Post on 16-Jan-2015
description
O Jardim Botânico do Rio de Janeiro como provedor de informações de qualidade sobre a biodiversidade
vegetal brasileira
Eduardo DalcinInstituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro
Diretoria de PesquisasNúcleo de Computação Científica e Geoprocessamento
Brasília- Maio de 2012
Tópicos da Apresentação• O Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro• Diretoria de Pesquisa• Escola Nacional de Botânica Tropical• Rodriguésia• Coleções Científicas• Centro Nacional para Conservação da Flora (CNCFlora)• Lista de Espécies da Flora do Brasil• Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento• Sistemas de Informação sobbre Biodiversidade• Projeto REFLORA• Desenvolvimento de Sistemas• Infraestrutura computacional• O JBRJ e o SiB-Br
O Instituto de Pesquisas Jardim Botânico
• Criado em 1808 (204 anos de existência)• Autarquia do Ministério do Meio Ambiente (2001)• “...Promover, realizar e divulgar o ensino e as pesquisas
técnico-científicas sobre os recursos florísticos do Brasil, visando o conhecimento e a conservação da biodiversidade, bem como manter as coleções científicas sob sua responsabilidade, competindo-lhe, em especial, com as diretrizes das políticas nacionais de meio ambiente fixadas pelo Ministério do Meio Ambiente.”
Diretoria de Pesquisa• 52 Pesquisadores (51 Doutores)• Indicadores 2010
– 290 projetos de pesquisa• 17 Institucionais
– 334 artigos em periódicos– 104 capítulos de livros– 15 livros
Diretoria de Pesquisas do JBRJ Produção de Artigos 2005-2009
0
20
40
60
80
100
2005 2006 2007 2008 2009
Total deArtigos
Artigos noISI Web ofScience
• Rede Laboratorial– Botânica Estrutural– Sementes– Micologia– Cultivo de Algas – Biologia Molecular
• Credenciada junto a ANP
Diretoria de Pesquisa
Escola Nacional de Botânica Tropical
• Criada em 2001• Programa de Pós-graduação strictu sensu
reconhecido pelo MEC/CAPES• Programa de Pós-graduação lato sensu• 21 Docentes• 2003 – 2011
– 79 dissertações de mestrado– 25 teses de doutorado
• Áreas de concentração– Diversidade Vegetal– Ecologia de Ecossistemas Neotropicais
• Mestrado Profissional aprovado pela CAPES (2011)– Biodiversidade em Unidades de Conservação
http://www.jbrj.gov.br/enbt/
Artigos 2006 2007 2008 2009 2010
Recebidos 61 93 97 158 192
Publicados 37 55 60 62 77
Recusados 12 41 37 34 49
Espécies novas 4 5 11 9 56
Português 31 45 51 53 52
Inglês 5 8 8 9 21
Espanhol 1 2 1 --- 7
tempo (meses) 20 12 10 9 6
RodriguésiaCriada em 1935, a Revista publica, trimestralmente, artigos científicos originais, de revisão, de opinião e notas científicas em diversas áreas da Biologia Vegetal (taxonomia, sistemática e evolução, fisiologia, fitoquímica, ultraestrutura, citologia, anatomia, palinologia, desenvolvimento, genética, biologia reprodutiva, ecologia, etnobotânica e filogeografia), bem como em História da Botânica e atividades ligadas a Jardins Botânicos.http://rodriguesia.jbrj.gov.br/
Coleções Científicas
• 550.000 amostras no Herbário– 6.000 typus– 20.000 fotos
• 7.000 amostras na Carpoteca• 8.200 amostras na Xiloteca• 30.000 amostras no Laminário• 5.298 amostras no
• Criado em 2008• Objetivos Gerais
– Coordenar a Lista de Espécies da Flora do Brasil– Coordenar a Lista Oficial de Espécies da Flora
Ameaçadas de Extinção– Elaborar Programa de Pesquisas e Conservação
em Ecossistemas de Montanhas do Brasil– Contribuir para o alcance das metas nacionais da
GSPC/CDB
Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento
• (Re)Criado em Abril de 2010• Atribuições:
– Realizar a administração de dados científicos da Diretoria de Pesquisas do JBRJ – DIPEQ;
– Coordenar o desenvolvimento de uma estrutura de suporte à modelagem computacional aplicada à biodiversidade;
– Desenvolver e implementar as atividades relacionadas com a mineração de dados;
– Desenvolver e implementar a prestação de serviços de geoprocessamento como apoio à pesquisa científica;
– Propor ao Diretor de Pesquisas programas de capacitação permanente nas áreas de bancos de dados para a biodiversidade, geoprocessamento, modelagem computacional, análise, visualização, mineração e qualidade de dados, além de supervisionar a execução de tais programas;
– Propor ao Diretor da DIPEQ a realização de acordos e parcerias com outras instituições, objetivando o desenvolvimento de projetos relacionados com as atividades do núcleo e o atendimento das demandas da DIPEQ nesta área.
Sistemas de Informação sobre Biodiversidade no JBRJ
JABOT
• 2003• Coleções
Científicas
Lista da Flora do Brasil
• 2009• Desenvolvido e
hospedado pelo CRIA
Espécies Ameaçadas(CNCFlora)
• 2010• Catálogo de
Metadados• Avaliação de Risco
de Extinção• Avaliação de Status
de Conservação
JABOT
Lista de Espécie da Flora do Brasil
Sistema CNCFlora
Catálogo de
Metadados
Referência Bibliográficas
Contatos(especialistas)
Taxon
Locais
Expedições
Recursos deInformação
Endereços Web
Conhecimento Sistematizado
Lista de Spp. Ameaçadas
Apresentações
Documentos
Dados Estruturados
Eventos
Vídeos
Imagens
Software
Lista doBrasil Planos de
Ação
PortfólioDe Espécies
Sistema de Espécies
Ameaçadas
JABOT(Coleções
Científicas)
Lista de Espécies da
Flora do Brasil
Sistema do CNCFlora
Situação Atual
Novo cenário institucional - 2011
• Lista oficial de espécies da flora brasileira (2008/2009)– MMA/PROBIO II
• Lista oficial das espécies ameaçadas da extinção da flora brasileira (2008/2009)– MMA/PROBIO II
• Lista da flora do Rio de Janeiro (2010)– FAPERJ
• Herbário Virtual “autenticado” das plantas repatriadas (K e P) – Projeto REFLORA - 2011– CNPq– NATURA– FAPERJ
Muséum National d’Histoire NaturelleParis
Royal Botanic Gardens , KewLondres
Jardim Botânico do Rio de Janeiro
Plantas do Brasil: Resgate Histórico e Herbário Virtual para oConhecimento e Conservação da Flora Brasileira
“REFLORA”
Objetivo Geral
O projeto tem como objetivo a construção de um Herbário Virtual de acesso público, abrangendo as amostras coletadas no território brasileiro, nos séculos 18, 19 e 20 (até 1970), e que estão depositadas nos herbários Royal Botanic Gardens, Kew e do Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris.
Componentes
Captura de Dados
Adequação da Infraestrutura
Desenvolvimento de Sistemas• JABOT 2 – Herbário Virtual
Manipulação e Tratamento de Dados
Banco de dados textual
Banco de imagens
Herbário Virtual
Outros herbários virtuais e agregadores
Em números
Instituição No. de imagens ~ em TB (x 200MB)
JBRJ 550.000 104,8
KEW 40.000 7,6
Paris 280.000 53,4
TOTAL 870.000 165,8
Desenvolvimento
Infraestrutura
Parcerias Envolvidas
POLI
Desenvolvimento“JABOT2”
Núcleo Taxonômico
ColeçõesCientíficas
Espécies Ameaçadas
Floras(RJ, BR,
etc.)
JABOT2
Consulta
AtualizaçãoE validação
Serviços
Conservação(Espécies Ameaçadas)
Taxonomia(Floras)
Testemunhos(Coleções)
JABOT2
Arquitetura Orientada a Serviços
Núcleo Taxonômico
ColeçõesCientíficas
Espécies Ameaçadas
Floras(RJ, BR, etc.)
JBRJ
IPNI
The Plant List
KEW
etc...
BiotaFAPESP
ServiçoFlorestalBrasileiro
Infraestrutura Computacional
• Processamento• Armazenagem• Conectividade
Infraestrutura Computacional Compartilhada*
• 10 Servidores arquitetura “Blade Servers”– “Lâminas” com 72GB de RAM e 12 núcleos (Xeon
2.93Ghz)
* Parceria com o MuMA - Recursos do BNDES
Infraestrutura Computacional Compartilhada
• Unidade de Armazenamento (“NAS”)– FAS3240 Cluster com 100TB líquidos (exp. 715TB)– 1TB FlashCache– Centro de Distribuição de Dados do SINAPAD
DIPEQ
Museu BotânicoCTIC
“Anel Coletor”24 Fibras ÓticasVelocidade 10Gbits/seg (atual 100Mbits/seg)
LNCC
Internet
Internet
Cenário atual e oportunidades• Listas oficiais
– Espécies da flora– Espécies ameaçadas
• Herbário Virtual (REFLORA)– Infraestrutura– Desenvolvimento– Parcerias estratégicas
• LNCC• PESC/COPPE
• Formalização do Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento– 2 doutores– 1 doutorando– 2 técnicos– 3 bolsistas
• 1 mestre• 1 doutor• 1 graduando
• Instituição reconhece como estratégico a produção, gestão e divulgação de informação de qualidade sobre biodiversidade
Otimizar a utilização dos
recursos
Mapa Estratégico do JBRJDesenvolver ações para a conservação
da biodiversidade e dos acervoscientífico e histórico-cultural...
Sociedade
Processos Internos
Aprendizado e Crescimento
FinançasAmpliar a dotação
orçamentária
Aperfeiçoar as edificações do
JBRJ
Ampliar a captação de recursos externos
Melhorar a qualidadedos gastos
Melhorar a infra-estrutura de TI e
segurança da informação
Promover a transformação da cultura
organizacional
Aumentar a eficiência dos
processos
Intensificar atividades científicas e culturaisno Museu do Meio Ambiente, Espaço
Tom Jobim...
Ampliar a receita própria
Promover a integração entre as diversas linhas de ações
institucionais
Promover ações paratornar a instituição um
qualificado provedor de dados de biodiversidade
Ampliar a ofertade cursos de pós-
graduaçãoe extensão
Difundir o conhecimento científico relacionada à
biodiversidade, com ênfase na flora
Formar recursos humanos em Botânica e ciências
correlatas
Gerar conhecimento científico relacionado
à flora nativa
Subsidiar a formulação ea execução das políticas
públicas de meio ambiente
Melhorar a avaliação do PPG (ENBT)
na CAPES
Conservar e ampliar acervo científico e histórico-cultural
Possuir quadro de pessoal comprometido e adequado
quantitativa e qualitativamente
O JBRJ e o SiB-Br
SiB-Br
Fauna
Lista de Espécies
Registro de Testemunhos
Conhecimento Sistematizado
Flora
Lista de Espécies
Registro de Testemunhos
Conhecimento Sistematizado
Ambientais
Clima Solo
Socioeconômicos
Uso da Terra Desmatamento Demografia Uso da Biodiversidade
O JBRJ e o SiB-Br
SiB-Br
Fauna
Lista de Espécies
Registro de Testemunhos
Conhecimento Sistematizado
Flora
Lista de Espécies
Registro de Testemunhos
Conhecimento Sistematizado
Ambientais
Clima Solo
Socioeconômicos
Uso da Terra Desmatamento Demografia Uso da Biodiversidade
Preparado para o Futuro
Compromisso com o passado
Instituto de PesquisasJardim Botânico do Rio de Janeiro
Eduardo Dalcinedalcin@jbrj.gov.br