Система управления данными в gLite
description
Transcript of Система управления данными в gLite
EGEE-II INFSO-RI-031688
Enabling Grids for E-sciencE
www.eu-egee.org
Система управления данными в gLite
Олешко С.Б.Петербургский институт ядерной физикиг.Гатчина
2
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Сервисы gLite
API
Access
Workload Mgmt Services
ComputingElement
WorkloadManagement
MetadataCatalog
Data Management
StorageElement
DataMovement
File & ReplicaCatalog
Authorization
Security Services
Authentication
Information &Monitoring
Information & Monitoring Services
Application
Monitoring
Connectivity
Accounting
Auditing
JobProvenance
PackageManager
CLI AvailablegLite
Implementation
ServiceDiscovery
3
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
• Задачи Системы Управления Данными (DMS)
• Storage Element (SE) и SRM
• File Catalogs и DM tools
• Перемещение данных (File Transfer Service)
• gLite I/O API
• JDL атрибуты для работы с данными
4
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Свойства и требования• Гетерогенность
– Данные хранятся на различных устройствах (диски, ленты), использующих различные методы доступа
• Распределенность– Данные хранятся на различных сайтах,
где отсутствует общая разделяемая файловая система
– Данные могут перемещаться между различными сайтами
• Различные административные домены– Данные хранятся там, куда обычный
доступ вам запрещен
– Необходим общий интерфейс к устройствам
Storage Resource Manager (SRM)
– Необходим способ определения местоположения файлов
File and Replica Catalogs
– Необходима управляемая, надежная передача файлов
File transfer and placement services
– Необходима общая модель безопасности
Реализация контроля доступа (ACL), основанного на применении Grid DNs
5
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Введение
• Предпосылки:– пользователи и программы являются источником и
потребителем данных– основным экземпляром данных принят файл (мы работаем с
файлами, а не с объектами или реляционными таблицами данные = файлы
• Файлы: – в основном записываются один раз, читаются многократно– размещены на Элементах Хранения - Storage Elements (SEs)– могут существовать несколько реплик одного файла на различных
сайтах– доступны для пользователей Грид “отовсюду”– местоположение м.б. определено WMS (data requirements в JDL)
• Также…– WMS может пересылать небольшой объём данных с заданием или
от выполненного задания: Input and Output Sandbox – файлы могут копироваться с локальной файловой системы (WNs,
UIs) в Грид (SEs), и наоборот
6
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Сервисы DMS
• Storage Element – общий интерфейс к ресурсам памяти
– Storage Resource Manager Castor, dCache, DPM, …– Native Access protocols rfio, dcap– Transfer protocols gsiftp
• I/O Servers – обеспечивает POSIX I/O для пользователя gLite-I/O• Catalogs – определение местоположения файлов
– File Catalog– Replica Catalog LCG File Catalog (LFC) – File Authorization Service– Metadata Catalog AMGA Metadata Catalog
• File Transfer – управляемая надёжная передача файлов
– Data Scheduler (в разработке)– File Transfer Service gLite FTS
(обеспечивает физическую передачу)
– File Placement Service gLite FPS (взаимодействие FTS и каталогов
способом транзакций)
7
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
• Задачи Системы Управления Данными (DMS)
• Storage Element (SE) и SRM
• File Catalogs и DM tools
• Перемещение данных (File Transfer Service)
• gLite I/O API
• JDL атрибуты для работы с данными
8
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Требования к gLite SE
• Storage Element - это сервис, который позволяет пользователю или приложению сохранять данные для будущего использование
• Управление локальными ресурсами памяти (диски) и интерфейс к Mass Storage Systems (ленты), таким как – HPSS, CASTOR, DiskeXtender (UNITREE), …
• Способность управлять различными системами хранения данных единым способом и прозрачно для пользователя (обеспечивается через SRM интерфейс)
• Поддержка основных протоколов передачи данных– GridFTP обязательно– Другие по возможности (https, ftp, etc…)
• Поддержка “привычного” протокола доступа для ввода/вывода удалённых файлов– POSIX (like) I/O client library for direct access of data (GFAL)
9
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Пример из жизни
Она запускает задачу, которой нужны:•данные реконструкции физического события•данные симуляции•некоторые файлы с данными анализа
Результаты также должны быть где-то сохранены
В CERNна dCache
В Fermilab на дисковом массиве
В Nikhefна classic SE
10
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Пример из жизни
dCacheСобственная система, свой протокол и параметры
CastorНет связи сdCache или classic SE
gLite DPMСистема, независимая ни от dCache ни от Castor
Как пользователь,
вы должны знать все эти
системы!!!SR
M
Я общаюсь с ними от вашего имениЯ буду выделять место для ваших файловИ я буду использовать протоколы передачи данных, чтобы пересылать ваши файлы туда
11
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Storage Resource Management
• Данные хранятся на disk pool servers или Mass Storage Systems
• Управление этими ресурсами должно обеспечивать:
– Прозрачный доступ к файлам (migration to/from disk pool)
– Выделение места для файлов (Space reservation)
– Получение информации о статусе файлов (File status notification)
– Управление временем жизни файлов (Life time management)
• SRM (Storage Resource Manager) сервис реализует все эти требования:
– SRM это Грид сервис, который реализует взаимодействие с локальными ресурсами хранения данных и обеспечивает Грид-интерфейс для внешнего мира
– SRM – это протокол управления ресурсами хранения данных, а не протокол доступа к файлам или протокол передачи файлов.
• SRM разработан, чтобы служить единым интерфейсом для управления дисковыми (или ленточными) ресурсами.
• В gLite взаимодействие с SRM обычно скрыто за сервисами более высокого уровня (DM tools и APIs)
12
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Поддерживаемые протоколы
Протоколы доступа к файлам в gLite SE 3.0:
Протокол Тип GSI Описание
GSIFTP(GridFTP) Передача файлов Да Аналог FTP
gsidcap (GSI dCache
Access Protocol)
Ввод/вывод Да Удалённый доступ
insecure RFIO (Remote
File Input/Output Protocol)
Ввод/вывод Нет Удалённый доступ
secured RFIO (gsirfio) Ввод/вывод Да Удалённый доступ
* Протокол file сейчас используется только для доступа к файлам на локальном компьютере (т.е. на UI или WN), но не к файлам на Грид SE
** GridFTP сейчас является обязательным для каждого из типов SE, поддерживаемых в gLite и основным для передачи файлов в Грид.
13
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Типы SE в gLite (I)
• Classic SE:–GridFTP сервер–Insecure RFIO daemon (rfiod) – ограниченный доступ для LAN–Только одно дисковое устройство или дисковый массив–Нет возможности управлять квотами (только partitioning)–Не поддерживает SRM интерфейс
• Mass Storage Systems–Комплексная иерархическая система хранения: front-end диски и back-end ленты–GridFTP для front-end (file transfere)–File access: insecure RFIO (CASTOR), gsidcap для dCache (front-end disk pool)–Поддерживает SRM интерфейс (пока только для Castor)
14
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Типы SE в gLite (II)
• Disk pool managers (dCache and gLite DPM)–Обеспечивает централизованное управление распределёнными серверами хранения данных–Физические диски и массивы объединены в общую (виртуальную) иерархическую файловую систему с единой точкой входа в SE–Диски могут быть динамически добавлены в пул–GridFTP сервер–Secure remote access protocols (gsidcap for dCache, gsirfio for DPM)–SRM интерфейс
15
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
gLite Storage Element
16
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
• Задачи Системы Управления Данными (DMS)
• Storage Element (SE) и SRM
• File Catalogs и DM tools
• Перемещение данных (File Transfer Service)
• gLite I/O API
• JDL атрибуты для работы с данными
17
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
File and Replica Catalog
Именование файлов
• Symbolic Link в пространстве логических имён (logical filename space)• Logical File Name (LFN) [lfn:<anything_you_want>]
– Имя, созданное пользователем для того чтобы ссылаться на некоторый элемент данных, напр. “lfn:cms/20030203/run2/track1”
• Globally Unique Identifier (GUID) [guid:<40_bytes_unique_string>]– Внутренний (машинный) идентификатор элемента данных, напр.
“guid:f81d4fae-7dec-11d0-a765-00a0c91e6bf6”
• Site URL (SURL) [<sfn | srm>://<SE_hostname>/<some_string>]
(or Physical File Name (PFN) or Site FN) – Физическое местоположение реплики элемента данных в системе хранения данных,
напр. “srm://pcrd24.cern.ch/flatfiles/cms/output10_1” (SRM) “sfn://lxshare0209.cern.ch/data/alice/ntuples.dat” (Classic SE)
• Transport URL (TURL) [<protocol>://<some_string>]– Временный указатель на реплику + протокол доступа: распознаётся SE, напр.
“rfio://lxshare0209.cern.ch//data/alice/ntuples.dat”
Symbolic Link 1
Symbolic Link n
GUID
Physical File SURL n
Physical File SURL 1
.
. ..
TURL 1
TURL n
.
.LFN
SRM
18
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Взаимодействие с SRM
Клиент SRM
Ресурс5
1
2
1. Клиент запрашивает SRM файл с указанным SURL (Site URL)2. SRM запрашивает ресурс, где находится файл3. Ресурс сообщает о доступности файла и его расположении4. SRM возвращает TURL (Transfer URL), т.е. место, откуда может быть получен файл5. Клиент взаимодействует с ресурсом, используя протокол, определённый в
TURL
3
4
19
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Каталоги (File and Replica Catalog)
• Главная цель - определить, где размещены файлы в Grid• File and Replica Catalog - это сервис, который реализует это и
поддерживает соответствие между LFNs, GUIDs и SURLs.• В gLite поддерживаются 2 типа каталогов:
– Replica Location Server (RLS) - старый Local Replica Catalog (LRC) Replica Metadata Catalog (RMC)
– LCG File Catalog (LFC) – по умолчанию
• Тип используемого пользователем каталога определяется переменной окружения LCG_CATALOG_TYPE: edg для RLS, lfc для LFC
• Оба каталога между собой несовместимы!!! Однако есть средства миграции из RLS в LFC
• Файл данных только тогда может считаться Грид-файлом, когда он физически присутствует на каком-либо SE и зарегистрирован в каталоге
20
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Свойства LFC
• Поддержка курсоров для больших запросов
• Таймауты и повтор запросов от пользователя
• Транзакции с использованием API
• Иерархическое пространство имён
• Единый каталог, где LFN – основной ключ
• Интегрированная GSI авторизация и аутентификация
• Поддержка ACL• Интеграция с VOMS• Поддержка системных
метаданных (размер файла, дата создания,…) + поле для пользовательских метаданных
• База данных: Oracle или MySQL
gLite
UI
File Catalog
SE
SE
SE
21
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Взаимосвязи в LFC
GUID
Xxxxxx-xxxx-xxx-xxx-
System Metadata
“size” => 10234“cksum_type” => “MD5”“cksum” => “yy-yy-yy”
Symlink
/grid/dteam/mydir/mylink
Replica
srm://host.example.com/foo/barhost.example.com
Replica
srm://host.example.com/foo/barhost.example.com
Replica
srm://host.example.com/foo/barhost.example.com
Replica
srm://host.example.com/foo/barhost.example.com
Symlink
/grid/dteam/mydir/mylink
Symlink
/grid/dteam/mydir/mylink
LFN
/grid/dteam/dir1/dir2/file1.root
User metadata
User defined string
22
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Структура LFC
• Все члены данной ВО имеют права чтения/записи в соответствующую директорию
• Если соответствующей директории нет, то это означает, что данный LFC сервер не поддерживает эту ВО
• Команды работы с LFC похожи на соответствующие команды в UNIX (с префиксом lfc-)
• Переменная окружения $LFC_HOST должна содержать имя LFC сервера
Defined by the userLFC Namespace
LFC имеет иерархическую структуру
/grid/<VO_name>/ <you create it>
23
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Команды LFC
lfc-chmod Изменить права доступа к файлу/директории LFC
lfc-chown Изменить владельца и группу для файла/директории LFC
lfc-delcomment Удалить комментарии, связанные с файлом/директорией
lfc-getacl Показать ACL для файла/директории
lfc-ln Создать символическую ссылку на файл/директорию
lfc-ls Вывести список файлов в директории
lfc-mkdir Создать директорию
lfc-rename Переименовать файл/директорию
lfc-rm Удалить файл/директорию
lfc-setacl Установить/изменить ACL для файла/директории
lfc-setcomment Добавить/заменить комментарий
24
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Средства работы с данными
• LCG Data Management tools (обычно называемые lcg-utils) позволяют копировать файлы между UI, CE, WN и SE, регистрировать в File Catalogs и реплицировать данные между SEs.
• Поскольку lcg-utils используют ИС, то должна быть правильно установлена переменная окружения LCG_GFAL_INFOSYS, которая указывает на BDII сервер
• Почти все команды требуют обязательного параметра (если не установлена переменная LCG_GFAL_VO)
--vo <vo_name>
25
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
lcg-utils
lcg-cp Копировать файл из Грид на локальный компьютер (UI)
lcg-cr Копировать файл на SE и зарегистрировать его в каталоге
lcg-del Удалить один файл (или реплику, или все реплики)
lcg-rep Репликация между SE и регистрация реплики
lcg-gt Получить TURL для данных SURL и протокола передачи
lcg-sd Установить статус “Done” для данного SURL в SRM запросе
File Catalog Interaction
lcg-aa Добавить синоним в LFC для данного GUID
lcg-ra Удалить синоним в LFC для данного GUID
lcg-rf Зарегистрировать в LFC файл, размещённый на SE
lcg-uf Удалить регистрацию в LFC файла, размещённого на SE
lcg-la Список всех синонимов для данного SURL, GUID или LFN
lcg-lg Получить GUID для данного LFN или SURL
lcg-lr Список всех реплик для данного GUID, SURL или LFN
Replica Management
26
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
• Задачи Системы Управления Данными (DMS)
• Storage Element (SE) и SRM
• File Catalogs и DM tools
• Перемещение данных (File Transfer Service)
• gLite I/O API
• JDL атрибуты для работы с данными
27
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Базовые понятия FTS
• Задание (Job) – состоит из множества файлов, которые должны быть переданы от источника к получателю (могут иметь дополнительные параметры для GridFTP) + информация о user proxy
• Файл (File) – ссылка на пару физических имён источник/получатель в формате SURL или GridFTP (для globus-url-copy)
• Статус файла (File State)– состояние процесса передачи отдельного файла
• Статус задания (Job State) – общее состояние процесса передачи, как функция всех статусов файлов, составляющих задание
• Канал (Channel) – однонаправленное соединение между двумя сайтами для передачи файлов. Различают 2 типа каналов:– production (dedicated network pipe) – обычно между Tier-0, Tier-1 и
основными Tier-2 центрами– nonproduction (open network) – не обеспечивают production QoS
28
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Job states
•Submitted – задание послано FTS, но ему ещё не назначен канал•Pending – канал назначен и файлы задания ожидают передачи•Active – идёт передача некоторых файлов задания•Canceling – задание назначено на аварийное завершение•Done – все файлы задания переданы успешно•Failed – передача некоторых файлов задания завершилась неудачно•Canceled – задание снято•Hold – требуется вмешательство, т.к. состояние некоторых файлов не может быть разрешено автоматически (напр.: много повторов передачи)
29
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Основы GridFTP
• Протокол доступа и передачи данных для безопасного и эффективного перемещения данных
• Стандартизован Global Grid Forum• Расширяет стандартный FTP протокол
– поддержка Grid Security Infrastructure (GSI) на базе технологии “шифрования открытым ключом” или Kerberos
- управление передачей данных для внешних программ (third-party control of data transfer)
- параллельная передача данных- чередование передачи данных (striped data transfer) - частичная передача данных (partial file transfer)- автоматическое согласование размера буфера/окна TCP- поддержка надёжной и возобновляемой (reliable and restartable)
передачи данных- встроенные средства для мониторинга выполнения процесса
передачи
30
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
GridFTP - реализация
• GridFTP – это основа большинства систем передачи файлов• Функция повторения операции ограничена
– Повтор только в случае проблем с сетью; нет возможности восстановления передачи в случае отказа сервера GridFTP
• GridFTP управляет одновременно только одной передачей– Нет возможности оптимизации групповой передачи– Нет возможности диспетчеризации параллельных передач
• Необходима служба верхнего над GridFTP уровня, которая обеспечит надёжную диспетчеризируемую передачу файлов– FTS/FPS– Globus RFT (layer on top of single gridftp server)– Condor Stork
31
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Передача данных (непосредственный контроль)
• Хотя транспортный протокол может быть надёжным, информация о статусе находится у клиента – это неудобно и ненадёжно (уязвимо)
• Клиент может знать только состояние отдельного задания, не имея представления об общем состоянии передачи данных между SEs.– SE может переполниться запросами на репликацию
– Может быть несколько репликаций одних и тех же данных одновременно
– Отдельный сайт очень слабо может управлять балансом (оптимизацией) сетевых ресурсов
Client
Source Storage Element
Destination Storage Element
Control Channels
Data Flow Channel
32
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Передача данных (сервис передачи)
• Использование сервиса для передачи данных
– клиент соединяется с сервисом, выдавая запрос на передачу
– сервис контролирует состояние передачи
– клиент периодически возобновляет соединение, получает информацию о статусе или отменяет задание
– сервис имеет информацию об общей картине, а не только об отдельном задании
балансировка загрузки диспетчеризация заданий
Transfer
Service
Source Storage Element
Destination Storage Element
Control
Data Flow
Client
•Submit new request•Monitor progress•Cancel request
SOAP via https
33
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Архитектура gLite FTS/FPS
• File Transfer/Placement Service (FTS,FPS)– База данных заданий на передачу файлов
(Job DB)– Предоставляет Transfer Web Service
интерфейс для клиента (submit, cancel, status)– Имеет Web Interface– Mодифицирует Catalog если необходимо
• Transfer Agent– Основные действия
Получает задания из Transfer Job Database Управляет передачей через множество каналов Moниторирует статус и модифицирует Transfer
Job Database
• Transfer Service (glite-url-copy)– Фактически выполняет передачу: SRM – SRM,
gsiftp – SRM, gsiftp – gsiftp – Moниторирование
Job DB
FTS/FPSWebService
Transfer Agent
Actions
Channel Channelglite-url-copy
glite-url-copy
glite-url-copy
glite-url-copy
glite-url-copy
glite-url-copy
Web Monitor
34
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Передача данных в gLite FTS (итоги)
• Передача файлов асинхронная• Понятие канала, как однонаправленного соединения между
сайтами• Задание может включать передачу нескольких файлов, но все
они должны использовать один и тот же канал• Пользователь может запрашивать состояние задания через
JobID• За передачу физических файлов отвечает FTS,
регистрацией/поиском в каталогах занимается FPS (File Placement Service)
• ВО, использующие канал для передачи файлов, могут вводить свои собственные правила для диспетчеризации заданий (напр. задания профессора более приоритетные, чем задания студента)
35
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Команды gLite FTS
Для пользователя• glite-transfer-submit - Запуск нового задания на передачу данных.
Возвращается JobID.• glite-transfer-cancel - Аварийно завершить задание• glite-transfer-list - Получить список всех заданий с указанным
статусом• glite-transfer-status - Получить статус данного заданияДля администратора• glite-transfer-channel-add - Создать новый канал передачи• glite-transfer-channel-drop - Удалить канал передачи• glite-transfer-channel-list - Получить список всех доступных
каналов• glite-transfer-channel-set - Изменить параметры канала• glite-transfer-channel-signal - Изменить статус задания(всех
заданий для данного канала). Используется для разрешения ситуации со статусом “Hold”
36
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
• Задачи Системы Управления Данными (DMS)
• Storage Element (SE) и SRM
• File Catalogs и DM tools
• Перемещение данных (File Transfer Service)
• gLite I/O API
• JDL атрибуты для работы с данными
37
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Свойства GFAL API
• GFAL (Grid File Access Library) – это API, имеющий POSIX интерфейс для операций с файлами, расположенными на SE
• Позволяет удалённую работу с файлами (особенно полезно, если нужен доступ к части очень большого файла)
• Библиотеки на C и могут быть включены в программы на C/C++
• Есть Java API • SE должен поддерживать протокол secure rfio (поэтому для
classic SEs использовать нельзя)• Скрывает взаимодействие с SRM для пользователя
38
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Data Management API
39
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
GFAL: переменные окружения
• Для некоторых функций GFAL необходимо взаимодействие с каталогом, а он ВО-зависим, поэтому должны быть установлены следующие переменные окружения:– LCG_GFAL_VO– LCG_GFAL_INFOSYS– LCG_CATALOG_TYPE– LFC_HOST
• Кроме того:– LCG_RFIO_TYPE– LD_LIBRARY_PATH
40
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
GFAL: доступные API
• C API– Файл заголовков gfal_api.h.– Вызов функции – добавление префикса gfal_ к POSIX имени
функции (open(), read()…), например gfal_open, gfal_read,...– Список аргументов и возвращаемые значения – идентичны
POSIX.– Переменная errno устанавливается в соответствии с Posix
Error Codes в случае ошибки.
• Java API (C API Wrapper)– Поддерживает три основных Java Objects, которые должны
быть импортированы в Java-программу. GFalFile : обработка и чтение/запись в файлы GFalDirectory : обработка и управление директориями
(создание, удаление, список) GFalUtilities : управление файлами (переименование, удаление,
свойства)
41
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
GFAL: функции I/O API (1)
int gfal_access (const char *path, int amode);
int gfal_chmod (const char *path, mode_t mode);
int gfal_close (int fd);
int gfal_creat (const char *filename, mode_t mode);
off_t gfal_lseek (int fd, off_t offset, int whence);
int gfal_open (const char * filename, int flags, mode_t mode);
ssize_t gfal_read (int fd, void *buf, size_t size);
int gfal_rename (const char *old_name, const char *new_name);
ssize_t gfal_setfilchg (int, const void *, size_t);
int gfal_stat (const char *filename, struct stat *statbuf);
int gfal_unlink (const char *filename);
ssize_t gfal_write (int fd, const void *buf, size_t size);
42
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
GFAL: функции I/O API (2)
int gfal_closedir (DIR *dirp);
int gfal_mkdir (const char *dirname, mode_t mode);
DIR *gfal_opendir (const char *dirname);
struct dirent *gfal_readdir (DIR *dirp);
int gfal_rmdir (const char *dirname);
43
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Пример выполнения gfal_open
44
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Ссылки
• Examples in gLite3 User Guide (Appendix F)– https://edms.cern.ch/file/722398//gLite-3-UserGuide.pdf
• GFAL C API Description:– http://grid-deployment.web.cern.ch
/grid-deployment/documentation/LFC_DPM/gfal/html/
• GFAL JAVA API– https://grid.ct.infn.it/twiki/bin/view/GILDA/APIGFAL
• GFAL Java API code and libraries:– https://grid.ct.infn.it/twiki/pub/GILDA/APIGFAL/GFAL_Java_API.zip
• On-line JavaDoc of Java API:– https://grid.ct.infn.it/twiki/GFAL/
• GFAL Excercises (C/Java):– https://grid.ct.infn.it/twiki/bin/view/GILDA/UsingGFAL
45
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
• Задачи Системы Управления Данными (DMS)
• Storage Element (SE) и SRM
• File Catalogs и DM tools
• Перемещение данных (File Transfer Service)
• gLite I/O API
• JDL атрибуты для работы с данными
46
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
Sandboxes
•InputSandbox – файл (список файлов) на локальном диске UI, которые будут переданы через узел WMS на WN при запуске задания. Все имена файлов должны быть различны (даже если они в разных директориях).
•OutputSandbox – файл (список файлов), которые в результате выполнения задания создаются на узле WMS и могут быть переданы на UI при помощи команды glite-job-output (edg-job-get-output).
Эти файлы не могут быть на SE, т.е. нельзя использовать LFN(Logical File Name). Существует ограничение на размеры файлов для Sandboxes, т.е. файлы должны быть небольшого размера
(ориентировочно < 100Mb).
47
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
InputData(deprecated)
• InputData – строка (список строк), представляющие в одном из допустимых форматов (LFN, GUID, ..) имена входных файлов. Они используются WMS только для получения PFN (Physical File Name), по которым затем WMS на этапе matchmaking сможет определить CE, имеющий максимальное количество физических файлов (реплик) на ближайшем SE (CloseSE). В зависимости от префикса имени файла будет выбираться тип каталога для определения PFN (RLS, StorageIndex, DLI). По умолчанию для lfn: и guid: используется RLS.
• StorageIndex – URL сервиса gLite Storage Index. Если указан, то для определения PFN файлов с lfn: и guid будет использоваться этот каталог.
• DataCatalog - URL сервиса LCG Data Location Interface. Если указан, то для определения PFN файлов с lfn: и guid будет использоваться этот каталог.
48
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
InputData (пример)
InputData = {
"lfn:/mydata/file1",
"lfn:/mydata/file2",
"guid:135b7b23-4a6a-11d7-87e7-9d101f8c8b70"
};
// Do not need to specify this attribute if you want to use the VO
// default StorageIndex catalog
StorageIndex =
"http://lxb1434.cern.ch:8080/EGEE/glite-data-/FiremanCatalog";
49
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
DataRequirements
DataRequirements - более гибкая форма задания атрибутов для требований на входные файлы. Состоит из групп, в каждой из которых могут быть указаны 3 атрибута:
• InputData - строка (список строк), представляющие в одном из допустимых форматов (LFN, GUID, ..) имена входных файлов.
• DataCatalogType – тип каталога, который будет использоваться для данной группы
RLS - LCG Replica Location Service SI – gLite Storage Index DLI - LCG Data Location Interface
• DataCatalog - URL сервиса каталога (может определятся, если он отличается от каталога по умолчанию для ВО)
50
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
DataRequirements (пример)
DataRequirements = { [ DataCatalogType = "DLI"; DataCatalog = "https://cms.org:8877/dli"; InputData = {"lfn:/my/test.data1", "guid:44rr44rr77hh77kkaa3”}; ], [ DataCatalogType = "SI"; DataCatalog = "https://glite.org:9443/StorageIndex"; InputData = {"lfn:/eo/test.file", "guid:ddffrg5451"}; ],
[ DataCatalogType = "RLS"; DataCatalog = "https://eu-datagrid.org/RLS"; InputData = {"lfn:/atlas/test.file", "guid:ggrgrg5656"}; ],
[ DataCatalogType = "RLS"; InputData = {"lfn:/myvo/test.file","guid:adbdefgilm1234"}; ], .... };
51
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
DataAccessProtocol
Если определён атрибут InputData либо DataRequirements, то должен быть указан атрибут DataAccessProtocol, который определяет список имён протоколов, которые приложение может использовать для доступа к файлам.
DataAccessProtocol = {
“file”,
“gridftp”
};
52
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
OutputSE
• OutputSE – представляет URL того SE, где пользователь хочет сохранять выходные файлы. Используется RB для определения CE, “ближайшего”(close) к данному SE.
Следует использовать осторожно, т.к. разные брокеры по-разному интерпретируют присутствие этого атрибута. Например LCG RB аварийно завершает задачу, если нет CE, определённого, как “ближайший” для OutputSE.
53
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
OutputData
• Пока не реализовано в gLite 3.0• Позволяет пользователю автоматически пересылать на SE и
регистрировать в каталоге выходные файлы задания.• Для каждого файла могут быть определены 3 атрибута:
• OutputFile (обязательный) – имя выходного файла• StorageElement (необязательный) – SE, где должен быть сохранён
файл• LogicalFileName (необязательный) – LFN, под который должен быть
зарегестрирован файл в каталоге
54
Enabling Grids for E-sciencE
EGEE-II INFSO-RI-031688
OutputData (пример)
OutputData = {
[
OutputFile = "dataset_1.out ";
LogicalFileName = "lfn:/test/result1";
],
[
OutputFile = "dataset_2.out ";
StorageElement = "se001.cnaf.infn.it";
],
]
OutputFile = "cms/dataset_3.out";
StorageElement = "se012.to.infn.it";
LogicalFileName = "lfn:/cms/outfile1";
],
[
OutputFile = "dataset_4.out ";
]
};