Biology影响因子最高（10.810）。
BMC出版的期刊学科范围涵盖了生物学和医学的所有主要
领域，包括：麻醉学、生物化学、生物信息学、生物技术等57
个分支学科。
4.BioMed Central
http://www.biomedcentral.com/
5.Faculty of 1000
Faculty of 1000是由BioMed Central出版的新型在线研究辅
助工具，由超过4000d位专家学者评议，提供目前世界
上最重要的生物和医学论文信息及研究趋势。
Faculty of 1000分为生物和医学两部分，收录的是顶级专家
或临床研究人员推荐的文章，并附有推荐评述。按研究
领域分为44类，生物24类，医学20类。
http://f1000.com/
主页
F1000支持的工作
空间，帮助科研人
员收集整理文章、
写作投稿以及共享。
生命科学的开放获取
数据库
F1000 Prime获取最新同行评议
Recommendations 论文评价（订购）
-Rankings 排名（免费）
-F1000 Prime Reviews同行评议报告（免费）
6.PLOS
公共科学图书馆（ the Public Library of Science， PLOS）创立于2000
年10月，由众多诺贝尔奖得主和慈善机构支持的非赢利性学术组织，旨
在推广世界各地的科学和医学领域的最新研究成果。PLoS出版了7种生
命科学与医学领域的开放获取期刊，可以免费获取全文，比较具有影响
力Plos系列的期刊目前都已被SCI收录。
http://www.plos.org/
7.Annual ReviewsAnnual Reviews系列期刊涉及生物学、医学、物理学和社会科学领
域，通过各学科领域权威科学家撰写的综述，回顾本学科最前沿的
进展，为科学研究提供方向性指导。Annual Reviews系列期刊的影响
因子很高，几乎所有期刊在其相应领域均排名前十位。
http://www.annualreviews.org/action/showJournals
8. 学协会期刊
• American Institute of Biological Sciences(AIBS)：美国生物科学研究所，1种刊
• American Society for biochemistry and molecular biology ：美国生化与分子学会，3种刊
• Genetics Society of America (GSA)：美国遗传学学会（会议预报，项目资助、项目信息）
• Royal Society of Medicine (RSM)：英国皇家药学会
9.其他重要数据库
Springer、Elsevier、PQDT-B/ PQDT全文、CNKI
二、生命科学领域重要信息资源获取
1.文献信息
Journal article—了解国内外最新进展，实验技术与方法
Review—了解某一领域的发展概貌、研究背景
Meeting/proceedings—了解最新进展
Patent—了解最新技术
Protocol—了解实验操作方法
2. 核酸信息获取
主要来源：
美国生物技术信息中心: GenBank
欧洲分子生物学实验室: EMBL-Bank
日本遗传研究所: DDBJDDBJ
Japan
GenBank
USA
EMBL
Europe
3. 蛋白质信息获取主要来源
美国生物医学基金会：PIR
Geneva大学和欧洲生物信息学研究所：SWISS-PROT
计算机注释的蛋白质数据库：TrEMBL
欧洲生物信息学研究所: UniProt SW
ISS
PR
OT
PIR
TrE
MB
L
Un
ipro
t
4.生物大分子结构信息获取
美国Brookhaven实验室: PDB(Protein Data Bank）
美国生物技术信息中心: MMDB(Molecular Modeling Database)
5.模式生物基因组信息获取酵母基因组http://www.yeastgenome.org/
拟南芥基因组http://www.arabidopsis.org/
曲霉基因组http://www.aspgd.org/
四膜虫基因组http://ciliate.org/
玉米基因组http://www.maizegdb.org/
水稻基因组http://www.gramene.org/
人类基因组http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/human/
老鼠基因组http://www.informatics.jax.org/
茄科基因组http://solanaceae.plantbiology.msu.edu/
斑马鱼基因组http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/guide/zebrafish/
果蝇基因组http://www.fruitfly.org/
6.生物论坛/博客
8.基金信息
类别：Award/grant 已经资助， Funding 将要资助
美国：NSF，NIH，ARS，DOE
中国：国家基金委、科学网、科技部
其他国家：
加拿大卫生研究院（CIHR）
德国科学基金（DFG)
英国生物技术与生物学研究理事会基金 http://www.bbsrc.ac.uk/funding/
其他方式：web of science、CSA--COS Funding Opportunities
9.重要研究机构
德国马普学会（http://www.mpg.de/）
英国John innes Center（https://www.jic.ac.uk/）
欧洲生物信息研究所（http://www.ebi.ac.uk/）
新加坡生物信息中心（http://www.bic.nus.edu.sg/）
10.jobs
• AcademicTransfer（https://www.academictransfer.com/）
• Science Careers
（http://jobs.sciencecareers.org/）
• Nature jobs（ https://www.nature.com/naturejobs/science/）
• Newscientist jobs （https://jobs.newscientist.com/）
Academic Transfer
https://www.academictransfer.com/
1997年成立，由荷兰的三大组织倡导组成：
VSNU, Association of Universities in the Netherlands
NFU, Dutch Federation of University Medical Centers
WVOI, Employers Association of Research Institutions
招聘：
PhD positions
research and post-doctoral positions
job openings for assistant, associate and full professors
Academic Transfer
https://www.academictransfer.com/
1997年成立，由荷兰的三大组织倡导组成：
VSNU, Association of Universities in the Netherlands
NFU, Dutch Federation of University Medical Centers
WVOI, Employers Association of Research Institutions
招聘：
PhD positions
research and post-doctoral positions
job openings for assistant, associate and full professors
Science Careers
• http://jobs.sciencecareers.org/
• AAAS: American Association for the Advancement of Science
• 信息服务：
Science Careers
• http://jobs.sciencecareers.org/
• AAAS: American Association for the Advancement of Science
• 信息服务：
Nature jobs
https://www.nature.com/naturejobs/science/
Naturejobs is the world’s largest dedicated
science jobs board.
Naturejobs helps serve the recruitment needs
of a wide range of science employers,
including universities, research institutes,
government departments and pharmaceutical
companies.
招聘：硕士、博士、博后、助研、教授等
Nature jobs
https://www.nature.com/naturejobs/science/
Naturejobs is the world’s largest dedicated
science jobs board.
Naturejobs helps serve the recruitment needs
of a wide range of science employers,
including universities, research institutes,
government departments and pharmaceutical
companies.
招聘：硕士、博士、博后、助研、教授等
Newscientist jobs
https://jobs.newscientist.com/
online resource for the best jobs, careers advice and candidates
是锐德商讯(Reed Business Information ) 的产品之一。
覆盖：欧美、亚非、中东地区
信息：jobs、studentships AND courses
Newscientist jobs
https://jobs.newscientist.com/
online resource for the best jobs, careers advice and candidates
是锐德商讯(Reed Business Information ) 的产品之一。
覆盖：欧美、亚非、中东地区
信息：jobs、studentships AND courses
其他重要网站
• 学会和期刊：
–美国细胞生物学会（http://www.cellbiologyjobs.org/）
–美国实验生物学会联合会（http://www.faseb.org/）
• 著名学院、大学和研究院所
–马普研究所(https://www.mpg.de/career )
• 其他综合信息：
–http://www.jobs.ac.uk/
–http://www.phdpositionswetsus.eu/research-projects
–博士后之家 http://www.zsr.cc/postdochome/index.html
–基金委、BBS
其他重要网站
• 学会和期刊：
–美国细胞生物学会（http://www.cellbiologyjobs.org/）
–美国实验生物学会联合会（http://www.faseb.org/）
• 著名学院、大学和研究院所
–马普研究所(https://www.mpg.de/career )
• 其他综合信息：
–http://www.jobs.ac.uk/
–http://www.phdpositionswetsus.eu/research-projects
–博士后之家 http://www.zsr.cc/postdochome/index.html
–基金委、BBS
11.实验方法
Springer protocls
• Springer Protocols是当今世界最大的生物医学和生命科学实验指南数据库。
• 该数据库包括众多经典文献，比如由John M. Walker博士编撰的《Methods in Molecular Biology》》(IF 13.9)全套系列丛书。
• 每周更新内容，目前22250条，每年增加2000条。
Springer protocls
• 标准化，可再现的实验指南
• 操作步骤、原料清单、注释提醒
–背景资料
–材料、仪器
–实验方法
–实例参考
–技巧提示
–疑难解决方案
–来源文献
1
2
3
4
5
• Nature methods
–顶级期刊，炫酷、前沿的新方法
• Nature protocols
–IF 9.646，内容补充springer protocols和nature methods的很多遗漏点
• Wiley Current Protocols
• Cold Spring Harbor Protocols
1 Massachusetts Institute of Technology (MIT) US
2 University of Cambridge UK
3= Harvard University US
3= Stanford University US
5 University of Oxford UK
6 Yale University US
7 University of California, Berkeley (UCB) US
8 California Institute of Technology (Caltech) US
9 University of Tokyo Japan
10 Imperial College London UK
• https://ocw.mit.edu.
• http://www.extension.harvard.edu/open-learning-initiative
• http://itunes.stanford.edu/
• http://oyc.yale.edu/
• 其他综合来源：– 网易公开课: https://open.163.com/
– Open culture:
http://www.openculture.com/freeonlinecourses
一、文献情报中心的资源
二、文献情报中心的服务
文献情报中心资源服务
中国科学院文献情报中心（National Science Library，Chinese Academy of Sciences）
• 文献中心（原国家科学图书馆），主要提供文献信息保障、战略情报研究服务、公共信息服务平台支撑和科学交流与传播服务。
• 2006年起为中科院每个研究所配备一名学科馆员，推行面向研究所、实验室、课题组和个人的学科化服务。
中关村北四环西路33号（4号线中关村站附近）
文献情报中心主页
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资源与服务-常用数据库
Web of science(常用英文文献检索)
常用中文文献检索
镜像问题：http://bjvip.las.ac.cn/
文献情报中心服务
普遍服务
• 文献信息查找获取
• 普遍培训
• 参考咨询
知识服务
• 论文收引与科技查新
• 科技决策咨询
• 科研成果转化（专利、产品化）
• 学科发展态势分析
• 学科竞争情报研究
• 领域平台建设
• 其他定制化服务
• 中国科讯
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随地获取该IP段可获取的所有文献。
• 移动获取
• 定期推送
知识服务1. 论文收引：申报院士、基金、职称评定
2. 科技查新：成果鉴定、成果报奖、新产品开发与申报
3. 知识产权分析：专利布局、技术态势分析
4. 领域信息调研：国内外政策计划、项目研究跟踪
5. 学科态势、竞争力分析：前沿机构、竞争对手分析
6. 领域平台建设：为研究所、实验室、课题组等搭建定制
化的平台
7. 其他: 任何文献情报获取相关问题可随时联系学科馆员！
科技报告：2016科技前沿
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