Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que...
Transcript of Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que...
![Page 1: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/1.jpg)
Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados
PPBio/CENBAM
Flávia Fonseca Pezzini
Pablo Hendrigo Alves de Melo
Rainer Xavier de Amorim
Dayane Oliveira
(PPBio/CENBAM - INPA)
CENBAM
![Page 2: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/2.jpg)
Bancos x Repositórios
• Bancos de dados relacionais, mais comuns, são modelados com tabelas estáticas e atributos pré definidos
• Pode ser relativamente simples montar e manejar um banco de dados quando o tipo de dado é simples e não muda com o tempo
– p. ex. GENBANK ou bancos de dados de coleções de espécimes
![Page 3: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/3.jpg)
Armazenamento de dados de coletas biológicas
• Já existem muitas iniciativas para armazenar dados de coletas biológicas
• Várias coleções (Herbários, Museus) tem feito esforços para colocar suas informações em bancos padronizados e que foram adotados por consenso (p.ex BRAHMS e Specify)
![Page 4: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/4.jpg)
Exemplo BRAHMS – Botanic Research and Herbarium Management System
![Page 5: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/5.jpg)
Dados complexos
• Dados de levantamentos biológicos são heterogêneos e imprevisíveis e precisam de abordagens mais específicas.
• É muito difícil prever todos os possíveis tipos de dados e estrutura das amostragens a priori, e portanto, definir uma estrutura de banco de dados que funcione para tudo
![Page 6: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/6.jpg)
Hale, S.S. 1999. How To
Manage Data Badly (Part
1). Bulletin of the
Ecological Society of
America, 80 (4): pp. 265-
268.
Hale, S.S. 2000. How
To Manage Data
Badly (Part 2).
Bulletin of the
Ecological Society of
America, 81 (1): pp.
101-103
![Page 7: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/7.jpg)
![Page 8: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/10.jpg)
- Journal of Evolutionary Biology,
- American Naturalist,
- Evolution,
- Molecular Ecology,
- Heredity,
- Biotropica
Arquivos públicos:
GenBank, TreeBASE, Dryade,
NCEAS, Knowledge Network for Biocomplexity
![Page 11: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/11.jpg)
• Não é possível ter 1 banco de dados para tudo
• Mas é possivel ter 1 repositório para tudo e deste, vários bancos de dados podem ser construídos
Matt Jones
National Center for Ecological Analysis and Synthesis
(NCEAS)
![Page 12: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/12.jpg)
Biblioteca de Manejo de Dados(Repositório)
“Proporcionar consultas aos dados baseada
nos metadados, com a capacidade de filtrar,
juntar e concatenar através de conjuntos de
dados heterogêneos."
![Page 13: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/13.jpg)
Repositórios
• Um repositório não é um “saco” ou “armário” onde os dados são jogados e guardados sem nenhuma regra.
• O que promove a qualidade dos repositórios locais é que eles tem uma grande preocupação com os metadados.
Metadados são informações que descrevem os dados
e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual for o
sistema de armazenagem.
![Page 14: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/14.jpg)
Linguagem para Metadados
• Já foram desenvolvidas linguagens eprotocolos de metadados para váriasdisciplinas
• Para dados ecológicos, o protocolo maisamplamente utilizado é o EcologicalMetadada Language (EML) desenvolvido peloKnowledge Network for Biocomplexity (KNB)
![Page 15: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/15.jpg)
Knowledge Network for Biocomplexity (KNB) http://knb.ecoinformatics.org/
• Metacat : armazenamento, busca, recuperação dos dados
• Morpho: criar, administrar e compartilhar os metadados
![Page 16: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/16.jpg)
![Page 17: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/17.jpg)
![Page 18: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/18.jpg)
![Page 19: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/19.jpg)
![Page 20: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/21.jpg)
![Page 22: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/22.jpg)
![Page 23: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/23.jpg)
Campo Metadados Dados
Site
30 dias 1 ano
Como funciona hoje
Revisão Revisão
Combinação de
várias tabelas de
dados
Análise
![Page 24: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/24.jpg)
![Page 25: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/25.jpg)
![Page 26: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/26.jpg)
Módulo Km 83 – BR-319
![Page 27: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/27.jpg)
Conversar com o gestor antes de ir para o campo!!
![Page 28: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/28.jpg)
Chaves primárias= identificadores Dados
A estrutura da tabela de dados
![Page 29: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/29.jpg)
Sugestão de planilha de campo
![Page 30: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/30.jpg)
Termo de compromisso
![Page 31: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/31.jpg)
![Page 32: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/32.jpg)
Ducke
Página inicial do Repositório de dados do PELD
Para realizar uma busca, digite a palavra chave desejada e
clique em “Procurar”
____
![Page 33: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/33.jpg)
_________________________
__
______________________
O site mostra a lista de Metadados
cadastrados que fazem referência à
palavra digitada na busca “Ducke”
Clique no metadado de seu interesse para visualizar seu
detalhamento
![Page 34: Armazenamento e Disponibilização de dados e metadados ... · Metadados são informações que descrevem os dados e sem eles, os dados não tem nenhum valor ou utilidade, seja qual](https://reader033.fdocuments.net/reader033/viewer/2022052613/5f1e3c1d1b702a6a214755eb/html5/thumbnails/34.jpg)
_________________________
_____________
O site mostra informações como:
- Autor
- Autores associados
- Resumo
- Palavras-chaves
- Licença e direitos de uso
- Cobertura geográfica
- Cobertura temporal
- Informações sobre o projeto
Para fazer download desse metadado, clique aqui
Para fazer download dos dados a que esse metadado se
refere, clique aqui