Inhibition of RNA binding to hepatitis C virus RNA-dependent RNA ...
2014年の流行に関する最新情報〜...Deltaviridae RNA HCV Flaviviridae RNA HBV...
Transcript of 2014年の流行に関する最新情報〜...Deltaviridae RNA HCV Flaviviridae RNA HBV...
A型肝炎
〜2014年の流行に関する最新情報〜
石井孝司 (国立感染症研究所・ウイルス第2部)
EM
nononoyesyesVaccine
noyesyesyesnoChronic infection
fecal-oralpercutaneous permucosal
percutaneous permucosal
percutaneous permucosalfecal-oralRoute of
transmission
fecesblood/blood-products
blood/blood-products
blood/blood-productsfecesSource of
virus
HEVHepeviridae
RNA
HDVDeltaviridae
RNA
HCVFlaviviridae
RNA
HBVHepadnaviridae
DNA
HAVPicornaviridae
RNAVirus
肝炎ウイルス
EM
nononoyesyesVaccine
noyesyesyesnoChronic infection
fecal-oralpercutaneous permucosal
percutaneous permucosal
percutaneous permucosalfecal-oralRoute of
transmission
fecesblood/blood-products
blood/blood-products
blood/blood-productsfecesSource of
virus
HEVHepeviridae
RNA
HDVDeltaviridae
RNA
HCVFlaviviridae
RNA
HBVHepadnaviridae
DNA
HAVPicornaviridae
RNAVirus
肝炎ウイルス
Rhino
Entero
Cardio
Aphtho
Erbo
Tescho
Kobu
Pareco
Hepato
HRV-A
HRV-B
Polio
HEV-CHEV-BPEV-B
BEVHEV-A
HEV-D
EMCV
TMEVFMDV
ERAV
ERBV
PTV
HAV
AEV
HPeV
AiV
ピコルナウイルスの系統樹
HAVの系統樹
based on 168 nt at VP1/2A cording region
100 90 80 70
StrainKRM031CR326HM175TKM005CF53SLF88PA21KRM003CY145AGM27JM55
Nucleotide sequence homology (%)
IA
IB
IIAIIB
IIIAIIIB
IVV
VIサル
ヒト
中和の血清型は単一
糞口感染• 食品を介して感染するウイルス疾病• 接触感染による感染の拡大
A型肝炎
集団発生飲食店の食材、調理人その他輸入感染症汚染輸入食品
予後良好の急性ウイルス性肝炎
A型肝炎ウイルス
糞便
汚染された容器、飲食物
糞口感染
50nm
A型肝炎ウイルス
A型肝炎
小児期:不顕性(80-95%)、または軽い風邪症状10%以下の小児で黄疸
成人:顕性(76-97%)38度以上の発熱で始まる。
強い食欲低下強度の全身倦怠感黄疸(40-70%)、治癒まで約1ヶ月
高齢者:劇症肝炎への注意致死率(USA):(50 歳以上で1.8%、全体では0.3%)
*致死率:上海の大流行では0.01%
A型肝炎の臨床的特徴
IgG 抗体
IgM 抗体
AST/ALTの推移
0 41 2 65 7 10 11 128 9
(感染後の週)
3 13
臨床症状がある時期
血液からウイルスRNAが検出される時期
便からウイルスRNAが検出される時期
A型肝炎の臨床経過
Geographic Distribution of Hepatitis A Virus Infection
Anti‐HAV prevalence
highhigh/intermediateintermediatelowvery low
0123456789
10
1987 1991 1995 1999 2003
Year
case
/ 10
0,00
0
わが国におけるA型肝炎報告数(1987-2003)
ワクチン市販(エームゲン)
日本におけるA型肝炎患者発生数の推移
0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014(年)
2014年は39週まで
400
320347
(患者数)
日本における年代別抗HAV抗体価陽性率
0
20
40
60
80
100
0‐4 5‐9 10‐14
15‐19
20‐24
25‐29
30‐34
35‐39
40‐44
45‐49
50‐54
55‐59
60‐64
≧65Age group
IgG
posi
tive
rat
e(%)
1973 1984 1994 2003
Kiyohara et al. 2007
感染経路・感染源(2006-8年)
国内感染例 165例 国外感染例 50例
国外感染例の推定感染国(2006-8年)
●発病までの潜伏期間が長いため、原因食材の特定が難しい。
●ウイルスが発病前から多量に糞便中に排出されるので、感染者自身が気付かぬうちに感染を拡大させる危険がある。
●汚染が疑われる食材の充分な加熱処理
●現状での対策として、飲食店従業員等への衛生管理と予防接種の励行が重要である。
食品を介して感染するA型肝炎の特徴と予防
2010年の日本におけるA型肝炎流行状況の解析
01〜23〜56〜10>10
1024
Total: 115 cases
2009年の急性A型肝炎発生状況
443034 28
21
11
13
1513
1701〜23〜56〜10>10
Total: 347 cases
2010年の急性A型肝炎発生状況
5011 01〜23〜56〜10>10
27
Total: 176 cases
2011年の急性A型肝炎発生状況
A型肝炎患者報告数の推移(2007年第1週〜 2010年第34週)
A型肝炎発生届受理時の検体の確保等について
平成22年4月26日(健感発第0426 第2号・食安監発0426 第4号)
結核感染症課長・監視安全課長
• A型肝炎については、糞便中にウイルスが排出され、患者との接触や水、食品等を介して経口的に感染することから、感染症法及び食品衛生法(昭和22 年法律第233 号。)の
双方の観点から必要な対応を行うようお願いしているところですが、感染後の潜伏期間が長く、その感染経路も多岐に渡ることから、聞き取りによる感染源の遡り調査が、非常に困難な場合が見受けられます。
• このような状況において、感染源の共通性を見出すためには、患者の糞便から分離されるウイルス株の分子疫学的手法を用いた解析を行い、集団発生の動向を確認することが極めて重要となります。
• つきましては、感染症及び食中毒の調査における原因究明及び発生予防の観点から、A型肝炎の発生届を受理した場合には、ウイルス株の分子疫学的手法による解析が実施できるよう、患者の糞便検体の確保に努めていただきますようお願い致します。また、引き続き、感染症対策主管部(局)及び食品衛生主管部(局)の間で連携を図りつつ、感染症法第15 条に基づく積極的疫学調査を速やかに実施して頂くことにつきましても、特段のご配慮をお願いします。
VP2 VP3 VP12A
2B 2C3A 3B
3C 3D3’NTR5’NTR
(IRES)VPg(3B)
P1-2A 2BC P3structural proteins non-structural proteins
AAAAAA
2907‐3296
2795‐33511st
nested
[AY644676]CF53/Berne_2A[AY644670]SLF88/USA_2B
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B[M20273]MBB/Germany_1B
[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng1P1/NiigataC/2006/J1006‐17891‐KawskC‐K41005‐13587‐YmgchP‐H22U31
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11010‐YokhmC‐y101005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg1
Shiga2006‐24/J1006‐16117‐KawskC‐100616
[AB300206]KRM031G47/Japan_1A2006‐15/Nagoya/2006/J[AF512536]DL3/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF357222]LU38/China_1A[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL
1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg31006‐08777‐SaitmP‐10280
1004‐09659‐NigatC‐10‐11005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy11005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk21005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA1004‐11042‐SagaP‐10s541005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz1[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐1961005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21005‐12239‐ToyamP‐31004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐09702‐SagaP‐10s491004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11004‐09811‐NigatC‐10‐18
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL1005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk3
1004‐10257‐NigatC‐10‐161005‐14322‐ToyamP‐41005‐12213‐ToyamP‐11003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09070‐NigatC‐10‐8[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1003‐09032‐NigatC‐10‐41005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12680‐YokhmC‐No21006‐17662‐SagaP‐10s56
1005‐12275‐NaganP‐22‐0351007‐19821‐YamgtP‐100715‐Yg11007‐21338‐YamnsP‐100729‐Yn1
1005‐12346‐OsakaC‐S100116[AJ299464]NOR‐21/Norway_3A[EU011791]PN‐IND/India_3A
1006‐16710‐HimejC‐100617[FJ360735]IND‐HAV‐97F/India_3A
1005‐NESID‐NagoyC‐100001F1005‐NESID‐NagoyC‐100004F1005‐13339‐KobeC‐69=100526Kb11005‐16627‐MieP‐66=100521Mi21006‐17605‐FukokP‐1‐201006261005‐14753‐KobeC‐77=100608Kb1005‐14778‐FukokC‐87=100623Fk41006‐14991‐SaitmP‐102811006‐13956‐NaganP‐22‐0411005‐12947‐KagsmC‐71=100602Kg2
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Jpn_3B
[AB425339]KRM003G72/Japan_3B
0.02
1A-1
1A-2
3A
1B
2010年春期に日本で流行したHAV遺伝子の系統樹解析
[AY644676]CF53/Berne_2A[AY644670]SLF88/USA_2B
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B[M20273]MBB/Germany_1B
[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng1P1/NiigataC/2006/J1006‐17891‐KawskC‐K41005‐13587‐YmgchP‐H22U31
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11010‐YokhmC‐y101005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg1
Shiga2006‐24/J1006‐16117‐KawskC‐100616
[AB300206]KRM031G47/Japan_1A2006‐15/Nagoya/2006/J[AF512536]DL3/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF357222]LU38/China_1A[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL
1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg31006‐08777‐SaitmP‐10280
1004‐09659‐NigatC‐10‐11005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy11005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk21005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA1004‐11042‐SagaP‐10s541005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz1[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐1961005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21005‐12239‐ToyamP‐31004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐09702‐SagaP‐10s491004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11004‐09811‐NigatC‐10‐18
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL1005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk3
1004‐10257‐NigatC‐10‐161005‐14322‐ToyamP‐41005‐12213‐ToyamP‐11003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09070‐NigatC‐10‐8[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1003‐09032‐NigatC‐10‐41005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12680‐YokhmC‐No21006‐17662‐SagaP‐10s56
1005‐12275‐NaganP‐22‐0351007‐19821‐YamgtP‐100715‐Yg11007‐21338‐YamnsP‐100729‐Yn1
1005‐12346‐OsakaC‐S100116[AJ299464]NOR‐21/Norway_3A[EU011791]PN‐IND/India_3A
1006‐16710‐HimejC‐100617[FJ360735]IND‐HAV‐97F/India_3A
1005‐NESID‐NagoyC‐100001F1005‐NESID‐NagoyC‐100004F1005‐13339‐KobeC‐69=100526Kb11005‐16627‐MieP‐66=100521Mi21006‐17605‐FukokP‐1‐201006261005‐14753‐KobeC‐77=100608Kb1005‐14778‐FukokC‐87=100623Fk41006‐14991‐SaitmP‐102811006‐13956‐NaganP‐22‐0411005‐12947‐KagsmC‐71=100602Kg2
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Jpn_3B
[AB425339]KRM003G72/Japan_3B
0.02
1A-17県、11例(18%)
発生年 地 域 原因施設 感染源 患者数 遺伝子型 備 考
2000 岐阜県 寿司店 調理従事者 23 1A
2001 浜松市 飲食店 大アサリ(中国産)
4 1A ノロウイルスの重複感染
2002 江東区 寿司店 調理従事者 24 1A
2002 江戸川区 飲食店 大アサリ(中国産)
5 1A ノロウイルスの重複感染
2006 新潟県 寿司店 不明 5 1A
2006 滋賀県 飲食店 調理従事者 17 1A
2010 新潟市 不明 不明 5 1A
2011 千葉市 寿司店 調理従事者 49 1A
HAVによる食中毒発生事例
0.02
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B
1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B
[M20273]MBB/Germany_1B[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1AE10‐528HAV_June2010
1102‐04474‐YamnsP‐287_2011_HAV[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A
1006‐16117‐KawskC‐100616[AB300206]KRM031G47/Japan_1A
Shiga2006‐24/J11MM‐02769‐Tokyo‐10‐119211105‐15212‐FukymC
1005‐13587‐YmgchP‐H22U311009‐29856‐SumidC‐97=101001Tk11005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng11006‐17891‐KawskC‐K4P1/NiigataC/2006/J
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421102‐03518‐YokhmC‐Yokohama101102‐06417‐YokhmC‐Yokohama111101‐02505‐ChibaC‐KHV‐5F1101‐02334‐ChibaC‐KHAV‐11101‐02330‐ChibaC‐KHAV‐21101‐02507‐ChibaC‐KHAV‐61101‐NESID‐ChibaC‐580151101‐02335‐ChibaC‐KHAV3F1101‐02333‐ChibaC‐KHAV4F1101‐02743‐ChibaC‐KHAV12F1101‐02749‐ChibaC‐KHAV13F1101‐02745‐ChibaC‐KHAV15F1101‐NESID‐ChibaC‐58032F1101‐03129‐ChibaP‐10K84811MM‐NESFD‐ChibaP‐10K86311MM‐05168‐ChibaP‐10K920Ibaraki_20110225‐211MM‐03671‐Tokyo‐10‐121491101‐37264‐SaitmP‐103561101‐02506‐ChibaC‐KHAV‐7
1012‐37891‐NaganC‐102=101215Ng1101‐02744‐ChibaC‐KHAV14F
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg11005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11010‐YokhmC‐y10
1011‐34867‐FukymC‐101=101112FyHA99_Black
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL1102‐05177‐SagaP‐11s71
2006‐15/Nagoya/2006/J[AF357222]LU38/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF512536]DL3/China_1A
[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
1103‐08847‐SagaP‐11s821104‐11007‐SagaP11s93¥HAV¥2F2R
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg3
1005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09702‐SagaP‐10s491004‐09070‐NigatC‐10‐81005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk31005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk2
1006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz11004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐11042‐SagaP‐10s541006‐08777‐SaitmP‐102801005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy1
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL
1005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21006‐17662‐SagaP‐10s561005‐12680‐YokhmC‐No21003‐09032‐NigatC‐10‐41004‐09811‐NigatC‐10‐18
[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1005‐12239‐ToyamP‐31005‐14322‐ToyamP‐41003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10257‐NigatC‐10‐161004‐09659‐NigatC‐10‐1
11MM‐06289‐SizokP‐1451004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11005‐12213‐ToyamP‐11005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐196
Outbreak in Chiba
IA-1
IA-2
IA
IB
2011年に千葉市で大規模なA型肝炎の食中毒事例が発生(確定診断49名)
•寿司店の調理人が感染源と判明。(生ものを扱う生産者、調理従事者のHAワクチン接種の必要性)
•今回の食中毒事例の株はGenotype 1Aの2006型と近縁。
[AY644676]CF53/Berne_2A[AY644670]SLF88/USA_2B
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B[M20273]MBB/Germany_1B
[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng1P1/NiigataC/2006/J1006‐17891‐KawskC‐K41005‐13587‐YmgchP‐H22U31
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11010‐YokhmC‐y101005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg1
Shiga2006‐24/J1006‐16117‐KawskC‐100616
[AB300206]KRM031G47/Japan_1A2006‐15/Nagoya/2006/J[AF512536]DL3/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF357222]LU38/China_1A[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL
1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg31006‐08777‐SaitmP‐10280
1004‐09659‐NigatC‐10‐11005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy11005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk21005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA1004‐11042‐SagaP‐10s541005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz1[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐1961005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21005‐12239‐ToyamP‐31004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐09702‐SagaP‐10s491004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11004‐09811‐NigatC‐10‐18
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL1005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk3
1004‐10257‐NigatC‐10‐161005‐14322‐ToyamP‐41005‐12213‐ToyamP‐11003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09070‐NigatC‐10‐8[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1003‐09032‐NigatC‐10‐41005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12680‐YokhmC‐No21006‐17662‐SagaP‐10s56
1005‐12275‐NaganP‐22‐0351007‐19821‐YamgtP‐100715‐Yg11007‐21338‐YamnsP‐100729‐Yn1
1005‐12346‐OsakaC‐S100116[AJ299464]NOR‐21/Norway_3A[EU011791]PN‐IND/India_3A
1006‐16710‐HimejC‐100617[FJ360735]IND‐HAV‐97F/India_3A
1005‐NESID‐NagoyC‐100001F1005‐NESID‐NagoyC‐100004F1005‐13339‐KobeC‐69=100526Kb11005‐16627‐MieP‐66=100521Mi21006‐17605‐FukokP‐1‐201006261005‐14753‐KobeC‐77=100608Kb1005‐14778‐FukokC‐87=100623Fk41006‐14991‐SaitmP‐102811006‐13956‐NaganP‐22‐0411005‐12947‐KagsmC‐71=100602Kg2
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Jpn_3B
[AB425339]KRM003G72/Japan_3B
0.02
1A-2•17県、31例(53%)
•フィリピンで分離された株(HAV-DE-2007/08-196)と同一
•13県からの26例の配列は100%一致
0
2
4
6
8
10
12
14
LateMar.
EarlyApr.
LateApr.
EarlyMay
LateMay
EarlyJun.
LateJun.
EarlyJul.
EarlyJul.
EarlyAug.
LateAug.
EarlySep.
LateSep.
EarlyOct.
LateOct.
EarlyNov.
LateNov.
IA-1
IA-2
IA-other
IB
IIIA
[AY644676]CF53/Berne_2A[AY644670]SLF88/USA_2B
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B[M20273]MBB/Germany_1B
[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng1P1/NiigataC/2006/J1006‐17891‐KawskC‐K41005‐13587‐YmgchP‐H22U31
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11010‐YokhmC‐y101005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg1
Shiga2006‐24/J1006‐16117‐KawskC‐100616
[AB300206]KRM031G47/Japan_1A2006‐15/Nagoya/2006/J[AF512536]DL3/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF357222]LU38/China_1A[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL
1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg31006‐08777‐SaitmP‐10280
1004‐09659‐NigatC‐10‐11005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy11005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk21005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA1004‐11042‐SagaP‐10s541005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz1[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐1961005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21005‐12239‐ToyamP‐31004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐09702‐SagaP‐10s491004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11004‐09811‐NigatC‐10‐18
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL1005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk3
1004‐10257‐NigatC‐10‐161005‐14322‐ToyamP‐41005‐12213‐ToyamP‐11003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09070‐NigatC‐10‐8[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1003‐09032‐NigatC‐10‐41005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12680‐YokhmC‐No21006‐17662‐SagaP‐10s56
1005‐12275‐NaganP‐22‐0351007‐19821‐YamgtP‐100715‐Yg11007‐21338‐YamnsP‐100729‐Yn1
1005‐12346‐OsakaC‐S100116[AJ299464]NOR‐21/Norway_3A[EU011791]PN‐IND/India_3A
1006‐16710‐HimejC‐100617[FJ360735]IND‐HAV‐97F/India_3A
1005‐NESID‐NagoyC‐100001F1005‐NESID‐NagoyC‐100004F1005‐13339‐KobeC‐69=100526Kb11005‐16627‐MieP‐66=100521Mi21006‐17605‐FukokP‐1‐201006261005‐14753‐KobeC‐77=100608Kb1005‐14778‐FukokC‐87=100623Fk41006‐14991‐SaitmP‐102811006‐13956‐NaganP‐22‐0411005‐12947‐KagsmC‐71=100602Kg2
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Jpn_3B
[AB425339]KRM003G72/Japan_3B
0.02
1A-2•17県、31例(53%)
•フィリピンで分離された株(HAV-DE-2007/08-196)と同一
•13県からの26例の配列は100%一致
HAV-DE-2007/08-196
HAV-DE-2007/08-196(218)•2007年7月から8月にフィリピンへ旅行した11歳の女児からドイツで分離された。
•帰国直後に急性A型肝炎を発症しており、フィリピンでの感染が強く示唆されている。
•Genotype 1Aだが、日本常在の 1Aとは異なるクラスターに分類される。
フィリピンのA型肝炎患者からの検体を採取することは困難なため、都市部の河川水からのHAVゲノム増幅を試みた。
[K02990]LA/USA_1A[X75215]GBM/WT/Germany_1A
[X83302]FG/Italy_1A
1006-16117-KawskC-1006162006-15/Nagoya/2006/J
*1111-NESID-IMCJ[AB300206]KRM031G47/Japan_1A
1004-11010-YokhmC-y10
1005-12036-KagsmC-20=100513Kg2
1004-11704-KagsmC-19=100513Kg1
**S120510-hav608vp1
*1102-05177-SagaP-11s71
**HAV-L12-2958.seq#Philippines-St2-4
#Philippines-St4-1
#Philippines-St4-3
#Philippines-Pa3-1
#Philippines-Pa3-4
#Philippines-St2-1
#Philippines-St2-3
#Philippines-La2-1
#Philippines-La2-2
#Philippines-La2-4
#Philippines-St4-2
#Philippines-Pa4-1
#Philippines-La2-3
#Philippines-St6-7N
#Philippines-St6-3N
#Philippines-St6-11N
#Philippines-St6-9N
#Philippines-Pa4-6
#Philippines-St2-2
[AF357222]LU38/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A
[AF512536]DL3/China_1A
[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
1004-10562-KobeC-2=100427Kb2
1005-24122-FukokC-85=100623Fk2
1005-12213-ToyamP-1
[EU825856]HAV-DE-2007/08-196
#Philippines-Pa3-2
1006-15699-SizokP-100616-Sz1
#Philippines-Pa4-4
1006-14079-NaganP-22-042
#Philippines-Pa4-7
#Philippines-Pa3-3
#Philippines-Pa4-5
#Philippines-St6-4N
#Philippines-St6-6N
#Philippines-St6-1N
#Philippines-St6-5N
#Philippines-St6-10N
#Philippines-St6-2N
*1103-08847-SagaP-11s82
#Philippines-Pa4-2
#Philippines-Pa4-3
#Philippines-Pa4-8
*1104-11007-SagaP-11s93
1005-13073-AomorP-76=100604Ao1
1004-11212-OkaymC-11-100429Ok1
#Philippines-St6-8N
*1101-37264-SaitmP-10356
1005-13587-YmgchP-H22U31
**1206-18814-120615-Kn1
**1205-13683-HAV**HAV-L12-2840.seq
**HAV-L12-3019.seq
1005-13313-OsakaC-S100142
*1102-03518-YokhmC-y10-HAV10*1102-06417-YokhmC-y10-HAV11*1101-02334-ChibaC-KHAV-1*1101-NESID-ChibaC-58032F*1104-13865-OsakaP-OS01M
**1204-10648-y12-HAV17
**1202-03411-WakaymC-120223-Wk
1005-12357-NaganC-22=100513Ng1
*1105-15212-FukymC-110523-Fy1
**1204-11236-HirsmC-2122301_2F
**1202-13334-ChibaP-120073
**1202-14759-ChibaP-120076
**1202-15699-ChibaP-120108
*110M-02679-TokyoP-10-11921
Shiga2006-24/J
**1204-11242-HirsmC-2122201_2F
**1202-05319-HirsmC-2121001_2F
**1204-13166-HirsmC-2122601_2F
**1204-10320-HirsmC-2122101_2F
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A
1012-37891-NaganC-102=101215Ng
日本とフィリピンのIA株の比較
フィリピンのマニラ市内の河川6ヶ所からすべてHAV遺伝子が検出され、ウイルスが常在していることが明らかとなった。検出されたHAV株はすべてgenotype IAであり、約600bpの配
列解析の結果、さらに3つのサブクラスター(S1〜S3)に分類されると考えられる。
2010年流行株は、2011年以降はフィリピン河
川からは引き続き検出されるが、日本では輸入例を除きほとんど検出されなくなった。何らかの理由で2010年に日本に流入した本株は、
日本で広域流行を起こした後は定着することなく消失したと推定される。
日本株(青字)無印:2010年検出*印 :2011年検出**印:2012年検出
IA
2010年流行
フィリピンでの感染
S1
S2
S3
・2013年ダバオでの感染・フィリピン産ブラックタイガー
[AY644676]CF53/Berne_2A[AY644670]SLF88/USA_2B
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B[M20273]MBB/Germany_1B
[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng1P1/NiigataC/2006/J1006‐17891‐KawskC‐K41005‐13587‐YmgchP‐H22U31
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11010‐YokhmC‐y101005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg1
Shiga2006‐24/J1006‐16117‐KawskC‐100616
[AB300206]KRM031G47/Japan_1A2006‐15/Nagoya/2006/J[AF512536]DL3/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF357222]LU38/China_1A[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL
1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg31006‐08777‐SaitmP‐10280
1004‐09659‐NigatC‐10‐11005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy11005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk21005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA1004‐11042‐SagaP‐10s541005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz1[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐1961005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21005‐12239‐ToyamP‐31004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐09702‐SagaP‐10s491004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11004‐09811‐NigatC‐10‐18
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL1005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk3
1004‐10257‐NigatC‐10‐161005‐14322‐ToyamP‐41005‐12213‐ToyamP‐11003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09070‐NigatC‐10‐8[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1003‐09032‐NigatC‐10‐41005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12680‐YokhmC‐No21006‐17662‐SagaP‐10s56
1005‐12275‐NaganP‐22‐0351007‐19821‐YamgtP‐100715‐Yg11007‐21338‐YamnsP‐100729‐Yn1
1005‐12346‐OsakaC‐S100116[AJ299464]NOR‐21/Norway_3A[EU011791]PN‐IND/India_3A
1006‐16710‐HimejC‐100617[FJ360735]IND‐HAV‐97F/India_3A
1005‐NESID‐NagoyC‐100001F1005‐NESID‐NagoyC‐100004F1005‐13339‐KobeC‐69=100526Kb11005‐16627‐MieP‐66=100521Mi21006‐17605‐FukokP‐1‐201006261005‐14753‐KobeC‐77=100608Kb1005‐14778‐FukokC‐87=100623Fk41006‐14991‐SaitmP‐102811006‐13956‐NaganP‐22‐0411005‐12947‐KagsmC‐71=100602Kg2
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Jpn_3B
[AB425339]KRM003G72/Japan_3B
0.02
3A10県、16例(28%)
2000年以降、IIIAの報告は輸入例以外はほとんどなかった。
Reported Cases of Genotype IIIA, 2010-2012
20102011
2
2 23
2012
2
2
0
2000
4000
6000
8000
10000
12000
14000
16000
2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
Information provided by Korea CDC(2010, 2011: provisional)
患者
数韓国での急性A型肝炎報告数
Yoon et al. 2011
Phylogenetic Tree Analysis of Korean HAV in 2009
(Korea, 2008)
(Japan, 2007)
(India, 2008)
(Norway, 1999)
IA
IIIA
1998.1~1999.122006.9~2007.8
93.3 6.764.6 35.6
IA IIIA
(%)
period
2007.9~2008.82009.1~2009.12
42.3 54.67.0 93.0
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A
DQ991029‐CP‐IND_3A_FJ360730‐IND‐HAV‐06F_3A_
FJ360732‐IND‐HAV‐08F_3A_FJ360734‐IND‐HAV‐99F_3A_
AY644337‐HMH_3A_2HA4‐Niigata
DQ991030‐GBS‐IND_3A_[EU011791]PN‐IND/India_3AIND‐HAV‐97F_3A
HA103‐GunmaGU908272
AB279732‐HA‐JNG04‐90_3A_GU908269
GU908263GU908284
HA64‐ChibaGU908286
GU908265GU908270
GU908277HA73‐Nagano
GU908266GU908276
GU908282GU908281GU908283
[AJ299464]NOR‐21/Norway_3AGU908268
GU908271HA66‐MieHA77‐KobeHA84‐FukuokaHA89‐OsakaHA71‐Kagoshima
HA69‐KobeHA68‐Nagano
HA87‐FukuokaHA96‐Fukuoka
GU908262HA94‐Yamagata
GU908275HA128‐ChibaGU908279
GU908260GU908261
GU908278GU908267HA127‐ChibaGU908273
GU908285GU908264
GU908280GU908274
GU908287[AB279735]HAJ85‐1/Japan_3B[AB425339]KRM003G72/Japan_3B[AB300205]KRM238G59/Japan_3B
[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Japan_3B
0.01
IIIA
Phylogenetic tree analysis of Japanese and Korean IIIA isolates
[AY644676]CF53/Berne_2A[AY644670]SLF88/USA_2B
[AF268396]HAF‐203/Brazil_1B[M14707]HM‐175/Australia_1B1006‐16473‐OsakaC‐91=100706Os3[AF314208]L‐A‐1/China_1B[M20273]MBB/Germany_1B
[X75215]GBM/WT/Germany_1A[X83302]FG/Italy_1A[K02990]LA/USA_1A
[EU131373]HAV5/Uruguay_1A1005‐14141‐MieP‐75=100603Mi1
1005‐13313‐OsakaC‐S1001421005‐12357‐NaganC‐22=100513Ng1P1/NiigataC/2006/J1006‐17891‐KawskC‐K41005‐13587‐YmgchP‐H22U31
1005‐12612‐KyotoC‐HAV‐2‐10_21004‐11051‐SagaP‐10s521004‐11010‐YokhmC‐y101005‐12036‐KagsmC‐20=100513Kg21004‐11704‐KagsmC‐19=100513Kg1
Shiga2006‐24/J1006‐16117‐KawskC‐100616
[AB300206]KRM031G47/Japan_1A2006‐15/Nagoya/2006/J[AF512536]DL3/China_1A
[AB020564]AH1/Japan_1A[AF357222]LU38/China_1A[AB020569]FH3/Japan_1A[AF485328]LY6/China_1A
[AB567670]Pa3‐2/Apr2009/MNL/PL[AB567666]La2/Mar2009/MNL/PL[AB567669]Pa1/Apr2009/MNL/PL
1004‐11212‐OkaymC‐11‐100429Ok11005‐13073‐AomorP‐76=100604Ao1
[AB567672]Ps2/Apr2009/MNL/PL1005‐13474‐KagsmP‐72=100602Kg31006‐08777‐SaitmP‐10280
1004‐09659‐NigatC‐10‐11005‐13238‐FukymC‐67=100524Fy11005‐24122‐FukokC‐85=100623Fk21005‐12221‐ToyamP‐21004‐09234‐KobeC‐10=100427KbA1004‐11042‐SagaP‐10s541005‐12497‐MieP‐65=100521Mi11006‐15699‐SizokP‐100616‐Sz1[EU825856]HAV‐DE‐2007/08‐1961005‐12163‐KyotoC‐HAV‐1‐10_21005‐12239‐ToyamP‐31004‐10563‐KobeC‐8=100427Kb81004‐09702‐SagaP‐10s491004‐10776‐KasiwC‐64=100518Ks11004‐09811‐NigatC‐10‐18
1006‐14079‐NaganP‐22‐042[AB567671]Pa4/Apr2009/MNL/PL1005‐13872‐FukokC‐86=100623Fk3
1004‐10257‐NigatC‐10‐161005‐14322‐ToyamP‐41005‐12213‐ToyamP‐11003‐08022‐KobeC‐9=100427Kb91004‐10562‐KobeC‐2=100427Kb21004‐09070‐NigatC‐10‐8[AB567673]La2/Aug2009/MNL/PL1003‐09032‐NigatC‐10‐41005‐12487‐KagsmC‐70=100602Kg11005‐13466‐GunmaP‐100715‐Gm11005‐12680‐YokhmC‐No21006‐17662‐SagaP‐10s56
1005‐12275‐NaganP‐22‐0351007‐19821‐YamgtP‐100715‐Yg11007‐21338‐YamnsP‐100729‐Yn1
1005‐12346‐OsakaC‐S100116[AJ299464]NOR‐21/Norway_3A[EU011791]PN‐IND/India_3A
1006‐16710‐HimejC‐100617[FJ360735]IND‐HAV‐97F/India_3A
1005‐NESID‐NagoyC‐100001F1005‐NESID‐NagoyC‐100004F1005‐13339‐KobeC‐69=100526Kb11005‐16627‐MieP‐66=100521Mi21006‐17605‐FukokP‐1‐201006261005‐14753‐KobeC‐77=100608Kb1005‐14778‐FukokC‐87=100623Fk41006‐14991‐SaitmP‐102811006‐13956‐NaganP‐22‐0411005‐12947‐KagsmC‐71=100602Kg2
[AB279733]HA‐JNG08‐92/Japan_3A[AB279734]HAJ95‐8/Japan_3A[AB258387]HA‐JNG06‐90F/Jpn_3B
[AB425339]KRM003G72/Japan_3B
0.02
3A•10県、16例(28%)•韓国で流行している株と類似
考 察
・2010年から日本で継続して検出されているGenotype IIIAについて、2009年に報告されている韓国のIIIA株
の配列と同じ部位を増幅、配列決定し、系統樹解析を行った。日本のIIIA株のほぼすべては韓国のIIIA株と非常に近縁であると思われる解析結果を得た。
IIIA
IA-2
IA-1 (domestic)
2010年のA型肝炎の流行は、2つの地域からの流入によると考えられる(IA-2 and IIIA)
2014年の日本におけるA型肝炎流行状況の解析
2014年の日本でのA型肝炎流行の背景
• 日本におけるA型肝炎は、2011年初めの千葉市における集団事例以降は低い頻度で推移していたが、2014年1月末から2月にかけて、仙台市を中心とする多発事例の報告があった。
• 同時期に堺市においても家族内感染による複数事例の報告があり、全国的な流行の可能性が示唆されたため、2月21日に厚労省の結核感染症課(肝炎対策室)、食品安全課、感染研の感染症疫学センターと打ち合わせを行った。
• 結論として、今後の動向に注意を払いつつ、引き続き経過を注視するということになった。
第8週からA型肝炎の報告が全国で急増
0
10
20
30
40
50
60
70
1 6 11 16 21 26 31 36 41 46 51
Average
Average + 2SD
2014
ベースラインと2014年の報告数
(ベースライン)
平均(ベースライン)=過去4年(2008, 9, 12, 13年; 2010, 11年はアウトブレイク発生のため除外)の当該週およびその前後2週の平均値
(週)
(患者数)
2014年の急性A型肝炎発生状況(ステータス未確認を含む)
01〜23〜56〜10>10
33
19
計378(第30週現在)31
3039
26
15
24
2310
10
10
性年齢階級別患者分布(全国;N=274)年齢 男 女 合計
人 % 人 % 人 %0‐4歳 2 1 4 4 6 25‐9歳 2 1 2 2 4 1
10‐14歳 7 4 2 2 9 315‐19歳 1 1 1 1 2 120‐29歳 13 8 9 8 22 830‐39歳 21 13 20 18 41 1540‐49歳 28 18 20 18 48 1850‐59歳 33 21 23 20 56 2060‐69歳 44 28 25 22 69 2570‐79歳 8 5 5 4 13 580‐89歳 0 0 2 2 2 1
90歳以上 1 1 1 1 2 1合計 160 114 274
症状(全国;N=274)
人 %全身倦怠感 239/274 87発熱 192/274 70食欲不振 195/274 71黄疸 213/274 78肝腫大 76/274 28肝機能異常 243/274 89
感染源・感染経路(全国;N=274)
人 %経口感染 227/274 83
カキa) 40/227 18刺身・魚介類a) 35/227 15生カキa) 30/227 13その他a) 13/227 6不明・未記載a) 57/227 25
性的接触(A.性交) 3/274 1性的接触(B.経口) 1/274 <1性的接触(ア.同性間) 0/274 0性的接触(イ.異性間) 2/274 1性的接触(ウ.不明) 3/274 1輸血・血液製剤 0/274 0a)重複記載あり
AY
644670-SLF88_2BA
Y644676-C
F53_Berne_2A
AF268396-H
AF-203_B
razil_1BM
14707-HM
175_Australia_1B
1403-15617-TMU
H-4H
A28N
1404-16394-ChibaP-1400020
AF314208-LA
1_China_1B
M20273-M
BB
_Germ
any_1BK
02990-LA_U
SA_1A
EU131373-H
AV
5_Uruguay_1A
AB
020564-AH
1_Japan_1AA
F357222-LU38_C
hina_1AA
F512536-DL3_C
hina_1AA
B020569-FH
1_Japan_1AA
F485328-LY6_C
hina_1A1401-06689-FukokC
-2014-4001-2FA
B973401 (2010 Japan outbreak)
1404-17632-ShizokP-4HA
38N1402-11270-SakaiC
-v58-01141402-12421-O
sakaP-OSN
2013-15_2A
B839692-B
aliA03-H
29_Indonesia1403-14465-K
umam
tC-4H
A33
X75215-G
BM
_WT_germ
any_1AX
83302-FG_Italy_1A
_K
F182323 (2013 EU
outbreak)140X
-NESID
-FukokP-FG81
1403-13482-FukokP-FG84
1403-13568-FukokP-FG83
1403-13133-FukokC-2014-4007-2F
110525-Ch1 (2011 Japan outbreak)
1404-17025-KobeC
-HA
V6
AB
819870-HA
JFF-Kan12_1A
1403-201413961-IwateP-14175001
1403-12390-OsakaC
-S131346-2F2R1404-16535-K
obeC-H
AV
41402-11786-N
iigatC-H
AV
1402251404-18821-W
akymP-4H
A41
1404-19858-KobeC
-HA
V37
1402-10961-ChibaP-131118
1404-20679-Wakym
C-4H
A43
13MM
-05949-FukokC-2013-4057-2F
1402-11949-FukokP-FG77
1402-11863-SendiC-13W
2550-AF2R
1402-12610-NiigatC
-HA
V140228
1403-13413-ChibaP-131196
1404-16505-KobeC
-HA
V5
1403-13269-Hirsm
C-2142201-2F2R
1402-11951-OsakaC
-s1312821403-12836-FukuiP-4H
A26
1402-12527-Am
gskC-4H
A4
1403-12777-OsakaC
-S131314-2F2R1403-13318-ShizokP-4H
A22
1402-12822-Okym
C-4H
A5
1402-12653-Yokohm
C-H
AV
27-11403-14384-Ehim
eP-14-376-2F2R1402-11164-W
akymC
-4HA
11403-12985-Fujisw
C-4H
A6
1403-11953-EhimeP-14-325-2F2R
1403-11808-Ym
gchP-H25SI207
AB
969748-1403-12190-Kagsm
P-4HA
7A
B279735-H
AJ85-1_Japan_3B
AB
300205-KR
M238_Japan_3B
AB
258387-HA
-JNG
06-90F-Japan_3B1402-10197-SendiC
-13W2548-A
F2R1403-10110-M
iyagiP-4HA
201402-11615-SendiC
-13Miya23-A
F2A
B973400-1401-09412-SendiC
-13Ao2532
AJ299464-N
OR
-21_Norw
ay_3AJQ
655151-Kor-H
AV
-F (Korea outbreak)
13MM
-04436-FukokC-2014-17-2F2R
1402-10375-FukokC-2013-4055-2F
FJ360735-IND
-HA
V-97F_3A
1405-22184-KobeC
-HA
V53
EU011791-PN
-IND
_India_3A1402-09703-O
sakaP-OSN
2013-11_21404-19351-Y
okhmC
-HA
V33-1
1404-20055-Wakym
C-4H
A42
AB
279733-HA
-JNG
08-92_Japan_3A0.02
z
IAIB IIIA
1000
1000
1000
994
997
997
998
899
615
476
980 760 1000
806
656483992
930415
126998
981
688
109
112
319998
941
6881000
広域型(亜型含む)堺型
仙台型(亜型含む)
広域株のほぼ全長配列を決定したところ、最も近縁の株はAB819870-HAJFF-Kan12_1Aであった。(7,388塩基中、違いは11塩基のみ。99.9%一致)
AUTHORS: Mishiro,S., Takahashi,K. and Uoshima,H. TITLE: Two elderly cases of severe or fulminant type of hepatitis A, where near complete HAV genome sequences could be analyzed.
AY
644670-SLF88_2BA
Y644676-C
F53_Berne_2A
AF268396-H
AF-203_B
razil_1BM
14707-HM
175_Australia_1B
1403-15617-TMU
H-4H
A28N
1404-16394-ChibaP-1400020
AF314208-LA
1_China_1B
M20273-M
BB
_Germ
any_1BK
02990-LA_U
SA_1A
EU131373-H
AV
5_Uruguay_1A
AB
020564-AH
1_Japan_1AA
F357222-LU38_C
hina_1AA
F512536-DL3_C
hina_1AA
B020569-FH
1_Japan_1AA
F485328-LY6_C
hina_1A1401-06689-FukokC
-2014-4001-2FA
B973401 (2010 Japan outbreak)
1404-17632-ShizokP-4HA
38N1402-11270-SakaiC
-v58-01141402-12421-O
sakaP-OSN
2013-15_2A
B839692-B
aliA03-H
29_Indonesia1403-14465-K
umam
tC-4H
A33
X75215-G
BM
_WT_germ
any_1AX
83302-FG_Italy_1A
_K
F182323 (2013 EU
outbreak)140X
-NESID
-FukokP-FG81
1403-13482-FukokP-FG84
1403-13568-FukokP-FG83
1403-13133-FukokC-2014-4007-2F
110525-Ch1 (2011 Japan outbreak)
1404-17025-KobeC
-HA
V6
AB
819870-HA
JFF-Kan12_1A
1403-201413961-IwateP-14175001
1403-12390-OsakaC
-S131346-2F2R1404-16535-K
obeC-H
AV
41402-11786-N
iigatC-H
AV
1402251404-18821-W
akymP-4H
A41
1404-19858-KobeC
-HA
V37
1402-10961-ChibaP-131118
1404-20679-Wakym
C-4H
A43
13MM
-05949-FukokC-2013-4057-2F
1402-11949-FukokP-FG77
1402-11863-SendiC-13W
2550-AF2R
1402-12610-NiigatC
-HA
V140228
1403-13413-ChibaP-131196
1404-16505-KobeC
-HA
V5
1403-13269-Hirsm
C-2142201-2F2R
1402-11951-OsakaC
-s1312821403-12836-FukuiP-4H
A26
1402-12527-Am
gskC-4H
A4
1403-12777-OsakaC
-S131314-2F2R1403-13318-ShizokP-4H
A22
1402-12822-Okym
C-4H
A5
1402-12653-Yokohm
C-H
AV
27-11403-14384-Ehim
eP-14-376-2F2R1402-11164-W
akymC
-4HA
11403-12985-Fujisw
C-4H
A6
1403-11953-EhimeP-14-325-2F2R
1403-11808-Ym
gchP-H25SI207
AB
969748-1403-12190-Kagsm
P-4HA
7A
B279735-H
AJ85-1_Japan_3B
AB
300205-KR
M238_Japan_3B
AB
258387-HA
-JNG
06-90F-Japan_3B1402-10197-SendiC
-13W2548-A
F2R1403-10110-M
iyagiP-4HA
201402-11615-SendiC
-13Miya23-A
F2A
B973400-1401-09412-SendiC
-13Ao2532
AJ299464-N
OR
-21_Norw
ay_3AJQ
655151-Kor-H
AV
-F (Korea outbreak)
13MM
-04436-FukokC-2014-17-2F2R
1402-10375-FukokC-2013-4055-2F
FJ360735-IND
-HA
V-97F_3A
1405-22184-KobeC
-HA
V53
EU011791-PN
-IND
_India_3A1402-09703-O
sakaP-OSN
2013-11_21404-19351-Y
okhmC
-HA
V33-1
1404-20055-Wakym
C-4H
A42
AB
279733-HA
-JNG
08-92_Japan_3A0.02
z
IAIB IIIA
1000
1000
994
997
997
998
899
615
476
980 760 1000
806
656483992
930415
126998
981
688
109
112
319998
941
6881000
広域型(亜型含む)堺型
仙台型(亜型含む)
全長配列決定(藤沢、鹿児島)7,407塩基中、違いは1塩基のみ
遺伝子型別検体数
件数 %
IA(広域型) 97 65.5
IA(堺型) 5 3.4
IA(その他) 20 13.5
IB 4 2.7
IIIA(仙台型) 12 8.1
IIIA(その他) 6 4.1
不明 4 2.7
合計 148 100.0
IA(堺型)5例はすべて家族内感染
遺伝子型別報告数推移
0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
報告
数
初診週
IA(広域型)
IA(堺型)
IA(その他)
IIIA(仙台型)
IA(広域型)は減少中。その他のIAが増加。
IIIA(仙台型)週別報告数(N=12)
発生は宮城、山形県のみ。近年に韓国で流行したIIIAのクラスターに属する。
2014年のⅠA(広域型)の検出状況(6月10日まで判明分)
(n=104)
2/5
7/10
15/15
5/138/10
11/15
5/612/17
3/12
3/4
7/7
4/4
12/13
2/2
1/3
1/6
1/1 1/21/1
分母:解析した検体数、分子:広域型の数大阪市、広島市、福岡市、愛媛県は他に配列が非常に類似した株が各1株ずつ検出されている
1/31/1
01〜23〜56〜10>10
1/2
リアルタイムPCRによる患者検体からのHAVゲノムの検出
HA1 Undetermined IA(広域型)
HA2-1 Undetermined IA(広域型)
HA-2-2 Undetermined IA(広域型)
HA-3 Undetermined -
HA-4 Undetermined IA(広域型)
HA5-1 Undetermined IA(広域型)
HA5-2 Undetermined IA(広域型)
HA-6 217.17 IA(広域型)
HA-7 Undetermined IA(広域型)
HA-8 282.66 IA(広域型)
HA-9 Undetermined IA(広域型)
HA-10 Undetermined IA(広域型)
HA-11 Undetermined IA(広域型)
HA-12 Undetermined IA(広域型)
HA-13 Undetermined IA(広域型)
HA-14 Undetermined IA(広域型)
HA-15 Undetermined IA(広域型)
HA-16 Undetermined IA(広域型)
HA-17 Undetermined IA(広域型)
HA-18 Undetermined IA(広域型)
HA-19 Undetermined IA(広域型)
HA-20 1256.87 IIIA
HA-21 Undetermined IA(広域型)
HA-22 Undetermined IA(広域型)
HA-23 Undetermined IA(広域型)
HA-24 Undetermined IA(広域型)
HA-25 Undetermined IA(広域型)
HA-26 Undetermined IA(広域型)
HA-27 Undetermined IA(広域型)
HA-28-1 Undetermined IB
HA-28-2 476.64 IB
HA-29 Undetermined -
HA-30 Undetermined -
HA-31 Undetermined IA(広域型)
HA-32 Undetermined IA(広域型)
HA-33 1970.56 IA
HA-35 1387041.88 IIIA(仙台型)
HA-36 Undetermined IA(広域型)
HA-37 Undetermined -
SA-8 1284.37 IIIA(仙台型)
SA-9 1584.49 IIIA(仙台型)
SA-10 1423.49 IIIA(仙台型)
SA-11 509.72 IIIA(仙台型)
SA-12 1052.80 IIIA(仙台型)
SA-14 1071.33 IIIA(仙台型)
SA-15 697.40 IIIA(仙台型)
SA-16 3001.67 IIIA(仙台型)
SA-17 Undetermined IA
SA-35 Undetermined IA(広域型)
HA1 Undetermined IA(広域型)
HA2-1 Undetermined IA(広域型)
HA-2-2 Undetermined IA(広域型)
HA-3 Undetermined -
HA-4 Undetermined IA(広域型)
HA5-1 Undetermined IA(広域型)
HA5-2 Undetermined IA(広域型)
HA-6 217.17 IA(広域型)
HA-7 Undetermined IA(広域型)
HA-8 282.66 IA(広域型)
HA-9 Undetermined IA(広域型)
HA-10 Undetermined IA(広域型)
HA-11 Undetermined IA(広域型)
HA-12 Undetermined IA(広域型)
HA-13 Undetermined IA(広域型)
HA-14 Undetermined IA(広域型)
HA-15 Undetermined IA(広域型)
HA-16 Undetermined IA(広域型)
HA-17 Undetermined IA(広域型)
HA-18 Undetermined IA(広域型)
HA-19 Undetermined IA(広域型)
HA-20 1256.87 IIIA
HA-21 Undetermined IA(広域型)
HA-22 Undetermined IA(広域型)
HA-23 Undetermined IA(広域型)
HA-24 Undetermined IA(広域型)
HA-25 Undetermined IA(広域型)
HA-26 Undetermined IA(広域型)
HA-27 Undetermined IA(広域型)
HA-28-1 Undetermined IB
HA-28-2 476.64 IB
HA-29 Undetermined -
HA-30 Undetermined -
HA-31 Undetermined IA(広域型)
HA-32 Undetermined IA(広域型)
HA-33 1970.56 IA
HA-35 1387041.88 IIIA(仙台型)
HA-36 Undetermined IA(広域型)
HA-37 Undetermined -
SA-8 1284.37 IIIA(仙台型)
SA-9 1584.49 IIIA(仙台型)
SA-10 1423.49 IIIA(仙台型)
SA-11 509.72 IIIA(仙台型)
SA-12 1052.80 IIIA(仙台型)
SA-14 1071.33 IIIA(仙台型)
SA-15 697.40 IIIA(仙台型)
SA-16 3001.67 IIIA(仙台型)
SA-17 Undetermined IA
SA-35 Undetermined IA(広域型)
リアルタイムPCRによる患者検体からのHAVゲノムの検出
+449 1:ATGGTAACAGCGGCGGATAT 2014HAV 1:AGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGGGAATTGATTGTCAGGGCTGT+482-P-FAM 1: AGACAAAAACCATTCAACRCCGRAGGAC -557.seq 1: AGTGRATTGAYTGTCAGGGCTGT
リアルタイムPCRが増幅する領域の広域株とプライマーの配列
それぞれのプライマーに1ヶ所ずつのミスマッチが存在する。‐557のミスマッチはcriticalな可能性が高い。
+449 1:ATGGTAACAGCGGCGGATAT 2014HAV 1:AGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGGGAATTGATTGTCAGGGCTGT+482-P-FAM 1: AGACAAAAACCATTCAACRCCGRAGGAC -557.seq 1: AGTGRATTGAYTGTCAGGGCTGT
+449 1:ATGGTAACAGCGGCGGATAT 2014HAV 1:AGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGGGAATTGATTGTCAGGGCTGT+482-P-FAM 1: AGACAAAAACCATTCAACRCCGRAGGAC -557New.seq 1: AGMGRATTGAYTGTCAGGGCTGT
‐557プライマーの配列変更(T→M)
HA1 110.34 IA(広域型)
HA2-1 1550.17 IA(広域型)
HA-2-2 119.87 IA(広域型)
HA-3 123.59 コンタミ?
HA-4 1921.78 IA(広域型)
HA5-1 13333.35 IA(広域型)
HA5-2 121.74 IA(広域型)
HA-6 675870.63 IA(広域型)
HA-7 3141.94 IA(広域型)
HA-8 750885.94 IA(広域型)
HA-9 231736.83 IA(広域型)
HA-10 4657.50 IA(広域型)
HA-11 3009.13 IA(広域型)
HA-12 26146.28 IA(広域型)
HA-13 81824.63 IA(広域型)
HA-14 3356.17 IA(広域型)
HA-15 4375.03 IA(広域型)
HA-16 3642.82 IA(広域型)
HA-17 918.37 IA(広域型)
HA-18 4421.63 IA(広域型)
HA-19 51871.93 IA(広域型)
HA-20 995.35 IIIA
HA-21 18886.81 IA(広域型)
HA-22 4678.13 IA(広域型)
HA-23 1272.86 IA(広域型)
HA-24 1776.30 IA(広域型)
HA-25 19111.28 IA(広域型)
HA-26 430.03 IA(広域型)
HA-27 14.15 IA(広域型)
HA-28-1 23.70 IB
HA-28-2 567.45 IB
HA-29 104.71 -
HA-30 4558.60 -
HA-31 449.13 IA(広域型)
HA-32 2901.11 IA(広域型)
HA-33 37559.08 IA
HA-35 831586.88 IA(広域型)
HA-36 11324.31 IA(広域型)
HA-37 -
HA-38 2914.28
HA-39 857359.75 IA(広域型)
HA-40 2919.69 IA(広域型)
SA-14 832.89 IIIA(仙台型)
SA-15 625.38 IIIA(仙台型)
SA-16 2410.69 IIIA(仙台型)
SA-17 6894.99 IIIA(仙台型)
SA-35 6718.83 IIIA(仙台型)
SA-8 1334.26 IIIA(仙台型)
SA-9 1294.38 IIIA(仙台型)
SA-10 809.90 IIIA(仙台型)
SA-11 586.64 IA
SA-12 1074.29 IA(広域型)
プライマーの改良により、広域型もリアルタイムPCRで検出可能になった
まとめ• 2014年のA型肝炎の多発は、2月上旬から仙台市を中心とするgenotype
IIIAの集団発生事例からはじまったが、本事例は仙台、山形に限局して終息したものと思われる。
• しかしながら、2月中旬から全国(宮城から鹿児島まで)で広範囲に渡りA型肝炎の発生が報告され、この株はgenotype IAであり、配列解析を行った株で構造/非構造 junction 領域の配列619塩基はほぼ完全に一致した。また、藤沢と鹿児島の2株で全長配列の決定を行ったところ、7,407塩基中違いは1塩基のみと、非常に均一性が高かった。
• この2014広域株による患者発生報告は第9週をピークとした一峰性であ
り、何らかの同一の感染源が短期間に全国に拡散したものと推測される。原因となる感染源については感染症疫学センターと調査を行っている。
• 今回の流行をかなりフォローすることができたのは、2014広域株による流
行の前に、偶然とは思われるが仙台市での集団発生事例があったために流行の初期からかなりの検体を蒐集、解析することができたことが重要であったと思われる。
• 2014広域株は、通知法のリアルタイムPCRではtiterが非常に高いサンプル
しか検出することができなかった。今までにこのような例は報告されておらず、この株には偶然にPCRにcriticalな部位(プライマーの3’端付近)に変異が入っていたことが理由であった。
• リアルタイムPCRにより病原体の同定を行っている自治体もあり、抗体陽性、遺伝子陰性と報告されていた事例で、後から行ったconventional PCRで
は遺伝子陽性という報告があった。他にもこのような事例はあるものと思われ、リアルタイムPCRプライマーの改良を全国に通知した(ウェブサイト:病原微生物検出情報およびメーリングリスト)。
• 感染研の感染症疫学センターと共同で広域株の感染源の調査を行っている。新たに詳細な喫食調査票の作成を行っており、集団発生が見られた自治体に協力をお願いしている。この調査により原因に迫れることを期待したい。
まとめ2
Masaki Takahashi (Research Institute for Environmental Sciences and Public Health of Iwate Prefecture), Makoto Sekine (Sendai City Institute of Public Health), Yoko Aoki (Yamagata Prefectural Institute of Public Health), Tetsuya Saito and Takuya Momoi (Niigata City Institute of Public Health and Environment), Saitama Institute of Public Health, Chiemi Hotta and Takeshi Niwa (Chiba Prefectural Institute of Public Health), Hideaki Shimizu (Kawasaki City Institute of Public Health), Shuzo Usuku (Yokohama City Institute of Health), Hironaga Yamada (Fujisawa City Puclic Health Center), Keiji Sahara (Shizuoka Institute of Environment and Hygiene), Shizuko Kasuo (Nagano Environmental Conservation Research Institute), Kazumasa Owada (Fukui Prefectural Institute of Public Health and Environmental Science), Shinichiro Shibata (Nagoya City Public Health Research Institute), Nobuhiro Iritani (Osaka City Institute of Public Health and Environmental Sciences), Naomi Tanaka-Sakon (Osaka Prefectural Institute of Public Health), Kiyoko Uchino and Tatsuya Miyoshi (Sakai City Institute of Public Health), Souichi Nukuzuma (Kobe Institute of Health), Hiroaki Kitamoto (Hyogo Prefectural Institute of Public Health and Consumer Sciences), Hiromi Ogura (Amagasaki City Institute of Public Health), Hiromoto Ohta (Wakayama City Institute of Public Health), Keiko Sakakibara (Okayama City Public Health Center), Miwako Yamamoto (Hiroshima City Institute of Public Health), Setsuko Iizuka (Shimane Prefectural Institute of Public Health and Environmental Science), Reiko Okamoto-Nakagawa (Yamaguchi Prefectural Institute of Public Health and Environment), Yasutaka Yamashita (Ehime Prefecture Institute of Public Health and Environmental Science), Mitsuhiro Hamasaki (Fukuoka Institute of Health and Environmental Sciences), Mamoru Miyashiro and Keiko Kajiyama (Fukuoka City Institute for Hygiene and Environment), Katsuyuki Ando (Saga Prefectural Institute of Public Health and Pharmaceutical), Akiko Honda (Oita Prefectural Institute of Public Health and Environmental Science), Miho Miura (Miyazaki Prefectural Institute for Public Health and Environment) and Mutsuyo Gokuden (Kagoshima Prefectural Institute for Environmental Research and Public Health)
Researchers contributed to this study