Breeding progress through data acquisition and data analysis Bachmann Neu i… · Introduction of...
Transcript of Breeding progress through data acquisition and data analysis Bachmann Neu i… · Introduction of...
Breeding progress through data acquisition and data analysis
Schweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V.
Dr. Norbert Bachmann
SSV breeding strategies
Execution of breeding in the SSV according to phase program: Phase I
In case „problems“ occur increasingly within the population,data will be collected.
“Problems” can be aberration of health as well as deviations in the exterior.
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V.
SSV breeding strategies
Execution of breeding in the SSV according to phase program: Phase II
Evaluation of the data collected in phase I.
Creation of a breeding program involving the club membersas well as scientific support.
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
Verification of the breeding success(population analysis)
• continue the breeding program
• modificate the breeding program
• stop the breeding program.
SSV breeding strategies
Execution of breeding in the SSV according to phase program: Phase III
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
health / high life span
FCI standard for Bernese Mountain Dogs
• movement (functional properties)
• behavior (functional properties)
• exterior
SSV breeding strategies
Breeding goals-priority list
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
health / high life span• increase the average• life span -> 9-10 years
fighting cancerfighting hip dysplasiafighting elbow dysplasia
SSV breeding strategies
Breeding goals-priority list
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
Movement (functional properties)
“GAIT / MOVEMENT :Sound and balanced movement in all gaits covering a lot of ground; free stride reaching well out in front, with good drive from behind; at the trot, coming and going, legs moving forward in a straight line. “
SSV breeding strategies
Breeding goals-priority list FCI standard for Bernese Mountain Dogs:
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
important for quality of life!
„BEHAVIOUR / TEMPERAMENT:
Self-confident, attentive, vigilant, fearless in every day situations; good-naturedanddevoted to his own people, self-assured and placid towards strangers ; of medium ; of medium temperament, docile.
SSV breeding strategies
Breeding goals-priority list FCI standard for Bernese Mountain Dogs:
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
important for quality of life !!!important for quality of life!
SSV breeding strategies
Breeding strategies since 1978 until 2012
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
Data capturingData storage
Data maintenanceTransparency of data (understandable for
every breeder)
Breeding withphenotypicinformation
Blood sample collectionBlood sample processing
Blood sample warehousingDNA-extraction
Since 1996
Data capturingData storage
Data maintenance
Blood sample collectionBlood sample processing
Blood sample warehousingDNA-extraction Breeding with
phenotypicinformation
Breeding withgenomic breeding
values
until 2012
from 2012 on
SSV breeding strategies
Promotion of data density / data transparency
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
Voluntary measures (examples) • questionnaire activities • reward of transparency • annual publication of the reporting rates of live and death
Non Voluntary Breeding regulations (examples) • responsibility to genome testing from the third litter..." • "10 out of 14 ancestors must have death or life reports • publication of data in database
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: life span
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
102,62 102,98103,53
101,7
97,22
93,41
100,4
98,77
92,2792,82
91,45
96,27
91,14 91,05 90,64
97,51 97,58
80
85
90
95
100
105
1986-1989/6
17 Mel
d.
1990/196 M
eld.
1991/230 M
eld.
1992/222 M
eld.
1993/268 M
eld.
1994/316 M
eld.
1995/306 M
eld.
1996/351 M
eld.
1997/483 M
eld.
1998/388 M
eld.
1999/372 M
eld.
2000/319 M
eld.
2001/438 M
eld.
2002/492 M
eld.
2003/401 M
eld.
2004/335 M
eld.
2005/289 M
eld.
ave
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s, S
SV
Year of birth Bernes Mountain dogs,SSV
SSV breeding strategiesPhase III - Breeding success review (population analysis)Example: life span
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
1990 1991 1992 1993 1994 1996 1997 1998 1999 2000 Formulare „Totmeld-ungen“
Blutabnahme bei Zuchthunden für eine "Blutbank" Dr. Terill Eckart referiert zum Malignen Histio- zytose bei dem SSV-Zucht- in Hohenroda
„Lebenserwartung beim Berner Sennenhund“ wird zum zentralen Thema
ca. 550 Todmeldungen
2001 2002
Fragebögen "Tod-/Lebendmeldung" Meldeverpflichtung Lebend-/Todmeldung
2. internationales Gesundheitssymposium in der Schweiz, der SSV stellt zum erstmalig seine Zuchtstrategien zu Langlebigkeit und Gesundheit vor. C.Fechler/ Dr. N. Bachmann
Altersfrischewettbewerbe Einführung SSV-Kurier als neues Medium Informationsartikel zum Lebensalter durch Arbeitskreis Berner 1. internationales Gesundheitssymposium in der Schweiz,
K.Klaiber Präsident C. Fechler Zuchtleiter u. Zuchtbuchführer
2003 2004 2005 Gesundheitssymposium
Hohenroda Zuchtplan Berner Sennenhunde: "Lebenserwartung Berner
Sennenhunde" zentrales Thema
Deckrüdenbeschränkung/-
umverteilung Höhere Lebenserwartung in SSV-
Chronik als Zuchtziel durch
Arbeitskreis Berner formuliert
"10 von 14 Regel, Lebend-
/Todmeldung" Anerkennung der Frühsterblichkeit
als "genetisches Problem"
Randomisierung
Röntgenkandidaten
Dr. N. Bachmann, Präsident
C. Fechler Zuchtleitung
Satzungsreform: Zuchtentscheidung: Zuchtausschuss u. Mitgliederversammlung
Introduction of the genome test on a voluntary basis: 2012• 1000 dogs tested genomically• 917 registered in Dogbase• 364 are dead
Publication of results for life expectancy, hip dysplasia and elbow dysplasia
SSV pretest (histiocytic sarcoma, MH)
SSV breeding strategiesPhase III - Breeding success review (population analysis)Example: life expectancy and genomic breeding values
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: life expectancy and genomic breeding values
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
1 2 3 4 5mittlere Lebenserwartung in Monaten 152 132,3 107,8 82,5 54,3mittlerer genomischer Zuchtwert
"Langlebigkeit" 121,4 112 102,3 89,7 80,1
152
132,3
107,8
82,5
54,3
121,4112
102,3
89,780,1
0
20
40
60
80
100
120
140
160
Life ecpectancy corelatingwith the genomic
breedingvalue for longevity
347 genomically tested dogs,reported dead
(07/2018)
mittlere Lebenserwartung inMonaten
mittlerer genomischer Zuchtwert"Langlebigkeit"
Lineair (mittlerer genomischerZuchtwert "Langlebigkeit")
Gr. 2:120- 143 Mo Gr. 4: 72- 95 MoGr. 3: 96- 142 Mo Gr. 5:< 72 MoGr. 1: > 143 Mo
42 dogs 74 dogs 85 dogs 79 dogs 76 dogs
average life expectancies in months
average genomic breeding value“longevity“
Linear (average genomicbreeding value “longevity“)
average life expectancies in months
average genomic breeding value“longevity“
We can draw the following conclusions:A high age means a high genomic life value.
In case the curve runs similarly linear in the next 3 to 5 years when a majority of the test candidates will be dead, we can for sure claim the genomic breeding value for age a suitable breeding instrument to increase the life expectancy.”
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: life expectancy and genomic breeding values
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: life expectancy and genomic breeding values
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
1 2 3 4 5mittlere Lebenserwartung in Monaten 152 132,3 107,8 82,5 54,3mittlerer genomischer Zuchtwert "Histiozytäres
Sarkom" 90,6 91,4 101,7 117,7 107,6
152
132,3
107,8
82,5
54,3
90,6 91,4101,7
117,7107,6
0
20
40
60
80
100
120
140
160
Life expectancy in relation toto the genomic breeding
value for "Histiocytic sarcoma"
(07/2018)
mittlere Lebenserwartung in Monaten mittlerer genomischer Zuchtwert "Histiozytäres Sarkom"
Gr. 2:120- 143 Mo
Gr. 4:72- 95 MoGr. 3: 96- 120 Mo
Gr. 5:< 72 Mo
Gr. 1: > 143 Mo
42 dogs 74 dogs 85 dogs 79 dogs 76 dogs
average genomic breeding value „Histiocytic sarcoma“
average life expectancies in months
average genomic breeding value„Histiocytic sarcoma“
average life expectancies in months
Conclusio: For reaching a very high age> 10 years the SSV-pretest alone is not meaningfulThe results of the SSV-pretest within the group 10 years and older (reached age) as well as within the group „died under the age of 8” are on a similar level.Therefore a simultaneous consideration of the genomic breeding value for age is essential for the breeding progress.
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: life expectancy and genomic breeding values
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: X-ray rate
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
0
10
20
30
40
50
60
70
%
1983 1985 1987 1989 1991 1993 1995 1997 1999 2001 2003 2005 2007 2009 2011 2013 2015 2017
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: hip-dysplasie
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
BERNER SENNENHUND
0%
20%
40%
60%
80%
100%
1983
1985
1987
1989
1991
1993
1995
1997
1999
2001
2003
2005
2007
2009
2011
2013
2015
2017
Geburtsjahrgang
HD-frei HD-Verdacht HD-leicht HD-mittel HD-schwer
SSV breeding strategies
Phase III - Breeding success review (population analysis)Example: ellbow-dysplasie
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
0%
20%
40%
60%
80%
100%
1997
1998
1999
2000
2001
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
2013
2014
2015
2016
2017
Geburtsjahrgang
ED-frei ED-Grad I ED-Grad II ED-Grad III
• Collection and record of data• Data density• Data quality• Blood sample collection• Constant evaluation and verification of the development of
breeding progress
SSV breeding strategies
The long way to healthy, suitable and standard-conformantdogs
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann
Thank you for your attention!
Dr. Norbert BachmannSchweizer Sennenhund-Verein für Deutschland e.V. Dr. Norbert Bachmann