Bioinformatika plastidu – tohle není název ode mne:-) · PDF fileROSIDS...
8
Bioinformatika plastidu – tohle není název ode mne:-)
Transcript of Bioinformatika plastidu – tohle není název ode mne:-) · PDF fileROSIDS...
Bioinformatika plastidu – tohle není název ode mne:-)
Zelený sekundární plastid vznikl nejméně dvakrát nezávisle na sobě
70 proteinových sekvencí 70 nukleotidových sekvencí
Turmel et al., Mol Biol Evol 2009
Fylogeneze streptofyt z pohledu plastidového genomu
Lemieux et al., BMC Biol 2007
45 proteinových sekvencí 45 nukleotidových sekvencí
Rychle se vyvíjející pozice – zdroj fylogenetické nekozistence
Plastidová fylogeneze
krytosemenných81 genů
(76 583 nukleotidových pozic)
Jansen et al., PNAS 2007
Bazální Amborella – artefakt v důsledku šumu?
Goremykin et al., J Mol Evol 2009
Bazální Amborella – artefakt v důsledku šumu?
Dynamicky se vyvíjející struktura plastidového genomu
Cai et al., J Mol Evol2009