Загрузка данных в системе R
-
Upload
sergey-mastitsky -
Category
Data & Analytics
-
view
452 -
download
10
description
Transcript of Загрузка данных в системе R
![Page 2: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/2.jpg)
3.1. Использование Excel для подготовки данных
![Page 3: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/3.jpg)
Microsoft Excel – одна из наиболее
распространенных программ для подготовки
данных для R
Перед загрузкой в R, Excel-файл обычно сохраняют как текстовый файл.txt or .csv
Имеется возможность работать и с др.
форматами (SPSS, SAS, Access, SQL, и др.) – см. пакет foreign
Author: Sergey Mastitsky
![Page 4: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/4.jpg)
Никаких пустых ячеек – отсутствующие значения обозначаются как NA
Присвойте имя каждой
переменной:
Никаких пробелов в именах
Имена не должны начинаться с точек или
чисел
Файл стоит поместить в текущую рабочую
папку
Author: Sergey Mastitsky
![Page 5: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/5.jpg)
Эксперимент по влиянию pH на рост
Dreissena polymorpha* 4 pH-группы: Control (вода из оз.
Онтарио), A (7.3), B (7.1), and C (6.9)
Три повтора на группу: Control1-
Control3, A1-A3, B1-B3, и C1-C3
Wikipedia Author: Sergey Mastitsky
* Claudi R, Graves A, Taraborelli AC, Prescott RJ, Mastitsky SE (2012)
Impact of pH on survival and settlement of dreissenid mussels. Aquatic
Invasions 7(1): 21-28
![Page 6: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/6.jpg)
3.2. Загрузка данных
Подробнее см.:
http://r-analytics.blogspot.de/2011/11/r_08.html
![Page 7: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/7.jpg)
Из командной строки: > setwd("~/Introductory R
Course/R_Course_Datasets")
Или в RStudio:
Session -> Set Working Directory -> Choose
Directory -> …
Author: Sergey Mastitsky
![Page 8: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/8.jpg)
Откройте файл pH_down_experiment.xls
Ознакомьтесь с данными
Сохраните как файл с разделителем в виде
табуляции
Откройте файл
в текстовом редакторе
и посмотрите, как
он выглядит
Author: Sergey Mastitsky
![Page 9: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/9.jpg)
"Рабочая лошадка" для загрузки данных
Основные аргументы: - file = "имя.txt": имя файла (или
URL-ссылка) - header = TRUE: есть ли в файле
заголовки столбцов - sep = "\t" или sep = "," :
разделитель значений в файле
Author: Sergey Mastitsky
![Page 10: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/10.jpg)
> LWdata <- read.table(
file = "pH_down_experiment.txt",
header = TRUE,
sep = "\t")
> names(LWdata)
> head(LWdata)
> LWdata
Author: Sergey Mastitsky
![Page 11: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/11.jpg)
Author: Sergey Mastitsky
![Page 12: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/12.jpg)
Author: Sergey Mastitsky
![Page 13: Загрузка данных в системе R](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042601/5481dc74b4af9f617d8b4688/html5/thumbnails/13.jpg)
> save.image(file =
"pH_experiment.rda")
Или в RStudio:
Environment -> Save Workspace As… pH_experiment.rda
Author: Sergey Mastitsky