Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national...

58
Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention on Biological Diversity Capacity and Needs for Taxonomic Knowledge Dayne Buddo Ph.D. April 2010

Transcript of Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national...

Page 1: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

 

Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention on Biological Diversity

Capacity and Needs for Taxonomic Knowledge  

Dayne Buddo Ph.D.          

April 2010      

 

 

 

 

Page 2: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 2  

Contents List of Figures ................................................................................................................................................3 

List of Tables .................................................................................................................................................3 

List of Acronyms............................................................................................................................................3 

1.0  Introduction .....................................................................................................................................6 

2.0 The Ideal Situation for Taxonomic Knowledge .....................................................................................10 

2.1  Agency and Research Programmes ...............................................................................................11 

2.2  Human Resources ..........................................................................................................................12 

2.3  Information Management .............................................................................................................13 

3.0  Major Findings: Resource and Capacity Assessment.....................................................................15 

3.1  The Institute of Jamaica – Natural History Museum of Jamaica (NHMJ) ......................................15 

3.1.1  The Jamaica Clearing‐House Mechanism (The JA CHM) .......................................................20 

3.2  The Department of Life Sciences (DLS) – UWI Mona.....................................................................20 

3.2.1  The UWI Herbarium ..............................................................................................................21 

3.2.2  Marine Taxonomy .................................................................................................................23 

3.2.3  Plant Mycology and Nematology ..........................................................................................25 

3.2.4  Entomology ...........................................................................................................................26 

3.2.1  The Centre for Marine Sciences (CMS), Department of Life Sciences ......................................27 

3.2.1.1  The Caribbean Coastal Data Centre (CCDC)......................................................................27 

3.3  The National Environment and Planning Agency (NEPA) ..............................................................29 

3.4  The Ministry of Agriculture and Fisheries......................................................................................30 

3.4.1  The Forestry Department......................................................................................................31 

3.4.2  The Fisheries Division............................................................................................................31 

3.5  The Non‐Governmental Organizations ..........................................................................................32 

3.5.1  The Nature Conservancy .......................................................................................................32 

3.5.2  Jamaica Conservation and Development Trust (JCDT) .........................................................33 

4.0  Conclusions from Main Findings....................................................................................................38 

5.0  Recommendations for Bridging the Gaps in Taxonomic Knowledge.............................................47 

6.0  References .....................................................................................................................................56 

Appendix 1‐Taxonomic Questionnaire .......................................................................................................57 

Page 3: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 3  

List of Figures 

 Figure 1: Sites for Reef Check (blue triangles) and AGRRA (red dots) (Creary, CCDC 2006) ......................29 

 

List of Tables  

Table 1: Breakdown of Botanical Collections at NHMJ (IOJ) ......................................................................16 

Table 2: Breakdown of Zoological Collections at the NHMJ (IOJ) ...............................................................16 

Table 3: Summary of National Capacity and Gaps in Taxonomy ................................................................42 

 

List of Acronyms  

ABRS    Australian Biological Resources Study 

AGRRA   Atlantic and Gulf Rapid Reef Assessment  

BJCMNP  Blue and John Crow Mountains National Park 

CARICOMP  Caribbean Coastal Marine Productivity 

CBD    Convention on Biological Diversity 

CCDC    Caribbean Coastal Data Centre 

CCAM    Caribbean Coastal Area Management Foundation 

CCMS    Conservation of Migratory Species of Wild Animals 

CITES    Convention on International Trade in Endangered Species of Flora and Fauna 

CMS    Centre for Marine Sciences 

Page 4: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 4  

CPACC    Caribbean Planning for Adaptation to Climate Change  

CWIP    Jamaica Coastal Water Quality Improvement Project  

DBML    Discovery Bay Marine Laboratory 

DLS    Department of Life Sciences 

EFJ    Environmental Foundation of Jamaica 

GCRMN  Global Coral Reef Monitoring Network  

GTI    Global Taxonomy Initiative 

I3N    IABIN Invasive Information Network 

IABIN    Inter‐American Biodiversity Information Network 

IAS    Invasive Alien Species 

IOJ    Institute of Jamaica 

IT IS    Integrated Taxonomic Information System 

JA CHM  Jamaica Clearing House Mechanism 

JCDT    Jamaica Conservation and Development Trust 

JCRMN   Jamaica Coral Reef Monitoring Network  

MACC    Mainstreaming Adaptation to Climate Change 

MCZ    Museum of Comparative Zoology 

Min. of Ag.  Ministry of Agriculture 

NBSAP   National Biodiversity Strategy and Action Plan 

NCU    Northern Caribbean University 

NEGAR   National Ecological Gap Assessment Report 

NEPA    National Environment and Planning Agency 

Page 5: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 5  

NHMJ    Natural History Museum of Jamaica 

NLBIF    Netherlands Biodiversity Information Facility 

NOAA    National Oceanographic and Atmospheric Administration 

OECS    Organization of Eastern Caribbean States 

PEET    Partnerships for Enhancing Expertise in Taxonomy 

PRML    Port Royal Marine Laboratory 

TNC    The Nature Conservancy 

UK    United Kingdom 

UWI    University of the West Indies 

WBD    World Biodiversity Database 

Page 6: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 6  

1.0  Introduction  

Taxonomy is the science of naming living organisms. The relation of one individual as a 

similar  species  to another  individual depends on  similarities  in external morphology,  internal 

anatomy and genetic  composition.  Individuals deemed  to belong  to  the  same  species would 

exhibit  similar physiology, ecology and  fecundity, and would have  the  capacity  to mate with 

each other producing viable offspring.  

Conservation of biological diversity is often focussed on the ecological status of species, 

especially  the  endemic,  endangered  and  rare  species.  Taxonomy  therefore,  would  play  an 

integral role in first identifying the species located in a particular area to inform conservation of 

that  species  or  conservation  of  the  habitat  of  the  species.  Therefore  the  first  step  to 

conservation is the determination of the species present in an area to deem that area necessary 

for conservation.  

The  importance  of  islands  in  biodiversity  conservation  has  been  underscored  in  the 

Convention on Biological Diversity (CBD). Islands, especially Jamaica, have shown a high level of 

endemism  as  species  found  on  islands  are  often  not  found  anywhere  else  in  the  world. 

Geographic  isolation over millions of years has  led  to  increased evolutionary divergence and 

increased  speciation.  The  rate  of  increase  in  knowledge  in  taxonomy  is  likely  to  lead  to 

increased  discoveries  of  new  species,  and  perhaps  more  species  of  important  ecological 

significance requiring conservation.  

The objectives of  this assessment of  taxonomic knowledge are  to  identify  the current 

strengths  and  weaknesses  in  taxonomic  knowledge  in  Jamaica  for  both  individuals  and 

institutions, and recommend practical solutions to address the gaps. Relevance to the CBD was 

a constant feature of this review.  

 

 

Page 7: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 7  

Elements of the task included: 

• Define the needs for taxonomic capacity and research 

• Assess the strengths and weaknesses and capacity needs for individuals involved 

in taxonomy 

• Assess the strengths and weaknesses and capacity needs for institutions involved 

in taxonomy 

• Identify  the  gaps  in  taxonomic  research  along  with  the  steps  to  meet  the 

technical capacity requirements  

• Define programmes which need to be established in order to monitor the status 

of selected and/or designated species and environmental areas 

• Investigate  and  propose  best  practices  for  local  implementation  of  suitable 

practices, based on current international standards or procedures 

The Approach and Methodology used in the assessment was designed to capture all the 

pertinent  information  in  a  participatory manner.  Pertinent  documents  and  other  literature 

were reviewed including the CBD and associated documents, National Biodiversity Strategy and 

Action Plan, National Ecological Gap Assessment Report, among others. A questionnaire was 

developed which covered the thematic areas; Agency and their Research Programmes, Human 

Resources and Information Management. The questionnaire has been  included as Attachment 

1 of this report.  

One‐on‐One  interviews were conducted with most of  the selected major stakeholders 

involved  in  taxonomic  research and/or management of  taxonomic  records.   These  interviews 

were conducted with most of the major stakeholders to  identify work being done and ensure 

representation of the various natural realms and groups directly related to their work.  During 

the  interviews  the  questionnaires were  used  as  a  guide.  Identification  of  Needs,  Gaps  and 

Mechanisms  to  fill  the  gaps was done,  and preliminary  findings  and  recommendations were 

presented to the wider stakeholder groups island wide for input and feedback. 

 

Page 8: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 8  

This list comprised:  

 

o University of the West Indies (Mona), Department of Life Sciences  

Herbarium:  Both  the  Curator  and  the  PhD  Researcher  were 

interviewed  to  assess  the  level  of  involvement  of  the  UWI 

Herbarium  in  taxonomic  research,  research  projects  by  the 

Herbarium, extent of taxonomic collections, interfaces with other 

herbaria,  and  technical  and  institutional  capacity  of  the 

herbarium. 

Dr. Mona Webber: Marine Ecology 

Professor Phyllis Coates‐Beckford: Plant Pathology (Nematology 

and Mycology) 

Dr. Katherine Murphy and Dr. Eric Garraway: Entomology 

Dr. Karl Aiken: Fisheries 

o Institute of  Jamaica, Natural History Museum of  Jamaica: The Director, 

Zoologists and Botanists, and the Clearing House Mechanism (CHM) Focal 

Point  (by email) were  interviewed  to assess  the extent of  the botanical 

and zoological collections. 

o National  Environment  and  Planning  Agency:  Representatives  from  the 

Ecosystems Management Branch  including  the Manager. These persons 

were interviewed to assess the required needs for taxonomic knowledge 

to manage  the  resources,  the  capacity  in  the  agency  and  the  national 

linkages with the CBD. 

o The Forestry Department: The Conservator of Forests was interviewed to 

assess the capacity  in taxonomic knowledge of the Forestry Department 

and the needs of the department.  

o The Fisheries Division: The Fisheries Officer acting in the capacity of Data 

Manager was  interviewed to assess the  level of fisheries data possessed 

by the Fisheries Division and the use of the data in fisheries management. 

Page 9: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 9  

o The  personnel  of  the  CMS  and  CCDC  were  consulted  on  numerous 

occasions prior to this project, and documentation on their function and 

capacity in taxonomy available for review. 

o The personnel of the JCDT were consulted on numerous occasions prior 

to  this  project,  and  documentation  on  their  function  and  capacity  in 

taxonomy available for review. 

o The Nature Conservancy 

 

The individuals not interviewed included: 

o Windsor Research Centre: Conflict with time availability 

o Other  Staff  at  DLS:  Conflict with  time  availability  due  to  teaching  and 

examination duties of the researchers. These included Dr. Eric Hyslop, Dr. 

Kurt McLaren, Dr. Byron Wilson.  

o NCU:  Conflict  with  time  availability  due  to  teaching  and  examination 

duties of the faculty 

o BirdLife  International:  Consulted  only  at  Kingston  Workshop,  but 

representative did not produce meaningful inputs 

o National  Arboretum:  Consulted  only  at  Kingston  Workshop,  but 

representative did not produce meaningful inputs 

o Montego Bay Marine Park: Conflict with time availability, and in addition, 

lack  of  experience  of  new Manager  to  address  questions  via  phone  or 

email. 

Page 10: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 10  

2.0 The Ideal Situation for Taxonomic Knowledge  

   Jamaica has a rich biodiversity and the high rate of endemism (ranked 5th  in the world 

for endemism) which is a characteristic of many islands.  The need for effective and coordinated 

approaches  to  taxonomic  research  is  consequently  significant  and provides  a  very  important 

foundation for all biodiversity assessments or conservation planning.  

The  need  for  taxonomic  knowledge  in  Jamaica  has  been  highlighted  in  the  National 

Biodiversity Strategy and Action Plan (NBSAP) as one of the major gaps and challenges affecting 

the conservation and sustainable use of Jamaica’s biodiversity.  

“Overcoming gaps in knowledge of the ecology, taxonomy and systematics, 

and status of species, and overcoming gaps in capacity for these …” 

  Depicted  as Goal  5:  Enhance Resource Management Capacity, within  the NBSAP,  the 

objective  is,  “To  increase  the  number  of  trained  personnel  in  conservation,  biodiversity, 

taxonomy, biotechnology and genetics”. The rationale  is that “Graduate training  is required to 

increase  the  number  of  dedicated  specialists,  especially  in  some  areas  where  no  national 

specialist now exists”.  

This  document  also  cites  the  need  to  identify  training  programmes  locally  and/or 

overseas  to  address  the  gaps  in  knowledge  among  institutions  and  agencies,  as  well  as 

community based and environmental non‐governmental organizations. 

This section outlines the national needs  in taxonomic knowledge to meet the required 

objectives  under  the Convention  on Biological Diversity  (CBD)  and  is done  in  context  of  the 

Jamaican situation. These needs cover the: 

1. agency and research programmes,  

2. human resources and  

3. information management.  

Page 11: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 11  

2.1  Agency and Research Programmes  

There are numerous agencies that are  involved  in biodiversity conservation  in Jamaica. 

These  agencies  include  government,  non‐government  and  academic  entities  spread  across 

Jamaica. Without a Coordinating Body, this would naturally result in overlap in the geographical 

area and the scope of work of these entities, underscoring the  importance of coordination of 

the programmes of work.  

  Generation and management of taxonomic records are essential for all scientific studies 

of  the  environment or biodiversity  and provide  the basis  for  justification of  any biodiversity 

conservation programmes. These records may take the form of actual specimens, species  lists 

or digitised specimen records with the associated taxonomic classifications  for each record. A 

critical  step  in  this process  is  the  accessioning of  these  records using  the  correct  taxonomic 

characteristics of the specimen which will avoid mistakes in future identification of species.  

  The coordination of specimen collections and subsequent accession of these specimens 

is  important  to ensure adequate  representation of  the natural biodiversity of  Jamaica within 

these  collections.  Collection  programmes  in  Jamaica  require  coordination  with  respect  to 

geographical areas as well as taxonomic groups. Such programmes should be firmly entrenched 

into  the  work  programmes  of  these  entities with  the  requisite  budgetary  allocations,  field 

resources and staff. This would allow consistent collections and taxonomic research in Jamaica, 

rather than be confined to the time frame or scope of a project.  

  The research agenda for an entity in Jamaica should be focussed on meeting the needs 

of  the  country.  Therefore,  the  agenda  in  taxonomic  research  should  be  driven  by  gaps  in 

taxonomic knowledge as they pertain to biodiversity conservation. Some areas  in Jamaica are 

not  given  adequate  attention  such  as  the Cockpit Country, Pedro  and Morant Cays, Dolphin 

Head Mountains,  the majority of  Jamaica’s Rivers and others  (NEGAR, 2008)  for a  variety of 

reasons. Some of  these  reasons  include accessibility  to  the  location, costs  for  transportation, 

lack of expertise to study the area,  intellectual  interest  in the area among other reasons. This 

then  results  in  some areas being  studied  in  far more detail and with greater  frequency  than 

Page 12: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 12  

other areas. A mechanism of regular dialogue among entities is needed in the country to guide 

the  research  agendas  as well  as  to  inform  on  the  areas  of  research.  Research  programmes 

should be able to demonstrate relevance to biodiversity conservation in Jamaica. 

   In the recently concluded National Ecological Gap Assessment for the Protected Areas 

System Master Plan (NEGAR, 2008), the  lack of taxonomic data formed a  limiting factor  in the 

assessment.  Also,  some  areas  of  Jamaica  were  in  significant  need  of  better  biodiversity 

information.  These,  and  other  documents  including  the  TNC  Ecoregional  Plan  and  NBSAP, 

should be used to guide the research agendas of the entities.  

  A mechanism  to document  research  in  taxonomy  is  required on a national  scale.  It  is 

required that the mechanism be dynamic and regularly updated. This would also be beneficial 

to  funding  agencies  in  addition  to  research  entities.  A  strong  link  to  the  CBD  Portal  for 

biodiversity information would also prove useful. Naturally, protocols for access to information, 

especially sensitive information, are required. 

 

2.2  Human Resources  

  Taxonomy is a very specialized science, requiring uniquely honed skills and training over 

a number of  years. This  science  is, on  the one hand,  focussed on being able  to  identify and 

accurately assign a name to those species of plants and animals found  in the field; and which 

had previously been found and have a valid published description.   However the greater level 

of skills are required to determine when species new to science have been collected; and the 

associated discipline and process required to properly describe and publish these new species 

and then to also ensure that the international scientific community has access to this data.  The 

vast spectrum of species requires specialists within almost each major taxonomic group to be 

fully confident that the taxonomic knowledge in Jamaica is adequately covered.  

  It is necessary, in Jamaica, to develop academic training programmes in taxonomy at the 

tertiary  level.  These  programmes  should  be  designed  in  a  coordinated  and  participatory 

Page 13: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 13  

manner  to  ensure  a  high  standard  and  reduce  duplication  of  effort. More  intensive  post‐

graduate programmes would be needed  in the country to further the development of skills  in 

the science while filling gaps  in taxonomic knowledge  in Jamaica. Short courses and exchange 

programmes would also be needed to supplement knowledge in some taxonomic groups.  

  Periodic review of the technical capacity in taxonomy is necessary in entities in Jamaica. 

There  is need  for a proactive approach  to ensuring  that  the  full  cadre of  technical expertise 

exists  in  the  country. Upgrade of  skills of existing  staff  is necessary  in  a dynamic manner  to 

ensure that the capacity in taxonomic knowledge is improving.   

 

2.3  Information Management  

  Information management of taxonomic records comprises the collection, identification, 

accession, storage and access. The quality of the information system hinges on the quality and 

effectiveness of all  these  components as well as  the ability  for  the  system  to be dynamic  to 

reflect current national needs.  

  It  is  necessary  to  have  a  national  body  to  coordinate  the  information management 

programme. This body does not need to have an active role in any of the specific elements, but 

should be cognisant of the value of taxonomic knowledge and the role  it plays  in biodiversity 

conservation.  

  The development of comprehensive and accessible collections of taxonomic records  is 

needed  to  adequately  support  research  and  conservation  of  Jamaican  biodiversity.  These 

collections are required to be accessible on a web‐based portal to enable convenient and timely 

use of  information.  It would also be useful to have digitised herbarium records and zoological 

specimens available through this web‐based solution, as opposed to only having metadata on 

the specimens.  This would be more useful in the identification of the unknown species.  

Page 14: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 14  

  A policy for access to taxonomic records and information is required to ensure security 

of specimens as well as protect sensitive  information  that may affect conservation of certain 

species  or  ecosystems. Various  levels  of  access  should  be  critical  to  this  system  so  that  the 

taxonomic  records  benefit  conservation  in  a  controlled manner. A  competent  national  body 

would then be responsible with appropriate legislation to implement and enforce this policy.  

  A key element to taxonomy is a system of dichotomous and polychotomous keys. These 

are used to identify unknown species. There is a need to make these keys readily available to all 

persons who  are working  in  conservation  of  biodiversity.  The  information  system  can make 

these keys available and served  through a web‐based portal. This  is  the case with  the World 

Biodiversity Database and the Global Biodiversity Information Network.  

  Collection of species information from field research is required. A system is needed to 

extract  information  from  scientific  reports  to  be  added  to  the  information  system.  This 

information should go through a system of validation before it is added to the system and made 

available.  

 

Page 15: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 15  

3.0  Major Findings: Resource and Capacity Assessment  

  These major  findings  are  based  on  the  interviews  conducted  with  the  persons  and 

entities described in Section 1.0, as well as through the review of relevant literature.  

   

3.1  The Institute of Jamaica – Natural History Museum of Jamaica (NHMJ)  

  The NHMJ  is  responsible  for  the  collection and management of  the  island’s botanical 

and  zoological  specimens.  It  is  the  repository  for  Jamaica’s  natural  history  and  serves  to 

promote  and  facilitate  research  and  education  on  Jamaica’s  biodiversity.  The  NHMJ  has  a 

programme  in  place  that  is  embedded  in  their  Corporate  and  Operational  Plans  to  collect 

specimens and manage taxonomic records according to prescribed standards for conservation 

of records.  

  There  are  currently  botanical  and  zoological  collections  present  in  the  NHMJ.  The 

Herbarium consists of over 130,000 specimens (see Table 1 below) covering most of the major 

plant  groups  found  in  Jamaica.  The  zoological  collections  comprise  approximately  110,000 

specimens (Table 2 below). There is currently a programme to digitize the botanical collections, 

making the taxonomic records easier to access and share  locally and overseas. The zoological 

collections metadata are also being digitally formatted.  

 

 

 

 

Page 16: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 16  

Table 1: Breakdown of Botanical Collections at NHMJ (IOJ) 

Groups  Estimated Numbers Spermatophyta  90,000 Pteridophyta  24,000 

Algae  8,000 Lichens  2,000 Fungi  6,000 TOTAL  130,000 

 

Table 2: Breakdown of Zoological Collections at the NHMJ (IOJ) 

Specimen Type  Estimated Numbers 

Echinoderms  1318 Annelids  420 

Reptiles  720 Tunicates  125 

Amphibia  800 Mammalia  400 

Coelenterates  1800 Aves  463 

Crustacea  1050 Pisces  5000 

Lepidoptera  8000 Diptera  6500 

Coleoptera  13000 Porifera  200 

Homoptera  6400 Orthoptera  500 

Odonata  2000 Slides  1400 

Eggs  100 Molluscs (marine)  35000 

Molluscs (land)  20000 Arachnida  5000 

TOTAL  110,196 

NB: Estimates based on complete inventory conducted in 1986 as well as  

Specimen counts from the computer database up to 2009. 

 

Page 17: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 17  

The NHMJ  is closely  involved with  the CBD as  the host of  the  Jamaica Clearing‐House 

Mechanism (JACHM). This  is the  island’s biodiversity  information network and  it also has  links 

with  other  taxonomic  databases  which  provide  information  on  species  present  in  many 

countries. The JACHM also hosts the database for invasive alien species (IAS) through the Inter‐

American Biodiversity Information Network (IABIN) – I3N Jamaica Programme. This database of 

invasive alien species for Jamaica was recently updated (in 2007) to encompass all known IAS in 

Jamaica,  and  now  hold  over  80  records  for  Jamaica.  These  records  comprise  taxonomic 

information on the species as well as distribution and management information.  

The NHMJ  is currently conducting  several projects  focussed on  taxonomic  research  in 

Jamaica,  and  has  also  conducted  other  projects  in  the  last  ten  (10)  years.  These  are  listed 

below: 

1: Endemic Trees of Jamaica: Funded by the Environmental Foundation of Jamaica (EFJ) 

examines the taxonomy, distribution, and uses of endemic trees in Jamaica to promote 

best practices and conservation. There are over 350 tree species covered in this project 

which is near completion. A Technical Report and a Field Guide will be produced. 

2: Ongoing accession of zoological taxonomic records into Biolink® and FishBase®. These 

are  two of  the main  zoological  cataloguing mechanisms  currently  in use. Biolink®  is a 

biological database that supports both primary species information, as well as research 

findings and resource persons. FishBase®  is a global Information System on fishes, that 

allows users to search for primary species data, as well as larval fish data and food web 

information.  

3: Cockpit Country Conservation Strategy: Conservation of Cockpit Country, using biota 

to define  the boundaries of  the Cockpit Country and document new  species  found. A 

Technical Report will be produced.  

4: Bird  Survey of Mason River Reserve:    Funded by  the Environmental  Foundation of 

Jamaica  (EFJ)  in 2003 examined  the diversity of avifauna  in  the Mason River Reserve. 

Page 18: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 18  

This Reserve  is also home to one of the NHMJ’s  field stations. A Technical Report was 

produced and can be accessed through the JACHM. 

5:  Lost  Species  in  Cockpit  Country:  This  project  aims  to  rediscover  species  from  the 

Cockpit County  that have not been described  for a very  long period of  time, and are 

feared extinct.  

6: Jamaica Clearing‐House Mechanism (JACHM): Developed in accordance with the CBD, 

this programme has seen the development of a very dynamic biodiversity  information 

network  of  websites,  databases,  institutions  and  people  within  Jamaica  as  well  as 

throughout the party countries to the CBD. 

7: Invasive Fern in Mason River: This project examined the removal of the invasive fern 

Dicranopteris sp.  from the Mason River Reserve to promote the colonization of native 

species. A Technical Report was produced. 

The Research Agenda for the NHMJ is set based on taxonomic gaps in collections, gaps 

in  knowledge  of  particular  taxonomic  groups  or  geographical  areas  as  well  as  current  and 

impending projects. These gaps are  identified based on the requests by external agencies and 

persons for taxonomic records.  For the most part, this agenda is set by the NHMJ.  

  Taxonomic research by the NHMJ is concentrated in the following areas, which has been 

driven by the research agenda and availability of resources: 

• Mason River 

• Green Hills 

• Cockpit Country 

• Around the Central Inlier (Harris Savannah etc) 

• John Crow Mountains  

• Braziletto Mountains  

• Fresh River 

• St. Thomas 

Page 19: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 19  

Research in the following taxonomic areas has been identified by the NHMJ as critically 

needed nationally, and the Museum will aim to target these in future projects.  

• Lower Plants  

• Aquatic Plants 

• Ferns 

• Mites 

• Soil organisms 

• Threatened groups (Orchids, palms, marine mammals, cycads, bromeliads) 

Other needs identified were training in: 

• Molecular taxonomy  

• Identification of Juvenile birds 

 There are  currently  six  (6)  staff members  that are  involved  in  taxonomic  research at 

varying  levels within  the NHMJ. Four  (4) of  the six  (6) have  received scientific  training at  the 

tertiary  level. Their  skills have been  improving  significantly mainly due  to on‐the‐job  training 

and periodic training courses on specific areas such as entomology and botany. The percentage 

of the work effort spent on taxonomic research is estimated to be as low as 20% and as high as 

80% among  these  staff members.   The  low  levels are due  to other  tasks,  such as day‐to‐day 

administration, which have been assigned to the scientific specialists.  

One of the two experts listed for Jamaica on World Taxonomist Database, The Director 

of the NHMJ, currently only spends about 20% of her effort in taxonomy, as the remaining 80% 

is  spent  in  administration  of  the  NHMJ.  This  disparity  is  not  unique  to  the  NHMJ  as  often 

taxonomic scientists are obligated to take on administrative roles which become greater roles 

than their scientific role.  

The  strength  of  taxonomic  knowledge  varies  significantly,  and  is  concentrated  in 

Flowering  Plants  and  Entomology.  The  main  weaknesses  exist  in  the  areas  of  Molecular 

Systematics, Marine Flora and Fauna, Phylogeny and Lower Plants.  

 

Page 20: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 20  

3.1.1  The Jamaica Clearing‐House Mechanism (The JA CHM)  

The  JA  CHM  is  the  island’s  biodiversity  information  network.  It  was  established  in 

accordance with Article 18(3) of  the Convention on Biological Diversity  (CBD).  It supports  the 

National Biodiversity  Strategy and Action Plan. The  JA CHM  receives ad  supplies  information 

through a variety of requests, from sources both locally and internationally. Though the JA CHM 

does  not  generate  taxonomic  information,  it  is  responsible  for  the  dissemination  of  such 

information.  

Species  information  is  held  by  the  JA  CHM  as  species  lists,  and  the  information  is 

available through the internet. This database is also linked to other web‐based portals involved 

in biodiversity such as the Inter‐American Biodiversity Information Network (IABIN). There is an 

online alien  invasive  species database  for  Jamaica as part of  the  IABIN Alien  Invasive Species 

Information Network  (IABIN  I3N)  programme.  This  database  requires  taxonomic  names  and 

classification for the species in the database. 

In  the  Jamaica  I3N database,  the  list of available  species  is based on  ITIS  ‐  Integrated 

Taxonomic Information System, which is an internationally recognized system.  

The JA CHM currently has lists for endemic species. However, these lists are only limited 

to Endemic Birds, Butterflies and Orchids.  

 

3.2  The Department of Life Sciences (DLS) – UWI Mona  

  The Department of  Life  Sciences  (UWI‐Mona)  represent  the  section of  the University 

dedicated  to  the biological sciences. The DLS covers areas of botanical and zoological studies 

spanning  the  terrestrial,  freshwater  and marine  environments.  The  DLS  is  also  involved  in 

conservation management and agricultural applications.    

 

Page 21: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 21  

3.2.1  The UWI Herbarium    

The main  repository  of  floral  taxonomic  information  in  the DLS  is  the  Plant Herbarium.  The 

herbarium  both  generates  and  stores  taxonomic  information.  The  quantity  of  specimens 

represented here are less than those of the NHMJ Herbarium. There are over 35,000 specimens 

covering  Gymnosperms,  Angiosperms  and  Pteridophytes  which  are  represented  by 

approximately  609  species;  3,000  specimens  of  Angiosperms  belonging  to  183  Angiosperm 

families  and  approximately  30  species  belonging  to  4  families  of  Gymnosperms.  These 

collections not only include specimens from Jamaica, but also several countries throughout the 

wider Caribbean Region. 

  Though  the DLS and  the Herbarium are not directly  linked with  the CBD,  they provide 

useful support to the national commitments under the CBD, especially in biodiversity research.  

  Past projects that the herbarium was integrally involved include: 

• 2007: Herbal Plants of Jamaica‐Monica Warner 

• 2004: Flowers of Jamaica‐Monica Warner 

• 2003: Manual of Dendrology, Tracey Parker for the Forestry Department 

• 2002: A Guide to Plants in the Blue Mountains of Jamaica ‐ Susan Iremonger 

• 1985: Ferns of Jamaica‐George Proctor 

• 1972: Flowering Plants of Jamaica, CD Adams 

  One of the major taxonomic projects conducted by the DLS (just recently completed) was 

“Digitising  Jamaica’s  Natural  Botanical  History  Collections”.  This  is  being  done  by  Ph.D. 

Candidate, Philip Rose of the DLS. This project is being done in partnership with the Institute of 

Jamaica  –  Natural  History  Museum  with  funding  from  the  Environmental  Foundation  of 

Jamaica.  It focuses on both herbaria using ten (10) plant families common in the tropics, from 

two (2) collectors who have and are collecting specimens (Harris 1800s‐1915 collection at UWI; 

Proctor 1950’s‐present at NHMJ). Approximately sixteen hundred  (1600) specimens  from DLS 

Herbarium  and  one  thousand  (1000)  specimens  from  NHMJ  Herbarium were  digitised.  The 

Page 22: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 22  

Jamaican Virtual Herbarium  is based on  the WAMP web page/database  software application 

stack  that  integrates  the Windows  operating  system,  Apache web  server, MySQL  database 

server  and PHP Hypertext Pre‐processor  into presenting  a web‐based  interface  that handles 

both back‐end data entry and end‐user database queries  (source: Rose, pers. comm. & Ph.D. 

Project Outline document). 

 

This EFJ Funded Pilot Project  is complete; however, the methodology and principles of 

digitisation of botanical collections have been entrenched in the NHMJ and DLS Herbaria. Both 

herbaria are set  to continue  the  transformation of  the specimen  records  into digital  formats. 

This process is anticipated by both institutions to be ongoing.  

  The  research agenda  for  the DLS‐Herbarium  is  largely based on external national and 

international  requests  for  research  purposes.  There  is  currently  no  research  programme  or 

dedicated researcher as yet for the herbarium and primarily, the herbarium provides support in 

the  field  for researchers. The DLS currently has plans to  introduce a dedicated researcher  for 

the  Herbarium,  but  this  has  not  materialized  to  date.  Once  this  is  in  place  however,  the 

herbarium would have its own research programme. There are no limitations for the herbarium 

to  be  involved  in  taxonomic  research with  respect  to  location,  as  research  is  conducted  all 

across the island as well as in other countries. 

It was cited by the DLS Herbarium that for the most part, the research agenda for the 

herbarium  fills  the  national  needs.  However,  some  taxonomic  groups  of  plants  are 

understudied. These include ferns, gymnosperms and other lower plants. More research is also 

needed for freshwater and marine plants. There are some areas  in Jamaica that require more 

taxonomic  research.  These  include,  in  priority  sequence,  the  Cockpit  Country,  John  Crow 

Mountains, Hellshire Hills and Dolphin Head Mountains. 

There are two (2) persons who work closely with the herbarium. One  is the herbarium 

curator and the other is a PhD student who is close to the end of his graduate programme and 

is responsible for the Digitisation of the Herbarium Project. The range of formal training varies 

from  specific  courses  at  the University  level  to  post‐graduate  training  in  botany  to  the  PhD 

Page 23: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 23  

level. Numerous  courses  have  contributed  to  the  on‐the‐job  training.  These  courses  include 

Smithsonian  Institution  Training  Course  for Herbarium  Employees, Monocot  Flora  of  Puerto 

Rico – Smithsonian Institution, Kew Workshop on Herbarium management and techniques and 

Tropical Flowering Plants course‐Fairchild Tropical Botanic Gardens. On‐the‐job experience has 

been  vastly  important,  as  the  knowledge  gained  from  conducting  research  and  serving  the 

needs  of  scientists  has  been  greater  than  the  knowledge  gained  from  the  training  courses. 

These courses, though useful, are short courses and tend to have very direct areas of focus.  

  Training  in grasses,  ferns and desktop  research  techniques are areas  identified by  the 

staff that are major weaknesses in their technical capacity.  

 

3.2.2  Marine Taxonomy  

Dr. Mona Webber, Senior Lecturer in the Department of Life Sciences is one of the main 

marine  researchers within  the Department of Life Sciences. According  to Dr. M. Webber,  the 

epifauna (aquatic animals that live on the bottom substratum) is reasonably well understood as 

research  in  this  area  has  been  sustained  over  the  years.  Meiofauna  (size  class  between 

microfauna and macrofauna which  tends  to be  the ~50‐500 µm size  range) has been studied 

through the research of then graduate student Avery Galbraith. Mangrove biota  is reasonably 

well  known  through work  done mainly  at  the  Port  Royal Mangroves  out  of  the  Port  Royal 

Marine  Laboratory.  Hard‐bottom  fauna,  such  as  coral  and  algae,  are  also well  studied  and 

understood.  

With  respect  to Sponges,  taxonomic work has been done on mangrove sponges using 

spicules, and a photographic guide was developed. This guide can be used for future taxonomic 

work in mangrove sponges. However, reef sponges are poorly known.  

Nudibranchs  are  also poorly  known. Research done  in  this  area  in  the past has been 

limited to brief descriptions, but the taxonomic range of species on Jamaica has not been the 

focus of any research project.  

Page 24: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 24  

Phytoplankton and Zooplankton  taxonomy  is perhaps  the area  that  is mostly  studied. 

There are also adequate  reference collections of species  that are used  for both  research and 

teaching. These reference collections are also supplemented with photos and taxonomic keys. 

Taxonomic knowledge in the Crustacean zooplankton is especially strong.   

Bryozoans  in Kingston Harbour have been studied  in depth. There  is now a taxonomic 

key produced by Marcia Creary, and  this  is available  for use. Reef bryozoans, however,  is an 

area that requires more taxonomic work.  

Mangrove  ascidians  have  been  extensively  studied  and  documented  by  Prof.  Ivan 

Goodbody,  especially  from  the  Port  Royal  mangroves.  There  are  also  collections  of  these 

specimens at the Port Royal Marine Laboratory and the Department of Life Sciences.  

Other  gaps  in  marine  taxonomy  include  benthic  macroinvertebrate  infauna  and 

jellyfishes.  The  former would  serve  pollution monitoring  activities  for  port  areas  and  urban 

bays, while the latter would be important in trophic interactions in fish stocks.  

Dr. Karl Aiken specialises in fisheries management, ecology and biology. The bony fishes, 

especially  the  commercially  important  groups  such  as  snappers,  parrotfishes,  acanthurids, 

groupers,  jacks  and  triggerfishes  are  well  understood.  There  are  no  comprehensive  fish 

collections, however, photographic and descriptive keys are readily available for assistance with 

taxonomy.  One  of  the  largest  gaps  in  taxonomic  knowledge  in  fishes  is  the  larval  groups. 

Currently, these specimens are only grouped as “larval fish”.  

Dr.  Eric Hyslop  is  the  primary  fish  biologist  in  the Department  of  Life  Sciences. With 

respect  to  freshwater  taxonomic knowledge,  the macroinvertebrates  require more attention. 

This  is  also  a  similar  situation with  freshwater  phytoplankton  and  freshwater  zooplankton. 

Freshwater fish, on the other hand, is reasonably well studied, including the development and 

availability of taxonomic keys and reference collections.  

 

Page 25: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 25  

3.2.3  Plant Mycology and Nematology  

Professor  Phyllis  Coates‐Beckford  is  the  Department’s  expert  on  plant  pathology, 

covering both  the mycology  and nematology  realms  in  taxonomy. Prof. Coates Beckford has 

developed expertise to  identify most of the plant parasites, but only as far as the genus  level.  

There are associates that are used as taxonomic experts on occasions, and these include: 

• Dave Hutton – plant parasites (mainly nematodes) 

• Kadene Williams – Plant nematodes 

• Ministry of Agriculture, Bodles Research Station – fungi and namatodes that are 

parasitic to agricultural plants (3 Officers) 

• Trevor Yee: Mushroom taxonomy 

With respect to gaps in free‐living nematodes in the soil, very little is known about their 

taxonomy. There are keys developed  for  the  temperate and some  tropical areas  that may be 

applicable to Jamaica, but this has not been explored. It is opinion of the Prof. Coates‐Beckford 

that  it  would  be  a  worthwhile  task  to  develop  keys  for  soil  nematodes  in  Jamaica,  first 

examining  the  applicability  of  the  international  keys.  Currently  there  are  no  collections  of 

nematode species, and this would be beneficial to taxonomic work on the group. 

Soil  fungi are not adequately described. Overall,  fungi  research has been  focussed on 

those that affect agricultural crops. Currently there are no collections of fungal species, and this 

would be beneficial to taxonomic work on the group.  

Courses  in Nematology and Mycology have been under‐subscribed over the years, and 

even lead to the removal of these kinds of courses from the teaching roster of the department. 

More  recently,  the  courses have  shown  a  return  to  the desired  subscription  level,  and Prof. 

Coates‐Beckford attributes  this  to a drastic  increase  in  the number of students overall  in Life 

Sciences. This short‐fall in undergraduates being taught the disciplines has also impacted on the 

level of graduate research in the disciplines.  

Page 26: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 26  

Training is required in molecular taxonomy of fungi and nematodes to complement the 

limited morphological  taxonomic expertise. This would provide  faster methods  to  identifying 

the species.  

Training  courses  for  Jamaican  scientists  are  available  in  the  United  States,  more 

specifically, University of North Carolina, Cornell University and University of Florida.   

 

3.2.4  Entomology  

  Entomology in the Department of Life Sciences is lead by Dr. Eric Garraway, with strong 

support from Dr. Catherine Murphy and Dr. Tanice Hall.  

  This  section  houses  a  small  insect  collection.  It  comprises  approximately  500  species 

representing  especially  members  of  the  Lepidopteran  Order.  There  is  also  a  collection  of 

approximately  100  land  snails  (mainly  from  eastern  Jamaica).  However,  there  are  large 

quantities  of  specimens  to  be  curated, which  are mainly  from  undergraduate  and  graduate 

students’ field collections.   

  The  Research  Agenda  is  set  by  Dr.  Garraway  with  inputs  from  his  aforementioned 

colleagues.  Most  of  the  agenda  arises  from  needs  for  conservation  studies  that  are 

encountered by other projects. He uses  the pure  research  to  feed  the applied  research. One 

such example is the pioneering work done on the Jamaica Swallowtail Butterfly.  

  Taxonomic work in this discipline has been limited to Eastern Jamaica for the most part. 

There has been  smaller number of projects  in West End Negril and  the Cockpit Country. Dr. 

Murphy  cited  transportation  and  safety  in  the  field  as main  reasons  for  the  limitations with 

localities for the research. 

  Some  of  the  taxonomic  groups  which  have  been  under‐studied  in  Jamaica  include 

Pyralidae (snout moths), Nocturidae, Caribidae (beetles), Pseudococcidae (mealy bugs) and the 

Homopterans. Many of  these are pest  species, and very  little  is  currently known about  their 

taxonomy.  

Page 27: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 27  

  There are currently 3 lecturers in Entomology and 6 graduate students.  

3.2.1  The Centre for Marine Sciences (CMS), Department of Life Sciences 

 The CMS is responsible for marine research and training in the University. There are two 

marine  laboratories that are under the Department, the Discovery Bay Marine Laboratory and 

Field Station (DBML) and the Port Royal Marine Laboratory (PRML). 

  The  DBML  and  the  PRML  support  the  scientific  research  for  the  UWI’s  marine 

researchers  primarily,  but  also  international  agencies  and  universities.  These  include  Stony 

Brook  University,  Wisconsin  University,  Dartmouth  University,  University  of  Miami,  Florida 

International  University,  National  Oceanographic  and  Atmospheric  Administration  (NOAA), 

Mote Marine Lab among others. These relationships have fostered and encouraged meaningful 

research collaborations and have built technical capacity in Jamaica in marine research. 

Research has been concentrated in the general region of these marine laboratories over 

the years, but research  in other parts of  Jamaica such as Pedro Bank, Portland Bight, Morant 

Bay, Montego  Bay  and  Negril  have  been  done  from  the marine  laboratories.  The  research 

agenda for these entities are determined by the mandate of the CMS and the DLS as they aim 

to provide scientific guidance to the national objectives. Relevance to the country has been a 

feature and will  continue  to be a  feature of  the  research agenda of  the CMS.  Inputs  for  the 

research  agenda  of  the  CMS  have  been  received  from  NEPA,  Fisheries  Division,  Maritime 

Authority  of  Jamaica  and  the  NGO  community.  These  inputs  allow  the  CMS  to  focus  their 

research in areas of national needs.  

  Dr. Dale Webber is an expert in marine phytoplankton. He has also coordinated training 

in  this discipline  through  the  research of graduate  students. Currently,  the CMS and  the DLS 

have  a  total  of  five  (5)  researchers  on  staff  that  are  experts  in  plankton  taxonomy,  both 

phytoplankton and zooplankton.    

3.2.1.1 The Caribbean Coastal Data Centre (CCDC)  

Page 28: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 28  

The main repository for marine taxonomic information within the CMS is the Caribbean 

Coastal Data  Centre  (CCDC).  The  CCDC  is  located  on  the Mona  Campus within  the DLS  and 

serves  as  the main  data  centre  for  the  Centre  for Marine  Sciences.  The  CCDC was  initially 

created in 1993 as the Data Centre for the Caribbean Coastal Marine Productivity (CARICOMP) 

Project,  and  then  became  the  CCDC  in  1998.  It  provides  data  archival  support  to  various 

national  and  regional  marine  monitoring  programs,  such  as  Global  Coral  Reef  Monitoring 

Network (GCRMN) and the Jamaica Coral Reef Monitoring Network (JCRMN).  

The  CCDC  deals with  database  creation  and management  and  provides  reports  and 

summaries for marine data from these programmes and projects. These include: 

• Caribbean Coastal Marine Productivity (CARICOMP) 

• Caribbean Planning for Adaptation to Climate Change (CPACC) 

• Mainstreaming Adaptation to Climate Change (MACC) 

• Atlantic and Gulf Rapid Reef Assessment (AGRRA) 

• Global Coral Reef Monitoring Network (GCRMN) 

• Reef Check® 

• Coral Disease Survey 

• Jamaica Coral Reef Monitoring Network (JCRMN) 

• Fish Survey Data 

• Jamaica Coastal Water Quality Improvement Project (CWIP) 

The generation of taxonomic information on coral reefs is concentrated mainly on hard 

and soft corals, reef fish, sponges, shellfish and some other invertebrates. The localities covered 

are limited and restricted by several factors including accessibility and funding. However, there 

is  a  concentration  of  activities  in  areas where  the marine  research  facilities  (the  Port  Royal 

Marine Laboratory and the Discovery Bay Marine Laboratory and Field Station) are located. The 

other  areas  around  Jamaica  receive  coverage  due  to  the  presence  of  environmental  non‐

governmental organizations. Figure 1 below shows the survey sites for AGRRA and Reef Check.  

Page 29: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 29  

Figure 1: Sites for Reef Check (blue triangles) and AGRRA (red dots) (Creary, CCDC 2006) 

   

3.3  The National Environment and Planning Agency (NEPA)  

NEPA  generates  small  amounts  of  taxonomic  information;  however  it  has  a  heavy 

demand  for taxonomic  information to carry out  its  functions. NEPA does not keep taxonomic 

specimens, but keeps species distribution data which are usually georeferenced. This taxonomic 

information within NEPA is in the form of products of species surveys conducted by the Agency 

or by consultants, and the information is embedded in technical reports.  

The  Agency  is  integrally  involved  in  the  CBD.  It  is  responsible  for  projects 

implementation,  preparation  of  the  National  Reports,  participation  at  CBD  meetings, 

Programme of Work for Invasive Alien Species and also the Focal Point for Access and Benefit 

Sharing.  The focal point for Protected Areas also resides within NEPA. 

The Research Agenda of the Agency is driven by management and conservation goals. It 

generally aims  to  fill gaps  in  information  to  support conservation and management Plans  for 

conservation areas. The NBSAP  is also used to guide this process. Research  is also done as an 

imperative for a development order and focus is given to areas where there is a concentration 

of impending development projects. This is especially important in processing of applications.  

Page 30: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 30  

One of the significant needs is to validate and collate species data that are currently part 

of Environmental  Impact Assessments and other  studies  such as  species  surveys. This would 

assist  in  filling  gaps  in  information  as  well  as  to  provide  greater  input  in  classification  of 

ecological status of species and locations.  

It was  cited  by NEPA  that more  attention  should  be  paid  to  taxonomic  research  on 

grasses and herbs,  insects  (with  the exception of butterflies),  freshwater  faunal  species, and 

endemic  flora  and  fauna  generally.    These  are  seen  as  areas  where  insufficient  biological 

information is available, but better information on these taxa would assist greatly in the design 

and implementation of conservation and management strategies. 

There are currently approximately eight (8) persons involved in some level of taxonomic 

research. These persons have received formal training to the post‐graduate levels as well as on‐

the‐job training and experience. There is an equal spread of the persons between the terrestrial 

zoological  (4)  and  marine  realms  (4),  however,  the  botanical  terrestrial  realm  is 

underrepresented and plant  taxonomists are needed. A permanent  freshwater  taxonomist  is 

also of urgent need within the agency.  

The most significant areas of taxonomic knowledge exist in coral reef species (reef fish, 

hard  and  soft  coral,  and  algae),  seagrasses, wetland  flora  and  fauna,  flora  and  fauna  in  dry 

limestone forests, avifauna, sea turtles, snakes, butterflies and bats.  

The greatest weaknesses in the NEPA exist in the areas of herbs and grasses, freshwater 

species, marine benthic macroinvertebrate infauna, ichtyoplankton and marine sponges. 

 

3.4  The Ministry of Agriculture and Fisheries    

The main  entities  within  the Ministry  that  have  some mandate  for  conservation  of 

biodiversity are the Forestry Department and the Fisheries Division. Both these entities do not 

focus on the generation of taxonomic information; however they are more responsible for  the 

management of the resource through sustainable utilization.  

Page 31: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 31  

3.4.1  The Forestry Department  

  The  Forestry  Department  generates  taxonomic  information  on  a  limited  and  ad‐hoc 

basis.  There  is  not  a  dedicated  taxonomic  research  programme  in  place  at  the  Forestry 

Department.  There  is  heavy  reliance  on  the  resources  of  the  IOJ  and  the UWI Herbaria  for 

support. There is however, the desire by the Forestry Department to establish a small collection 

in  the  future.  The  reliance  on  the UWI‐DLS Herbarium  and  the  IOJ‐NHMJ Herbarium would 

continue,  as  it  is  not  deemed  necessary  to  create  a  replicate  of  these  herbaria.  Research 

projects  are  generally  done  in  collaboration with  the  IOJ  and  visiting  researchers, who may 

require the support of the Forestry Department.  

  There  are  very  limited  human  resources  in  taxonomic  research  in  the  Forestry 

Department. Most  of  the  focus  by  the  scientific  officers  is  placed  on  forestry management 

rather than the generation of new taxonomic  information. The new design of the Department 

will  see  the  introduction  of  specialized  scientists  in  the  field  of  arboriculture,  ecology  and 

biology. This would be the opportunity to implement a strong taxonomic research programme.  

  Training  programmes  in  botanical  species  are  needed  for  the  field  staff.  These 

programmes are not only to be limited to the tree species, but shrubs and lower plants as well.  

 

3.4.2  The Fisheries Division  

  The Fisheries Division’s focus is on commercial species, and marine taxonomic research 

outside of  these commercial species  is not an area of  focus  for  the division. Fish  surveys are 

carried  out  at  216  landing  sites  across  the  island.  Information  is  collected  on  reef  species, 

coastal  pelagic  species,  large  pelagic  species,  conch  and  lobster.    These  surveys  are  geared 

towards assessing  the  fishable stock of  these species, and  therefore  information  is  limited  to 

species that are removed by the fishers.  

Page 32: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 32  

  There is a Fisheries Information System within the Fisheries Division. The mechanism to 

collect the data on the species is decentralized through the operation of field officers based at 

or near major fish landing sites across the island. The management of the fisheries data is done 

at the main office; however, this data is not readily available for use. There is a notable lack of 

confidence in the quality of the data collected, as species are sometimes misidentified.   

 

3.5  The Non­Governmental Organizations 

3.5.1  The Nature Conservancy  

  The  Nature  Conservancy  (TNC)  is  a  non‐profit  US  based  environmental  non‐

governmental organization and has the reputation of being the largest such organization in the 

world.  The  Jamaica  Programme  focuses  on  projects  in  all  three  eco‐regions,  terrestrial, 

freshwater and marine. These however, have significant variation in the emphasis that is placed 

on each. The Jamaica Programme  is currently heavily biased towards ecosystem management 

rather  than  taxonomic  research. Most  of  the  programmes  now  are  focussed  on  the marine 

environment with management of marine protected areas, not only in Jamaica, but regionally. 

TNC  is  involved  in  the  CBD,  especially  as  it  relate  to  the  Programme  of Work  on  Protected 

Areas. There are currently three (3) scientific officers within TNC Jamaica: 

• Conservation Coordinator, Pedro Bank Management Project 

Management of Pedro Bank Management Project 

Establishment  and Maintenance  of  Remote  Field  Station  on  Pedro 

Bank 

• Sustainable Waters Programme Manager 

Main tasks includes the Marine Protected Areas Sustainable Financing 

Project (OECS/World Bank/TNC)  

 

Page 33: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 33  

• Jamaica Country Representative 

Main  tasks  includes  integral  involvement  in  the  Formulation  of  the 

Protected Areas System Master Plan for Jamaica (policy level) 

  TNC Jamaica previously generated taxonomic  information  in  freshwater environments, 

but currently, they are not generating much of this kind of  information on a regular basis, but 

rely heavily on the  information that  is generated from other sources. There  is  limited and ad‐

hoc generation of freshwater taxonomic information.  

  The organization does not keep specimens but do however, retain species  information 

such  as  those  that  emanate  from  specific  projects  in  Jamaica.  Over  the  past  6  years,  the 

Conservancy has spent considerable effort  in Eco‐regional planning  for  the  terrestrial, marine 

and  freshwater  environments.  These  assessments  depended  heavily  on  existing  taxonomic 

knowledge available in Jamaica.  

  There  is no current agenda  for  freshwater research at TNC Jamaica. This research was 

being  done  ‐  several  years  ago  ‐  but  with  the  shift  in  programme  objectives  to  more 

management  the  research work has  ceased. This  is  in a  significant way  the  result of  funding 

constraints which have caused  the Conservancy  to shape  the Work Programme  to adapt and 

meet  other  objectives.  Conservation  programmes  in  freshwater  environments  was 

concentrated  in  the  Cockpit  Country  and  the  Rio Grande  Valley.  The  Conservancy’s  Cockpit 

Country Parks  in Peril Project aimed to promote the sustainable use of the Cockpit Country as 

well  as  preservation  of  the  rich  biodiversity  with  the  area.    In  the  Rio  Grande  Valley,  the 

prevalence  of  River  Poisoning  events  as  a  fishing  practice  was  substantial  and  deemed 

necessary for attention by TNC in order to conserve the freshwater fauna in the system.  

 

3.5.2  Jamaica Conservation and Development Trust (JCDT)  

  Since its inception in 1987, the JCDT has been a leading environmental NGO in Jamaica. 

The focus of its work has been and continues to be the conservation of the Blue and John Crow 

Page 34: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 34  

Mountains National Park (BJCMNP). The JCDT has conducted some biological research such as 

bird surveys, and has facilitated and participated in floral and faunal research within the park.  

  The Research Prospectus of the JCDT is shown below: 

1. The distribution of Pittosporum undulatum and appropriate methods of control in the 

Blue and John Crow Mountains National Park.  

2. Controlling Pittosporum viridiflorum, Melinus minutiflora (molasses or Wynne grass), 

Gleichenia sp. (fern), Hedychium gardnerianum (ginger lily), and Polygonum chinense 

(red bush) in the Blue and John Crow Mountains National Park.  

 3. Investigating competition between invasive plant species (P. undulatum, P. viridiflorum, 

Melinus minutiflora, Gleichenia sp., Hedychium gardnerianum, and Polygonum 

chinnense) of the Blue and John Crow Mountains National Park.  

 4. Bird composition in the central and eastern regions of the Blue and John Crow 

Mountains National Park.  

 5. Bird composition in the Blue and John Crow Mountains below 1,000 meters.  

 6. Status of the range expanding Shiny Cowbird in the Blue and John Crow Mountains 

National Park.  

 7. Population status of the Jamaican Blackbird in the Blue and John Crow Mountains 

National Park.  

 8. Demographic Study on the Jamaican Hutia in the Blue and John Crow Mountains 

National Park.  

 9. A taxonomic survey of the insects found in the Blue and John Crow Mountains National 

Park.  

 

Page 35: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 35  

10. Investigating potential bio‐indicators of ecosystem health in the Blue and John Crow 

Mountains National Park.  

 11. Demographic study of the Giant Swallowtail Butterfly (Papilio homerus)  

 12. A taxonomic survey of the aquatic invertebrates found in the streams and rivers Blue 

and John Crow Mountains National Park.  

13. Ecological studies of conservation targets and other species within the Blue and John 

Crow Mountains National Park, with particular emphasis on specific threats and 

conservation management requirements.  

 14. The distribution, size, growth and shrinking rate of coffee farms in and around the Blue 

and John Crow Mountains National Park.  

 15. The harvesting of non‐timber forest resources, and the examining of resource dynamics 

and resource users. 

 16. Silvicultural requirements and suitability of some indigenous tree species on farmland 

areas around the Blue and John Crow Mountains National Park.  

 17. The survival and growth rates of young indigenous trees in open agricultural areas 

around the Blue and John Crow Mountains National Park.  

 18. Species composition in forest soil seed banks of the Blue and John Crow Mountains 

National Park.  

 19. Habitat assessment of the upper montane rainforest over limestone on John Crow peak.  

 20. Habitat assessment of the Montane Summit Savannah and Riparian communities in the 

Blue and John Crow Mountains National Park.  

 

Page 36: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 36  

21. Assessment of species on the northern slopes of the Blue Mountains, particularly 

bryophytes and lichens.  

 22. The effect of forest clearance on soil fertility and productivity and water yield.  

 23. Updated forest and wildlife inventory  

 24. Re‐opening of the Park/Forest Reserve boundary and investigation of land tenure and 

lease issues resulting in an accurate delineation of Park lands and boundaries.  

 25. The impact of buffer zone communities on the Blue and John Crow Mountains National 

Park, including issues related to demographic changes.  

 26. Maroon communal land ownership within the Blue and John Crow Mountains National 

Park.  

 27. Analysis of participatory approaches to natural resources management.  

 28. Impact of wild hog hunting on the ecological integrity of the BJCMNP.  

 29. Studies and pilot projects on sustainable harvesting and use of natural resources e.g. 

wicker, insects.  

 30. Studies and pilot projects on growing of native plant species e.g. orchids, and farming of 

animal species e.g. Giant Swallowtail Butterfly for revenue generation.  

 31. Limits of acceptable change in the protected area especially recreational areas.  

 32. Analysis of hazard vulnerability within the Blue and John Crow Mountains National Park, 

and identification and mapping of areas for special management. 

 

Page 37: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 37  

This Research Prospectus shows the linkages between taxonomy and conservation, and also 

demonstrates  the  involvement  of  communities  within  the  BJCMNP  in  conservation  and 

research.   Though  it  is mainly  focussed on management strategies  for conservation, the  JCDT 

carries out early detection and  response  to  invasive alien plants,  larval  food preservation  for 

butterflies, avifuanal  surveys, park wildlife  inventories,  lower plants  (such as bryophytes and 

lichens), and entomological surveys. The Trust carries out some of this taxonomic research, but 

collaborations with the UWI, Forestry Department and other agencies are prevalent in meeting 

the goals of the Research Prospectus.  

The Rangers and other staff members who work for the JCDT in the BJCMNP have received 

training  in plant  and  animal  identification,  and  this  training has been  continuous while  they 

perform  their duties. Their  interest  levels are high  in also broadening  their skills and  learning 

about the flora and fauna that are found in the park.  

 

Page 38: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 38  

4.0  Conclusions from Main Findings 

  The following represents a summary of the major gaps elucidated during the study.  

1. Human  capacity  at  the  NHMJ  is  limited.  Persons  are  not  trained  specifically  for  a 

taxonomic area, but are required to be knowledgeable across all taxa  in order to serve 

the country’s needs.  

 

2. Marine Collections are the most limiting at the NHMJ as there is the absence of a marine 

biologist  on  staff;  ongoing  collections  are  therefore  biased  towards  the  terrestrial 

environment though adequate SCUBA gear is present within the NHMJ. 

 3. The JACHM’s capacity to house comprehensive statistics is limited to lists, and features 

such as georeferenced distribution data is not available.  

 4. Information flow into the JA CHM is limited, and persons have to be urged to contribute 

data to the JA CHM. This is reflected in the representation of taxa in the JACHM. 

 5. There is currently no taxonomic research project in the NHMJ focussed on the marine or 

freshwater environments, and this is primarily a reflection of the training and expertise 

of the current staff cadre towards the terrestrial environment.  

 6. The Research Agenda  for  the NHMJ  is  set  internally mainly,  thereby underscoring  the 

need for increased collaboration and coordination of taxonomic research. 

 7. The  geographic  range  of  taxonomic  research  by  the  NHMJ  is  limited  though  the 

responsibility  given  to  the Museum  is  island wide.  Lack  of  resources  for  travel  and 

shortage of trained persons appear to be the main reasons for this finding.   

 8. Training in Molecular Systematics, Marine Flora and Fauna, Phylogeny and Lower Plants 

required  for  existing  researchers  in NHMJ,  or  persons with  these  skills  added  to  the 

current staff cadre. 

Page 39: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 39  

9. Taxonomic Research Programme  for  the UWI‐DLS herbarium absent. Taxonomists are 

also absent from this facility.  

 

10. Only one (1) dedicated staff member is assigned to the herbarium, as the other person 

has  recently  completed  his  graduate  work,  and  will  soon  be  relocating  out  of  the 

Herbarium. 

 11. The staff of  the UWI‐DLS Herbarium  require  training  in  lower plants, grasses,  ferns as 

well as performing effective and accurate desktop research. 

12. Mangrove biota  is reasonably well known through work done mainly at the Port Royal 

Mangroves out of the Port Royal Marine Laboratory.  

13. Hard‐bottom fauna, such as coral and algae, are also well studied and understood.  

14. Taxonomic work on Sponges has been done on mangrove sponges using spicules, and a 

photographic guide was developed. However, reef sponges are poorly known.  

15. Nudibranchs are poorly known. 

 

16. Mangrove  ascidians  have  been  extensively  studied  and  documented  by  Prof.  Ivan 

Goodbody, especially from the Port Royal mangroves. 

 

17. Phytoplankton and Zooplankton taxonomy is perhaps the area that is mostly studied in 

the UWI‐DLS/CMS. 

18. Bryozoans in Kingston Harbour have been studied in depth. Reef bryozoans, however, is 

an area that requires more taxonomic work.  

19. Other  gaps  in marine  taxonomy  at UWI‐DLS/CMS  include  benthic macroinvertebrate 

infauna and jellyfishes. 

 

Page 40: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 40  

20. The marine bony fishes, especially the commercially important groups such as snappers, 

parrotfishes, acanthurids, groupers, jacks and triggerfishes are well understood. 

 21. The freshwater macroinvertebrates require more attention. 

 22. With respect to gaps in free‐living nematodes in the soil, very little is known about their 

taxonomy. 

 23. Soil fungi are not adequately described. 

 24. Training is required in molecular taxonomy of fungi and nematodes to complement the 

limited morphological taxonomic expertise. 

25. Some of the entomological taxonomic groups which have been under‐studied in Jamaica 

include Pyralidae (snout moths), Nocturidae, Caribidae (beetles), Pseudococcidae (mealy 

bugs) and the Homopterans. Many of these are pest species, and very little is currently 

known about their taxonomy.  

26. At NEPA,  a  substantial  amount of  species  information  is embedded  in environmental 

assessment submitted to the Agency. This information is not however in a readily usable 

form, and validation of the taxonomic data is required.  

 

27. NEPA  requires  in‐house human capacity  in plant  taxonomy,  freshwater  taxonomy and 

increased  technical  capacity  in  several  areas  of  taxonomy  which  include  herbs  and 

grasses, freshwater species, marine benthic macroinvertebrate  infauna,  ichtyoplankton 

and marine sponges. 

 28. The Forestry Department’s field staff  lack substantial training  in plant  identification, to 

include not only trees, but also shrubs and lower plants. 

 

Page 41: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 41  

29. The Forestry Department does not have reference collections and relies substantially on 

the UWI‐DLS and the IOJ‐NHMJ Herbaria. There  is however the future desire to have a 

small reference collection with the Department.  

 30. The Fisheries Division does not focus on taxonomic research in the marine environment. 

Focus  is on management of  the  fish  stocks based on data  collected on  landings.  The 

Fisheries  Information System at  the Fisheries Department  collects  inadequate data  to 

produce meaningful stock assessment to guide management of the fishable resources. 

Human,  technical  and  infrastructure  gaps  exist  and  these  hinder  the  collection  and 

provision of useful information.  

 31. TNC  is focussed currently on management of the marine environment mainly. There  is 

some focus on the terrestrial and freshwater environments, but this again  is  limited to 

mainly protected area management and community participation in conservation.  

 32. The JCDT’s research programme covers some areas of taxonomy in the BJCMNP. These 

include  invasive  alien  plants  and  animals,  freshwater  invertebrates,  avifauna,  tress 

species, and insects. 

 33. There is no nominated focal point from Jamaica for the Global Taxonomy Initiative (GTI) 

under the CBD.  

 

Page 42: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

Table 3: Summary of National Capacity and Gaps in Taxonomy 

Taxonomic Group  Current Main Research Activities 

Existing Human Resources  (Please note that the numbers 

presented here will have overlaps, as there is normally one person that has 

more than one skill set) 

Availability and Status of Reference Collections 

Aspects for Improvement of Capacity 

Angiosperms  ‐ Collections of specimens occur regularly at UWI‐DLS and NHMJ‐IOJ 

‐ Research consistently being carried out across Jamaica by UWI‐DLS, NHMJ‐IOJ, NEPA, JCDT, Forestry Department 

‐ UWI‐DLS: 4 

‐ NHMJ‐IOJ: 3 

‐ NEPA: 2 

‐ Forestry Dept: 4 

‐ JCDT: 2 

 

Herbaria at UWI‐DLS and NHMJ‐IOJ; both collections are well kept and extensive.  

‐ Expertise in grasses  needed 

‐ Research Programme needed 

 

Pteridophytes  ‐ collections and research being done but on a minimal and ad‐hoc basis 

‐ UWI‐DLS: 1  Herbaria at UWI‐DLS and NHMJ‐IOJ; contain some specimens, but this needs improvement. 

‐ Expertise in pteridophytes needed 

‐ Research programme needed 

Gymnosperms  ‐ collections and research being done but on a minimal and ad‐hoc basis 

‐ UWI‐DLS: 1  Herbaria at UWI‐DLS and NHMJ‐IOJ; contain some specimens, but this needs improvement. 

‐ Expertise in gymnosperms needed 

‐ Research programme needed 

 

 

Page 43: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 43  

Taxonomic Group  Current Main Research Activities 

Existing Human Resources  (Please note that the numbers 

presented here will have overlaps, as there is normally one person that has 

more than one skill set) 

Availability and Status of Reference Collections 

Aspects for Improvement of Capacity 

Marine Hard bottom flora & fauna  Ongoing research being done at the UWI‐DLS, CMS, NEPA, and some eNGOS such as MBMP, CCAM. 

UWI‐DLS: 8 (includes current graduate students) 

CMS: 6 (includes current graduate students) 

NEPA: 5 

eNGOs: 4 (transient numbers) 

No established reference collections exist, but photos and field guides are easily available at these agencies, as well as from online sources 

‐ current capacity is adequate 

‐ succession of new students and trainees also adequate 

Marine Phytoplankton  Ongoing research, teaching and monitoring being done at the UWI‐DLS, CMS. 

UWI‐DLS/CMS: 10 (includes current graduate students) 

Reference collections exist in the DLS‐UWI 

‐ current capacity is adequate 

‐ succession of new students and trainees also adequate 

Marine Zooplankton  Ongoing research, teaching and monitoring being done at the UWI‐DLS, CMS. 

UWI‐DLS/CMS:  6 (includes current graduate students) 

Reference collections exist in the DLS‐UWI 

‐ current capacity is adequate 

‐ succession of new students and trainees also adequate 

Sponges  ‐ Significant Research was done on the taxonomy of mangrove sponges by UWI‐DLS 

‐ UWI‐DLS/CMS: 1  Though some collections exist in UWI‐DLS, these collections are not exhaustive. Photographic guide of spicules available for the mangrove sponge taxonomy 

Reef Sponges need attention 

Page 44: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 44  

Mangrove Ascidians  ‐ Significant Research was done on the taxonomy of mangrove ascidians by UWI‐DLS: Prof. Ivan Godbody 

No current expert resident in Jamaica 

Extensive collections exist on the mangrove ascidians collected and accessioned by Prof. Goodbody 

Sustained programme required 

Nudibranchs  No current work being done on this group 

No human capacity currently engaged 

No reference collections exist 

Programme required 

Bryozoans  Bryozoans in Kingston Harbour studied by UWI‐DLS 

UWI‐DLS: 2  Key for Bryozoans in Kingston Harbour developed 

Reef Bryozoans need to be studied 

Macrobenthic Invertebrate Infauna  No current work being done on this group 

No human capacity currently engaged 

No reference collections exist 

Programme required 

Jellyfishes  No current work being done on this group 

No human capacity currently engaged 

No reference collections exist 

Programme required 

Bony fishes  Ongoing research, teaching and monitoring being done at the UWI‐DLS, CMS.  

UWI‐DLS/CMS: 14 (including current graduate students) 

NEPA: 4 

Fisheries Division: 24 

‐ Small reference collection exist at UWI‐DLS;  

‐ Fisheries Division has fisheries information management system  

‐ current capacity is adequate 

‐ succession of new students and trainees also adequate 

Freshwater Phytoplankton  No current work being done on this group 

No human capacity currently engaged 

No reference collections exist 

Programme required 

Page 45: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 45  

Freshwater Zooplankton  No current work being done on this group 

No human capacity currently engaged 

No reference collections exist 

Programme required 

Freshwater Fish  Ongoing research, teaching and monitoring being done at the UWI‐DLS, CMS. 

UWI‐DLS/CMS: 5 (including current graduate students) 

 

‐ Small reference collection exist at UWI‐DLS;  

 

‐ current capacity is adequate 

‐ succession of new students and trainees also adequate 

Mycology  Ongoing research and teaching being done at the UWI‐DLS and Min. of Ag. on small sectors of the group, mainly agricultural pests. 

UWI‐DLS: 4 

Min. of Ag.: 3 

No reference collection exist 

‐ succession of new students and trainees inadequate 

‐ scope of taxonomic knowledge needs to be broadened to cover soil fungi 

‐ molecular taxonomic training needed 

Nematology  Ongoing research and teaching being done at the UWI‐DLS and Min. of Ag. on small sectors of the group, mainly agricultural pests. 

UWI‐DLS: 4 

Min. of Ag.: 3 

No reference collection exist 

‐ succession of new students and trainees inadequate         

‐ scope of taxonomic knowledge needs to be broadened to cover soil fungi 

‐ molecular taxonomic training needed 

Page 46: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 46  

Entomology  Ongoing research and teaching being done at the UWI‐DLS 

UWI‐DLS: 9 (including current graduate students) 

NHMJ‐IOJ: 3 

 

Reference collection exist at the UWI‐DLS and NHMJ‐IOJ 

Some of the major gaps in taxonomic work include Pyralidae (snout moths), Nocturidae, Caribidae (beetles), Pseudococcidae (mealy bugs) and the Homopterans. 

Land Snails  Ongoing research and teaching being done at the UWI‐DLS 

UWI‐DLS: 3 (including current graduate students) 

NHMJ‐IOJ: 3 

 

Reference collection exist at the UWI‐DLS and NHMJ‐IOJ 

Large quantities of specimens to be curated; work to be done outside of the eastern sections of Jamaica 

Taxonomic Databases and Information Systems 

Maintenance of Information Systems at UWI‐CMS‐CCDC, JACHM‐IOJ, Fisheries Division‐Min. of Ag. 

UWI‐CMS‐CCDC: 1 

JACHM: 1, sometimes 2 

Fisheries Division‐Min. of Ag.: 1 

Not applicable  Synergies to be enhanced; quality and quantity of data coming into the systems also to be enhanced 

 

Page 47: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

5.0  Recommendations for Bridging the Gaps in Taxonomic Knowledge  

There are several gaps in taxonomic knowledge which have been outlined in the previous 

section and covers areas such as infrastructure, resources and technical expertise. The 

recommendations to bridge these gaps are outlined below: 

Recommendation 1: Training programmes in taxonomy should be developed and implemented on an ongoing basis.  

 

These programmes should target the training of undergraduates and postgraduates  in the 

first  instance.  There  is  a  shortage  of  taxonomists,  and  therefore  the  training  of  high  level 

experts in taxonomy is crucial. It would be strategically wise to implement this level of training 

first  to  improve  the  cadre of  trainers  in  taxonomy, as well as  increase high  level  research  in 

taxonomy. These persons would then be able to design and deliver similar training programmes 

as well as short courses in certain areas of taxonomy, especially those areas cited as gaps in the 

previous section.  

Of immediate focus, taxonomic training programmes should be developed in the following 

areas: 

• Molecular Systematics,  

• Phylogeny  

• Lower Plants 

• Marine Benthic Macroinvertebrate infauna 

• Grasses 

• Herbs 

• Ichtyoplankton 

Trainees for these high level programmes should be comprised of persons from the Natural 

History Museum, University  of  the West  Indies, National  Environment  and  Planning Agency, 

Page 48: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 48  

Ministry  of  Agriculture  and  Fisheries,  and  selected  non‐governmental  agencies  and  tertiary 

institutions.  These  persons  are  both  generators  and/or  significant  users  of  taxonomic 

information.  Taxonomy  is  a  very  specialized  science,  and  requires  significant  aptitude  and 

patience  to acquire  the necessary  skills. Training of persons who are already  in  the  field and 

who truly realize the value of taxonomic knowledge would be the first step to ensuring that the 

training is effective and long lasting.  

These  trained  experts  can  now  design  programmes  to  train  young  taxonomists  for 

succession  planning.  Training  of  environmental  scientists,  protected  areas  personnel, 

naturalists and other such person as parataxonomists would add value and capacity to the field 

of taxonomic research in Jamaica.  

This training programme would be better served to be hosted in Jamaica. The University of 

the West Indies (Mona) ‐ Department of Life Sciences,  is currently more distinctly placed than 

other  academic  institutions  in  Jamaica  to  lead  the  training.  There  is  the  combination  of  the 

accredited  academic  structure,  teaching  facilities,  field  resources,  laboratory  facilities, 

taxonomic  collections,  as well  as  a  network  of  academic  partnerships  that  can  provide  the 

training. The programmes being hosted  in  Jamaica would make  the  training more affordable 

and would be able to train more persons over a long period of time. The training would also be 

more  relevant  as  areas  of  special  biodiversity,  such  as  the  Blue  and  John  Crow Mountains, 

Hellshire Hills and the Cockpit Country can be used as the field locations. 

Some  training programmes overseas  that would  fill current gaps  in  taxonomic knowledge 

identified above include: 

• Fairchild  Tropical  Botanic  Gardens  –  “Tropical  Flowering  Plants”  course,  which  

provides a logical basis for identification of species in a structured way 

• Internship/Observership  with    KEW  and/or  UWI‐Trinidad‐Kew  Workshop  on 

Herbarium management and techniques  

• Smithsonian Institution Internship Programme 

• University of Puerto Rico taxonomy programme 

Page 49: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 49  

• University of Georgia taxonomy programme in freshwater shrimp 

• North Carolina State University taxonomy programme in migratory fish 

• Exchange Programmes through the Centre for Marine Sciences to NOAA South‐east 

Fisheries Science Centre (Florida) 

 

Recommendation 2: Digitisation of Botanical and Zoological Collections should be done for all previous collections along with the implementation of a programme to digitise current collections. 

It  should  be  the  goal  to  digitise  all  botanical  and  zoological  collections  and make  these 

databases searchable through the  internet. The process has started with the work being done 

at the UWI Herbarium and the IOJ/NHMJ Herbarium, and represents a good model.  Digitisation 

should  be  embedded  in  practice  as  part  of  the  accession  process  for  new  specimens.    This 

should include creating an electronic entry and updating the database at regular intervals. The 

vast  number  of  specimens  that  currently  exist  at  these  herbaria  makes  the  process  of 

digitisation extremely  labour  intensive, and  therefore dedicated  staff  time  is  required over a 

protracted amount of time to covert these  into digital records.  It  is not possible for this to be 

done using the existing staff members, as already the human resource capacity present  in the 

herbaria is significantly lacking in numbers and technical expertise. Therefore, new staff will be 

required.  A programme of digitisation should be implemented rather than specific projects, as 

these  projects  are  often  short‐lived  and  would  not  lead  to  a  significant  and  sustained 

conversion rate of the specimens into digital formats. 

Training  in  the methodology  can be delivered  locally employing  the  skills  learned by  the 

current researcher.  

In  addition  to  specimens,  reference materials  such  as  books,  journals,  dichotomous  and 

polychotomous  keys  should  also  be  digitally  formatted  and  made  available  through  the 

internet.   

Page 50: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 50  

A model  for  biodiversity  systematics  and  taxonomic  databases  is  ETI  Bioinformatics.  ETI 

BioInformatics develops and produces  scientific and educational  computer‐aided  information 

systems. They offer a wide range of products and services, including scientific and educational 

web applications; the Linnaeus II software package for biodiversity documentation; a series of 

scientific and popular titles on CD‐ and DVD‐ROM and a 3D imaging studio.  

Taxonomists and specialists are invited to become ETI partners and to sign up to the World 

Taxonomist  Database,  joining  4,602  colleagues.  The  World  Biodiversity  Database  currently 

includes 25,493 extensively described and illustrated taxa. 

The World Biodiversity Database (WBD) is a continuously growing taxonomic database and 

information  system  that allows  you  to  search and browse a number of online  species banks 

covering a wide variety of organisms. The 21 species banks accessible through the WBD offer 

taxonomic  information,  species  names,  synonyms,  descriptions,  illustrations  and  literature 

references,  as  well  as  online  identification  keys  and  interactive  geographical  information 

systems.  The WBD  currently  includes  25,493  unique  taxa,  plus  4,149  synonyms.  The  online 

publication of several projects was made possible by the financial support of NLBIF. The World 

Biodiversity Database allows a user  to work  through  taxonomic keys  to  identify an unknown 

species. The interactive mechanism shows a series of decisions based on taxonomic traits that 

the user can employ to identify the species, and also includes definitions for anatomical parts, 

as well as drawings and images to assist.  

 

Recommendation 3: Advancement of DNA Bar‐coding should be done and used as a tool for Taxonomic Research to complement traditional techniques. 

DNA bar‐coding employs the use of short genetic markers to identify an already known 

organism as belonging to a particular species. This has far‐reaching benefits in filling the gaps in 

human resources for identification of specimens. It will also assist as a filter for taxonomists, as 

effort would not have to be spent to try and identify an already known and described species. 

Page 51: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 51  

This would also reduce the chances of duplication of classification of specimens as belonging to 

two different species, rather than two specimens of the same species.  

The technology should be made available in at least one institution in Jamaica. This type 

of technology is very expensive and the associated human and technical capacity is required on 

a permanent basis. The best place for this is the Natural History Museum – Institute of Jamaica. 

With  the high percentage of  species  in  Jamaica being  endemic,  genetic  signatures  for  these 

species should be formulated and added to the system for future comparisons.  

 

Recommendation 4: A mechanism to improve access to technical assistance should be implemented 

  The users of taxonomic information and the providers of taxonomic information should 

have clear lines of contact. Though taxonomic professionals are limited, the country should 

make more efficient use of the existing capacity.  

  The  World  Taxonomist  Database  is  an  excellent  platform  that  can  be  used  to  list 

taxonomic  experts  in  Jamaica.  Currently,  only  two  experts  are  listed  from  Jamaica.  The 

population  of  this  database with  the  other  Jamaican  taxonomists will  be  very  beneficial  to 

linking the demand and supply for taxonomic knowledge in Jamaica.  

  It would prove to be more beneficial for the JA CHM to provide a link to this database, 

rather  than host  the  Jamaican  list of  taxonomic experts. This would allow a user  to visit one 

database  to  find experts  in particular  taxa  that may not be present  in  Jamaica. The  JA CHM 

through  its  network  of  subscribers  and  visitors  should  aim  to  regularly  update  the  experts 

listing  for  Jamaica,  and  also  to  publicize  such  listing  to  biodiversity  practitioners,  especially 

those  environmental  professional  who  carry  out  biological  assessments  for  Environmental 

Impact Assessments.  

The  JA  CHM  can  also  have  a mirrored  list  of  local  experts  which  is  simultaneously 

updated with the world database. 

Page 52: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 52  

 

Recommendation 5: Publication of taxonomic research regionally should be encouraged 

  The publication of taxonomic research is vitally important to the sharing of knowledge 

nationally and globally. Though there are numerous international journals in taxonomy, there 

are no such journals regionally. The presence of a regional taxonomy journal would promote 

the dissemination of taxonomic research locally and regionally. This would also encourage 

taxonomic research in Jamaica by scientists, as they would now have a suitable and receptive 

outlet for their valuable work.  

  The  Institute of Jamaica should source  funding  from the Global Taxonomy  Initiative to 

start  this  kind  of  publication.  The  scope  can  be  broadened  to  include  the wider  Caribbean 

region, and a sustainable fee structure would be required for submission of papers. 

 

Recommendation 6: Nominate a focal Point for the Global Taxonomy Initiative (GTI) 

  At the CBD Conference of the Parties (COP8) in 2006, all party countries were urged to 

nominate GTI National Focal Points. Jamaica is currently without a nominated GTI Focal point.  

  This move would positively advance taxonomy in Jamaica.  The presence of a focal point 

would place the country’s commitment to improve taxonomic knowledge to conserve 

biodiversity in a clear light with the CBD. This move would also allow for greater information 

sharing among participating countries in the GTI which will also increase the county’s technical 

capacity.  

According to the CBD‐GTI, the general role of the GTI National Focal Points is to:  

• Develop linkages and facilitating information exchange in order to advance the 

implementation of the GTI at national level; 

• Respond to requests for input from the Conference of the Parties and the Secretariat 

related to the GTI; 

Page 53: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 53  

• Communicate and collaborate with other GTI National Focal Points to facilitate 

implementation of the GTI at sub‐regional, regional and global levels; 

• Collaborate with other national‐level focal points for the Convention and focal points 

from other biodiversity‐related conventions to facilitate implementation and 

mainstreaming of the GTI at national level. 

  The nominated focal point from Jamaica for the GTI should reside in the Natural History 

Museum‐Institute of Jamaica.  

Recommendation 7: Coordination of Taxonomic Research and Dissemination of findings should be a feature of the national biodiversity action plan.  

The establishment of a national working group on taxonomy should be done. This body 

would be responsible, among other things, to: 

• Review national needs for taxonomic research in particular taxa and localities on 

an ongoing basis 

• Make recommendations for research agendas for institutions such as UWI, TNC, 

NEPA, IOJ to include taxonomic research ensuring that the research is relevant to 

the national objectives 

• Monitor projects  to provide updates  to  the wider group as well as ensure  the 

effective use of research in conservation planning 

• Coordinate research to promote effective use of resources and maintenance of 

scientific integrity and rigour 

• Source funding for taxonomic research, training and publication 

• Source technical expertise to fill gaps in taxonomic research 

The Institute of Jamaica – Natural History Division is the best positioned institution to 

lead this Working Group.  

Page 54: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 54  

Recommendation 8: Source funding for taxonomic research should be established and managed  to ensure it is available continuously 

  A sustainable and coordinated approach to seeking funding for taxonomic research 

should be a part of the mandate of all institutions involved in taxonomy. Small grants are 

available on a regular basis to supplement larger but more irregular grants.  

  Some of these small grants targeted towards taxonomic research are outlined below: 

1. The Ernst Mayr Travel Grants in Animal Systematics 

This special grant  is focussed on research  in animal systematic and  is administered 

by  The Museum  of  Comparative  Zoology  (MCZ)  at Harvard University.  This  grant 

provides  travel  support  only  to  conduct  research  on  poorly‐known  taxa.  The 

principal objective of these grants is to stimulate taxonomic work on neglected taxa. 

These include taxa in institutional collections. The study of type specimens and their 

correct  identification  is  the  greatest  need  in  poorly  known  taxa.  This  typically 

requires visits to other museums.  

2. The Linnean Society  

This Society distributes a number of small grants to a total of £30,000 in any one 

year.   These grants are separated into different themes: 

• SynTax: Collaborative research in systematics 

• The Systematics Research Fund: Systematics and Taxonomy 

• The Anne Sleep Award: Biological Research in the Middle and Far East 

• The Appleyard Fund: Supporting research projects in botany or zoology by 

Fellows and Associates of the Society

• The Dennis Stanfield Memorial Fund: Supporting botanical research on 

tropical African plants  

• Percy Sladen Memorial Fund Grants: Supporting field work abroad in the 

earth and life sciences  

3. Partnerships for Enhancing Expertise in Taxonomy (PEET) 

Page 55: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 55  

This grant supports and encourages partnerships with academic institutions, botanical 

gardens, freshwater and marine institutes, and natural history museums. It is administered by 

the US National Science Foundation and seeks to enhance taxonomic research and help prepare 

future generations of experts. Projects should train new taxonomists and should translate 

current expertise into electronic databases and other products with broad accessibility to the 

scientific community.  

4.  National Taxonomy Research Grant Program 

The Australian Biological Resources Study (ABRS) National Taxonomy Research Grant 

Program provides grants for taxonomic research. Grants are awarded for research projects 

where the primary aim is to undertake taxonomic research on the Australian biota or to 

develop products that aid in the dissemination of taxonomic information. The program also 

supports projects that build Australian taxonomic capacity. 

5.  GTI Special Fund  

Delete space 

  At COP8, the GTI received offers for special funding from external agencies to conduct 

research in taxonomy. The major player and administrator of this special fund is BioNET 

International.  

6.   The Darwin Initiative  

Delete space 

The Darwin  Initiative assists countries that are rich  in biodiversity but poor  in financial 

resources  to  meet  their  objectives  under  one  or  more  of  the  three  major  biodiversity 

Conventions:  the  Convention  on  Biological  Diversity  (CBD);  the  Convention  on  International 

Trade  in  Endangered  Species  of Wild  Flora  and  Fauna  (CITES);  and  the  Convention  on  the 

Conservation of Migratory Species of Wild Animals (CCMS), through the funding of collaborative 

projects which draw on UK biodiversity expertise. 

 

Page 56: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 56  

6.0  References  

Documents: 

1. Baseline Survey  for  the Development of a Sustainable Fisheries Management Plan  for 

CARICOM (2009) – CRFM and Trevor Hamilton and Associates Ltd.  

2. Jamaica’s National Environmental Action Plan (JaNEAP) – 2006‐2009 

3. National Biodiversity Strategy and Action Plan 

4. National  Ecological  Gap  Assessment  Report  (2008)  for  the  Jamaica  Protected  Areas 

System Master Plan 

5. The  Nature  Conservancy  Eco‐Regional  Plan  –  Marine  ERP,  Terrestrial  ERP  and 

Freshwater ERP 

6. United Nations Convention on Biological Diversity 

 

Websites: 

 1. Department of Life Sciences (UWI): http://www.mona.uwi.edu/lifesciences/  

2. ETI Bioinformatics ‐ http://www.eti.uva.nl/ 

3. Global Biodiversity Information Network: www.gbif.org  

4. Global Taxonomy Initiative (GTI): http://www.cbd.int/gti/  

5. Jamaica Clearing‐House Mechanism: www.jamaicachm.org.jm  

6. Jamaica Conservation and Development Trust: http://www.greenjamaica.org.jm  

7. The Nature Conservancy: www.nature.org  

Page 57: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 57  

Appendix 1­Taxonomic Questionnaire  

Date:

Name of Interviewee: Organization/ Agency /Affiliation:

Status: (Gov’t, NGO, Academia etc.):

Section A: Agency and Research Programmes

1. Does your organization generate or use taxonomic information, (or both)?

2. Does your organization keep taxonomic records, such as specimens or species information?

3. Which plant or animal taxonomic groups comprise the collections?

4. Is the organization involved with the Convention on Biological Diversity and in what capacity?

5. Outline any projects undertaken and publications produced by your organization in taxonomic research in the last 10 years.

6. How is the research agenda for this organization set, especially as it relates to generation of taxonomic information?

7. Do you think that the research agenda is aligned to meet the needs of the country?

8. Which locations in Jamaica is the agency focussed on with respect to taxonomic research?

9. Which area(s) of taxonomy do you think is (are) not given as much attention in Jamaica as it should? .. .and why is the attention required?

Section B: Human Resources

10. How many staff members are involved in taxonomic research in this organization?

11. What level of training in taxonomy do you and/or your staff possess in taxonomy?

12. Where did you/they receive training?

13. What was the focus of the training programmes?

14. Which area of taxonomy do you consider your / your team’s greatest strength?

15. Which area of taxonomy do you consider your or your team’s greatest weakness?

Page 58: Assessment of Capacity‐Building Needs for the Convention ......This section outlines the national needs in taxonomic knowledge to meet the required objectives under the Convention

P a g e  | 58  

16. Which training programme would be most desirable for you to increase your taxonomic knowledge? Please also state the reason.

17. Do persons outside your organization seek assistance from you with respect to taxonomy? Describe the assistance provided.

18. Do you think that your organization adequately fosters your development in taxonomy?

19. What percentage of your work effort is spent on taxonomy?

20. Other (describe)

Section C: Information Management

21. Does your organization keep and manage taxonomic information?

22. In what form does this information exist?

23. Is taxonomic information generated by your organization available to persons outside the organization? In what form?

24. Is the taxonomic information shared through a web-based mechanism?

25. Are there duplicates of this information?

26. Is the format and design of the information system aligned to any particular standard, local or international? If so, which one (s)?