1BU Médecine Déc. 2012

Recherche et veille documentaires

Séminaire du mercredi 16 janvier 2013

DES de Médecine Générale

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Vos contacts à la bibliothèque

• dominique.minquilan@u-psud.fr

• suzy.duport@u-psud.fr

• vincent.chekib@u-psud.fr

• Tél. accueil : 01 49 59 67 80

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Objectifs de la séance

Adopter une méthodologie de recherchedocumentaire

Interroger les principaux types d'outils documentaires

Localiser et accéder aux documents dont vous avez trouvé les références

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Plan• Comment accéder à l’ENT ?• Définir le sujet, rechercher les mots-clés

– Formulation de la question à partir de la question clinique– Définition et fonctionnement du MeSH – Utilisation du site du CISMEF pour retrouver le terme MeSH et le traduire en anglais :

recherche dans le portail terminologique du CiSMeF : http://pts.chu-rouen.fr/ pour trouver les mots-clés MeSH et leur traduction

– Interrogation en anglais• Trouver de l’information

– Les annuaires : CiSMeF, liste proposée par la BIUS– Les sites spécialisés : http://www.has.fr– Les moteurs de recherche spécialisés : Google scholar http://scholar.google.fr/ et Mednar

http://www.mednar.com– Les bases de données en français : BDSP http://www.bdsp.ehesp.fr/ et EM Premium

accessible sur le site de Paris-Sud– La base de données de référence PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

• PubMed• Accéder aux articles• Faire de la veille documentaire• Exercices

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Comment accéder à l’ENT à partir du portail de l’Université Paris-Sud

L’accès à l’Environnement Numérique de Travail se fait par authentification après activation de son compte informatique

Identifiant: prenom.nom

Mot de passe: celui de la messagerie u-psud.fr

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Méthodologie de la recherche documentaire

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Identifier le problème

Synthèse de la situation clinique

=> le problème à résoudre est-il un problème :

• diagnostique ?

• étiologique ?

• thérapeutique ?

• pronostique ?

• ou autre ?

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Formuler la question

La question sera différente en fonction du problème, mais il faudra toujours se demander :

De qui est-il question ? (Qui ?)

Que cherche-t-on à faire ? (Quoi ?)

Pourquoi faire ? (Pourquoi ?)

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"Que pensent les femmes de la réalisation du frottis cervico-vaginal

au cabinet de médecine générale ? »

Sujet de recherche :

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Contexte et justification du travail :

le cancer du col de l’utérus était le 2e cancer féminin dansle monde en 2008, il y a eu une diminution de l’incidence etde la mortalité en France entre 1980 et 2005 mais il existeUne disparité dans la réalisation du dépistage. Sur le plandémographique il existe une diminution des gynécologuesmédicaux (-19%). En 2015 il y aura 600 gynécologuesmédicaux pour 30 millions de femmes et 180 en 2020.

Actuellement les MG ne réalisent que 10% des frottis qui sont de bonne qualité. L’HAS en 2010 désire une implication croissante du MG.

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Hypothèse et question

Hypothèse : « les femmes pensent que le frottis est un acte de spécialiste.  »

Question : Pourquoi les femmes ne consultent-elles pas leur médecin généraliste pour la réalisation de leur frottis ?

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Objectif : identifier les freins et acteurs favorisant

Méthode :

étude prospective descriptive menée

chez toutes les patientes venant

consulter âgées de 18 à 65 ans sur une

durée de 6 mois, durant le stage chez le

praticien en niveau 1.

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Etape 1 : Définir le sujet et chercher les mots-clés pour la recherche suivante

• "Que pensent les femmes de la réalisation du frottis cervico-vaginal au cabinet de médecine générale ? 

Mots-clés français: • frottis cervico-vaginal• cancer du col de l’utérus• dépistage• prévention• gynécologue• femmes de 18 à 65 ans• médecin généraliste ou

médecin traitant• medecine générale• enquête

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Recherche dans le portail terminologique du CiSMeF :

http://pts.chu-rouen.fr/

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Rechercher dans le portail terminologique du CiSMeF

• Le CISMEF:http://pts.chu-rouen.fr/

outil inévitable pour rechercher des informations enmédecine.

On utilise le portailterminologique de santépour trouver des mots-clés MESH (MEdical Subject Headings) et leur

traduction.

Termes Mesh

Frottis vaginal Vaginal smears

Tumeurs du col de l'utérus Uterine cervical neoplasms

Détection précoce de cancer Early detection of cancer

Gynécologie Gynecology

Femmes Women

Médecins généralistes General practitioners

Médecine générale General practice

Prévention et contrôle Prevention & control

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Etape 2 Rechercher de la documentation : dans la base documentaire du CiSMeF

• Une recherche en anglais « Uterine cervical neoplams » dans toutes les listes et Index propose 3 résultats avec 100% de pertinence.

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Rechercher dans l’annuaire de la BIUS, bibliothèque inter universitaire de santé

Les annuaires de recherche, à la différence des moteurs de recherche qui recensent des pages, indexent des sites web.

Ils permettent de se constituer une liste de favoris.

Annuaire de sites spécialisés en santé

http://www2.biusante.parisdescartes.fr/signets/index.las?specif=div&acces=libre&med=oui&tri=alp&form=o

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Rechercher dans les sites spécialisées:Haute Autorité de Santé (HAS)

• La Haute autorité de Santé utile pour les recommandations et les rapports publics.

• Recherche à partir des mots-clés:

« dépistage cancer col de l’utérus ET médecin »

et Recommandations et guides

Possibilité d’affiner la recherche par thème:

• Dépistage, prévention• Cancer de l’appareil génital

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Rechercher dans les sites spécialisées:HAS

• Recommandations en Santé Publique: on retrouve dans les résultats de recherche un document relatif à des questions-réponses et un rapport plus général sur les pratiques de collaboration entre professionnels de santé en France et à l’étranger.

Tags permettant d’élargir notre recherche

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Rechercher dans les bases de données BDSP: articles de revues, ouvrages, rapports, travaux académiques…

• Base de données bibliographique alimentée par un réseau d’organismes français spécialisés en santé publique

• La BDSP dispose de son propre thésaurus

• L’interrogation se fait par mots-clés.

Rechercher avec les mots-clés «  dépistage cancer col utérus médecin généraliste »

Accès en ligne à un mémoire en fichier pdf

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Rechercher dans les bases de données BDSP: travaux académiques

• Recherche avec les mots clés : « femmes frottis enquête »

• Autre recherche possible avec

les mots-clés: « comportement santé et collecte d’information »

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Les moteurs de recherche spécialisés

Google Scholar : http://scholar.google.fr est un moteur spécialisé dans les travaux scientifiques provenant de sources telles que des éditeurs commerciaux, des sociétés savantes, des référentiels de prépublication, des universités et d’autres organisations de recherche. Il indexe des articles issus de revues avec évaluation par des pairs, des thèses, des livres, des résumés analytiques, rapports, des articles en prépublication, etc. La recherche s’effectue de la même façon que dans Google.

Mednar : http://www.mednar.com est un moteur de recherche spécialisé développé et alimenté par Deep Web technologies (compagnie privée américaine) ; il est spécialisé dans les travaux universitaires. Il indexe les notices de documents publiés dans Google Scholar, dans PubMed ou issus de revues spécialisées dans le domaine des sciences de la santé.

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Google scholar http://scholar.google.fr

• Recherche par mots clés en français ou en anglais

Prévention cancer col uterus médecin généraliste ou Prevention control Uterine cervical neoplasms

• les termes sont automatiquement associés avec AND

• Recherche par facettes pour affiner la recherche

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Google scholar http://scholar.google.fr

• Recherche par mots clés en français ou en anglais frottis enquête médecin généraliste ou Vaginal smears

data collection general practitioner*

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Mednar : http://www.mednar.com

• Recherche en anglais par mots clésVaginal smears general practitioners : 193 résultats

• Possibilité d’affiner les recherches avec la navigation à facettes à gauche de l’écran : sujets, auteurs, titres de publication, éditeurs…

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PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

• PubMed  est une base de données bibliographiques, multilingue et internationale dans tous les domaines des sciences de la vie et en particulier des sciences biomédicales. Elle indexe, avec son thesaurus hiérarchisé (MeSH), des articles de revues (environ 5000) de plus de 80 pays, mais plus de la moitié des revues sont américaines. Accès gratuit au moteur de recherche ; les articles peuvent être gratuits ou payants.

• On peut interroger Pubmed en passant – par la recherche simple en langage courant ou Mesh,

– par la recherche avancée (advanced search) en sélectionnant un index (le plus souvent : MeSH terms),

– par la recherche MeSH database (par mot-clés MeSH),

– par la fonction de recherche « single citation matcher » si on recherche

un titre précis d’article.

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PubMed Central

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

PubMed Central (2.6 millions de références en texte intégral) est une archive ouverte qui donne accès au texte intégral

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MyNCBI

MyNCBI est un espace personnalisé sur lequel l’usager peut :

• Enregistrer ses recherches et les relancer automatiquement.

• Faire de la veille documentaire

Il faut se créer un compte personnalisé

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PubMed : recherche simple

• Une recherche simple avec les termes Vaginal smears data collection General practitioners : 110 résultats

Trois types de notices d’articles• [PubMed - as supplied by publisher] :

articles envoyés à PubMed mais non encore indexés

• [PubMed - in process] : articles en cours d’indexation

• [PubMed - indexed for MEDLINE] : articles indexés

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Recherche avancée

Recherche avancée 1. Construction d’une

requête avec « Add to history » et recherche dans les index.

2. Combinaison des recherches

gynecologist* OR general practitioners AND vaginal smears : 198 réponses

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Recherche avancée

Une notice complète avec un accès vers le texte intégral sur une base de données payée par l’université Paris-Sud

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Recherche par MeSH

Recherche dans MeSH database

• Recherche par MeSH terms

• Construction de la requête

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Clinical queries

Recherche dans « Clinical queries » par mots-clés

Les catégories sont :

1. Therapy

2. Etiology

3. Diagnosis

4. Prognosis

5. Clinical prediction guides

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Astuces pour élargir une recherche dans PubMed

• Utiliser un descripteur avec explosion• Combiner plusieurs descripteurs avec

l’opérateur OR• Utiliser un terme générique• Passer de MeSH Major Topic à MeSH Terms• Eliminer un terme de la requête si plusieurs

termes sont combinés avec AND• Supprimer les qualificatifs

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Astuces pour restreindre une recherche dans PubMed

• Utiliser un descripteur avec un qualificatif• Utiliser un descripteur sans explosion• Utiliser un descripteur en tant que MeSH Major

Topic• Combiner plusieurs descripteurs avec les

opérateurs AND et NOT• Utiliser la navigation par facette• Utiliser un terme spécifique

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Retrouver des articles en texte intégral

• Le plus souvent, les résultats ne donnent pas accès directement et gratuitement au texte intégral de l’article. Dans ce cas, il faut retrouver l’article en interrogeant les bouquets de revues de l’université Paris-Sud à l’adresse suivante :http://www.u-psud.fr/fr/biblio/bases_de_donnees_22.html (Science direct, Wiley...) ou retrouver la revue en ligne en interrogeant le moteur de recherche AtoZ à l’adresse suivante http://atoz.ebsco.com/Titles/7245

• Highwire http://highwire.standford.edu (accès à 360 revues gratuites)

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Accéder aux articles en interrogeant les bouquets de revues payées

par l’Université Paris-Sud

A partir de A to Z, en effectuant une recherche avec des

mots-clés on obtient comme résultat un article

disponible au format pdf.

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Rechercher des références : Utiliser des encyclopédies EM Premium

L’Encyclopédie médico-chirurgicale permet l’accès à une quarantaine de revues en médecine en français

•l’Encyclopédie médico-chirurgicale est spécialisée en médecine accessible via la base de données EM PREMIUM•Recherche par groupe de mots par l’onglet « Titre, mots-clés, résumé » Exemple :Prévention, col, utérus

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Les catalogues de bibliothèques

• Pour rechercher des livres, des thèses, il faut consulter :

Le catalogue de Paris-Sud http://opac.u-psud.fr/lorutf8_pro

Le SUDOC, catalogue collectif des bibliothèques françaises http://www.sudoc.abes.fr

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Recherche de thèses dans le SUDOC

Recherche par titre Que pensent les femmes de la réalisation du frottis cervico-utérin en cabinet de médecine générale ?

Complément du titre : enquête qualitative auprès de 19 femmes de la région de

Franche-Comté

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La veille documentaire

1.Les Newsletters

2.Les Flux RSS

3.Les requêtes automatisées : par ex. dans MyNCBI ou dans google alert

4.Les sites comme Zotero qui gèrent les signets

5.Le microblogging (Twitter)

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Impact factor

Pour calculer le facteur d’impact d’une revue, il faut utiliser la base de données Journal of citations reports disponible sur le site de la bibliothèque de l’université de Paris Sud : http://www.u-psud.fr/fr/biblio/bases_de_donnees_22/sciences_techniques_medecine/isi_journal_citation_reports.ht

ml

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Exercice 1• Exercice 1• Observation

Me S. âgée de 63 ans vient vous consulter pour le 3e épisode de cystite de l’année.Elle suit scrupuleusement vos recommandations : boire beaucoup, ne pas rester constipée, soins d’hygiène intime, etc. et elle utilise régulièrement de la colpotrophine pour pallier localement la carence hormonale. Sa voisine lui a parlé de prendre de la canneberge.Prescrivez-vous de la canneberge ?

- Trouvez les mots utiles pour cette recherche et élaborez l’équation de recherche (mots clés combinés entre eux par les opérateurs booléens appropriés)

- Effectuez cette recherche notamment dans les moteurs de recherche Google, Google Scholar, Google books et Mednar (écran de recherche avancée), et dans l’annuaire de recherche Cismef (écran de recherche simple). Comparez les résultats.

- Conserver dans un fichier 1 référence de livre, 1 d’article et 1 de site Web

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Exercice 2

• Exercice 2Observation M. Z, 75 ans, se plaint de troubles mictionnels nocturnes (il se lève 4 à 5 fois par nuit). Il n’a aucun retentissement rénal (clairance à 70) et ne tient pas à se faire opérer. À l’échographie la prostate est légèrement augmentée de volume.Que préconisez-vous ?

• Trouvez les mots-clefs et les opérateurs booléens utiles pour cette recherche, puis effectuez la recherche notamment dans les bases de données EM-Premium (recherche avancée) et BDSP (recherche simple).

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Exercice 3• Exercice 3

M. X, 65 ans, a eu un infarctus du myocarde il y a 3 ans, il est diabétique depuis 20 ans traité par sulfamide.Son dernier bilan montre une glycémie à 1.30 g/l à jeûn et une hémoglobine glycosylée à 7.4%. Modifiez-vous son traitement ?

Question : Quelle valeur cible de l’hémoglobine glycosylée (HbA1c) faut-il atteindre chez un patient diabétique et insuffisant coronarien ?

• Trouvez les mots utiles pour cette recherche et traduisez-les en mots-clefs Mesh grâce à Cismef. Effectuez alors la recherche notamment dans PubMed en utilisant les opérateurs booléens appropriés.

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Exercice 4• Exercice 4

Il y a 10 jours, dans la soirée, Séverine, 19 ans, était seule dans la cuisine lorsque sa mère entendit un fracas de casseroles. Elle se précipita vers la cuisine pour y trouver Séverine inconsciente sur le sol dans une flaque d’urine, les bras et les jambes animés de mouvements saccadés qui cessèrent après quelques minutes, laissant sa fille somnolente et confuse.Séverine ne prend pas de médicaments de façon régulière et n’a aucun antécédent de maladie grave .Rien ne laisse supposer la responsabilité de l’alcool ou de substance illicites. Il s’agit du premier épisode de ce type.Examinée dans le service d’urgences, elle est autorisée à rentrer chez elle après avoir été rassurée quant à la totale normalité des examens cliniques , sanguins, électrocardiographiques et du scanner réalisé en urgence .Un rendez-vous est pris à la consultation de neurologie .Cette consultation a lieu huit jours plus tard , l’EEG et l’IRM pratiqués sont normaux et Séverine sort sans traitement.Séverine vient en consultation avec sa mère car elles vivent dans la crainte de la survenue d’une nouvelle crise convulsive d’autant plus qu’elle prend sa voiture très régulièrement.

• Trouvez les mots utiles pour cette recherche et traduisez-les en mots-clefs Mesh grâce à Cismef. Effectuez alors la recherche notamment dans PubMed en utilisant les opérateurs booléens appropriés.