Carmen M. Redondo Marey Unidad Oncología … · • Gestión de proyectos: Openproj, Onepoint...

Carmen M. Redondo Marey Unidad Oncología Genética. CHUVI 28 Septiembre 2012

Herramientas en la web para el investigador.

Gestores documentales (docs, netvibes)

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Índice

1. Introducción

– Herramientas informáticas en investigación, en qué nos ayudan

– Ejemplos de herramientas

2. Gestores documentales

– Qué son ?

– Tipos:

. Netvibes y mashups

. Herramientas colaborativas

3. Resumen

4. Bibliografía

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Herramientas en la web para el investigador. Introducción.

1. Introducción

- Qué son ?

Software general disponible en internet, muchas veces gratuito, que podemos usar/adaptar en nuestra investigación.

- En qué nos pueden ayudar ?

. Búsqueda de información

. Análisis de información y resultados del proyecto

. Planificación de proyectos

. Presentación de la información

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1. Introducción: Búsqueda de información

• Búsqueda de información:

- Bases de datos o portales bibliográficos:

PubMed (MedLINE), OMIM, IME, Embase, SCOPUS, LILACS,

Cochrane Plus, WHOLIS, Bibliosaúde, Web of Knowledge/Science

- Bases de datos de proteínas, genes y rutas metabólicas:

NCBI: CDD, Gene, UniGene

EBI: UniProt, PDBe, Reactome

KEGG: KEGG, KEGG Pathways

- Encuestas: encuesta fácil, Lime Survey, SurveyMonkey

- Gestores documentales: Netvibes

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1. Introducción: Análisis de información y resultados.

• Análisis de información y resultados:

- Programas estadísticos: EpiInfo, EpiDat, R

- Programas gráficos: Gnuplot, Grace, Jmol, Vmd

- Programas análisis información/resultados proteínas y genes:

- proteínas: estructura 3D, función, dinámica, docking

Blast, Pfam, NAMD, AutoDock

- genes: Babelomics

- Mashups

- Gestores documentales: Herramientas colaborativas

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1. Introducción: Gestión de proyectos y Presentación de resultados

• Gestión de proyectos:

Openproj, Onepoint Community Server

(cronogramas, gestión recursos, análisis de camino crítico)

• Presentación de información/resultados:

- Gestores documentales: Herramientas colaborativas

- Gestores de referencias

EndNote, RefWorks, integrados en texto (Word, Latex)

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2. Gestores documentales: netvibes, mashups y herramientas colaborativas

2. Gestores documentales

- Qué son ?

Software que permite crear, capturar, organizar, almacenar y

recuperar documentos

- Tipos:

. Netvibes y mashups

. Herramientas colaborativas

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2. Gestores documentales: Netvibes

• Netvibes: www.netvibes.com/usalbiomedica#Biblioteca

- “universo de ventanas”, “portal de entrada”

- escritorio virtual que agrupa fuentes de información (de nuestro

interés) que se actualizan frecuentemente (feeds)

http://www.netvibes.com/usalbiomedica

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2. Gestores documentales: Mashups

• Mashups:

- Aplicación web que usa información de distintas fuentes relevantes (netvibes) para crear un nuevo servicio usando Servicios Web y APIs públicas.

- HealthMap: mapa mundial de alertas epidemiológicas

http://www.healthmap.org/es/

http://www.healthmap.org/es/

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2. Gestores documentales: Mashups

• GoPubMed: www.gopubmed.org/

http://www.gopubmed.org/

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2. Gestores documentales: Netvibes y Mashups

• PubMedReMiner: bioinfo.amc.uva.nl/human-genetics/pubreminer/





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2. Gestores documentales: Netvibes y Mashups

• Pubgle: guías de práctica clínica www.pubgle.com

http://www.pubgle.com/

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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas

• Herramientas colaborativas:

- Qué son?

Herramientas disponibles en internet que permiten el trabajo en

equipo sin tenernos que reunir físicamente.

- En qué nos ayudan ?

1. Crear y compartir documentos

2. Publicaciones colaborativas

3. Compartir calendarios de trabajo / lista tareas pendientes

4. Compartir enlaces y recursos web

5. Crear foros de comunicación

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• Herramientas colaborativas:

- Son sencillas de usar (para algunas se necesita formación)

- Se adaptan a nuestras necesidades

(distintas tareas, personas con distintas habilidades informáticas, …)

- Hay muchas para escoger

- No dependen del ordenador/tablet/smartphone que tengamos

ni de dónde estemos físicamente

- Se usan en muchos entornos (sanidad, educación, empresas…)

- Permite decidir quién puede ver/modificar los documentos

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• Entornos colaborativos:

Espacio virtual con herramientas comunes que facilitan el intercambio de información, el trabajo colaborativo y la comunicación entre usuarios

- Yahoo groups y Google groups:

. Exigen tener cuenta de correo Yahoo o Google

. Google ha eliminado algunas herramientas

- GNOSS:

. Comunicación y compartir recursos

. Enlace con redes sociales (Facebook, Twitter, etc.)

- Wiggio:

. Calendario, archivos, mensajes, foros, reuniones virtuales

. Subgrupos de trabajo

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• Crear y modificar documentos:

- Google Docs:

. Crear nuevos documentos o compartir los ya existentes (doc, xls, odt,

ods, csv, ppt, etc.)

. Compartir documentos, hojas de cálculo, presentaciones o formularios.

. Necesitamos tener cuenta en Google

. Varias personas pueden modificar el documento a la vez pero, sabemos

quién ha cambiado qué y cuándo.

. Diferentes permisos (lector, colaborador).

. Publicar directamente el documento como web o blog.

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- Dropbox:

. Guardar archivos en “local” para trabajar sin internet

. Guardar archivos “en la nube” para acceder desde cualquier sitio

. La versión “local” se sincroniza con la remota al conectarnos y así trabajamos siempre sobre la última versión del documento.

. Si dos personas hacen cambios al mismo tiempo guarda las dos versiones y avisa

- Zoho:

. Revisar los cambios introducidos por otros

. Exportar los textos a distintos formatos: doc, pdf, latex

. Copia “en local” y copia “en la nube”

. Presentación online colaborativa

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- Crocodoc:

. Revisar y comentar documentos word, powerpoint, pdfs, imágenes, etc entre varias personas.

- Prezi:

. Crear una presentación online colaborativa

- Etherpad:

. Bloc de notas colaborativo

- Lucidchart:

. Crear diagrama de flujos o mapas de ideas

- SkyDrive: (Microsoft)

. Compartir documentos con otros usuarios y entre equipos (ordenador, smartphone, tablet) de forma muy sencilla y rápida

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• Publicación colaborativa: Blogs

. Publicación web que organiza sus contenidos cronológicamente

. No exige saber programar

. Integrar imágenes, vídeos, presentaciones, mashups …

. Eficaz para recoger las conclusiones de una reunión científica,

divulgar resultados de investigación al público en general …

. Editar por varios autores “internos” y colaboraciones “externas”

. www.blogger.com/start es.wordpress.com

http://www.somosmedicina.com/2010/02/blogs-sanitarios-en-espanol-activos-y_24.html

http://www.blogger.com/start















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• Publicación colaborativa: Blogs:

http://medicablogs.diariomedico.com/drdelgado/

http://medicablogs.diariomedico.com/drdelgado/


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• Publicación colaborativa: Wiki

. Página web que se puede crear, borrar o modificar de forma

interactiva, fácil y por cualquier usuario que acceda a ella (registrado)

. Debate sobre contenido/información de un tema

. Cada uno aporta su conocimiento, experiencia

. “Tablón de anuncios”

. wiki.zoho.com www.wikispaces.com

. Wikipedia, wiki de cursos, compañías (modificar desde intranet)

http://webtrends.about.com/od/wikilists/tp/list_of_health_wikis.htm

http://www.wikispaces.com/





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• Publicación colaborativa: WikiHealth www.wikihealth.com

http://www.wikihealth.com/

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• Compartir calendarios y lista de tareas pendientes:

- Google calendar:

. Compartir calendario común con múltiples personas

. Copia local sincronizada

(para consultar sin estar conectados a internet)

. Ideal para: calendarios de reuniones, tareas de un proyecto, etc.

. Acceder a los datos desde el móvil

. Se necesita cuenta en Google para poder modificar el calendario,

no para consultarlo.

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• Compartir calendarios y lista de tareas pendientes:

- Doodle:

. Muy sencilla de usar

. Fijar reuniones, eventos

. Elegir quién participa

(invitamos por email)

. Muestra resumen actividad

realizada

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• Compartir enlaces y recursos web:

- Delicious:

. Guardar los marcadores web de “Favoritos” para poderlos ver desde cualquier equipo desde el que nos conectemos.

. Compartir nuestros marcadores con otros usuarios

. Se integra en cualquier navegador (Explorer, Firefox)

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• Compartir enlaces y recursos web:

- Diigo:

. Compartir enlaces con un grupo de personas

. Compartir notas, imágenes, capturas de pantallas, etc.

. Más sencilla de usar que Delicious

. Se integra en el navegador (Explorer, Firefox)

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• Foros de comunicación:

- Vyew:

. Webminars (seminarios web), presentaciones, reuniones de equipo, ayudar a clientes en tiempo real…

. Compartir documentos, imágenes, vídeos, presentaciones

que se pueden modificar conjuntamente

. Guardar la sesión como vídeo para verlo después

. Comentarios en vivo o a través de chat, webcam para ver al participante que habla (si quiere)

. Visualizar el escritorio remoto del moderador

. Se necesita tener Java y Flash instalado.

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• Foros de comunicación:

- Skype:

. Escribir, hablar o videoconferencia con varias personas a la vez

. Muy sencillo de instalar y usar

. Permite retomar conversaciones pasadas

. Funciona en cualquier ordenador/smartphone

. Permite compartir escritorio

. Útil llamadas internacionales gratis

. Envío de archivos

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Resumen

3. Resumen

1. Las herramientas disponibles en la web ayudan al investigador en todas

y cada una de las etapas de investigación.

2. Hay herramientas disponibles que se ajustan a nuestras necesidades,

sólo hay que buscar !!!

3. Netvibes y mashups permiten agrupar fuentes de información

que se actualizan rápidamente y extraer nuevo contenido.

4. Las herramientas colaborativas permiten el trabajo

conjunto con otros sin tenernos que reunir físicamente

5. con los datos personales/pacientes: LOPD

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4.Bibliografía

1. http://cooltoolsforschools.wikispaces.com/Collaborative+Tools

2. http://www.library.uq.edu.au/research-support/research-collaboration-tools

3. http://whitepapers.virtualprivatelibrary.net/Online%20Research%20Tools.pdf

4.

http://cooltoolsforschools.wikispaces.com/Collaborative+Tools







http://www.library.uq.edu.au/research-support/research-collaboration-tools

















http://whitepapers.virtualprivatelibrary.net/Online Research Tools.pdf

http://whitepapers.virtualprivatelibrary.net/Online Research Tools.pdf

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