Bioinf 2012 g1

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Universidad Ricardo Palma Facultad de Ciencias Biológicas E.A.P Biología INTEGRANTES: - Aguirre Aysanoa, Vanessa - Carrión Herrera, Cinthya - Pérez Effio, Nidia PROFESOR: Roberto Pineda CURSO: Bioinformática CICLO: 2012-I

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Exposición de Alumnos Bioinformatica 2012

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Universidad Ricardo PalmaFacultad de Ciencias Biológicas

E.A.P Biología

• INTEGRANTES:

- Aguirre Aysanoa, Vanessa

- Carrión Herrera, Cinthya

- Pérez Effio, Nidia

• PROFESOR: Roberto Pineda

• CURSO: Bioinformática

• CICLO: 2012-I

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Las secuencias o genes ortólogos son aquellas secuencias homólogas

que se han separado por un evento de especiación.

La evidencia más concluyente de que dos

genes similares son ortólogos es el resultado del análisis filogenético

sobre el linaje de ese gen.

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Resulta esencial para inducirla respuesta de la célula anteel daño del ADN, deteniendoel ciclo celular en casode mutación. El gen p53 esun gen supresor tumoral quedesempeña un papelimportante en apoptosis ycontrol del ciclo celular.

El gen p53 o tp53, tambiénllamado el "guardián delgenoma", se encuentra en elbrazo corto del cromosoma 17(17p13) y codifica un factorde transcripción nuclear de43.7 Kda.

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Filo•Chordata

Clase•Mammalia

Familia•Muridae

Filo• Chordata

Clase• Mammalia

Familia• Canidae

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Filo•Chordata

Clase•Mammalia

Familia•Bovidae

Filo• Chordata

Clase• Mammalia

Familia• Cercopithecidae

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Filo•Chordata

Clase•Mammalia

Familia•Monodontidae

Filo•Chordata

Clase•Mammalia

Familia•Hominidae

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Filo• Chordata

Clase• Amphibia

Familia• Pipidae

Filo• Chordata

Clase• Actinopterygii

Familia• Adrianichthydae

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Filo• Arthropoda

Clase• Malacostraca

Familia• Penaeidae

Filo• Echinodermata

Clase• Echinoidea

Familia

• Strongylocentrotidae

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Filo• Arthropoda

Clase• Insecta

Familia• Bombycidae

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Simbología:

. Menos parecidos

: No son iguales, se

parecen en alto grado

* Identidad (igualdad)

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El supresor de tumores o p53 se une al ADN con sus cuatro brazos. En la

imagen que se muestra aquí (construido a partir 1tup, 1olg y 1ycq), dosdominios de p53 están ligados en la parte superior de la cadena deADN y dos se han consolidado en el mismo sitio en la parte inferior.

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La molecula tiene 3 copias de dominios ligados al ADN.

Presenta:

Estructura beta con

hojas antiparalelas,

cada una con

cintas.

Loops o bucles

externos.

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Las mutaciones más

comunes: Arginina AA 248 =

color rojo Residuos de arginina

AA 175, 249, 273 y 282; y

glicina AA 245 = color

rosa

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248 y 273 son Arg y se unen

directamente al ADN

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Cadena A, B y C (= molécula o domino ligado al ADN)

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Cytoscape es un software bioinformatico de “open source” para visualizar las redes de

interacción molecular y la integración con los perfiles de expresión génica y otra data. Además

tiene aplicaciones complementarias.

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