C. elegans : un espejo de 959 células
description
Transcript of C. elegans : un espejo de 959 células
C. elegans: un espejo de 959 células
Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez Aguilera
Centro Andaluz de Biología del Desarrollo,Universidad Pablo de Olavide, Sevilla.
¿C. elegans?
Caenorhabditis elegans
www.news.wisc.edu
1 mm
Goldstein lab
¿C. elegans?
www.wormatlas.org
Caenorhabditis elegans
Seis cromosomas, dos sexos
www.wormatlas.org
959 células somáticas302 son neuronas95 son miocitos pared
99% de la población
1031células somáticas381 son neuronas
1% de la población
Paul Stenberg’s Lab
Reproducción (a)sexual
Asexual
• Obtención y propagación de cepas genéticamente homogéneas• Facilidad de obtención y mantenimiento de estirpes homocigóticas• Mutagénesis en condiciones controladas
Sexual• Mapeo genético por cruces• Estudios con heterocigotos• Retrocruzamiento con parentales• Estudios de segregación ligados al sexo
Desarrollo de C. elegans
www.wormatlas.org
(558 cells)
(959 cells)
Desarrollo de C. elegans
www.wormatlas.org
Goldstein lab
Linaje embrionario
www.wormatlas.org
Linaje post-embrionario
www.wormatlas.org
Estructura génica
(in humans 8.8 ± 1.2 exons/gene)
www.wormbook.org
Estructura génica
www.wormbook.org
27.000 genes humanos23.000 genes C. elegans
Genoma secuenciado
www.wormbook.org
ww
w.w
orm
bo
ok.
org
ww
w.w
orm
ba
se.o
rg
Termotactismo
Rosenzweig et al. , Gen. Dev 19: 419-424, 2005
Quimiotactismo
Hir
ots
u e
t al
. G
enes
to
Cel
ls (
2005
) 10
, 51
7-53
0.
Mutantes a la carta por ARNi
Silenciamiento por alimentación
Transformación por microinyección
• vectores purificados (miniprep), segmentos lineales de ADN (digestiones), productos de PCR
• Arrays extracromosómicos, poca estabilidad, herencia
www.wormbook.org
Sam Ward's lab
Transformación biolística
• Integración cromosómica, estable, mutaciones colaterales
www.bio-rad.com www.bio-rad.com
Algunos recursos
• Wormbase• Wormbook• Wormatlas• Wormimage• Wormserver• Wormclassroom• Textpresso• KO consortium• CGC Genetics Center
C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético
www.wormbook.org
C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético
www.wormbook.org
C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético
Señalización y energía
www.wormbook.org
Interacción rutas metabólicas
www.wormbook.org
Efectos deletéreos en mutantes coq
N2 coq-1
coq-2 coq-8
Ga
vilá
n
et
al.,
Bio
fact
ors
, 2
00
5
Degeneración muscular faríngea
Ga
vilá
n
et
al.,
Bio
fact
ors
, 2
00
5
coq-1 coq-2 coq-8 / N2
Alteraciones bombeo faríngeo
N2 coq-1 coq-2
Ga
vilá
n
et
al.,
Bio
fact
ors
, 2
00
5
Fenotipos de mutantes coq
Gavilán et al., Biofactors, 2005
Eexpresión larvaria de coq-8
Ase
cio
et
al.,
Me
ch.
Ag
e.
De
v. 2
00
6
Expresión adulta de coq-8
Ase
cio
et
al.,
Me
ch.
Ag
e.
De
v. 2
00
6
Ase
cio
et
al.,
Me
ch.
Ag
e.
De
v. 2
00
6
Expresión embrionaria de coq-8
Ase
cio
et
al.,
Me
ch.
Ag
e.
De
v. 2
00
6
Fácil y asequible
www.nematodes.org
• Una lupa estereoscópica con transiluminación (4.000 €)• Una estufa con termostatización (1.500 €)• Un mechero de gas (50 €)• Reactivos varios (300 €)• Pipetas (400 €)
• Incubador de cultivos: un cajón (0 €)• Libros técnicos especializados (0 €)• Librería de mutantes (0 €)• Librería de vectores de expresión (0 €)• Librería de vectores de silenciamiento (0 €)• Suscripción a bases de datos genéticas (0 €)
• Aprendizaje y destreza (3 meses)
Entra en el “mundo elegans”…
by Adam Hartley and Carolyn Marks
Gracias por su atención
Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez AguileraCentro Andaluz de Biología del Desarrollo,
Universidad Pablo de Olavide, Sevilla.