Post on 08-Feb-2016
description
TECHNOLOGIE INFORMATYCZNE
Tydzień 8Przetwarzanie tekstów – część III
Edycja wzorów chemicznych
Przygotował: dr inż. Piotr Rutkowski
Zawartość lekcji
• Isis Draw – edycja wzorów chemicznych
• Ćwiczenia
Programy do edycji wzorów chemicznych
•http://www.mdli.com•MDL Information Systems Inc.•Isis Draw 2.5 (lub wcześniejsze wersje)
•http://www.acdlabs.com•Advanced Chemistry Development•ChemSketch 10 (lub wcześniejsze wersje)
Programy do edycji wzorów chemicznych
Zalety:• darmowy dostęp w
pakiecie edukacyjnym;• intuicyjny interfejs;• kompatybilność z
płatnymi dodatkami, np. bazami danych o związkach chemicznych
Wady:• ograniczona baza
gotowych wzorów;• ograniczone
możliwości nazewnictwa;
• ograniczone możliwości wizualizacji.
Isis/Draw 2.5
Wstawianie wzorów chemicznych do Worda
1. Z poziomu programu Word:• Zaznaczyć miejsce osadzenia obiektu,• Wstaw→Obiekt... (utwórz nowy → typ obiektu → Isis/Draw Sketch
→ OK) – uruchamia się program Isis Draw,• Narysować wzór chemiczny,• Korzystając z opcji „Update Microsoft Office Word” lub „Exit &
Return to Microsoft Office Word” wkleić obiekt do Worda.
2. Z poziomu programu Isis Draw:• Uruchomić program Isis Draw (ikona )• Narysować wzór chemiczny,• Zaznaczyć obiekt i go skopiować • Przejść do pliku tekstowego w programie Microsoft Word,• Wkleić obiekt w odpowiednie miejsce
Wstawianie wzorów chemicznych do Worda
Okno programu
Menu tekstowePasek narzędziSzablony wzorów (Templates)Chem InspectorMenu tytułowe
Isis/Draw – podstawy rysowania wzorówEtapy rysowania:
1. Narysować podstawową strukturę korzystając z „Templates”;
2. Dorysować grupy funkcyjne i pozamieniać węgle na odpowiednie pierwiastki (standardowo wszystkie rysowane wiązania są pomiędzy atomami węgla);
3. Jeśli konieczne dokonać edycji atomów, wiązań lub całej struktury;
4. (opcja) Skorzystać z „Chem Inspector” do sprawdzenia poprawności struktury lub reakcji;
5. (opcja) Zaznaczyć cząsteczkę i korzystając z polecenia: „Object>Clean Molecule…” ujednolicić długości wiązań i kąty między nimi.
Isis/Draw – rysowanie struktur
pasek narzędzi: „Templates”
1. kliknąć na wybrany wzór (zamiast pojawia się znak ) ;2. obiekt wstawić do dokumentu w wybranym miejscu;3. kliknąć na pionowym pasku narzędzi ikonę „lasso select” ;
Isis/Draw – rysowanie struktur
strony „Templates”
Isis/Draw
rysowanie wiązań i łańcuchów
myszą rozwinąć menu wiązania
Isis/Draw
rysowanie wiązań i łańcuchów
Isis/Draw
rysowanie wiązań i łańcuchów
Isis/Draw
rysowanie wiązań i łańcuchów
Isis/Draw
rysowanie wiązań i łańcuchów: łączenie wiązania z pierścieniem lub łańcuchem
Isis/Draw
rysowanie wiązań i łańcuchów: łączenie wiązania z pierścieniem lub łańcuchem
Isis/Draw
rysowanie atomów
Isis/Draw
Edycja atomów, wiązań i struktur: klikając prawym przyciskiem myszy atom, wiązanie i całą strukturę uaktywnić menu kontekstowe i wybrać opcję „Edit”. Zmodyfikować poszczególne elementy cząsteczki.
Isis/Draw
wyświetlanie atomów węgla i wodoru
Isis/Draw
Wyrównywanie zniekształconej struktury
Isis/Draw – zadanie 1
Narysować poniższe reakcje w programie Isis/Draw, wkleić do MS Word i zapisać
CH3
C C
CH3
CH3
CH3
CH2
C CH
CH3
CH3
CH3
CH3
C CH
CH3
OH
CH3CH3+
85% H3PO4
80 °C
C O
R
CR' ONu
R
CR' ONu
HR
R'
Nu:-
H-Nu:Nu-+
Isis/Draw – zadanie 2
Narysować poniższe wzory w programie Isis/Draw, wkleić do MS Word i zapisać
N
H
NH
HH
HO