Atelier Pubmed Décembre 2012
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Medline via l’interface Pubmed
Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO
BU Santé
DécembreDécembre 2012 2012
Décembre 2012
![Page 2: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/2.jpg)
Objectifs de la séance
Connaître les principes de constitution de la base Medline
Se repérer dans Pubmed
Savoir effectuer une requête pertinente dans la base
Savoir mettre en place des alertes sur un thème
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Medline, quelques principes
Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA
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Ne pas confondre
Medline ≠ Pubmed
Le contenu(la base de données)
L'interface d'interrogation
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Bases de données Un éditeur privé ou un
organisme institutionnel
Un référencement humain
Un thésaurus organisé
Une interface d'interrogation
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Medline
Qui?
Quoi?
Thésaurus MESH
Interface PUBMED (il en existe d'autres)
National Library of Medicine Etats-Unis)
20 M de références d'articles biomédicaux,
issues de 5200 périodiques depuis 1948
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Pubmed, quelques repères (interface web)
Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY
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Vos premiers pas dans Pubmed
Recherche libre sur la grippe H1N1 chez les femmes enceintes
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
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Présentation de la liste des résultats
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Quelques filtres
Triez vos résultats pour n'afficher que les articles écrits en anglais ou en français
Précisez votre recherche en ne sélectionnant que les revues de la littérature
![Page 11: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/11.jpg)
Types d'articles : rappel Case report / étude de cas Clinical Trial / essai clinique Randomized Controlled Trial / essai clinique
en aveugle avec groupe contrôle Practice guideline / recommandation de
bonne pratique Review / revue de la littérature Systematic Review / revue systématique Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)
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Pour des recherches fines : le Mesh
Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC
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S'il te plaît, dessine-moi...
...un thésaurus
Vocabulaire normalisé
Descripteurs
Hiérarchie
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Plusieurs synonymes, un seul descripteur officiel
Syndrome, Down
Down's Syndrome
Downs Syndrome
Syndrome, Down's
Mongolism
Trisomy 21
Trisomy 21, Meiotic Nondisjunction
Trisomy 21, Mitotic Nondisjunction
Down Syndrome, Partial Trisomy 21
Partial Trisomy 21 Down Syndrome
Down Syndrome
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Le thésaurus de Medline : le MeSH
Medical Subject Headings
Mots-clefs uniquement en anglais
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
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Le MESH
Descripteurs (>25 000)
Qualificatifs (83)
« L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de l'interrogation de Medline »*
*(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)
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Les opérateurs booléens.
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Recherche libre vs. Équation de recherche
Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques
multiple sclerosis
environmental factors
1213 résultats – pas tous pertinents
Multiple Sclerosis/etiology"[Mesh]
AND environment[Mesh]
378 résultats pertinents
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Un exemple de recherche
Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné
publiés les 10 dernières années
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Un exemple de recherche
Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années
"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh]
+ Filters : English, French, published in the
last 10 years
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![Page 22: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/22.jpg)
Correspondances Mesh français – Mesh anglais
=> « Mesh bilingue de l’INSERM » :http://mesh.inserm.fr/mesh/
ou
=> « Portail terminologique de santé » (CISMEF)
http://pts.chu-rouen.fr/
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Bref
« Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de
l’hôpital ou entre 2 stations de métro avec son
smartphone ou sa tablette. »
Philippe Eveillard
Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr
![Page 24: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/24.jpg)
Exercices1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
à la chirurgie de l’ostéochondritede hanche à l’épidémiologie de la maladiede Crohn
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Réponses1- Rechercher les affiliationsdescripteurs/qualificatifs correspondant :
à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche"Legg-Calve-Perthes Disease/surgery"[Mesh]
à l’épidémiologie de la maladie de Crohn"Crohn Disease/epidemiology"[Mesh]
![Page 26: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/26.jpg)
1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte d'équation de recherche et rebond)
3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
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2) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)
3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
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3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
3) Directement dans la barre de recherche simple
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La veille dans Pubmed : services personnalisés
Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr
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My NCBI : votre Pubmed personnalisé
Ouvrir un compte sur My NCBI « Sign in » « Register for an account »
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Paramétrer dans votre compte les filtres suivants
Anglais Français Texte intégral gratuit BU Santé Brest
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Filtre « BU Santé Brest »
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Icône UBO pour l'accès direct au texte intégral
![Page 34: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/34.jpg)
Exercice
2 - Saignement de nez et hypertension
Recherche de références à partir des mots MESH etsauvegarder des références dans MY NCBI
![Page 35: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/35.jpg)
![Page 36: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/36.jpg)
Exercice
3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu.Exclure les traitements médicamenteux et lachirurgie.
Limiter aux recommandations de bonne pratique publiées ces deux dernières années
![Page 37: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/37.jpg)
Exercice3 - ("Acute Coronary Syndrome/therapy"[Mesh])
NOT
( "AcuteCoronary Syndrome/drug therapy"[Mesh] OR "AcuteCoronary Syndrome/surgery"[Mesh] )
![Page 38: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/38.jpg)
Du problème de la veille
équation de recherche ≠ équation de veille
![Page 39: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/39.jpg)
Des mots MESH ?.
Ne contient pas de mots MESH
Contient des mots MESH
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Exercice
4 - Trouvez les articles les plus récents sur le diagnostic de la mucoviscidose(sans utiliser les mots Mesh)
![Page 41: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/41.jpg)
Solution : le champ Title/abstract ou [tiab]
« cystic fibrosis/diagnosis »[Mesh]
Équation de recherche (pour des résultats les plus
pertinents possibles)
(« cystic fibrosis »[tiab] OR « mucoviscidosis »[tiab]OR
« fibrocystic disease »[tiab]) AND diagnos*[tiab]
Équation de veille (pour des articles récents / pas
forcément aussi pertinents)
![Page 42: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/42.jpg)
Créer une alerte dans MyNCBI
![Page 43: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/43.jpg)
![Page 44: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/44.jpg)
Retrouvez le support en ligne sur
http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine
![Page 45: Atelier Pubmed Décembre 2012](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042623/548318b4b4af9faf0d8b495f/html5/thumbnails/45.jpg)
Ateliers BU Santé 2013
autres ressources en Santé (parce qu'il n'y a pas que Pubmed dans la vie...) mercredi 16 et 23 janvier 2013
Sudoc Cochrane Library Pascal BDSP Cismef EM-Premium
Zotero les mercredi 30 janvier, 13 et 20 février 2013
Inscription libre surhttp://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine