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MDD-6106 Méthodologie de la recherche en sciences dentaires
Par la bibliothécaire-conseil
Marie-Claude Laferrière M.S.I.
15 septembre 2017
Recherche dans les bases de données PubMed et Embase
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Plan de la présentation
Site web de la Bibliothèque
Recherche dans les bases de données PubMedet Embase (Vocabulaire libre et contrôlé)
Apprendre à faire une recherche structurée à l’aide d’un plan de concept
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• Services
» Bibliométrie et impact de la recherche
» Bureau du Droit d’auteur
» CorpusUL – Dépôt institutionnel de l'Université Laval
» Logiciels de gestion de références bibliographiques (EndNote et Zotero)
• Collections et ressources
» Catalogue Ariane
» Films, disques, etc. (Médiathèque)
» Ressources électroniques
» Explorer par discipline : Médecine dentaire
La Bibliothèque : services et collections
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• Vous trouverez les ressources propres à votre discipline telle que:
» les bases de données spécialisées pour retrouver des articles en médecine dentaire;
» les ensembles de livres électroniques en sciences de la santé;
» les dictionnaires et encyclopédies en médecine dentaire;
» les nouveautés à la bibliothèque;
» et plus !
Explorer par discipline : Médecine dentaire
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Accès à distance aux ressources électroniques
IDUL
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Modalités et conditions d'accès
• Une fois la session activée, vous pouvez consulter toutes les ressources électroniques désirées.
• Vous devrez donc vous déconnecter à la fin de votre session de travail en cliquant sur dans le coin gauche du navigateur.
• La session expire à la fermeture du navigateur Web ou après 60 minutes d'inactivité.
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Recherche dans les bases de
données PubMed et Embase
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Interroger une base de données
La recherche à l’intérieur des bases de données bibliographiques se fait à l’aide de deux méthodes de recherche différentes qui se complètent:
Vocabulaire libre (mots-clés)
Vocabulaire contrôlé
(thésaurus ou sujet)
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Vocabulaire libre (mots-clés)
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La recherche en vocabulaire libre (mots-clés)
Généralités
Le vocabulaire libre est la méthode de recherche la plus utilisée.
Utilisation de ses propres mots, afin de repérer des documents sur le sujet d’intérêt.
Le choix et l’orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche.
Les champs à privilégier dans la recherche:• PubMed: [Title/Abstract] • Embase: ti,ab
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Recherche en vocabulaire libre (mots-clés)
Vos termes de recherche
Les termes utilisés par l’auteur
OlysioLes articles qui parlent d’Olysio
directement
Pas nécessairement ceux qui parlent de Simeprevir
ou de Galexos
?
Exemple : Je m'intéresse aux traitements de l’hépatite C chronique chez l’adulte
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Outils pour trouver du vocabulaire
• HeTOP - Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)• Traduit le MeSH de Medline
• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)
• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)
Dictionnaires gratuits en ligne
• Notes de cours, manuels, articles scientifiques et vous!
Autres sources
Disponibles : Explorer par discipline > Médecine dentaire > Atlas, dictionnaires et encyclopédies Dictionnaire et ressources sélectionnés > Sélection de dictionnaires et autres ressources > Dictionnaires, grammaires et encyclopédies en ligne
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Exercice – HeTOP
Utilisez le HeTOP - Portail Terminologique de Santé du CISMeF.
Trouvez cinq synonymes anglophones pour la maladie Diabète de type 1.
Autoimmune diabetes
Brittle diabetes mellitus
Insulin dependent diabetes mellitus
Juvenile-onset diabetes / Juvenile onset diabetes
Sudden-onset diabetes mellitus
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Exemple - PubMed
1. Traduction
Consultation d’HeTOP
Obésité > Obesity
2. Synonymes et variantes orthographiques
Body weight, body weights, body-weight, body fat distribution, fat tissue distribution, overweight, over weight, over eat, over eating, obesities, obese, visceral obesity, morbidobesity, morbid obesities, abdominal obesity, body fat, waist, body fat, fat load, body mass index, quetelet index, BMI, etc.
Je cherche des articles qui portent sur l’obésité
Astuce: utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chacun des concepts afin de maximiser le repérage.
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Outils - Les symboles
Troncature : placée à la fin d’un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme.
Child* permet de repêcher child, children, childhood.
Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d’apparition.
"Mouth protector" ou "Mouth guard" permet de repêcher ces mots tels qu’ils apparaissent dans le texte.
Pour gagner du temps et de la précision
$ * ? | +
""*
Voir le tableau Astuces et syntaxe – Bases de données en sciences de la santé
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Exercices - Recherche simple
Combien trouvez-vous d’articles sur le
diabète insulino-dépendant (Type 1)?
diabetes type 1 = 68 203
Insulin-Dependent Diabetes = 90 882
"type 1 diabetes" = 29 495
diabetes mellitus type 1 = 68 283
Combien trouvez-vous d’articles de
l’auteur Kevin J. Donly?
Donly, Kevin J[Author] = 55
Donly, Kevin[Author] = 63
Donly KJ[Author] = 127
Donly KJ[Author] OR Donly, Kevin J[Author] OR Donly, Kevin[Author] = 135
Utilisez la recherche simple. Utilisez la recherche Advanced.
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Vocabulaire
contrôlé (thésaurus ou sujet)
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Méthode de recherche faite à partir de termes normalisés
Le langage propre utilisé par une base de données pour décrire le contenu des articles scientifiques qu’elle indexe.
Pour utiliser cette méthode, on doit d’abord valider notre terme dans le dictionnaire de la base de données, appelé « thésaurus ».
Le champ à privilégier dans les bases de données est:
PubMed > MeSH (Medical Subject Headings)
ex: "Diabetes Mellitus, Type 1"[Mesh]Embase > Emtreeex: 'insulin dependent diabetes mellitus'/de
Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)
Généralités
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Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)
Avantage: supprime l'ambiguïté du langage naturel (synonymes / variantes orthographiques)
Permet de regrouper et de repérer tous les documents sur un sujet donné.
DiabetesMellitus, Type 1
Insulin-Dependent
Diabetes
AutoimmuneDiabetes
Juvenile-Onset
Diabetes
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Thésaurus
• Listes de termes normalisés:
» Utilisés uniquement dans un domaine particulier.
» Classés par ordre sémantique et hiérarchique.
• Plusieurs termes sont attribués à chaque référence.
Ils permettent de décrire de la manière la plus
spécifique possible le contenu de l’article.
Par conséquent, les articles sont indexés uniformément, peu importe le vocabulaire utilisé
par l’auteur.
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Thésaurus en santé
La plupart des bases de données disciplinaires en santé publient un thésaurus et souvent celui-ci est intégré au logiciel de la base.
PubMed
MeSH
(Medical SubjectHeadings)
Embase
Emtree
CINAHL
Descripteurs Cinahl
Cochrane
MeSH
(même que PubMed)
PsyINFO
Thesaurus
(sous l’onglet « Term Finder »)
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Recherche MeSH - PubMed
Je cherche des articles sur la prévention de la carie dentaire.
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Définition du MeSH
Subdivisions
Transformation du MeSH en concept majeur [MAJR]
Empêcher l’explosion automatique du MeSH
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Concepts plus larges Concepts spécifiques
> Recherchés automatiquement dans PubMed. Pour l'empêcher, sélectionner Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.
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Vous sélectionnez les options voulues et cliquez sur Add to search builder. Puis sur SearchPubMed pour lancer la recherche.
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Exercice – MeSH | subdivisions
Combien trouvez-vous d’articles sur les complications du bruxisme du sommeil?
"Sleep Bruxism/ complications"[Mesh] = 96
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Pour raffiner rapidement les résultats de recherche (Langue, âge, date de publication,
journal en dentisterie, etc.)
Les filtres sont des termes du vocabulaire contrôlé (MeSH).
Attention! Show = affichage et non-sélection.
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Exercice – MeSH | Filtre et concept majeur
Vous vous intéressez à la cervicalgie. Combien de résultats obtenez-vous en sélectionnant le concept majeur? Combien
d’entre eux sont des revues systématiques?
"Neck Pain"[Majr] = 3 680Filters : Systematic Reviews = 283
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Pour combiner des recherches, vous pouvez utiliser l’historique de recherche qui se trouve dans Advanced.
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Combiner deux MeSH
Vous pouvez également utiliser les opérateurs booléens du Builder dans le MeSH Database pour combiner uniquement des MeSH.
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Exercice – MeSH | combiner deux recherches
Combien trouvez-vous d’articles sur les soins dentaires dansles foyers pour personnes âgées?
"Dental Care for Aged"[Mesh] AND "Homes for the Aged"[Mesh] = 141
("Dental Care"[Mesh]) AND "Homes for the Aged"[Mesh] = 185
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Recherche Emtree - Embase
Je cherche des articles sur la prévention de la carie dentaire.
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Les termes plus spécifiques sont recherchés automatiquement dans Embase. Pour l'empêcher, désélectionner Explode.
Explosion du Emtree
Transformation du Emtreeen concept majeur /mj Remarquez la hiérarchie
de Dental cariesd’Emtree est différente de celle du MeSH.
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Définition du Emtree
Synonymes du Emtree
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Dans Embase, il y a uniquement des subdivisions pour la recherche sur les maladies (Diseases Search), les médicaments (Drugs Search) et les équipements (Devices Search). > Si sur le bouton bleu, il est inscrit Take this query to Advanced Search, c’est qu’il n’y a pas de subdivisions disponibles.
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Pour raffiner rapidement les résultats de recherche (Langue, âge, date de publication, etc.)
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Pour combiner des recherches, vous devez utiliser l’historique de recherche qui se trouve dans le haut de la page de résultats.
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Exercice – Emtree
Combien trouvez-vous d’articles sur les
complications du bruxisme du sommeil?
'bruxism'/exp/dm_co
= 650
Vous vous intéressez à la cervicalgie. Combien de
résultats obtenez-vous en sélectionnant le concept majeur? Combien d’entre
eux sont des revues littérature?
'neck pain'/mj = 4 114
AND 'review‘/it = 399
Combien trouvez-vous d’articles sur les soins
dentaires dans les foyers pour personnes âgées?
'home for the aged'/de AND 'dental
procedure'/exp
= 247
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Obtenir le texte de l’article
• Le bouton permet de vérifier si un document est disponible à l’Université Laval.
» Ce dernier est visible avec le Format: Abstract ou si vous cliquez sur le titre de la notice.
» Directement sur la page de résultats.
• Si la Bibliothèque n’est pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si l’article est disponible gratuitement sur le Web.
• Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$.
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Gestion des résultats
• Send to (sur la page de résultats) permet plusieurs options:
» File : enregistrer les notices sélectionnées» E-mail : envoyer les notices par courriel» Clipboard : permets de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu’à 500
notices (effacées après 8 heures d’inactivité).
Les options sont aussi disponibles dans le Clipboard.
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Création d’un compte dans les bases de données
• Sauvegarder des stratégies de recherche.
• Obtenir des alertes par courriel.
• Personnaliser l’interface de PubMed (pas Embase).
• Nécessité de s’inscrire.
Vous permet de :
Créez votre compte My NCBI
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Apprendre à faire une recherche structurée à l’aide d’un plan de concept
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Élaboration d’une stratégie de recherche
Formuler son sujet de recherche
Identifier les principaux concepts
Trouver le vocabulaire approprié
Formuler des équations de
recherche (opérateurs booléens)
Analyser et évaluer les
résultats de la recherche
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1. Formuler son sujet de recherche
PICO
• Patient (population): Adultes
• Intervention : Soie dentaire
• Comparateur : aucun
• Outcomes : Prévention ou diminution des maladies parodontales
Cerner et délimiter son sujet en l’exprimant sous la forme d’un énoncé ou d’un PICO.
Est-ce que l’utilisation de la soie dentaire prévientles maladies parodontales chez l’adulte?
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2. Identifier les principaux concepts
Peu importe la base de données, une recherche efficace requiert un choix pertinent des concepts.
Concept 1
• Soie dentaire
Concept 2
• Maladies parodontales
Est-ce que l’utilisation de la soie dentaire prévient
les maladies parodontales chez l’adulte?
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3. Trouver le vocabulaire approprié | outils
Vocabulaire libre Vocabulaire contrôlé
Dictionnaires• HeTOP - Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)
• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)
• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)
Autres documentations
• Notes de cours
• Manuels
• Articles scientifiques
Et vous!
La plupart des bases de données disciplinaires en santé publient un thésaurus et souvent celui-ci est intégré au logiciel de la base.
• MeSH (Medline et Cochrane)• Emtree (Embase)• Descripteurs CINAHL • Thésaurus (PsycINFO et Eric)• etc.
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3. Trouver le vocabulaire approprié | analyse d’articles
Résumé
Titre
Sujets de la base de données (MeSH,
Emtree, Descripteurs CINAHL)
Recherche
vocabulaire libre
Recherche
vocabulaire contrôlé
Combinaison des deux
recherches
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3. Trouver le vocabulaire approprié
Concept 1Soie dentaire
Vocabulaire libre (mots-clés) Vocabulaire contrôlé
Dental flossDental tape*Clean* interdental / inter-dentalClean* interproximal / inter-proximal
MeSH:"Dental Devices, Home Care"[Mesh]
Emtree: 'dental floss'/de
Vocabulaire libre et contrôlé
Concept 2Maladies
parodontales
Vocabulaire libre (mots-clés) Vocabulaire contrôlé
Periodontal Disease*Gingivi*Gingival pocket*Periodontal pocket*Gum(Gums) inflammationGum(Gums) bleed* (blood)
MeSH: "Periodontal Diseases"[Mesh]
Emtree: 'periodontal disease'/exp
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4. Formuler des équations de recherche en utilisant
les opérateurs booléensPour lier les différents concepts ou les différents champs
AND (ET)
Limite la recherche à
l’intersection des concepts
OR (OU)Unit les différents concepts
NOT(SAUF)
Exclut un ou plusieurs concepts
non souhaités
Précise la recherche, mais
ATTENTION
Soie
dentaireMaladies
parodontales
Gum Gingiva
Adultes Enfants
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4. Formuler des équations de recherche en
utilisant les opérateurs booléens
ET/AND
Concept 1 Équation de recherche en vocabulaire libre (mots-clés)
Équation de recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus)
OU / OR
Concept 2Équation de recherche en vocabulaire libre (mots-clés)
Équation de recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus)
OU / OR
Zones de recherche
Title Abstract Keyword (de l’auteur)
Zone de recherche
Sujet
(spécifique à une base de données)
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Équations de recherche dans EmbaseÀ partir de votre plan de concept, vous pouvez formuler plusieurs équations simples de recherche, puis vous les combinez à l’aide de l’historique de recherche.
Combinaison des
deux concepts
9. 4 AND 10 = 691 résultats
1. (floss* OR 'dental tape*'):ab,ti = 1 331 résultats
2. (clean* NEAR/4 (interdental OR 'inter dental' OR interproximal OR 'inter proximal')):ab,ti= 209 résultats
3. 'dental floss'/de = 4158résultats
Concept 1Soie dentaire
4. 1 OR 2 OR 3 = 5 495 résultats
5. periodont*:ab,ti = 64 645 résultats
6. gingiv*:ab,ti = 44 792 résultats
7. ((gum OR gums) AND (blood* OR bleed* OR inflamm*)):ti,ab = 2 922 résultats
8. ((blood OR bleed*) NEAR/4 prob*):ab,ti = 14 086 résultats
9. 'periodontal disease'/exp = 93 572 résultats
Concept 2Maladies parodontales
10. 5 OR 6 OR 7 OR 8 OR 9 = 141 233 résultats
BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVALBIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 61
Les stratégies de recherche sont dans la section « Appendices » des Cochrane Reviews.
Référence
Sambunjak D, Nickerson JW, Poklepovic T, Johnson TM, Imai P, Tugwell P, Worthington HV. Flossing for the management of periodontal diseases and dental caries in adults. Cochrane Database of Systematic Reviews 2011, Issue 12. Art. No.: CD008829. DOI: 10.1002/14651858.CD008829.pub2.
Exemple de stratégie dans Cochrane Library
BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVALBIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 62
5. Évaluer les résultats de la recherche
Vous obtenez trop de résultats
• Limitation de la recherche par date de publication, par langue, par type de documents, etc.
• Ajout de termes spécifiques en utilisation l’opérateur booléen AND (et).
Vous obtenez trop peu de résultats
• Augmentation de la portée de la recherche en utilisant des termes plus généraux.
• Ajout de mots-clés (synonymes) en utilisant l’opérateur booléen OR (ou).
BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVALBIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 63
Pour plus d’information!
• PubMed
» Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm
» Guide d’utilisation :
• PubMed : http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline.pdf
• MeSH : http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh.pdf
» PubMed help – http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start
• Plan de concept
» Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Plan_concepts_Nursing/Plan_concepts_Nursing.htm
» PDF: http://www4.bibl.ulaval.ca/cgi-bin/Diapason/plan_concepts.pl
• Astuces et syntaxe – Bases de données en santé http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/astuces_synthaxe_bd_sante.pdf
• Comment trouver des documents pertinents à partir d’une publication parfaite sur mon sujethttp://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/foresterie/images/comment-trouver.jpg
BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVALBIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 64
Marie-Claude LaferrièreConseillère à la documentationBibliothèque scientifiqueBureau 1018-C418 656-2131, poste 7948marie-claude.laferriere@bibl.ulaval.ca
> Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité.
Service de clavardage
Offert aux heures d'ouverture du service d'aide à la recherche(Techniciennes en documentation)en documentation)
Obtenir de l’aide