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新型冠状病毒相关文献播报

北京诚济制药 市场部 2020年2月19日

第9集

2020年2月19日,共更新新型冠状病毒相关文献9篇 总 述

序号 文献题目

1 Challenges of coronavirus disease 2019

2 Discovery and development of safe-in-man broad-spectrum antiviral agents

3 Outbreak of coronavirus disease 2019

4 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and corona virus disease-2019

(COVID-19)_ the epidemic and the challenges

5 Timely research papers about COVID-19 in China

6 What are we doing in the dermatology outpatient department amidst the raging of 2019-nCoV_

7 Fast assessment of human receptor-binding capability of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)

8 The 2019-new coronavirus epidemic_ evidence for virus evolution

9 Therapeutic Drugs Targeting 2019-nCoV Main Protease by High-Throughput Screening

Challenges of coronavirus disease 2019

冠状病毒疾病的挑战2019

https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30072-4

文献1

截至2月12日,在25个国家/地区已报告了45204例2019年确诊的冠状病毒病(COVID-

19)和1116例死亡。大多数情况都发生在中国,尽管已通过关闭交通,隔离整个城市并强

制使用口罩来制止传播,国际航班已取消,受影响的游轮已被隔离。

尚不清楚严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS_x0002_CoV)-2爆发是否会如2003

年SARS-CoV那样继续发展,或是否会成为病毒性肺炎的地方性病因。

在国际上,我们已经看到迅速产生和共享知识以利于疫情应对,但一些国家也采取了

适得其反的行动,包括限制贸易和关闭边界,这对其不利。随着人畜共患性外溢导致人类

感染和传播的频率越来越高,大流行的防范工作显然已成为全球卫生议程的优先事项。

世界正在经历人畜共患起源的全球病毒流行

做好应对疫情的充分准备

成立柳叶刀传染病委员会 对新出现的流行威胁的准备情况。委员会将重新审查诸如《国际卫生条例》等协议所依据的全球备灾计划和假设。它旨在解决在应对和应对传染病暴发方面的新挑战。SARS-CoV-2爆发将与政治和体制,社会,环境,技术和病原体相关的这些挑战置于前沿。 中国在几天之内建立医院 没有其他国家能够以这种速度调动资源和人力。一月中旬,已经获得并共享了SARSCoV-2的全基因组序列,在以前的传染病暴发中,以这种速度不可能实现这一壮举。该顺序将允许对现有技术进行微调,并开发出更好的诊断方法和针对性疗法。积极研制疫苗,即使威胁级别下降,也要维护公共利益。 非洲卫生部门高度戒备 最破坏性的影响将发生在卫生系统薄弱,冲突不断或存在传染病流行的国家。非洲大陆与亚洲存在广泛的贸易和运输联系,在非洲疾病控制与预防中心和世界卫生组织的领导下,正在建立非洲筛查,隔离和治疗患者以及进行接触者追踪的能力。

勿信谣言,拒绝虚假信息

社交媒体和耸人听闻的报道正在挑战疫情应对工作。在社交媒体上传播的

错误信息和阴谋论已引起公众的恐慌和不信任,使人们的注意力从爆发反应中

转移开来,并阻碍了医护人员的活动。

世卫组织总干事特德罗斯·阿哈诺姆·盖布里亚索斯说,世卫组织正在采

取“四管齐下的办法”来应对虚假信息的传播,包括利用其世卫组织流行病信

息平台跟踪多种语言的错误信息,并与社交和数字公司(如Facebook)合作,

微博和Twitter过滤掉虚假信息。

Discovery and Development of Safe-in-man Broad-Spectrum Antiviral Agents

人用安全广谱抗病毒药物的发现与发展

International Journal of Infectious Diseases. S1201-9712(20)30076-X DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.02.018

文献2

在世界上,病毒特异性疫苗和抗病毒药物是对抗病毒性疾病最有力的工具。

然而,广谱抗病毒药物(BSAAs),即针对两个或多个病毒家族的病毒化合物

为普通民众提供额外保护,新出现的病毒性疾病加强了现有抗病毒药物的储备。

在这里,我们回顾了牛血清白蛋白的发现和发展,并总结了牛血清白蛋白的研

究进展。

未来和正在进行的临床前和临床研究将增加牛血清白蛋白的数量,扩大其适

应症的范围,并确定治疗新发和再发病毒感染及合并感染的药物组合。

摘要

病毒是世界上主要的发病和死亡原因之一。抗病毒药物和疫苗被用来对抗

人类的病毒感染。以前,人们关注的焦点是药物,它依赖于针对病毒的特异

性因子。一个与此相对应的是“一种药物,多种病毒”范式,它伴随着广谱

抗病毒药物(BSAAs)发现多种人类病毒。这种范式是基于病毒利用相似的

途径和宿主因子在细胞内复制。虽然BSAAs的概念已经存在了将近50年,但

是最近埃博拉、兹卡、登革热、流感和其他病毒感染,发现新的宿主导向药

物以及药物定位方法学的发展。

介绍

体外和体外模型不能完全反映生物体的复杂性和生理学。因此,一些体内模型已经开

发出来,以测试牛血清白蛋白的新的抗病毒活性。这些包括免疫活性和基因或化学免疫

受损的小鼠、豚鼠、仓鼠、雪貂,猪、猕猴和其他动物(图2B)。PK/PD研究确定药物

吸收、剂量和半衰期。毒理学研究确定药物是否对药物有不良影响。动物组织器官及不

良反应剂量的确定. 研究BSAAs的疗效通常是通过治疗用药物或载体感染感兴趣的病毒

的动物。端点通常是体重/死亡率(取决于病毒)、组织病理学、病毒器官滴度、临床

症状和免疫发育。尽管动物模型可以给出BSAA的特性,重要的是要记住它们的不同从

人类的症状,疾病表现来看,易感性、免疫反应、发病机制和药代动力学。

牛血清白蛋白在动物模型中的评价

(A)检测BSAA毒性(左)以及永生细胞

培养和共培养的功效(右面板)。

(B)在动物模型中测试BSAA毒性(左侧

面板)和功效(右面板)。如果BSAA从另

一种疾病(即PK/PD)和毒性谱重新定位

可用于动物模型)可绕过安全性研究。

(C) 临床牛血清白蛋白试验。(左面板)

药代动力学(PK)和安全性研究。(右

(小组)疗效研究。如果药物从人类的另

一种疾病安全性资料中重新定位,它可以

绕过PK和安全性研究伙计。

BSAA发展过程

Outbreak of coronavirus disease 2019

2019年冠状病毒病爆发

Published Online February 17, 2020 https://doi.org/10.1016/ S1473-3099(20)30076-1

文献3

始于中国武汉的2019年冠状病毒病(COVID-19)疫情持续快速演变,截至2020 年2月9日,中国已确诊37 251例COVID-19,比前一天增加2657例。其中6188例病 情严重,812人死亡,全国各地都受到了影响。全球其他24个国家累计报告了307例 病例和1例死亡。 2020年1月30日,世卫组织宣布COVID-19的爆发为国际关注的突发公共卫生事 件(PHEIC)。

2019新冠病毒爆发

全球主要城市的独立自发性爆发可能不可避免,因为大量症状前患病患者的

出行以及政府缺乏大规模的公共卫生干预,所有这些都是推测性的,只有在几个

关键问题最终得到解答之后,才有可能弄清这种流行病的发展过程,其中最关键

的是无症状和亚临床患者能在多大程度上传播病毒仍不清楚。

世界各国可能都会受此次病毒影响

确诊病例的分布将受到诊断筛查和检测的范围和质量的影响,而在某些条件落

后区域可能存在无法鉴别的情况,这是一个令人担忧的问题,因为它使周边国家和

地区也变得脆弱。此外,该病毒在春节前不久出现,在中国,春运通常有30亿人次

的出行。

此次疫情可能会进一步扩大,特别是在中国及周边国家

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and corona virus disease-2019 (COVID-19): the

epidemic and the challenges

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)和冠状病毒疾病-2019(COVID-19):流行病和挑战

International Journal of Antimicrobial Agents 11 February 2020

文献4

2019年底,中国出现了严重的急性呼吸综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)已引起全球

大规模爆发和主要公众健康问题。截至2020年2月11日,世界卫生组织的数据显示,

在28个国家/地区中已鉴定出43,000例确诊病例,其中超过99%的病例在中国被发现。

它通过飞沫或直接接触通过人与人之间的传播而传播,据估计感染的平均潜伏期为

6.4天,基本繁殖数为2.24-3.58。引起的肺炎患者中,发烧是最常见的症状,其次是咳

嗽。从胸部计算机断层扫描图像中发现,最常见的发现是双侧肺累及毛玻璃样混浊。

当前,控制感染以防止SARS-CoV-2传播是主要的干预措施。

新型冠状病毒的爆发

越来越多的研究表明,SARS-CoV- 2通过液滴或

直接接触传播。此外,根据一项研究,在41%的

患者中怀疑与SARS-CoV-2有关的医院传播。

基于感染发生率迅速增加的证据和无症状携带

者传播的可能性,SARS-CoV-2可以在人与人之间

有效传播,并具有大流行的可能性。全球旅行的

进步和便利还可以进一步提高其在世界范围的传

播。

卫生工作者,政府和公众需要在全球范围内合

作以防止其传播。

新冠病毒传播能力极强

根据对2020年1月10日至2020年1月24日中国大陆早期暴发的数据的观察,发病率

增加的趋势很大程度上遵循指数增长,并且平均基本繁殖数(R0)估计为2.24。平均

潜伏期的估计为6.4天,范围为2.1到11.1天(2.5%到97.5%),并且可能无症状地传

播。

28个国家/地区已报告确诊病例,大多数是在中国大陆发现的(n = 44,653),报告

的死亡率为2.5%。

根据基因组研究的结果以及武汉市海鲜市场中一些蝙蝠和活动物的存在,SARS-

CoV-2可能起源于蝙蝠或与市场或周边地区受污染材料相关的蝙蝠粪便。

流行病学

在成年患者中,心血管疾病和高血压是最常见的基础疾病,其次是糖尿病。发烧

是最常见的症状(92.8%) ,其次是咳嗽(69.8%),呼吸困难(34.5%),肌痛

(27.7%),头痛(7.2%),腹泻(6.1%)。

56.8% 的患者患有白细胞减少症。需要重症监护的患者年龄较大,更可能患有

基础疾病。重症监护病房(ICU)住院的患者比非ICU患者更容易出现呼吸困难。

临床表现

到目前为止,还没有有效的治疗COVID-19的方法。超过85%的患者接受了抗病毒

药物,包括奥司他韦(口服每12小时75 mg),更昔洛韦(口服每12 h 0.25 g)和洛

匹那韦/利托那韦片(400/100毫克,每日两次,口服)。90%的患者开了经验性抗生

素。

几种潜在的候选药物,包括洛匹那韦/利托那韦(Kaletra®),核苷类似物,神经

氨酸酶抑制剂,伦德昔韦,umifenovir(arbidol),DNA合成抑制剂(如替诺福韦二

甲酚和拉米夫定),氯喹和中药(如舒方解毒杜)或联华清温胶囊),已被提出。

此外,理论上,基于ACE2的肽,3CLpro抑制剂(3CLpro-1)和新型乙烯基砜蛋白酶抑

制剂似乎显示出抗SARS-CoV-2的抗病毒活性的潜力。

潜在的治疗选择

尽管全世界都在努力了解COVID-19,但许多问题仍然不清楚。首先,一份报告表

明粪便中存在SARS-CoV-2。但是,SARS-CoV-2是否可以通过粪口途径传播尚不清楚。

其次,先前的研究表明SARS-CoV和其他冠状病毒可以在环境表面和无生命的物体中存

活,但是,尚未报告环境中存在的SARS-CoV-2。

同时目前缺乏对常用消毒剂抗SARS-CoV-2功效的研究。接受了全身性类固醇治疗

的患者,引起的炎症反应的时间特征的研究与治疗干预的时间有关。整体效果不尽

人意。

尚未解决的问题

COVID-19的爆发已成为全世界普通人群和医护人员的临床威胁。但是,关于这种

新型病毒的知识仍然有限。目前正在评估和开发抗病毒治疗和疫苗接种的有效选择

我们现在能做的是积极采取感染控制措施,以防止SARS-CoV-2通过人与人之间的

传播而传播。公共卫生当局应继续监视局势,因为我们越了解这种新型病毒及其相

关爆发,我们就可以做出更好的反应。

结论

Timely research papers about COVID-19 in China

关于中国COVID-19的即时研究论文

Published Online February 17, 2020 https://doi.org/10.1016/ S0140-6736(20)30375-5

文献5

已发表论文概况

作为新出现的传染病,COVID-19引起了极大的研究兴趣。根据《自然》杂志上

的最新报告,到2020年1月30日,至少有54篇关于COVID-19的学术论文在英语期刊上

发表。我们搜索了中国的主要数据库,包括中国国家知识互联网和万方数据。截至

2020年2月3日,仅发表了23篇关于COVID-19的中文论文。这些出版物主要关注流行

病学,COVID-19的临床特征以及严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)

的结构或遗传学。

论文发表的担忧

国际期刊上关于COVID-19的许多研究论文都是由中国研究人员撰写的,

引起了极大的关注,因为这些发现由于语言障碍而不能直接使一线卫生专业人

员和政策制定者受益。对健康科学来说,在英语期刊上发表以促进交流,实现

全球协调和及时的流行病应对至关重要。

一些媒体担心学术机构中的中国研究人员专注于在国际知名期刊上发表

论文,但对COVID-19的流行病预防却未给予足够的重视,而忽略了将其研

究结果发表在中文期刊中。

论文发表的建议

鼓励研究人员将重点放在流行病预防上,并用中文发表结果。

强调以英文发表临床研究有助于促进中国科学家与世界其他地区之间的知识

交流。

希望研究界将努力传播所有除英文出版机构外,用中文发表的与COVID-19

爆发有关的发现。

以中英文进行广泛传播将实现向国际科学界及时传达重要发现的目标,

同时还将这些信息传播给需要了解COVID-19的流行病学和临床特征的一线

医疗人员。该策略将有利于改进目前的控制策略,并最终控制病毒,保护公

众健康。

What are we doing in the dermatology outpatient department amidst the raging of2019-nCoV?

在2019- ncov肆虐之际,皮肤科门诊部在做什么?

Chen Y, Pradhan S, Xue S, What are we doing in the dermatology outpatient department amidst the raging of 2019-nCoV?, Journal of the American Academy of Dermatology (2020),doi:

https://doi.org/10.1016/j.jaad.2020.02.030.

文献6

全国各省市医院都采取了有效措施控制2019-nCoV的传播。2020年1月24

日,四川大学华西医院暂时关闭皮肤科门诊和皮肤科手术,推迟所有选修手术,

仅限于紧急手术。但是并未完全停止为某些需要就诊的患者提供服务。2019-

nCoV爆发期间的皮肤科门诊。在同一时间,以满足医疗要求并减少患者进入皮

肤的流量诊所,其通过在线和电话咨询提供免费的皮肤病学资料。

华西医院皮肤科的应对措施

华西医院皮肤科门诊计划于2020年1月28日运行,主要针对重症监护患者。谁

的病人已经预约了就医服务,但选择不去看望已收到全额退还的注册费。皮肤科

门诊已从八家急剧减少到四家,只有一名陪同人员允许人员进入诊所。进入门诊

和住院楼的人必须戴口罩,并穿着专业人士紧身防护服。

华西医院皮肤科的应对措施

在皮肤诊所治疗期间,患者不得脱下口罩,除非有面部病变迹象。医生必须

戴口罩,手术帽,防护服,工作手套和护目镜,脱下防护设备后工作只能到达

指定的一次性区域。在其他方面,华西医院的教育计划和活动停下来,禁止研

究生和实习生回国上学和工作。另外,华西医院建立了特殊的心理咨询平台,

通过电话和网络平台进行干预咨询,以帮助有需要的人,同时出版了免费下载

的心理保护手册。

华西医院皮肤科的应对措施

Fast assessment of human receptor-binding capability of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)

2019新型冠状病毒人受体结合能力的快速评估

State Key Laboratory of Genetic Engineering, MOE Engineering Research Center of Gene Technology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, 200438, China 2 Institute for Biology and IRI Lifesciences, Humboldt-

Universität zu Berlin, 10115 Berlin, Germany

文献7

• 动物冠状病毒(cov)的基因组进化可能使其获得人类传播能力从而对全球公共

卫生造成全球威胁

•目前利用病毒基因组数据的方法仍然缺乏。

•本研究提出了一种快速评估新出现的CoV及其突变的人类传播能力的方法,并证

明蛋白质-蛋白质相互作用的后基因组分析可能为病毒的早期科学指导预防和控制,

文章概要

文章概要

普遍认为冠状病毒人类传播是由其三聚体的相互作用驱动的, S蛋白由两个亚基(即S1

和S2)组成,对于宿主细胞的早期发育至关重要,病毒粒子的S蛋白通过其S1受体结合域

(SRBD)与宿主细胞受体结合,然后将病毒膜与细胞膜融合。

文章总结

经过大规模的蛋白-蛋白对接,以评估SARS-CoV和2019-nCoVS-RBDs与人类

ACE2受体的结合亲和性,从而定量评估2019-ncov的人类受体结合能力,经过充分

的研究SARS-CoV ,结果表明019-nCoV达到了SARS-CoV ACE2 受体结合强度的73%

左右。

这一研究支持了基因组编码的2019-nCoV s蛋白已经处理了接近SARS-CoV的人

类受体结合能力,因此,这种新出现的病毒可能能够结合ACE2,然后驱动人际传

播。

The 2019-new coronavirus epidemic: evidence for virus evolution

2019年新的冠状病毒流行:病毒进化的证据

bioRxiv preprint https://doi.org/10.1101/2020.01.24.915157

文献8

新冠病毒与SARS病毒基因序列密切相关

新冠病毒具有极性氨基酸

S蛋白和N蛋白的突变表明新冠病毒稳定性高于SARS病毒

可变区域

与SRAS不同区域

Therapeutic Drugs Targeting 2019-nCoV Main Protease by High-Throughput Screening

高通量筛选抑制靶向2019-nCoV主蛋白酶的治疗药物

https://doi.org/10.1101/2020.01.28.922922

文献9

2019新型冠状病毒(2019-nCoV)是我国武汉市首次发现的一种确定为肺炎暴发原因的病

毒。有关该病毒的传染性、严重性和其他相关特征的调查正在进行中。目前,还没有疫苗或治

疗性抗体来预防感染,需要更多的时间来制定有效的免疫策略。相比之下,针对参与病毒复制

和增殖的关键蛋白酶的特异性抑制剂是缓解疫情的最有效手段。SARS-CoV的主要蛋白酶对病

毒的生命周期至关重要,与2019-nCoV的主要蛋白酶具有96.1%的相似性,被认为是药物开发

的一个有吸引力的靶点。本研究在8000个临床药物文库的基础上,通过高通量筛选,筛选出4

种与SARS-CoV主蛋白酶结合能力强的小分子药物,这些药物已广泛应用于临床,具有一定的

安全性,有望成为治疗2019例nCoV感染的候选药物。

关键词:2019-nCoV;SARS-CoV;主要蛋白酶;治疗药物。

前言

为了筛选能够预防或治疗感染的可能候选药物,基于8000个临床药物库,使用在

线软件Vina和SeeSAR,结合我们的内部自动处理脚本和筛选程序,进行了高通量筛选

,鉴定出4种与SARS-CoV主要蛋白酶结合能力强的小分子药物。

方法

鉴定出4个分子,包括6651号分子(普卢利沙星)、6589号分子(双替格拉维)

、0097号分子(奈非那韦)和6626号分子(替戈布韦)。

鉴定结果

结果表明,四种分子均与病毒主蛋白酶呈良好的结合构象。其中普卢利沙星与主

要蛋白酶有3个结合位点,其中2个与奈非那韦和双替格拉维相同。此外,经SeeSAR亲

和力和理化性质分析证实,普卢利沙星、替戈布韦和双替加韦分子优于奈非那韦。根

据靶蛋白的口袋功能,提示这些分子应具有阻断病毒蛋白活性位点或阻断其二聚体形

成的能力。因此,他们可能会在寻找阻断2019-nCoV药物的过程中,成为药物再利用

和开发的候选品种。

结论和建议

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