1 Biological Oxidation 第九章 生物氧化 Biological Oxidation 第一节 生物能学简介...
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一、生物能的转换及生物系统中的能流
二、自由能的概念及化学反应中自由能的计算
三、高能化合物
第一节 生物能学简介
生物能学就是应用物理化学、生物物理学和量子物理学的原理和方法,来研究生物系统中能量的流动和传递规律的科学。
4
二、自由能的概念及化学反应中自由能的计算
自由能的变化能预示某一过程能否自发进行,即: ΔG<0 ,反应能自发进行 ΔG>0 ,反应不能自发进行 ΔG=0 ,反应处于平衡状态。
11 .. 自由能(自由能( free energyfree energy )的概念)的概念
自由能 (G) :指一个反应体系中能够做有用功的 那部分能量。
2. 化学反应自由能的计算
a. 利用化学反应平衡常数计算 基本公式: ΔG′=ΔG°′+ RTlnQc (Qc- 浓度商 )
ΔG°′= - RTlnKeq 例:计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化 b. 利用标准氧化还原电位( E° )计算(限于氧化还原反应)
基本公式: ΔG°′= - nFΔE°′ (ΔE°′=E+°′-E-°′)
例:计算 NADH 氧化反应的 ΔG°′
计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化
达平衡时 =Keq=19解:
ΔG°′= - RTlnKeq =-2.3038.314 311 log19 =-7.6 KJ / mol
ΔG′=ΔG°′+ RTlnQc (Qc- 浓度商 ) =-7.6+ 2.3038.314 311 log0.1 =-13.6 KJ / mol
未达平衡时 =Qc=0.1
反应 G-1-PG-6-P 在 380C 达到平衡时, G-1-P 占5% , G-6-P 占 95% ,求 G0 。如果反应未达到平衡,设 [G-1- P]=0.01mol.L , [G-6-P]=0.001mol.L,求反应的 G 是多少?
例题:
7
例题:计算下列反应式 ΔG°′
NADH + H+ + ½ O2====NAD+ + H2O
正极反应: 1/2 O2 + 2H+ + 2e H2O E+°′ 0.82
负极反应: NAD+ + H+ + 2e NADH E-°′ -0.3
ΔG°′-nFΔE°′ -2×96485×[0.82-(-0.32)]
-220 KJ·mol-1
8
三、高能化合物
1 、高能化合物的类型
2 、 ATP 的特点及其特殊作用
生化反应中,在水解时或基团转移反应中可释放出大量自由能( >21 千焦 / 摩尔或 5 千卡 / 摩尔)的化合物称为高能化合物。
1 、高能化合物的类型 根据高能化合物键的特性可以分成以下几种类型:
① 磷氧键型
a)a) 酰基磷酸化合物酰基磷酸化合物
CH3 C
O
O P
O
O-
O-
乙酰磷酸10.1 千卡 / 摩尔
C O
CH
O
CH2
OH
O P
O
O-
O-
P
OO-
O-
1 , 3- 二磷酸甘油酸
11.8 千卡 / 摩尔
12
② 氮磷键型
OP
O
O
NH
C NH
N CH3
CH2COOH
磷酸肌酸10.3 千卡 / 摩尔
OP
O
O
NH
C NH
N CH3
CH2CH2CH2CHCOOH
NH2
磷酸精氨酸7.7 千卡 / 摩尔
这两种高能化合物在生物体内起储存能量的作用 !
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2.ATP 的特点
在 pH=7 环境中, ATP 分子中的三个磷酸基团完全解离成带 4 个负电荷的离子形式( ATP4- ),具有较大势能,加之水解产物稳定,因而水解自由能很大( ΔG°′= -30.5 千焦 / 摩尔)。
腺嘌呤—核糖— O — P — O — P — O — P — O-
O O O
O- O- O-
+ ++
Mg2+
ATP 的特殊作用1. ATP 是细胞内的“能量通货”
2. ATP 是细胞内磷酸基团转移的中间载体
~ P~ P
~ P
~ P
ATP~ P
0
2
10
8
6
4
12
14
磷酸基团转移能
磷酸烯醇式丙酮酸
1 , 3- 二磷酸甘油
酸
磷酸肌酸 (磷酸基团储备物)
6- 磷酸葡萄糖
3- 磷酸甘油
第二节 生物氧化概述一、生物氧化的概念 物质在体内的氧化分解过程,主要是糖、脂、蛋白质等在体内分解时逐步释放能量、最终生成二氧化碳和水的过程。
糖
脂肪
蛋白质
CO2 和 H2O O2
能量
ADP+Pi
ATP
热能
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二、生物氧化特点二、生物氧化特点
1. 在活的细胞中( pH接近中性、体温条件下),有机物的氧化在一系列酶、辅酶和中间传递体参与下进行,其途径迂回曲折,有条不紊。2. 氧化过程中能量逐步释放,其中一部分由一些高能化合物(如 ATP )截获,再供给机体所需。在此过程中既不会因氧化过程中能量骤然释放而伤害机体,又能使释放的能量尽可得到有效的利用。
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生物氧化与体外氧化之相同点:
☆生物氧化中物质的氧化方式有加氧、脱氢、失电子,遵循氧化还原反应的一般规律。☆都服从热力学规律。☆物质在体内外氧化时所消耗的氧量、最终
产物( CO2 , H2O )和释放能量均相同。
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是在细胞内温和的环境中(体温, pH接近中性),在一系列酶促反应逐步进行,能量逐步释放有利于有利于机体捕获能量,提高 ATP 生成的效率。
进行广泛的加水脱氢反应使物质能间接获得氧,并增加脱氢的机会;脱下的氢与氧结合产生 H2O ,有机酸脱羧产生 CO2 。
生物氧化与体外氧化之不同点:生物氧化 体外氧化
反应是在强酸、强碱、高温、高压条件下进行的。
能量是突然释放的。
产生的 CO2 、 H2O 由物质中的碳和氢直接与氧结合生成。
CO2 的生成
方式方式:糖、脂、蛋白质等有机物转变成含羧基的中间化合物,然后在酶催化下脱羧而生成CO2 。
类型类型:α-脱羧和β-脱羧 氧化脱羧和单纯脱羧
CH3COSCoA+CO2CH3-C-COOH
O 丙酮酸脱氢酶系
NAD+ NADH+H+CoASH
例:+CO2H2N-CH-COOH
R氨基酸脱羧酶
CH2-NH2
R
H2O 的生成
代谢物在脱氢酶催化下脱下的氢由相应的氢载体( NAD+ 、 NADP+ 、 FAD 、 FMN 等)所接受,再通过一系列递氢体或递电子体传递给氧而生成 H2O 。
CH3CH2OH CH3CHO
NAD+ NADH+H+
乙醇脱氢酶例:
1\2 O2
NAD+
电子传递链
H2O
2e
O=
2H+
脂肪
葡萄糖、其它单糖
三羧酸循环电子传递
(氧化)
蛋白质
脂肪酸、甘油
多糖
氨基酸
乙酰 CoA
e-
磷酸化+Pi
小分子化合物分解成共同的中间产物(如丙酮酸、乙酰 CoA等)
共同中间物进入三羧酸循环 ,氧化脱下的氢由电子传递链传递生成 H2O ,释放出大量能量,其中一部分通过磷酸化储存在 ATP 中。
大分子降解成基本结构单位
生物氧化的三个阶段
H2O
( 1)代谢脱下的成对氢原子( 2H)通过多种酶和辅酶所 催化的氧化还原反应逐步从高能向低能传递,最终 与氧结合生成水,其中释放的能量被用于合成 ATP ;( 2)在真核生物细胞内,酶和辅酶按一定顺序排列在位 于线粒体内膜上;原核生物中,位于细胞膜上。 传递氢的酶和辅酶——递氢体 传递电子的酶和辅酶——递电子体( 3)此过程与细胞呼吸有关,此传递链称为呼吸链。 递氢体、递电子体都起传递电子的作用,又称电子 传递体。
二、电子传递链的概念
三、呼吸链的组成和顺序
复合体 酶名称
复合体Ⅰ
复合体Ⅱ
复合体Ⅲ
复合体Ⅳ
NADH-泛醌还原酶
琥珀酸-泛醌还原酶
泛醌-细胞色素C还原酶
细胞色素c氧化酶
辅基
FMN,Fe-S
FAD,Fe-S
铁卟啉,Fe-S
铁卟啉,Cu
多肽链数
39
4
10
13
复合体 酶名称
复合体Ⅰ
复合体Ⅱ
复合体Ⅲ
复合体Ⅳ
NADH-泛醌还原酶
琥珀酸-泛醌还原酶
泛醌-细胞色素C还原酶
细胞色素c氧化酶
辅基
FMN,Fe-S
FAD,Fe-S
铁卟啉,Fe-S
铁卟啉,Cu
多肽链数
39
4
10
13
1 .电子传递链中各中间体的顺序
NADH
FMN
CoQ
Fe-S
Cyt c1
O2
Cyt b
Cyt c
Cyt aa3
Fe-S
复合物 IV
复合物 I
复合物 III
NADH-Q NADH-Q 还原酶还原酶
细胞色素还原酶
细胞色素氧化酶
FADH2 Fe-S琥珀酸等
复合物 II琥珀酸 -Q 还原酶
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泛醌(辅酶 Q, CoQ, Q ) :带有聚异戊二烯侧链的苯醌,脂溶性,位于膜双脂层中,能在膜脂中自由泳动。它是电子传递链中唯一的非蛋白电子载体。
+2H
传递氢机理: CoQ CoQH2
- 2H功能:氢原子传递体
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复合体Ⅲ: CoQ - 细胞色素 C 还原酶
功能:将电子从 CoQ 传递给 Cytc
组成: Cytb 、 Fe-S 、 Cytc1
细胞色素 (Cyt) :含铁卟啉辅基的色蛋白,分 a 、 b 、 c 三类,每类中又分几种亚类。
细胞色素
Cyta辅基
N N
NN
H3C
CHHO
CH2 (CH2 CH C CH2)3 H
CH3
CH3
CH CH2
CH3
CH2
CH2
COOH
CH2
CH2
COOH
HC
OFe
Cytb辅基
N N
NN
H3C
CHCH2 CH3
CH CH2
CH3
CH2
CH2
COOH
CH2
CH2
COOH
Fe
H3C
功能:单电子传递体
Fe3++e
-eFe2+
Cytc辅基
蛋白质
N N
NN
H3C
CH CH3
CH
CH3
CH2
CH2
COOH
CH2
CH2
COOH
Fe
H3C
CH3
CH3
S
Cys
S
Cys
42
复合体Ⅳ:细胞色素氧化酶功能:将电子从 Cytc最终传递到 O2
组成: Cyta 、 Cyta3 、 Cu
2
12Fe3+
2Fe2+
2Fe2+
2Fe3+
2Cu2+
2Cu+
Cytc Cyta
2Fe2+
2Fe3+
Cyta3
H2O
ϸ °ûÉ«ËØÑõ»¯Ã¸
O2
总结
NADH
FMN
CoQ
Fe-S
Cyt c1
O2
Cyt b
Cyt c
Cyt aa3
Fe-S
复合物 IV
复合物 I
复合物 III
NADH-Q NADH-Q 还原酶还原酶
细胞色素还原酶
细胞色素氧化酶
FADH2 Fe-S琥珀酸等
复合物 II琥珀酸 -Q 还原酶
氧化还原对 Eº' (V)
NAD+/NADH+H+ -0.32
FMN/ FMNH2 -0.30
FAD/ FADH2 -0.06
Cyt b Fe3+/Fe2+ 0.04(或0.10)Q10/Q10H2 0.07
Cyt c1 Fe3+/ Fe2+ 0.22
Cyt c Fe3+/Fe2+ 0.25
Cyt a Fe3+ / Fe2+ 0.29
Cyt a3 Fe3+ / Fe2+ 0.55
1/2 O2/ H2O 0.82
呼吸链中各种氧化还原对的标准氧化还原电位
ee EEOO’’ (小) (小) EEOO’’ (大)(大)
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四、线粒体外 NADH 的氧化
胞浆中 NADH必须经一定转运机制进入线粒体,再经呼吸链进行氧化磷酸化。
酵解(细胞质)
氧化磷酸化 (线粒体)
转运机制主要有:1.α- 磷酸甘油穿梭系统 (主要存在于骨骼肌、神经细胞)主要存在于骨骼肌、神经细胞)2.苹果酸 -天冬氨酸穿梭系统 (主要存在于肝、心肌组织) (主要存在于肝、心肌组织)
NADH+H+
FADH2
NAD+
FAD
线粒体 内膜
线粒体 外膜
膜间隙 线粒体 基质
α- 磷酸甘油 脱氢酶
呼吸链
磷酸二羟丙酮 PiCH2O-
CH2OH
C=O
PiCH2O-
CH2OH
C=O
α- 磷酸甘油PiCH2O-
CH2OH
CHOH
PiCH2O-
CH2OH
CHOH
α- 磷酸甘油 脱氢酶
1. α- 磷酸甘油穿梭机制
细胞液
NADH +H+
NAD+
-OOC-CH2-C-COO-
O
-OOC-CH2-C-COO-
OH
H
NADH +H+
NAD+
谷氨酸 -天冬氨酸
转运体
苹果酸 -α-酮 戊二酸转运体
-OOC-CH2-C-COO-
OH
H
苹果酸
-OOC-CH2-C-COO-
O
草酰乙酸
-OOC-CH2-CH2-C-COO-
O
-OOC-CH2-CH2-C-COO-
O
α- 酮戊二酸
-OOC-CH
2-CH
2-C-COO
-
H3N
+
H谷氨酸
苹果酸 脱氢酶
谷草转 氨酶
胞液
线粒体内膜
基质
呼吸链
-OOC-CH
2-C-COO
-
H3N
+
H天冬氨酸
-OOC-CH
2-C-COO
-
H3N
+
H
-OOC-CH
2-CH
2-C-COO
-
H3N
+
H
2. 苹果酸 -天冬氨酸穿梭机制
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第四节 氧化磷酸化作用一、氧化磷酸化的概念一、氧化磷酸化的概念 呼吸链中电子的传递过程偶联呼吸链中电子的传递过程偶联 ADPADP 磷酸化,磷酸化,
生成生成 ATPATP 的方式,称为氧化磷酸化;是体内产生的方式,称为氧化磷酸化;是体内产生ATPATP 的主要方式。的主要方式。
线粒体离体实验测得的一些底物的P/O比值
底 物 呼吸链的组成 P/O比值 可能生成的 ATP数
β-羟丁酸 NAD+→复合体Ⅰ → CoQ→复合体Ⅲ 2.4~2.8 3
→ Cyt c→复合体Ⅳ→ O2
琥珀酸 复合体Ⅱ → CoQ→复合体Ⅲ 1.7 2
→ Cyt c→复合体Ⅳ→ O2
抗坏血酸 Cyt c→复合体Ⅳ→ O2 0.88 1
细胞色素c (Fe2+) 复合体Ⅳ→ O2 0.61-0.68 1
P/O比值: 物质氧化时,每消耗 1mol O2所消耗无机磷的 mol 数(或 ADP mol 数),或每消耗 1mol O2所生成的 ATP 的 mol 数。
电子传递链自由能变化
区段 电位变化(⊿ Eº′ )
自由能变化⊿ Gº′ =-nF⊿ Eº′
能否生成ATP(⊿ Gº′ 是否大于30.5KJ)
Cyt aa3~O2 0.53V 102.3KJ/mol 能
NAD+~CoQ 0.36V 69.5KJ/mol 能CoQ~Cyt c 0.21V 40.5KJ/mol 能
ATP ATP ATP
氧化磷酸化偶联部位
-
-
-
58
三、氧化磷酸化的偶联机理
1. 化学渗透假说 (chemiosmotic hypothesis)
电子经呼吸链传递时,可将质子( H+ )从线粒体内膜的基质侧泵到内膜胞浆侧,产生膜内外质子电化学梯度,储存能量。当质子顺浓度梯度回流时驱动 AD
P与 Pi 生成 ATP 。
化学渗透假说示意图
2H+
2H+
2H+
2H+
NADH+H+
2H+
2H+
2H+
ADP+Pi ATP
高质子浓度
H2O
2e-
+ + + + + + + + +
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _
质子流
线粒体内膜
磷酸化
氧化
ⅢⅠ Ⅱ Ⅳ F0
F1
Cyt c
Q
NADH+H+
NAD+
延胡索酸
琥珀酸
H+
1/2O2+2H+
H2O
ADP+Pi ATP
H+
H+
H+ 胞液侧
基质侧
+ + + + + + + + + +
- - - - - - - - -
化学渗透假说详细示意图
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3. 氧化磷酸化的解偶联作用
① 解偶联剂 增加线粒体内膜对质子的通透性。 如: 2 , 4— 二硝基苯酚( DNP ), FCCP
② 氧化磷酸化抑制剂 阻止质子从 F0质子通道回流。 如:寡霉素 ③ 离子载体抑制剂 增加线粒体内膜对一价阳离子的通透性。 如:缬氨霉素,短杆菌肽
2,4- 二硝基苯酚的解偶联作用
NO2
NO2
O-
NO2
NO2
OH
NO2
NO2
O-
NO2
NO2
OH
H+
H+
线粒体内膜
内外低 pH 高 pH
不能形成质子梯度,使氧化与磷酸化偶联过程脱离。抑制 ATP 的生成,不抑制电子传递,使电子传递产生的自由能都变为热能散失。
非线粒体氧化系统 通过线粒体细胞色素系统进行氧化的体系是一切动物、植物、微生物主要氧化途径,它与 ATP 的生成紧密相关。除此以外,生物体内还存在非线粒体氧化系统,其特点是从底物脱氢到 H2O 的生成是经过其它末端氧化酶完成的,与 ATP 的生成无关,但各自具有重要的生理功能。
生物体内主要的非线粒体氧化系统如下:1 、多酚氧化酶系统
2 、抗坏血酸氧化酶系统
3 、黄素蛋白氧化酶系统
4 、超氧化物歧化酶氧化系统
5 、植物抗氰氧化酶系统