a2 Practicals for Biology

8/18/2019 a2 Practicals for Biology

1/23

O b s er v

i n g p a t t er n

s b y e

c ol o gi c

al

s am

pl i n g.

C on

t r ol l e

d v

a

r i a b l e

s ?

A b i o t i c

f a c t o r s , l i g h t , t e m

p , s o i l ,

w a t e r , h u m i d i t y , o 2 c o n c e n t r a t i o n ,

p H

, a s p e c t s l o p e a n

g l e

H ow

d o y o u ex

e c u t er an

d om

s am

pl i n g? S

e t u p g r i d u s i n g t a p e m e a s u r e , u s e

r a n d

o m

n u m b e r s t o g

e n e r a t e p o i n t s

t o

p l a c e q u a d r a t e t o c o l l e c t d a t a


2/23

H ow

d o y o u

ex e c u t e s y s t em

a t i c s am

pl i n

g? L

i n e t r a n s e c t , t a p e m e a s u r e l a i d a l o n g

s e v e r a l z o n e s t o b e l o o k e d a t

a n d q u a d r a t e

a r e u s e d t o r

e c o r d d a t a a t r e g

u l a r i n t e r v a l s

H ow d o y o um

e a

s ur e a b un

d an

c e , d en

s i t y ?

D e n s i t y = p r e s

e n c e o f

o r g a n i s m s p e r q u a d r a t e


3/23

H ow

d o

y o um

e a s ur ef r e

q u en

c y ?

P e r c e n t a g e o f q u a d r a t e

s q u a r e

s c o n t a i n i n g o r g a n i s m s

Wh

a t d o y o u

u s e a pi t f al l t r a

p

f or ?

T o c o l l e c t i n v e r t e b r a t e s


4/23


5/23

Wh

a t d o y o u u s e a t ul l gr en

f unn

el f or ? T

o c o l l e c

t o r g a n i s m s f r o m

l e a f l i t t e r

Wh

a t d o y o u u s

e aB

e ar m

anf un

n el f or ?

T o

c o l l e c t o r g a n i s m

s f r o m

w a t e r


6/23

O b s er v

i n g p a t t er n

s b y e

c ol o gi c

al

s am

pl i n

g.P o

s s i b l e

ev

al u

a t i oni s

s u e s ?

c o n s t a n t c h

a n g i n g o f a b i o t i c

c o n d i t i o n s ,

m o v e m e n t

o f o r g a n i s m , s a m

p l i n g t a k e n

w i t h i n s m a l l a m o u n t o f t i m e ,

l i m i t a t i o n s o f

o n l y o n e s t u

d y , c o n s i d e r a t i o n

f o r s a f e t y o f

o r g a n i s m s ,

d i s r u p t i o n o f n o r

m a l h a b i t a t ,

e t h i c s o f

m e a s u r i n g w i l d o

r g a n i s m s

T h

e ef f e

c t

of t em

p of h

a t c h i n g

s u c c e s s of

b r i n

e s h r i m

p.I n

d e p en d

en

t

an

d d e p en d

en

t v

ar i a

b l e

s ?

I n

d e p e n d e n t : t e m p

D e p e n d e n t :

n u m b e r o f s h r i m p s h a t c h e d


7/23

T h

e ef f e

c t of t em

p of h

a t c h

i n g s u c c e s s

of

b r i n

e s

h r i m p.

C on

t r ol l e

d

v ar i a

b l e

s ? C

o n t r o l l e

d v a r i a b l e s : l i g h t

i n t e n s i t y ,

p H , s a l t c o n t e n t , p r e s e n c e

o f c h l o r i n e

f r o m

t a p w

a t e r , o x y g e n c o n

c e n t r a t i o n

O p t i m a

l t em p er a

t ur ef or

b r i n

e s h r i m p

e g g s t oh

a t c h

?

2 8 d e g r e e s , m o s t e g g

s s h o u l d h a t c h

b e t w e e

n 2 5 t o 3 0 d e g r e e s i n t h i s p r a c t i c a

l


8/23

T h

e ef f e

c t of t em

p of h

a t c h i n

g s u c c e s s of

b r i n

e s h r i m

p.P o s s i b l e

ev

al u

a t i oni s

s u e s ?

e t h i c s o f h a t c h i n g s h r i m

p u n d e r

d i f f e r e n t c

o n d i t i o n s , u s i n g

a n i m a l s i n

e x p e r i m e

n t s , m a y b e a d i f

f e r e n c e i n

l i g h t a t e a c

h s a m p l e , f l u c t u a

t i n g t e m p s ,

n o t a c c u r a

t e s a l t m e a s u r e m

e n t s , m a y

n o t h a v e

c o u n t e d e x a c t l y

4 0 e g g s ,

m a y m i s s

s e e i n g s o m e b a

b y s h r i m p

Wh

a t s t a t t e s

t u s e d f or

c or r el a

t i on?

S p e a r m a n s

r a n k


9/23

Wh

a t s t a t t e s t u s e d t o c om

p ar em

e an

s ?

S t u d e n t t t e s t

Wh a t s t a t t e s t u s e d t o c om

p ar em

e d i an

s ?

m a n n w h i t n e y

- u t e s t


10/23

I nwh

a t

s t a t t e s t s d o y o u

r e j e c t n

ul l

h y p o t h e s i s i f

t h e c al c

ul a

t e d v

al u

e

i s m

or

e t h an

t h e c r i t i c

a

l v al u

e?

s t u d e n t t t e s t a n d s p e a r m

a n s r a n k

I nwh

a t s t a

t t e s t s d o y o ur e

j e c t

n ul l h

y p o t h e s i s i f

t h e c al c

ul a

t e d

v al u

ei s l e

s s t h an

t h e c r i t i c

al v

al u e?

m a n n w h i t n e y u t e s t


11/23


12/23

D N

A g el el e

c t r o ph

or

e s i s ,

o u t c om e of

t h i s

pr a

c

t i c al ?

D N A w i l l b

e s e p a r a t e d o u t t h r o u g h t h e

a g a r g e l , w i t h t h e h e a v i e s t ( b

i g g e s t ) D N A

s t r a n d s n e

a r t h e w e l l s a n d

t h e l i g h t e s t

( s m a l l e s t ) w

i l l b e a t t h e o p p o s i t e e n d . T h e

D N A r e s t r i c

t i o n l a d d e r c a n b

e u s e d a s a

“ r u l e r ” t o m e a

s u r e t h e s i z e o f t h e f r a g m e n t s

D N A

am

pl i f i c a t i on

u s i n

g

P C R

, e q

ui pm

en

t n

e e d e d ?

T h

e r m o c y c l e r , D N A

s a m p l e , t a q

p o l y m e r a s e , n u c l e o t i d e s , p r i m e r s


13/23

D N

A g el el e

c t r o ph

or

e s i s .

E

q ui pm

en

t n

e e d e

d ?

s e l e c t e d r e s t r i c t i o n e n z y m e s ,

a g a r g e l , g e l

t a n k , e l e c t r i c

a l s u p p l y , m i c r o p

i p e t t e s , D N A

s a m p l e , l o a d i n g d y e , U V l i g

h t , c a m e r a ,

b u f f e r s o l u

t i o n , D N A r e s t r i c

t i o n l a d d e r

D N A

am

pl i f i c a

t i on

u s i n

gP

C

R ,

wh

a t or d

er

of t h

e t em

p er a

t ur

e s ?

9 4 , 5 4 , 7

2


14/23


15/23

E f f e

c t s

of d i f f er en

t an

t i b

i o t i c s on

b a c t er i a.

C on

t r ol l e

d v

a

r i a b l e

s ? c

o n c

e n t r a t i o n o f a n t i b

i o t i c ,

a m o u

n t o f a n t i b i o t i c , d i s c s i r ,

b a c t e r i a l s p e c i e s , t e m p

, r u l e r

E f f e

c t s of

d i f f er en

t an

t i b i o

t i c s on

b a c t er i a.I n

c u

b a t i on

t i m e an

d t em p? 4

8 h

o u r s , 3 0 d e g r e e s , u p s i d e d o w n


16/23

E f f e

c t s

of d i f f er en

t an

t i b

i o t i c s on

b a c t er i a.

P o s s i b l e

ev

al u

a t i oni s

s u e s ?

E n s u r i n g t h e d i s c s a r e e v e

n l y p l a c e d

o n t h e

p e t r i d i s h , h a v i n g g o o d

a s e p t i c t e c h n i q u e t o p r e v

e n t p l a t e

c o n t a m i n a t i o n , a g e o f a n t i b i o t i c , i f o u t o f

d a t e l i k e l y

t o b e l e s s e f f e c t i v e , r e p e a t s ,

a c c u r a c y o f i n c u b a t i o n t i m e

a n d t e m p

M e a s ur i n

g

t h er a

t e of

ox

y g en

u p t ak

e.

C on t r ol l e

d v

ar i a

b l e

s ?

n o o f o r g a n i s m

s , t e m p ,

t i m e , a m o u n t o f

s o d a l i m e


17/23


18/23

U t u b er e

s pi r om

e t er .A

d v

an d

d .A

d v ?

d . a d v : t e n d

e n c y f o r c o n n e c t i o n s t o l e a k

i n e l d e r l y m

o d e l s ( m a k i n g t h e e q u i p m e n t

u s e l e s s ) e x

p e n s i v e , a d v : d o

e s n o t n e e d

t o h a v e a n a

d d i t i o n a l c o n t r o l a s a s e c o n d

t u b e b a l a

n c e s o u t t h e e f f e

c t s o f t h e

c h a n g e s i n t e

m p a n d a t m o s p h

e r i c p r e s s u r e

E f f e

c t s of

ex

er c i s e

on

t i d al v

ol um

e an

d

b r e

a t h i n

gr a

t e.E

q ui pm

en

t n

e e

d e d ?

s p i r o

m e t e r , k y m o g r a p

h , d i s i n f e c t a n t ,

e y e p r o t e c t i o n , s o d a l i m e


19/23

D e

f i n e t h e t i d al v

ol u

m e?

T h e t i d

a l v o l u m e i s t h e

v o l u m e

o f a i r b r e a t h e d i n a n d o u

t i n o n e

b r e a t h a t r e s t . T h e t i d a l v o l u m e f o r

m o s t a d u l t s i s o n l y a b o u t

0 . 5 d m 3 .

D ef i n

e t h ev i t al c

a p a c i t y ?

V i t a l c a p a c i t y i s t h e m a x i m u m

v o l u m e

o f a i r t h a t c a n b e b r e

a t h e d i n o r o u t

o f

t h e l u n g s i n o n e f o r c e d b r e a t h


20/23


21/23

Wh

a t i s r e

s i d

u al ai r ,

an d

w

h a t d o e s i t

pr ev

e

n t ?

S o m e a i r a l w a y s r e m a i n

s i n t h e

l u n g s a s

r e s i d u a l a i r a n d c a n n o t b e

b r e a t h e d

o u t . R e s i d u a l a i r p r e v e n t s

t h e w a l l s o f t h e b r o n c h i o

l e s a n d

a l v e o l i f r o

m

s t i c k i n g t o g e t h

e r . A n y a i r

b r e a t h e d

i n m i x e s w i t h r e s i d u a l a i r .

I nv

e s t i g a t i n gh

a b i t u a t i on

t o a s t i m ul u

s .

I n d e p en

d en

t an

d d e p en

d en

t v

ar i a b l e

s ?

I n

d e p e n d e n t : n u m b e r o f p o k e s

D e p e n d e n t : r e t r a

c t i o n t i m e


22/23

I nv

e s

t i g a t i n gh

a b i t u

a t i on t o a

s t i m ul

u s . C on

t r ol l e

d v

a

r i a b l e

s ?

r e p l i c a t i o n u s i n g s n a

i l s o f

a p p r o x i m

a t e l y s a m e s i z e

a n d a g e ,

e q u a l h a n d l i n g h i s t o r y , d r y i n g o u t

I nv


a b i t u

a t i on

t o

a

s t i m ul u

s .E

q ui pm

en

t n

e e d e

d ? 1 g i a n t a f r i c a n l a

n d s n a i l , 1

d a m p e n e d c o t t o n

w o o l b u d ,

c l e a n f i r m

s u r f a c e , s t o p w a t c h


23/23

I nv

e s t i g a t i n g

h a b i t u

a t i on

t o a

s t i m ul u

s .wh

a t

h a p p en

s w

i t h r e

p e a t e d s t i m

ul a t i on? wh

y

d o e s t h e s n

ai l t ak

el e

s s t i m e

t or e- em

er g

e? r e

p e a t e d s t i m u l a t i o n = c a l c i u

m

c h a n n e l s ,

p r e s y n a p t i c m e m b r a n e l e s s

r e s p o n s i v e ,

l e s s c a l c i u m

i n t o p r e s y n a p t i c n e u r o n e ,

l e s s n e u r o t r a n s m i t t e r , a c t i o n p o t e n t i a l l e s s

l i k e l y , f e w e r

a c t i o n p o t e n t i a l s

p r o d u c e d i n

p o s t s y n a p t i c m o t o r n e u r o n e ,

l e s s r e s p o n s

I nv


a b i t u

a t i on

t o

a

s t i m ul u

s .P

o s s

i b l e ev

al u

a t i oni s

s u e s ? S

n a i l s a l r e a d y h a n d l e d b e f o r e t h e

e x p e r i m e n t m a y n o t r e

a c t i n t h e s a m e

w a y , d

e t e r m i n i n g w h e n

a s n a i l h a s f u l l y

e e m e

r g e d c a n b e h a r d

, l a c k o f m o i s t u r e

a y e n c

o u r a g e s n a i l s t o

s t a y l o n g e r i n t h e

i r

h e l l , m

e a s u r i n g e y e s t a l k l e n g t h i n s t e a d

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