Post on 10-Jul-2015
UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MATO GROSSO
CAMPUS UNIVERSITÁRIO DE CÁCERES “JANE VANINI”
BIOLOGIA MOLECULAR
Marcadores Moleculares
Discente: Taniele Oliveira
Marcadores Moleculares de
Expressão
Surgiram recentemente com o advento dabiologia molecular;
Nível alto de polimorfismo para cada locoestudado;
Neutros em relação a efeitos fenotípicos;
Em geral, são co-dominantes, contendo maiorquantidade de informação genética por loco;
Podem ser usados para caracterizar o genótipode um indivíduo a partir de amostras de célulasou de tecidos e, em qualquer estádio dedesenvolvimento da planta.
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP SNP - Single Nucleotide Polymorphism ou
Polimorfismos de Nucleotídeos Únicos
Polimorfismo baseados na alteração de uma
única base no genoma.
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP Tipos mais comuns de
SNPs:
Transição: base púrica é
substituída por outra
púrica A-T, G-C.
Transversão: púrica
substituída por pirimídica
ou vice-versa : A-C, G-T,
A-C e C-T.
SNP: variação >1%
Mutação: variação <1%
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP Vantagens:
Abundância no genoma
Elevado grau de polimorfismo
Detecção de diferentes alelos para genes de
interesse
Desvantagem:
Sequenciamento de DNA em grande escala.
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP Aplicações:
Construção de mapas genéticos
Mapeamento de características de interesse
Análise de populações
Identificação de cultivares
Utilização:
Identificação e validação de marcadores
moleculares INDEL e SNP lipoxigenases de
sementes de soja.
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ESTP ESTP - Expressed sequence tag polymorphism
ou Sequencia expressa de polimorfismo.
Sequência de DNA para genes expressos.
Desenvolvimento de marcadores baseados na
sequência de genes.
Teste em diferentes genótipos.
Utilização:
Caracterização de cultivares de videira através de
ESTP.
(Sítios específicos em videiras)
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ASP ASP – Allele Specific Polymorphism ou Alelo
Polimorfismo Específico
Trabalha-se com a sequência do gene
Identificação de plantas variantes alélicos de um
gene
Eventos de Inserção / Deleção / Substituição de
base na região transcrita de um gene
Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ASP Desenvolvimento:
Identificação e sequenciamento dos variantes
alélicos do gene de interesse
Desenho de um par de primers
Anelamento – local de inserção / deleção /
substituição
Aplicação:
Analise filogenética e mapeamento genético.