Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский...

18
Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии (RCAM) Роботизированный криобанк микроорганизмов – уникальная возможность для долгосрочного авторизованного хранения коммерческих Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии Санкт-Петербург

description

Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии ( RCAM). Роботизированный криобанк микроорганизмов – уникальная возможность для долгосрочного авторизованного хранения коммерческих. Сафронова В.И., Тихонович И.А. - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский...

Page 1: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии (RCAM)

Роботизированный криобанк микроорганизмов – уникальная возможность для долгосрочного

авторизованного хранения коммерческих

Сафронова В.И., Тихонович И.А.

ГНУ Всероссийский научно-исследовательскийинститут сельскохозяйственной микробиологии

Россельхозакадемии Санкт-Петербург

Page 2: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Преимущества метода криоконсервации микроорганизмов

• Сохранение жизнеспособности культур микроорганизмов в течение десятилетий без единого пересева

• Обеспечение генетической стабильности (сохранение всех свойств культур, в т.ч. практически-ценных)

• Возможность проведения генетической паспортизации штаммов

в целях защиты авторских прав

Метод рекомендован для использования в БРЦ микроорганизмов

Page 3: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Недостатки использования сосудов Дьюара и морозильных камер

• низкая оперативность• высокая вероятность

ошибок• флуктуации

температуры в камере

• возможность несанкционированного отбора коммерческих штаммов

Page 4: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Преимущества:

•Стабильная температура хранения (−80°C), исключение флуктуаций температуры в камере;

•Организация авторизованного доступа к штаммам;

•Минимизация ошибок оперирования;

•Защитные противоаварийные системы.

•Вместимость (200 000 образцов);

Роботизированная система хранения - принципиально новый подход к проблеме надежного поддержания биологических

образцов (культур микроорганизмов, ДНК, белков)

Page 5: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский
Page 6: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Уникальные 2D-баркоды на дне пробирок позволяют локализовать образцы в хранилище и отследить все их перемещения.

С помощью робота TubePicker единичные образцы отбираются без выгрузки (размораживания) целого штатива.

Page 7: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Система паролей при различных уровнях доступа

размещение,

выдача,

контроль ж/c

открытый

доступ

ограниченный доступ

закрытый

доступ

A

B1

B2

A A+C1

A+C2

A+C3

А - пароль руководителя коллекции

В1, В2 … - пароли сотрудников коллекции

С1, С2, С3 … - пароли депозиторов

Page 8: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский
Page 9: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский
Page 10: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Рефрижератор

основной

Генератор LN2

ИБП

10 КВт

Рефрижератор

резервный

Генератор переменного тока

Основные средства Резервные средства

Хранилище

Электрическая сеть

LN2 back up

система

Средства обеспечения стабильной температуры в хранилище

Page 11: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

ГНУ Всероссийский институт защиты растений

ГНУ ГосНИИ хлебопекарной промышленности

ГНУ ВНИИ пищевых ароматизаторов, кислот и красителей

ГНУ ВНИИ мясной промышленности

ГНУ ВНИИ пищевой биотехнологии

ГНУ ВНИИ кормов

ГНУ Дальневосточный зональный научно-исследовательский ветеринарный институт

ГНУ ВНИИ ветеринарной санитарии, гигиены и экологии

ГНУ Якутский научно-исследовательский институт сельского хозяйства

Институты Россельхозакадемии – участники RCAM

Page 12: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Полезные свойства микроорганизмов сельскохозяйственного назначения:

•Антифунгальная активность

•Энтомоцидные свойства

•Биодеградация

•Ростстимулирующий эффект

•Антистрессовая активность

•Продукция пищевых компонентов

•Консервирующие свойства

Page 13: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Международные научные связи RCAM

Университет г. Ланкастер --------------(Великобритания)

Научный центр г. Сассари -------------- (Италия)

Университет г. Ватерлоо ---------------- (Канада)

Университет г. Вагенинген --------------(Голландия)

Университет г. Хельсинки --------------- (Финляндия)

Ассоциативные бактерии, утилизирующие АБК

Микросимбионты засухоустойчивых бобовых

Ассоциативные бактерии с АЦК деаминазой

Бактерии с антифунгальной активностью

Клубеньковые бактерии малоизученных видов бобовых культур

Page 14: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Система BioLog для идентификации микроорганизмов с помощью

мультисубстратного тестирования:

Page 15: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Паспортизация коммерческих штаммов микроорганизмов с помощью геномного анализа

Page 16: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

• Метод пульс-электрофореза (PFGE) - фракционирование высокомолекулярных ДНК от 10 тпн до 10 млн пн с помощью электрофореза в агарозном геле в условиях периодически меняющегося по направлению электрического поля.

• Секвенирование обширных участков генома микроорганизмов (или целых геномов) с помощью

системы Junior GS (Roche) для

высокопроизводительного

пиросеквенирования.

Методы, перспективные для молекулярно-генетической паспортизации коммерческих

штаммов микроорганизмов

Page 17: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

Резюме

• Ведомственная коллекция Россельхозакадемии обладает обширным фондом микроорганизмов для использования в растениеводстве, земледелии, ветеринарии, пищевой промышленности.

• Коллекция обеспечивает долгосрочное хранение микроорганизмов без потери их ценных свойств.

• Коллекция гарантирует авторизованный доступ к практически-ценным штаммам, а также проводит их паспортизацию с целью защиты авторских прав.

Page 18: Сафронова В.И., Тихонович И.А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский

СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ