2-D DIGE: Decyder v6.5 software analysis. Architecture de Decyder v6.5.
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2-D DIGE: Decyder v6.5 software analysis
Architecture de Decyder v6.5
Cy2Cy3 Cy5
StandardExtrait 2Extrait 1
co-analyse des données issus des 3 images
Transfert des découpes de spot sur les 3 images indépendantes
Co-détection des spots
Quantification précise: soustraction du bruit de fond
et quantification des spots
détection des spots sur l’image fusion
Un gel, 3 images
Standard interne et quantification des spots
extrait 2 (Cy5)extrait 1 (Cy3)
Gel 1
extrait 3 (Cy3) extrait 4 (Cy5)
Gel 2
Standard (Cy2)
Standard (Cy2)
sans standard interne:
mesure de l’abondance
dans chacune des images
avec standard interne
avec standard interne:
mesure de l’abondance par paire de gel pour une même aire
Internal standard and 2 samples per gel
Gel 1
Gel 2
Gel 3
Cy2Cy5
Standard
Standard
Cy2
Standard
Cy2
Cy3
extrait 1
extrait 3
extrait 5
Cy3
Cy3
extrait 2
Cy5
extrait 4
Cy5
extrait 6
Co-détection Intra-gel + Quantification Intra-gel
: Differential In-gel Analysis
Standard interne:matching inter-gel et normalisation de l’abondance des
spots
extrait 2 (Cy5)extrait 1 (Cy3)
Gel 1
extrait 3 (Cy3) extrait 4 (Cy5)
Gel 2
Standard (Cy2)
sans standard interne
avec standard interne
- Matching des spots
- Normalisation de l’abondance par rapport
à chaque spot du standard
Standard (Cy2)
Inter-gel matchingGel 1
Cy2Cy5
Standard
Cy3
extrait 1 extrait 2
Internal standard and 2 samples per gel
Gel 2
Standard
Cy2
extrait 3
Cy3 Cy5
extrait 4
Cy2
Standardextrait 5
Cy3 Cy5
extrait 6
: Biological Variation Analysis
Master
Gel 3
Protein difference ratios