Capítulo 13, Ciclo de Krebs
-
Upload
natalia-pineda -
Category
Documents
-
view
224 -
download
0
description
Transcript of Capítulo 13, Ciclo de Krebs
1
Capítulo13ElciclodelÁcidoCítrico
13.1ConversióndePiruvatoenacetil‐CoA:ComplejodePiruvatoDeshidrogenasa
Fig.1
Observarqueentreelprocesodelaglicólisis, cuyo producto es elpiruvato y el ciclo del Ácido Cítrico(o ciclo de Krebs), cuyo principalsustrato es la acetil‐CoA, existe unpaso llamado: Complejo PiruvatoDeshidrogenasa.Este es la primerasecuenciaaestudiaracontinuación.
LaconversiónentrePiruvatoAcetil‐CoAesimportanteyaquelaAcetil‐CoAeselsustratoprincipalenelciclodelácidocítrico.Laestequiometríageneraldelareaccióncompletaes:
Fig.2ReaccióngeneraldePiruvatoAcetilCoA
dondelaHS‐CoAeslacoenzimaA.Eselprimerpasoenlaoxidacióndelpiruvato.Productos:
1. Acetil‐CoA2. 1moléculadeCO23. 1moléculadeequivalentereductor(NADH).
Recomendación:VeranimacióndeComplejoPiruvato
Deshidrogenasa
2
Como se observa en elmedio de la flecha, esta reacción de óxido‐reducción es catalizada porPiruvatodeshidrogenasa. Sin embargo, es importante comprender quemás que una enzima, es unComplejo dePiruvatoDeshidrogenasa(PDC)1.Esta es una de las enzimas centrales del metabolismo aerobio y sirve como la vía intermedia entre laglicólisis y el ciclo del ácido cítrico, y es una de las principales enzimas de regulación metabólica quecontrola el flujo demetabolitos entre estos dos procesos. Este complejo actúa como un grifo (llave deagua) para el suministrode carbonosdesde la glicólisis quepuede ser apagadodependiendodel estadometabólicodelacélula.
Localización
ElComplejoPiruvatoDeshidrogenasaseencuentraenlamatrizmitocondrial.Así,mientraslamembranaexteriordelamitocondriaespermeablealamayoríadepequeñasmoléculas,enlamembranainternadebehaberunaproteínaquepermiteingresarelpiruvatoyllegaralPDC.Selogramedianteunaproteínallamada:piruvatotranslocasa.
Fig.3
1SiglaseninglésdePiruvateDehidrogenaseComplex.
3
ComplejoPiruvatoDeshidrogenasa
Es un complejo multienzimático compuesto por variassubunidadesde3enzimas:
1. E1: Piruvato deshidrogenasa (20‐30 copias):Deshidrogenaciónydescarboxilación
2. E2:Dihidrolipoamidaacetiltransferasa(60copias)3. E3:Dihidrolipoamidadeshidrogenasa(6copias)
Ademásdeutilizar5coenzimasasociadas:
1. Pirofosfatodetiamina(TPP):GrupoprostéticodeE12. Ácidolipoico:GrupoprostéticodeE23. FAD+:GrupoprostéticodeE34. HS‐CoA(CoenzimaA)5. NAD+
Las primeras tres están unidas fuertemente a las enzimas delcomplejo y las otras dos (CoA y NAD+) se usan comotransportadoresdelosproductosdelaactividaddelcomplejodelaPDH.El tamaño del complejo es más grande que un ribosoma. Esmiembrodeunafamiliadecomplejosmultienzimáticosllamadosfamiliadela2‐osoácidodeshidrogenasa.
Fig.4
Verde:EnzimasE2:Tieneunbrazoenlazantequesobresalehacialasuperficie(allíestálalipoamida)Amarillo:EnzimasE1:Sondos
subunidadesalfaydossubunidadesbetal
Rojo:EnzimasE3:Estáenelcentro.
(Animación)ElComplejoPiruvatoDeshidrogenasa(PDC)catalizaengeneral,laoxidacióndepiruvatohaciaacetil‐CoA. La reaccióngeneral sedescomponeen tres transformacionesquímicasque requieren las tresenzimasdelcomplejo:
1. Descarboxilación(pérdidadeCO2)2. Oxidacióndeungrupoceto(C=O)aungrupocarboxilo3. ActivaciónporacoplamientoalaCoenzima‐Apormediodeunenlacetioester2
Fig.5
ReaccióndePiruvatohaciasusproductos:AcetilCoA,CO2,NADH+.Sepuedeobservarlapresenciadelas3enzimasdelComplejoPiruvatoDeshidrogenasaqueactúanmediantesusgruposprostéticos(TPP,lipoamidayFAD),ademásdelas
otrasdoscoenzimas:HS‐CoAyNAD.
2UnióndeunsulfuroconungrupoaciloconlafórmulageneralR‐S‐CO‐R'.
4
(Libro:Horton)Ladescarboxilaciónoxidativadelpiruvatosepuededividirencincopasos:
Paso Enzima‐Coenzima Descripción
Paso1
SubunidadE1delPDCseunecovalentementeconpiruvato
paraliberarCO2Productos:
1. CO22. Formacarbanióndel
hidroxietilo‐TPP(HETPP)
SubunidadE1(Pirofosfatodeshidrogenasa)+
TPP(Pirofosfatodetiamina)• Esta coenzima es creada en el
cuerpoapartirdelaVitaminaB1oTiamina.
• Tiene funcióncatalíticaenvariasreaccionesdelacarboxilasa.
• Forma activa de TPP: en formadecarbaniónoiluro.
(Animación)Reacción:Descarboxilación1. El TPP se activa (tiene un
protónmuy ácidoque es fácilde remover para generar elcarbaniónreactivo)
2. Este carbanión en TPP es unnucleófilo fuerte, por esoataca y hace un enlace con elcarbono carbonilo (C=O)enelpirvutato.
3. Esto causa, la liberación deCO2
Paso2
Elgrupohidroxietilo,condoscarbonos,estranferidoalgrupolipoamidadelasubunidadE2
Producto:
1. Acetil‐dihidrolipoamida2. Iluro(formacarbanión
deTPP)
Catalizadapor:‐ComponenteE1delcomplejopiruvatodeshidrogenasa(PDC)
SubunidadE2(Dihidrolipoamidaacetiltransferasa)+
Lipoamida
• Esta coencima está formadapor ácido lipoico unido enforma covalente por unenlacedeamidaaun residuodelisinaenunasubunidaddeE2.
• Debidoaqueseunedeformacovalente a E2, a estacoenzima se le llama grupoprostético.
• De manera oxidada estacoenzima tiene un enlacedisulfuro. Pero para quepuedaaceptarelgrupoacetilo(formadopor laoxidacióndelHE‐TPP que se originó en el
(Animación)Reacciónredox:La enzima E2 (dihidrolipoamidaacetiltransferasa) transfiere elhidroxietil derivativo que estáunidoalTPP (HE‐TPP)deE1haciasupropiacoenzima,lipoamida.Para que ocurra, la oxidación delhidroxietilo‐TPP se acopla con lareducción del disulfuro de lalipoamida y el grupo acetilo setransfiere a uno de los grupossulfhidrilodelacoenzima.
5
paso anterior) se debe dereducir.
Paso3
TransferenciadelgrupoacetiloalHS‐CoA(CoenzimaA)
Catalizadapor:‐ComponenteE2delPDC
CoA‐SH(CoenzimaA)
(Animación)1. Elgrupoacetilestransferidoal
grupo–SHdelaCoenzimaA.2. Produce Acetil‐CoA: tiene un
enlacetioésterdealtaenergía,que esta cargado paratransferir el grupo acetil de 2carbonos al ciclo del ácidocítrico.
3. Produce Ditiol, la formareducida de la lipoamidausadaenelpasoanterior.
Paso4
Regeneracióndelipoamidaasuformaoriginalparaquepuedan
repetirlasreaccionescatalizadas
Producto:‐E3‐FADH2(reducido)
SubunidadE3(Dihidrolipoamidadeshidrogenasa)+
FAD(Flavinaadeninadinucleótido)
• Lafuncióndeestacoencima
esre‐oxidarelgrupoprostéticolipoamidaenlasubunidadE2.
Reacciónredox1. Transferenciadedosprotones
y dos electrones de la formaditioldelalipoamidaalFAD.
2. Seproduce:FADH2(formareducidadeFAD)
6
Paso5
RegeneracióndeFADH2asuformaoriginalparaquepuedan
repetirlasreaccionescatalizadas
Producto:‐E2‐FAD(oxidado)‐NADH+H+
NAD+
Reacciónredox1. El E3‐FADH2 se oxida hacia
FAD.2. ElNAD+sereduceaNADH+
Unprotónseliberaenelpaso5yunprotónsetomaenelpaso1,porloquelaestequiometríageneraldelareaccióndepiruvatodeshidrogenasanotieneganancianiperdidanetadeprotones.Laacciónrecíprocade5coenzimasenelcomplejodelapiruvatodeshidrogenasailustralaimportanciaquetienenlascoenzimasenlasreaccionesmetabólicas.Puedenactuarcomo:
Cosustratos Gruposprostéticos‐ HS‐CoA‐ NAD+
‐ TPP(conE1)‐ Lipoamida(conE2)‐ FAD(conE3)
LosgruposlipoamidaunidosaE2sonlosprincipalesresponsablesdetransferirreactivosdeunsitioactivohaciaotroenelcomplejo.Enestasreacciones,elgrupoprostéticolipoamidafuncionacomounbrazoquevisitalostressitiosactivosenelcomplejo.Estemecanismoaseguraqueelproductodeunareacciónnosedifundaalmedio,sinoquesobreélactúedeinmediatoelsiguientecomponentedelsistema.El mecanismo de las tres enzimas del CPD y sus coenzimas es un gran ejemplo de canalización desubstratosdeunaenzimahaciaotra.Estecasodifieredeotrosporqueelcompuesto intermediodedoscarbonosseuneenformacovalentealgrupoflexibledelipoamidaenE2.
7
Fig6
MecanismodelComplejoPiruvatoDeshidrogenasa
Toda reacción de piruvato deshidrogenasa es una seria de reacciones de óxido‐reducción acompladas,dondesetransportanelectronesdelsustratoinicial(piruvato)alagenteoxidativofinal(NAD+)
ControldelComplejoPiruvatoDeshidrogenasa
LaregulacióndeestavíahaciaelCiclodelÁcidoCítricoesesencialporquelaconversióndepiruvatohaciaacetil‐CoA catalizadaporelCPDes altamente favorecida termodinámicamente, esta reacciónesunpasometabólicoirreversible.ElcontroldelaCPDocurrepordosmecanismos:
1erMECANISMO
Moduladoresalostéricos
(Regulaciónporretroalimentación
porNADHyAcetilCoA)
(TomadodeHorton)Engeneral,lossustratosdelComplejoPiruvatoDeshidrogenasaactivanelcomplejo,ylosproductosloinhiben.Inhibiciónde:1. Acetiltransferasa(E2):altaconcentracióndeAcetilCoA.2. Deshidrogenasa(E3):altaconcentracióndeNADH
Fig.7
InhibicióndelCPDpormoduladoresalostéricos
8
(TomadodelaAnimación)
ReguladoresdeCPD:Enunestadodebajaenergía,elAMP,NADyCoASHactivanelCPDparaaumentarlacantidaddeAcetilCoA.Mientrasqueenunestadodealtaenergía, elATP,NADHyAcetilCoAinhibenlaCPD.
Moduladores+ActivanactividaddeCPD
Moduladores–InhibenactividaddeCPD
‐ AMP‐ NAD+‐ CoASH
‐ ATP‐ NADH‐ AcetilCoA
2ºMECANISMO
Modificacióncovalente
(PorfosforilacióndelasubunidadE1‐soloeneucariotas)
(TomadodeHorton)Unaproteínacinasayunaproteínafosfatasaseasocianalcomplejo.Piruvatodeshidrogenasacinasa(PDK):
o CatalizalafosforilacióndeE1 o DesactivacióndeE1
Piruvatodeshidrogenasafosfatasa(PDP):
o CatalizaladesfosforilacióndeE1 o ActivacióndeE1.
El control de la actividad de E1 (piruvato deshidrogenasa) controla la velocidad dereaccióndetodoelcomplejo.Tambiénsecontrolanlasactividadesdeestasdosproteínas(lacinasaylafosfatasa):Piruvatodeshidrogenasacinasa(PDK):
o Activación:NADHyAcetilCoA(indicanquehaydisponibilidaddeenergía,motivandoalafosforilaciónyalainhibicióndelComplejo)
o Inactivación:Piruvato,NAD,CoA‐SHyADP(provocanladesfosforilaciónyporende,laactivacióndelComplejo)
Piruvatodeshidrogenasafosfatasa(PDP):o Activación:altas concentraciones de Ca+2 (lo que provoca la activación
delComplejo)
9
Fig.8RegulacióndelCPDpormodificacióncovalente
11.2OxidacióndelaAcetilCoAenelciclodelácidocítrico
Antesdeconsiderarcadaunadelasreaccionessedebenconsiderardospropiedadesgeneralesdelaruta:1. Flujodelcarbono
Fig.9DestinodeloátomosdecarbonodeloxaloacetatoylaacetilCoAduranteunavueltadelciclodelácidocítrico.
Elbalancedelcarbonoenlarutatotaldereaccioneses tal que por cada grupo de dos carbonos de laAcetilCoAqueentraalciclo,seliberandosátomosdecarbono durante una vuelta completa al ciclo(ObservarlasmoléculasdeCO2encolorceleste).
2. Produccióndemoléculasricasenenergía
LaAcetilCoAesunamolécularicaenenergía.Elenlacedetioésterconservaalgodelaenergíaadquiridapordescarboxilacióndelpiruvatomedianteelcomplejodelapiruvatodeshidrogenasa.Durantelasreaccionesdelciclodelácidocítrico,lamayorpartedelaenergíaliberadaseconservaenformadeelectronestransferidosdesdeácidosorgánicos,paragenerarlascoenzimasreducidasNADHyFADH2.‐ElNADHseformaentrespasosdeóxido‐reducción;dosdeellossondescarboxilacionesoxidativas.‐LaFADH2seformacuandoseoxidasuccinatoafumarato.
10
Además de la formación de los equivalentes reductores, el ciclo del ácido cítrico produce un nucleótidotrifosfatoenformadirectaporfosforilaciónaniveldesustrato3.ElproductopuedeserATPoGTP.Esdecir,laproduccióntotaldeenergíay/oequivalentesdeenergíaes: 3NAHD,1FADH2,1GTP(quesetransformaenATP)AcontinuaciónsemuestraelciclocompletodelÁcidocítrico:
3EslaformacióndeATPporlatransferenciadeungrupofosforilodesdeuncompuestodealtaenergía.
11
Fig.10:CiclodelÁcidoCítrico/CiclodeKrebs/Ciclodelácidotricarboxílico
12
Fig.11:
Tabladereaccionesenzimáticasdelciclodelácidocítrico
(Animación)Esteciclo seencuentraenel corazóndelmetabolismoaerobio.Envuelveel rompimientodetresgrandesgruposalimenticios:carbohidratos,lípidosyproteínas.Observarelesquemasiguiente:
Fig.12
Carbonosparaelciclodelácidocítrico
# EnzimayReacción Características
1
PuntodeControlNo.1:IrreversibleCitratoSintasa(Hidrólisis)AcetilCoA+Oxaloacetato+H2O
Hidrólisis de un enlace tioéster de alta energía: liberación deenergía.Lanaturalezaexergónicasdelareacciónbajocondicionesestándarasegura que el ciclo del ácido cítrico funcione en la dirección deoxidación de AcetilCoA, aún bajo condiciones donde laconcentracióndeoxaloacetatoseamuybaja.
13
Citrato+CoASH+H+
Producto:Citrato(6carbonos)
Lacitratosintasaesunatransferasa.• Sintasas:son liasas cuyopapelprincipales la reaccióndonde
secombinandossutratosparaformarunamoléculamayor.• Sintetasas: son ligasas que se deben acoplar con una
coenzima,encasoseslahidrólisisdeATP(oGTP).La estructura de la enzima necesita que el oxaloacetato y laacetilCoAseunanen formasucesiva.Esto reduce laprobabilidaddeenlazarlaacetilCoAenausenciadeoxaloacetatoylaposibilidaddecatalizar lahidrólisisdelenlacetioésterenelacetilCoAenunareaccióndesperdiciada.
2
Aconitasa(Isomerización)CitratoisocitratoProducto:Isocitrato(6carbonos)
Nombresistemático:Aconitasahidratasa.Elcitratoesunalcoholterciarioyporello,nosepuedeoxidarenformadirectapara formaruncetoácido.Poreso,enestepasoseforma un alcohol secundario como un compuesto intermedio, elcis‐aconitato(delquederivaelnombredelaenzima).
Laaconitasaesunmiembrodeunafamiliadeproteínas.Todoslosmiembrosdelafamiliatienenungrupocaracterístico[4Fe‐4S]dehierro‐azufre. La reacción que cataliza es de isomerización y nounadeóxido‐reducción.Existe 4 estereoisómeros diferentes del isocitrato, pero sólo seproduceunodeellosenestareacción:elRS.
3
PuntodeControlNo.2:IrreversibleIsocitratodeshidrogenasa(Descarboxilaciónoxidativa)Isocitrato+NAD+alfa‐cetoglutarato+NADH+CO2Producto:
‐ alfa‐Cetoglutarato(5carbonos)
‐ NADH‐ CO2
Estareacciónesimportanteporsusdosefectos:
1. Oxidación2. Descarboxilación
Estaes laprimerade4 reaccionesdeóxido‐reducciónenel ciclo.OcurrereduccióndelNAD+.4Hay2partesenestareacción:
1. Primero, se produce un compuesto intermedio:oxalosuccinato, por acción deshidrogenasa (quitarhidrógenos).
2. Segundo, se produce el alfa‐cetoglutarato, pordescarboxilación (liberación de CO2) y la toma de unprotón.
Esta es la primera de las reacciones que dan como resultado
4Recordarquereducciónserefiereagananciadeelectrones.Esdecir,NAD+pasaráaserNADH+H
14
pérdidadeelectrones(esdecir,laoxidacióndeunácidoorgánico)paraformarNADH+H.
4
PuntodeControlNo.3:IrreversibleComplejoalfa‐cetoglutaratodeshidrogenasa(Descarboxilaciónoxidativa)Alfa‐Cetoglutarato+CoASH+NAD+Succinil‐CoA+CO2+NADHProducto:
‐ Succinil‐CoA(4carbonos)‐ NADH‐ CO2
Ladescarboxilacióndelalfa‐KG5esanálogaalareaccióncatalizadaporlapiruvatodeshidrogenasa6.El Complejo alfa‐cetoglutarato deshidrogenasa es un complejogrande que se parece a la piruvato deshidrogenasa, tanto enestructuracomoen función. Intervienen lasmismascoenzimasyelmecanismodelareacciónesigual.Las3enzimascomponentesson:
1. E1:alfa‐cetoglutaratodeshidroegenasa2. E2:dihidrolipoamidasucciniltransferasa3. E3:dihidrolipoamidadeshidrogensa
Lareaccióngenerales:‐ La2ªproductoradeCO2‐ La2ªreacciónquegeneraequivalentesreductoresCuandoseleagregalacoenzimaA,seactivalamolécula.
Aquíterminaelprocesodecatabolismo.
5
Succinil‐CoAsintetasaSuccinil‐CoA+GDP(oADP)+PiSuccinato+GTP(oATP)+CoASHProducto:
‐ Succinato(4carbonos)‐ CoenzimaA(CoASH)
‐ GTP
A esta enzima a veces se le llama succinato tiocinasa. En lareacciónseacoplanlahidrólisisdeenlacetioéster,dealtaenergía,enlasuccinil‐CoAylaformacióndeunnucleósidotrifosfato(ATPoGTP).Lareacciónseefectúaen3pasos:1. Se genera succinil‐fosfato como compuesto intermedio y se
liberacoenzimaA.2. Se transfiere el grupo fosforilo a una cadena lateral de
histidinaenelsitioactivodelaenzima.3. Se transfiere el grupo fosforilo a GDP para formar GTP. Esta
reacción es el único ejemplo de fosforilación a nivel desustratoquehayenelciclodelácidocítrico.
Elnombrede laenzimasedebea lareaccióncontraria,dondesesintetiza succinilCoA a partir de succinato a expensas de GTP oATP. Se llama sintetasa porque la reacción se combinan 2moléculas y está acoplada a la hidrólisis de un nucleósidotrifosfato.
6
Complejodesuccinatodeshidrogenasa(oxidación)Succinato+QFumarato+QH2
Esta enzima cataliza la oxidación de succinato a fumarato,formando un doble enlace carbono‐carbono y perdiendo dosprotonesydoselectrones.Loselectronesylosprotonespasanaunaquinona,quesereduceaQH2. Además, el FAD es un cofactor esencial en las enzimas
5Alfa‐cetoglutarato6Verel1ertemadelapresentehoja
15
Producto:
‐ Fumarato‐ QH2
succinatodeshidrogenasaqueexisteentodaslasespecies.Este complejo es parte del sistema de transporte de electronesque está en lamembranamitocondrial interna de las eucariotas(NOTA:Seexplicaráenelsiguienteresumen)El sustrato análogo: malonato, es un inhibidor competitivo delcomplejosuccinatodeshidrogenasa. Ésteseenlazaal sitioactivodelcomplejo.Peroelmalonatonopuedeefectuarlaoxidación.
7
Fumarasa(Hidratación)Fumarato+H2OL‐MalatoProducto:• L‐Malato
Nombresistemático:fumaratohidratasa.Catalizalaconversióndefumaratoamalatomediantelaadicióndeaguaaldobleenlacedefumarato.EstaesunareaccióntransestereoespecíficaporquesiempreproducináelestereoisómeroLdelhidroxiácidomalato.
8
Malatodeshidrogenasa(Reacciónredox:deshidrogenación)L‐Malato+NAD+oxaloacetato+NADH+H+Producto:
‐ Oxaloacetato‐ NADH+H+
Estepasoeslaregeneracióndeoxaloacetato,conlaformacióndeunamoléculadeNADH.
13.4LascoenzimasreducidaspuedengenerarlaproduccióndeATPEnlareacciónnetadelciclodelácidocítricoseproducenporcadamoléculadeacetilCoA:
‐ 3moléculasdeNADH‐ 1moléculadeFADH2‐ 1moléculadeGTPoATP
Fig.11:ReacciónnetadelciclodeKrebs
ElNADHyelFADH2sepuedenoxidarmediantelacadenadetransportedeelectrones,queestáacopladaalaproduccióndeATP.Laoxidaciónde1moléculadeAcetilCoAenelciclodelÁcidocítricoylasreaccionesposterioresseasocia,porconsiguientealaproduccióndeunas10moléculasdeATP:7
7RecordarqueHortonusala“nueva”equivalenciadeNADHyFADH2haciaATP(NADH=2.5ATPyFADH2=1.5ATP)
16
Lacombinacióndelosdemásprocesosmetabólicos,dancomoresultado32moléculasdeATPpormoléculadeglucosa:
Fig.12.1
ProduccióndeATPenelcatabolismodeunamoléculadeglucosaporglucólisis,ciclodelácidocítricoyreoxidacióndeNADHyFADH2.Laoxidacióncompletadelaglucosallevalaformacióndeunas32moléculas
deATP.8
13.5RegulacióndelCiclodelÁcidoCítrico
(TomadodeAnimación)ModuladorespositivosdelCiclodeKrebs:AMP,ADP
8Nota:recordartambiénque32seríanenlautilizacióndelaLanzaderaMalato‐Aspartato;mientrasquesieslaLanzaderaGlicerol‐3‐fosfato,serían30.(Vercuaderno)
17
Fig.13
RegulacióndelCiclodelÁcidoCítrico
Enelciclodelácidocítricoseregulan3reacciones.Sonlascatalizadasporlassiguientestresenzimas:
Reacción1Citratosintasa
Reacción3Isocitratodeshidrogenasa
Reacción4Complejoalfa‐cetoglutarato
deshidrogenasa• Activada:ADP• Inhibida:NAD,ATP,
SuccinilCoA,citrato.(ATP:aunquenosesabesupapelencélulasvidas)
Estepasoeselmásregulado,yaqueeseliniciodelciclo.
• Activadaalostéricamente:
Ca+2,ADP• Inhibida:NADH,ATP
• Activada:9IonesCa+2(seunen
aE1,bajansuKmyaumentanlaformacióndesuccinil‐CoA)
• Inhibida:NADH,Succinyl‐CoA
13.6Elciclodelácidocítriconosiempreesun“ciclo”:RUTASANAPLERÓTICAS
El ciclo del ácido cítrico no es solo una ruta catabólica para oxidar Acetil‐CoA, también tiene un papelcentralenelmetabolismo:
‐ Algunos compuestos intermedios del ciclo son importantes precursores de otras rutas debiosíntesisyademás,
‐ Algunasotrasrutasproducencompuestosintermediosdelmismociclo.
Analizarelsiguienteesquema:
9 A pesar de su semejanza con el Complejo Piruvato Deshidrogenasa, las proteínas cinasas o fosfatasas no serelacionanconestecomplejo.
18
Lavelocidada laqueel ciclodelácidocítricometaboliza laAcetil‐CoAesextremadamentesensiblea loscambios en la concentración de sus productos intermedios; quiere decir que el reabastecimiento decualquiera de sus compuestos intermedios resultará en la mayor concentración de todos sus otrosproductosintermedios(dadasunaturalezacíclica).Deestamanera,lasRutasAnapleróticas(palabraquesignificaengriego,“llenado”)suministrandeintermediariosalciclodeKrebs.Sedicequeelcicloesanfibólico,yaquesirvetantoparacatabolismocomoparaanabolismo.
CiclodeKrebscomoprecursordemetabolitosenlasrutasdebiosíntesis
Apartirdelossiguiente
metabolitosdelCiclodeKrebs
Genera
Citrato1. Formacióndeácidosgrasosyesteroides.2. SedivideenAcetilCoAqueesprecursordelípidos(estareacciónsellevaacaboen
elcitosolydebesertransportadohaciafueradelamitocondria)Alfa‐
Cetoglutarato1. Se convierte reversiblemente a glutamato, que puede entonces incorporarse a
proteínasyusarseparasintetizaraminoácidosonúcleotidos.Succinil‐CoA 1. Puedeiniciarbiosíntesisdeporfirinas(comoengruposhemodecitocromos)
Oxaloacetato
0. Se interconvierte con el aspartato, que se puede usar para la síntesis de urea,aminoácidosynúcleotidosdepirimidina.
1. Laproduccióndeoxaloacetatoporlapiruvatocarboxilasa10tambiénespartedelarutadegluconeogénesis:
LaAcetilCoA activa alostéricamente la piruvato carboxilasa (cuando haymuchoacetilCoA, quiere decir que hay baja cantidad de oxalacetato y que se necesitanmásintermediariosparaelciclo);así,laactivacióndeestaencima:
• SuministraeloxalacetatocomometabolitonecesarioparallevaracaboelCiclodelácidocítrico.
• Puedeiniciarlasíntesisdecarbohidratos(gluconeogénesis).
10EnzimaquecatalizalaconversióndePiruvatoenOxalacetato,mediantelahidrólisisdeunamoléculadeATP.Eselprimerpasodelagluconeogénesis.
Aumentalademandadeenergía
AumentaconcentracióndeAMP
AcpvacióndelComplejoPiruvato
Deshidrogenasa
AumentaproduccióndeAceplCoA
LosmetabolitosdelciclodeKrebsdebenestarseproduciendoparaqueaumentesusconcentracionesyasí,puedametabolizartodoelAceplCoAqueleestéllegando.
ParaelloexistenlasRutasAnaplerómcas,quealimentandeciertosintermediariosdelciclo,
permipendoqueésteseacelereymetaboliceelAceplCoAquele
llega.
19
Nota:paracomprendermejorestecuadro,observarlaimagensiguiente:
Fig.14
Rutasqueconducenalácidocítricoysalendeeste.LoscompuestosintermediosenelciclodeKrebssonprecursoresdecarbohidratos,lípidosyaminoácidos,asícomodenucleótidosyporfirinas.Lasreacciones
queentranalcicloreabastecenlareservadecompuestosintermediosenelciclo.
RUTASANAPLERÓTICAS
Generan Apartirde
Oxalacetato
1. Transaminacióndeaspartato(aminoácido)
Aspartatotransaminasa
Lareacciónqueocurrees:
20
DurantelasreaccionesdeTransaminaciónseproducensiempreentreunalfa‐aminoácido(enestecaso,esaspartato)yunalfa‐cetoácido,dondeelprimerotraspasaelgrupoaminoalalfa‐cetoácidooriginal;dandolugaralasiguienteconversión:
‐ Alfa‐aminoácido1(aspartato)Alfa‐cetoácido2(oxalacetato)‐ Alfa‐cetoácido1alfa‐aminoácido2
LasenzimasquecatalizanestasreaccionessedenominantransaminasasylacoenzimadeestasenzimaseselFosfatodepiridoxal(PLP)11.2. Fosfoenolpiruvato(PEP)
PEPcarboxilasa
3. Piruvato
Piruvatocarboxilasa
Estareacciónconsumeenergía,esirreversible.
Malato
‐ PiruvatoEnzimamálica
Alfa‐Cetoglutarat
o
‐ TransaminacióndeGlutamato(aminoácido)Glutamatotransaminasa
EsunaTransaminación,porloquepresentalasmismascaracterísticasdescritasenlaanteriortransaminación.
Nota:observaresquemasiguiente:
11EstacoenzimaprovienedelavitaminaB6ydebeestarpresentesiemprequeunatransaminasaquieraactuar.
21
Fig.15Majorbiosyntheticrolesofsomecitricacidcycleintermediates(Mathews)
Energía
(TomadodelaAnimación)Elciclodelácidocítricoesunmayorproductordecoenzimasreducidas(NAHD+HyFADH2).
NAHD(3) GTP(1) FADH2(1)Seproducenen:1. Paso3(isocitrato
deshidrogenasa)2. Paso4(Complejodeα ‐
cetoglutarato)3. Paso8(Malato
deshidrogenasa)
Seproduceen:1. Paso5(Succinil‐CoA
sintetasa)
Seproduceen:1. Paso6(Complejode
succinatodeshidrogenasa)
22
ShuttledeCitrato12
Whenacetyl‐CoAaccumulatesinthemitochondrialmatrix(forexample,afterabigmeal),itmustbemovedtothecytoplasmwhere itcanbeused infattyacidbiosynthesis.Acetyl‐CoAcannotpassdirectlythroughthe innermembraneof themitochondrion,however,andmustbeshuttledoutof themitochondriononthebackofoxaloacetate(toformcitrate).Estefuncionaasí:
Fig.16
FuncionamientodelShuttledeCitrato,dondeelexcesodeAcetilCoA,transformadoencitratoseutilizaparaLipogénesis.
12Nota:sedescribeaquí,debidoaquealfinalizarelcapítulo13,elLic.Gonzaloloexplicó.
Cuando:1.Yasecubrióla
demandadeenergía2.Nohaydemandadeenergía(Metabolismo
basal)
3.Losdepóspcosdeglucosayglucógeno
están"llenos"
LaacumulacióndeAceplCoAseuplizaparaLipogénesis
(Lainsulinapromuevelipogénesis)
ElAceplCoAseuneconOxalacetatoyforman
Citrato
El"ShuoledeCitrato"sacaalcitratodela
mitocondría
IniciaprocesodeLipogénesis
23
Theneteffectofthesereactionsisthatacetyl‐CoAismovedoutofthemitochondrionandcytosolicNADHisconvertedtocytosolicNADPH.NADPHisused,inturn,forthebiosynthesisoffattyacids.